2021/10/25 更新

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アイジヤン ムラツ
AYCAN MURAT
AYCAN MURAT
所属
教育研究院 自然科学系 特任助教
農学部 特任助教
職名
特任助教
連絡先
メールアドレス
通称等の別名
Aycan Murat
外部リンク

学位

  • Dosctor of Phylosophy (Ph.D.) ( 2018年6月   Ankara University, Graduate School of Natural and Applied Science )

  • Master of Science ( 2015年1月   Ankara University, Graduate School of Natural and Applied Science )

  • Biologist ( 2012年9月   Sakarya University )

研究分野

  • 環境・農学 / 遺伝育種科学  / Developing Stress Tolerant Plant

  • 環境・農学 / 作物生産科学  / Plant Stress Tolerance Mechanism

  • 環境・農学 / 遺伝育種科学  / Stress heredity

経歴(researchmap)

  • 新潟大学   農学部   Assistant Professor

    2020年4月 - 現在

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    国名:日本国

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  • 新潟大学   Institute of Science and technology   Visiting Scholar

    2018年10月 - 2020年3月

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    国名:日本国

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  • M.Sc.   Ankara University   Assistant Researcher

    2014年1月 - 2018年6月

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    国名:トルコ共和国

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  • M.Sc.   Ankara University   助手

    2013年10月 - 2016年10月

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経歴

  • 新潟大学   農学部   特任助教

    2020年4月 - 現在

学歴

  • Ankara University   Graduate School of Natural and Applied Science, Department of Agronomy/Field Crops   Doctorate

    2015年2月 - 2018年6月

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    国名: トルコ共和国

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  • 新潟大学   Graduate School of Science and Technology   Exchange Student

    2017年9月 - 2018年2月

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    国名: 日本国

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  • Ankara University   Graduate School of Natural and Applied Science, Department of Agronomy/Field Crops   Master of Science

    2013年2月 - 2015年1月

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    国名: トルコ共和国

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  • Sakarya University   Faculty of Science and Letter, Department of Biology   Bachelor Degree

    2007年9月 - 2012年9月

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    国名: トルコ共和国

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所属学協会

  • 日本応用糖質科学会

    2021年5月 - 現在

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  • American Society of Plant Biologist

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留学歴

  • Niigata University   Exchange Ph.D. Student

    2017年9月 - 2018年2月

 

論文

  • Direct contribution of the maternal genotype on the transgenerational salinity tolerance in wheat (Triticum aestivum L.) 査読

    Murat Aycan, Marouane Baslam, Bayram Ozdemir, Rasit Asiloglu, Toshiaki Mitsui, Mustafa Yildiz

    Environmental and Experimental Botany   104648 - 104648   2021年9月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.envexpbot.2021.104648

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  • Development of new high-salt tolerant bread wheat (Triticum aestivum L.) genotypes and insight into the tolerance mechanisms 査読

    Murat Aycan, Marouane Baslam, Rasit Asiloglu, Toshiaki Mitsui, Mustafa Yildiz

    Plant Physiology and Biochemistry   2021年5月

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    担当区分:筆頭著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.plaphy.2021.05.041

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  • Effect of protists on rhizobacterial community composition and rice plant growth in a biochar amended soil 査読

    Rasit Asiloglu, Bahar Sevilir, Solomon Oloruntoba Samuel, Murat Aycan, Muhittin Onur Akca, Kazuki Suzuki, Jun Murase, Oguz Can Turgay, Naoki Harada

    Biology and Fertility of Soils   2020年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media {LLC}  

    DOI: 10.1007/s00374-020-01525-1

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  • The effect of magnetic field strength on shoot regeneration and Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer in flax (Linum usitatissimum L.) 査読

    Murat Aycan, Ramazan Beyaz, Anzel Bahadir, Mustafa Yildiz

    Czech Journal of Genetics and Plant Breeding   55 ( No. 1 )   20 - 27   2019年3月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Czech Academy of Agricultural Sciences  

