2024/04/27 更新

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ハカマタ　マリコ
袴田　真理子
HAKAMATA Mariko
所属
医歯学総合病院 呼吸器・感染症内科 助教
職名
助教
外部リンク

学位

  • 博士(医学) （ 2021年3月   新潟大学 ）

研究キーワード

  • 呼吸器感染症

研究分野

  • ライフサイエンス / 感染症内科学

  • ライフサイエンス / 細菌学

  • ライフサイエンス / 呼吸器内科学

経歴（researchmap）

  • 新潟大学医歯学総合病院   呼吸器・感染症内科   専任助教

    2023年4月 - 現在

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  • 新潟大学医学部細菌学分野

    2018年7月 - 2021年3月

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  • 新潟大学大学院医歯学総合研究科   呼吸器・感染症内科

    2017年4月 - 2023年3月

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経歴

  • 新潟大学   医歯学総合病院 呼吸器・感染症内科   助教

    2023年4月 - 現在

学歴

  • 新潟大学大学院   医歯学総合研究科

    2017年4月 - 2021年3月

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  • 新潟大学   医学部医学科

    2008年4月 - 2014年3月

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所属学協会

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論文

  • Recombinant mycobacterial DNA-binding protein 1 with post-translational modifications boosts IFN-gamma production from BCG-vaccinated individuals' blood cells in combination with CpG-DNA. 国際誌

    Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Akihito Nishiyama, Yutaka Yoshida, Yukiko Ohara, Tsukasa Mashima, Chikako Tomiyama, Amina K Shaban, Atsuki Takeishi, Mayuko Osada-Oka, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Jun-Ichi Maeyama, Mariko Hakamata, Hiroshi Moro, Toshiaki Kikuchi, Daisuke Hayashi, Fumiko Suzuki, Toshiko Yamamoto, Sumiko Iho, Masato Katahira, Saburo Yamamoto, Sohkichi Matsumoto

    Scientific reports   14 ( 1 )   9141 - 9141   2024年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Tuberculosis remains a large health threat, despite the availability of the tuberculosis vaccine, BCG. As BCG efficacy gradually decreases from adolescence, BCG-Prime and antigen-booster may be an efficient strategy to confer vaccine efficacy. Mycobacterial DNA-binding protein 1 (MDP1, namely Rv2986c, hupB or HU) is a major Mycobacterium tuberculosis protein that induces vaccine-efficacy by co-administration with CpG DNA. To produce MDP1 for booster-vaccine use, we have created recombinant MDP1 produced in both Escherichia coli (eMDP1) and Mycolicibacterium smegmatis (mMDP1), an avirulent rapid-growing mycobacteria. We tested their immunogenicity by checking interferon (IFN)-gamma production by stimulated peripheral blood cells derived from BCG-vaccinated individuals. Similar to native M. tuberculosis MDP1, we observed that most lysin resides in the C-terminal half of mMDP1 are highly methylated. In contrast, eMDP1 had less post-translational modifications and IFN-gamma stimulation. mMDP1 stimulated the highest amount of IFN-gamma production among the examined native M. tuberculosis proteins including immunodominant MPT32 and Antigen 85 complex. MDP1-mediated IFN-gamma production was more strongly enhanced when combined with a new type of CpG DNA G9.1 than any other tested CpG DNAs. Taken together, these results suggest that the combination of mMDP1 and G9.1 possess high potential use for human booster vaccine against tuberculosis.

    DOI： 10.1038/s41598-024-58836-8

    PubMed

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  • Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy. 国際誌

    Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Tomoyuki Narita, Noriyuki Kodera, Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Mariko Hakamata, Amina Kaboso Shaban, Yoshitaka Tateishi, Kosuke Ito, Sohkichi Matsumoto

    Nucleic acids research   2023年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Mycobacteria are the major human pathogens with the capacity to become dormant persisters. Mycobacterial DNA-binding protein 1 (MDP1), an abundant histone-like protein in dormant mycobacteria, induces dormancy phenotypes, e.g. chromosome compaction and growth suppression. For these functions, the polycationic intrinsically disordered region (IDR) is essential. However, the disordered property of IDR stands in the way of clarifying the molecular mechanism. Here we clarified the molecular and structural mechanism of DNA compaction by MDP1. Using high-speed atomic force microscopy, we observed that monomeric MDP1 bundles two adjacent DNA duplexes side-by-side via IDR. Combined with coarse-grained molecular dynamics simulation, we revealed the novel dynamic DNA cross-linking model of MDP1 in which a stretched IDR cross-links two DNA duplexes like double-sided tape. IDR is able to hijack HU function, resulting in the induction of strong mycobacterial growth arrest. This IDR-mediated reversible DNA cross-linking is a reasonable model for MDP1 suppression of the genomic function in the resuscitable non-replicating dormant mycobacteria.