    <jats:p>This study was conducted to determine the effects of magnetic field (MF) strength on shoot regeneration and Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer in flax (Linum usitatissimum L.). Seeds of flax cv. Madaras were exposed to different MF strengths (0 – control, 75, 150, and 300 millitesla (mT)) for 24 h by using an electromagnetic generator system fabricated in laboratory conditions. After sterilization, seeds were germinated on MS (Murashige and Skoog) medium in Magenta vessels. Hypocotyl explants excised from 7-days-old seedlings were used for regeneration. GV2260 strain of Agrobacterium tumefaciens was used in transformation studies. Inoculated hypocotyls were cultured on MS medium containing 1 mg/l BAP (6-benzylaminopurine) and 0.02 mg/l NAA (naphthaleneacetic acid) for 2 days by co-cultivation. Then, they were transferred to MS medium containing the same growth regulators, 100 mg/l kanamycin and 500 mg/l Duocid for selection. The presence of the nptII gene was verified by PCR (polymerase chain reaction) analysis in putative transgenic plants. The highest results with respect to shoot regeneration and transformation frequency were obtained from treatments of 75 mT MF strength.   </jats:p>

    添付ファイル: 195_2017-CJGPB.pdf

    DOI: 10.17221/195/2017-cjgpb

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  • Optimized Nuclear Pellet Method for Extracting Next-Generation Sequencing Quality Genomic DNA from Fresh Leaf Tissue 査読

    Md Masud Rana, Murat Aycan, Takeshi Takamatsu, Kentaro Kaneko, Toshiaki Mitsui, Kimiko Itoh

    Methods and Protocols   2 ( 2 )   54 - 54   2019年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MDPI AG  

    Next-generation sequencing (NGS) is a revolutionary advancement allowing large-scale discovery of functional molecular markers that has many applications, including plant breeding. High-quality genomic DNA (gDNA) is a prerequisite for successful NGS library preparation and sequencing; however, few reliable protocols to obtain such plant gDNA exist. A previously reported nuclear pellet (NP) method enables extraction of high-yielding gDNA from fresh leaf tissue of maize (Zea mays L.), but the quality does not meet the stringent requirements of NGS. In this study, we optimized the NP method for whole-genome sequencing of rice (Oryza sativa L.) through the integration of simple purification steps. The optimized NP method relied on initial nucleus enrichment, cell lysis, extraction, and subsequent gDNA purification buffers. The purification steps used proteinase K, RNase A, phenol/chloroform/isoamyl alcohol (25:24:1), and chloroform/isoamyl alcohol (24:1) treatments for protein digestion and RNA, protein, and phenol removal, respectively. Our data suggest that this optimized NP method allowed extraction of consistently high-yielding and high-quality undegraded gDNA without contamination by protein and RNA. Moreover, the extracted gDNA fulfilled the quality metrics of NGS library preparation for the Illumina HiSeq X Ten platform by the TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit (Illumina). We provide a reliable step-by-step guide to the extraction of high-quality gDNA from fresh leaf tissues of rice for molecular biologists with limited resources.

    添付ファイル: mps-02-00054.pdf

    DOI: 10.3390/mps2020054

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  • The effect of boron on the morphological and physiological responses of sunflower seedlings (Helianthus annuus L.) 査読

    27 ( 5A )   3554 - 3560   2018年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    添付ファイル: 41FEB_17_02082cr.pdf

    Web of Science

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  • Seed Dormancy

    Mustafa Yildiz, Ramazan Beyaz, Mehtap Gursoy, Murat Aycan, Yusuf Koc, Mustafa Kayan

    Advances in Seed Biology   2017年12月

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    掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:InTech  

    DOI: 10.5772/intechopen.70571

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  • The effect of explant position on Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer in flax (Linum usitatissimum L.) 査読

    Ramazan Beyaz, Murat Aycan, Mustafa Yildiz

    Journal of Biotechnology   256   S39 - S39   2017年8月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    DOI: 10.1016/j.jbiotec.2017.06.678

    Web of Science

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  • Explant position effect on gene transformation to flax (Linum usitatissimum l.) via agrobacterium tumefaciens 査読

    Ramazan Beyaz, Murat Aycan, Mustafa Yildiz

    Periodicum Biologorum   119 ( 3 )   223 - 228   2017年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PERIODICUM BIOLOGORUM  

    Background and purpose: In this study, it was aimed to determine the influence of the position where explant was taken, on gene transfer via Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation in flax (Linum usitatissimum L.).
    Materials and methods: In the study, three different hypocotyl explants, 0.5 cm long, were used according to the position where they were isolated from. Seven-day-old sterile seedlings having cotyledon leaves and no root system were inoculated with bacterial solution for 20 min. GV2260 line of Agrobacterium tumefaciens having 'pBIN 19' plasmid containing npt II gene and GUS reporter gene, was used in transformation studies. After inoculation, hypocotyl section of the seedlings was divided into 3 parts labeled with number 1 (part above the root), number 2 (part above number 1) and number 3 (part below cotyledon leaves) and these parts were left to co-cultivation for 2 days. Then, hypocotyl segments were transferred to selection medium containing antibiotics. The presence of npt-II (neomycin phosphotransferase II) gene in transformants was confirmed by PCR analysis.
    Results: It was observed that the highest transgenic plant number was obtained from the explants taken from the region labeled 1, which was followed by explants taken from the region labeled 2. No transgenic plants could be obtained from explants isolated from region labeled 3.
    Conclusions: This study showed that not only explant type but also the position explant was excised from is very important in gene transfer via Agrobacterium tumefaciens.

    添付ファイル: ExplantPosition.pdf

    DOI: 10.18054/pb.v119i3.5020

    Web of Science

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  • New Approaches to Agrobacterium tumefaciens-Mediated Gene Transfer to Plants

    Mustafa Yildiz, Murat Aycan, Sunjung Park

    Genetic Engineering - An Insight into the Strategies and Applications   2016年12月

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    掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:InTech  

    DOI: 10.5772/66465

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  • The effect of magnetic field strength on shoot regeneration and Agrobacteium tumefaciens-mediated gene transfer in flax (Linum usitatissimum L.) 査読

    Murat Aycan, Mustafa Kayan, Fatma Eda Vuran, Ramazan Beyaz, Mustafa Yildiz

    Journal of Biotechnology   231   S40 - S40   2016年8月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    DOI: 10.1016/j.jbiotec.2016.05.156

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  • The effect of magnetic field strength on Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer in Rapeseed (Brassica napus L.) 査読

    Mustafa Kayan, Murat Aycan, Fatma Eda Vuran, Emine Selcen Darcin, Semra Mirici, Mustafa Yildiz

    Journal of Biotechnology   231   S40 - S40   2016年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    DOI: 10.1016/j.jbiotec.2016.05.157

    Web of Science

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  • The Effect of Salt Stress on Seedling Growth of Sunflower (Helianthus annus L.) 査読

    アイジャン ムラッツ

    Research Journal of Agricultural Sciences   9 ( 1 )   9 - 13   2016年4月

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    記述言語:トルコ語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Characterization of Phenotypic Variability of Sudanese Gum Arabic Tree Acacia senegal var. senegal Using Multiprimer Random Amplificatıon of Polymorphic DNA (RAPD) 査読

    アイジャン ムラッツ

    International Journal of Genetics and Genomics   4 ( 3 )   20 - 20   2016年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.11648/j.ijgg.20160403.12

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  • A novel method for high-frequency transgenic shoot regeneration via Agrobacterium tumefaciens in flax (Linum usitatissimum L.) 査読

    Ramazan Beyaz, Emine Selcen Darcin, Murat Aycan, Mustafa Kayan, Mustafa Yildiz

    Journal of Plant Biotechnology   43 ( 2 )   2016年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    添付ファイル: A_novel_method_for_high-frequency_transgenic_shoot.pdf

    DOI: 10.5010/JPB.2016.43.2.240

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  • Antibacterial Activity of Mentha pulegium L. from Turkey 査読

    Murat Aycan, Mustafa Yildiz, Selcen Darcin, Kenan Tunc, Aysegul Hos, Elif Dundar

    American Journal of Life Sciences   3 ( 6 )   383 - 383   2015年

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Science Publishing Group  

    添付ファイル: 10.11648.j.ajls.20150306.11.pdf

    DOI: 10.11648/j.ajls.20150306.11

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  • The effect of in vitro spacing competition on shoot regeneration from cotyledon node explants of Lathyrus chrysanthus Boiss 査読

    Aycan, M., Kayan, M., Yildiz, M.