    DOI： 10.1093/nar/gkad1149

    PubMed

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  • Dynamics of iron metabolism in patients with bloodstream infections: a time-course clinical study

    Hiroshi Moro, Yuuki Bamba, Kei Nagano, Mariko Hakamata, Hideyuki Ogata, Satoshi Shibata, Hiromi Cho, Nobumasa Aoki, Mizuho Sato, Yasuyoshi Ohshima, Satoshi Watanabe, Toshiyuki Koya, Toshinori Takada, Toshiaki Kikuchi

    Scientific Reports   13 ( 1 )   2023年11月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    The close relationship between infectious diseases and iron metabolism is well known, but a more detailed understanding based on current knowledge may provide new insights into the diagnosis and treatment of infectious diseases, considering the growing threat of antibiotic-resistant bacteria. This study investigated adult patients with bloodstream infections, temporal changes, and relationships between blood levels of iron and related markers, including hepcidin and lipocalin-2 (LCN2). We included 144 samples from 48 patients (mean age 72 years, 50% male), with 30 diagnosed with sepsis. During the acute phase of infection, blood levels of hepcidin and LCN2 increased rapidly, whereas iron levels decreased, with values in 95.8% of cases below the normal range (40–188 μg/dL). Later, hepcidin and LCN2 decreased significantly during the recovery phase, and the decreased iron concentrations were restored. In the case of persistent inflammation, iron remained decreased. Acute LCN2 levels were significantly higher in patients with sepsis (p < 0.01). Hypoferremia induced by increased hepcidin would reduce iron in the environment of extracellular pathogens, and the increased LCN2 would inhibit siderophores, resulting in the prevention of the pathogen’s iron acquisition in each manner during the acute phase of bloodstream infection.

    DOI： 10.1038/s41598-023-46383-7

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    その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41598-023-46383-7

  • Mycobacterial DNA-binding protein 1 is critical for BCG survival in stressful environments and simultaneously regulates gene expression. 国際誌

    Amina K Shaban, Gebremichal Gebretsadik, Mariko Hakamata, Hayato Takihara, Erina Inouchi, Akihito Nishiyama, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Yukiko Nishiuchi, Takehiro Yamaguchi, Naoya Ohara, Shujiro Okuda, Sohkichi Matsumoto

    Scientific reports   13 ( 1 )   14157 - 14157   2023年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Survival of the live attenuated Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccine amidst harsh host environments is key for BCG effectiveness as it allows continuous immune response induction and protection against tuberculosis. Mycobacterial DNA binding protein 1 (MDP1), a nucleoid associated protein, is essential in BCG. However, there is limited knowledge on the extent of MDP1 gene regulation and how this influences BCG survival. Here, we demonstrate that MDP1 conditional knockdown (cKD) BCG grows slower than vector control in vitro, and dies faster upon exposure to antibiotics (bedaquiline) and oxidative stress (H2O2 and menadione). MDP1-cKD BCG also exhibited low infectivity and survival in THP-1 macrophages and mice indicating possible susceptibility to host mediated stress. Consequently, low in vivo survival resulted in reduced cytokine (IFN-gamma and TNF-alpha) production by splenocytes. Temporal transcriptome profiling showed more upregulated (81-240) than downregulated (5-175) genes in response to MDP1 suppression. Pathway analysis showed suppression of biosynthetic pathways that coincide with low in vitro growth. Notable was the deferential expression of genes involved in stress response (sigI), maintenance of DNA integrity (mutT1), REDOX balance (WhiB3), and host interactions (PE/PE_PGRS). Thus, this study shows MDP1's importance in BCG survival and highlights MDP1-dependent gene regulation suggesting its role in growth and stress adaptation.

    DOI： 10.1038/s41598-023-40941-9

    PubMed

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  • Lysocin E Targeting Menaquinone in the Membrane of Mycobacterium tuberculosis Is a Promising Lead Compound for Antituberculosis Drugs. 国際誌

    Geberemichal Geberetsadik, Akane Inaizumi, Akihito Nishiyama, Takehiro Yamaguchi, Hiroshi Hamamoto, Suresh Panthee, Aki Tamaru, Manabu Hayatsu, Yusuke Mizutani, Shaban Amina Kaboso, Mariko Hakamata, Aleksandr Ilinov, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Kazuhisa Sekimizu, Sohkichi Matsumoto

    Antimicrobial agents and chemotherapy   66 ( 9 )   e0017122   2022年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Tuberculosis remains a public health crisis and a health security threat. There is an urgent need to develop new antituberculosis drugs with novel modes of action to cure drug-resistant tuberculosis and shorten the chemotherapy period by sterilizing tissues infected with dormant bacteria. Lysocin E is an antibiotic that showed antibacterial activity against Staphylococcus aureus by binding to its menaquinone (commonly known as vitamin K2). Unlike S. aureus, menaquinone is essential in both growing and dormant Mycobacterium tuberculosis. This study aims to evaluate the antituberculosis activities of lysocin E and decipher its mode of action. We show that lysocin E has high in vitro activity against both drug-susceptible and drug-resistant Mycobacterium tuberculosis var. tuberculosis and dormant mycobacteria. Lysocin E is likely bound to menaquinone, causing M. tuberculosis membrane disruption, inhibition of oxygen consumption, and ATP synthesis. Thus, we have concluded that the high antituberculosis activity of lysocin E is attributable to its synergistic effects of membrane disruption and respiratory inhibition. The efficacy of lysocin E against intracellular M. tuberculosis in macrophages was lower than its potent activity against M. tuberculosis in culture medium, probably due to its low ability to penetrate cells, but its efficacy in mice was still superior to that of streptomycin. Our findings indicate that lysocin E is a promising lead compound for the development of a new tuberculosis drug that cures drug-resistant and latent tuberculosis in a shorter period.