    Australian Journal of Crop Science   8 ( 7 )   1019 - 1023   2014年

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    添付ファイル: tylidiz_8_7_2014_1019_1023.pdf

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  • The effect of in vitro competition on shoot regeneration from cotyledon node explants of Lathyrus chrysanthus Boiss 査読

    Cansu Telci Kahramanogullari, Mehdi Taher, Murat Aycan, Mustafa Yildiz

    Current Opinion in Biotechnology   24   S125 - S126   2013年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:CURRENT BIOLOGY LTD  

    DOI: 10.1016/j.copbio.2013.05.399

    Web of Science

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  • A new method for high transgenic shoot regeneration frequency via Agrobacterium tumefaciens 査読

    Yildiz Mustafa, Alizadeh Behrouz, Beyaz Ramazan, Kahramanogullari, Cansu Telci, Aycan Murat

    24   S40 - S41   2013年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

    DOI: 10.1016/j.copbio.2013.05.084

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  • A novel method for gene transfer to durum wheat (Triticum durum Desf.) via Agrobacterium tumefaciens 査読

    Mustafa Yildiz, Behrouz Alizadeh, Mehdi Taher, Murat Aycan

    Current Opinion in Biotechnology   24   S38 - S38   2013年7月

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    担当区分:最終著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:CURRENT BIOLOGY LTD  

    DOI: 10.1016/j.copbio.2013.05.076

    Web of Science

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書籍等出版物

  • Gamma Radiation Effect on Agrobacterium tumefaciens-Mediated Gene Transfer in Potato (Solanum tuberosum L.) in Solanum tuberosum - a Promising Crop for Starvation Problem

    Murat Aycan, Muhammet Cagri Oguz, Yasin Ozgen, Burak Onol, Mustafa Yildiz( 担当: 共著)

    InTECH  2021年8月 

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  • Morphological and Physiological Response of Commonly Cultivated Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Cultivars in Turkey to Salt Stress

    アイジャン ムラッツ( 担当: 共著)

    Cambridge Scholars Publishing  2018年7月 

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  • Seed Dormancy

    アイジャン ムラッツ( 担当: 共著)

    InTECH  2017年12月 

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  • New Approaches to Agrobacterium tumefaciens- Mediated Gene Transfer to Plants

    アイジャン ムラッツ( 担当: 共著)

    InTECH  2016年12月 

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講演・口頭発表等

  • Role of autophagy in rice seed maturation under high temperature stress

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Evaluation of new inbreeding bread wheat (Triticum aestivum L.) genotypes salinity tolerance during early stage by morphologic and Simple Sequence Repeat (SSR) analysis.

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Effects of increasing CO2 levels and temperature on rice yield and nutrient use efficiency.

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Multiomics reveal mechanisms of rice to microbial Volatile Compounds (VCs) exposure in a changing climate

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Inbreeding of new high-salt tolerant wheat (Triticum aestivum L.) genotypes and insight into the tolerance mechanisms.

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Designing climate-resilient rice cultivar ‘YNU31-2-4’ with high-yielding suited for the combined effect of salinity and heat

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    開催年月日: 2021年1月 - 2021年

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Effects of biochar amendment on community structure of protists and their predatory effects on bacterial community composition in a rice rhizosphere.

    日本土壌肥料学会 

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    開催年月日: 2020年9月

    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Effect of Hight-affinity K+ Transporter (HKT) Gene on Salt Tolerant Bread Wheat. 国際会議

    アイジャン ムラッツ

    KAAB International Symposium 2018  2018年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Expression Profiles of ∆1-pyroline-5-carboxylate synthase (P5CS) Gene in Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Under Salt Stress Conditions 国際会議

    アイジャン ムラッツ

    KAAB International Symposium 2017  2017年9月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • The Effect of explant position Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer in flax (Linum usitatissimum L.). 国際会議

    アイジャン ムラッツ

    European Biotechnology Congress 2017  2017年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • The effect of in vitro competition on shoot regeneration from cotyledon node explants of Lathyrus chrysanthus Boiss. 国際会議

    アイジャン ムラッツ

    European Biotechnology Congress 2013  2016年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • The Effect of magnethic field strength on Agrobacterium tumefaciens-mediated gene transfer in rapeseed (Brassica napus L.) 国際会議

    アイジャン ムラッツ

    European Biotechnology Congress 2016  2016年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • The Effect of Magnethic Field Strength on Shoot Regeneration and Agrobacteium tumefaciens­Mediated Gene Transfer in Flax (Linum usitatissimum L.) 国際会議

    アイジャン ムラッツ

    European Biotechnology Congress 2016  2016年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • The Effect of Squirting Cucumber (Ecballium elaterium (L.) A. Rich.) Fruit Juice on Shoot Regeneration in Durum Wheat (Triticum durum Desf.).

    アイジャン ムラッツ

    18th National Biotechnology Congress  2015年12月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • The Effect of Light on the Germination of Sunflower (Helianthus annuus L.) and Flax (Linum usitatissimum L.) Seeds

    アイジャン ムラッツ

    2nd National Environmental Congress  2015年11月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:ポスター発表  

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  • Possible Adverse Effects of Genetically Modified Plants on the Environment

    アイジャン ムラッツ

    2nd National Environmental Congress  2015年11月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:ポスター発表  

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  • Determining the Responses of Different Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Cultivars to Salt Stress at Early Growth Stage

    アイジャン ムラッツ

    2nd National Congress of Botanic  2015年10月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:ポスター発表  

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  • The Effect of Squirting Cucumber (Ecballium elaterium (L.) A. Rich.) Fruit Juice on Agrobacterium tumefaciens – Mediated Gene Transfer in Potato (Solanum tuberosum L.)

    アイジャン ムラッツ

    National Congress of Molecular Biology and Biotechnology  2015年10月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • The Effect of Herbisite Bialophos on Germination and Seedling Growth in Durum Wheat (Triticum durum Desf.)

    アイジャン ムラッツ

    2nd National Congress of Botanic  2015年10月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:ポスター発表  

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  • The Effect of Boron on The Seedling Development in Sunflower (Helianthus annuus L.)

    アイジャン ムラッツ

    2nd National Congress of Botanic  2015年10月 

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    記述言語:トルコ語   会議種別:ポスター発表  

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受賞

  • Young Researcher Oral Presentation Award

    Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition   Tropic regulation of rice root endophytes by protist

    Rasit Asiloglu, Keiko Shiroishi, O Solomon Samuel, Murat Aycan, Naoki Harada

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共同研究・競争的資金等の研究

  • Phytopathogen: a good Opportunity to Improve crop yieldS and quality under changing Environmental conditions (POISE).

    2017年9月 - 2021年9月

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    担当区分:研究分担者 

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  • Exploring the Usability of Universal SSR Markers as an Indicator of Salt Tolerans/Resistance and Examining of Gene Expression Profiles Under Salt Stress Conditions in Some Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Cultivars of Our Country.

    2015年9月 - 2018年9月

    Republic of Turkey Ministy of Agriculture and Foresty 

    アイジャン ムラッツ

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    担当区分:研究分担者  資金種別:競争的資金

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  • Improving Transgenic Wheat (Triticum sp.) Cultivars Tolerant to Herbicides.

    2014年10月 - 2018年7月

    Ankara University  Scientific Research Council 

    アイジャン ムラッツ

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    担当区分:研究分担者  資金種別:競争的資金

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  • Utilization Possibilities from Gamma Radiation, Magnetic Field and Squirting Cucumber (Ecballium elaterium (L.) A. Rich.) Fruit Juice in Increasing Adventitious Shoot Regeneration and Agrobacterium tumefaciens-mediated Gen Transfer Frequencies in Some Field Crops

    2013年10月 - 2016年10月

    The Scientific and Technological Research Council of Turkey 

    アイジャン ムラッツ

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    担当区分:研究分担者  資金種別:競争的資金

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  • Utlizing Possibilities of Gamma Radiation in Increasing Gene Transfer Frequency via Agrobacterium tumefaciens in Durum Wheat (Triticum durum Desf.).

    2013年10月 - 2014年10月

    Ankara University  Scientific Research Council 

    アイジャン ムラッツ

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    担当区分:研究分担者  資金種別:競争的資金

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