    DOI： 10.1128/aac.00171-22

    PubMed

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  • Identification and functional analysis of a new type of Z,E-mixed prenyl reductase from mycobacteria. 国際誌

    Tohru Abe, Mariko Hakamata, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Sohkichi Matsumoto, Hisashi Hemmi, Daijiro Ueda, Tsutomu Sato

    The FEBS journal   289 ( 16 )   4981 - 4997   2022年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Isoprenoids with reduced Z,E-mixed prenyl groups are found in various organisms. To date, only polyprenol reductases (PR-Dol) involved in dolichol biosynthesis have been identified as enzymes capable of reducing Z,E-mixed prenyl groups. Although C35 -isoprenoids with reduced Z,E-mixed prenyl groups are found in mycobacteria, Z,E-mixed heptaprenyl reductase (HepR) remains unidentified. In the present study, the identification and functional analysis of HepR was performed. No PR-Dol homolog gene was detected in the genome of Mycolicibacterium vanbaalenii. However, a homolog of geranylgeranyl reductase (GGR), which reacts with an all-E prenyl group as a substrate, was encoded in the genome; thus, we analyzed it as a HepR candidate. In vitro enzymatic assay and in vivo gene suppression analysis identified the GGR homolog as HepR and revealed that HepR catalyzes the reduction of ω- and E- prenyl units in Z,E-mixed heptaprenyl diphosphates, and C35 -isoprenoids are mainly biosynthesized using E,E,E-geranylgeranyl diphosphate as a precursor. Thus, it was demonstrated that the Z,E-mixed prenyl reductase family exists in the GGR homologs. To the best of our knowledge, this is the first identification of a new type of Z,E-mixed prenyl reductase with no sequence homology to PR-Dol. The substrate specificity of HepR significantly differed from that of GGR, suggesting that it is a new enzyme. HepR homologs are widely distributed in mycobacterial genomes, and lipid analysis suggests that many strains, including pathogenic species, produce HepR metabolites. The discovery of this new enzyme will promote further research on Z,E-mixed isoprenoids.

    DOI： 10.1111/febs.16412

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  • Factors associated with cytomegalovirus antigenemia in patients with rheumatic disease: A retrospective study. 国際誌

    Hideyuki Ogata, Nobumasa Aoki, Kei Nagano, Mariko Hakamata, Yuuki Bamba, Satoshi Shibata, Takeshi Koizumi, Yasuyoshi Ohshima, Satoshi Watanabe, Hiroshi Moro, Toshiyuki Koya, Toshiaki Kikuchi

    Journal of infection and chemotherapy : official journal of the Japan Society of Chemotherapy   28 ( 11 )   1471 - 1477   2022年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    INTRODUCTION: This study aimed to examine the factors associated with cytomegalovirus (CMV) antigenemia and the time of onset of CMV antigenemia among patients with rheumatic diseases. METHODS: A single-center, retrospective, observational study was conducted in our institution from January 2009 to December 2017. This study included patients with rheumatic diseases who had at least one CMV antigen measurement. Multivariate analysis and receiver operating characteristic analysis was performed. RESULTS: A total of 249 patients underwent CMV antigenemia assay, and 84 (33.7%) patients tested positive. When the association between CMV antigenemia and possible associated factors was investigated, multivariate analysis showed that daily steroid dose increased the odds of having CMV [odds ratio 16.25, 95% confidence interval (CI), 5.360-49.253]. In this study, the cutoff value of daily steroid dose found in this study (0.45 mg/kg/day) was reasonable in clinical practice, and the area under the curve of the steroid dose was 0.838 [95% CI 0.781-0.882], which was the largest of the known indicators. Moreover, the median time from the start of immunosuppressive therapy to the onset of CMV antigenemia was 30 (interquartile range, 21-44) days, and most of the daily steroid users (85.7%) developed CMV antigenemia within 60 days. CONCLUSIONS: The daily steroid dose is the most important factor associated with CMV antigenemia. Therefore, monitoring and treatment strategies based on the steroid dose, especially in the initial 2 months, are important.

    DOI： 10.1016/j.jiac.2022.07.004

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  • Chronic Hypercapnic Respiratory Failure in an Adult Patient with Silver-Russell Syndrome.

    Mariko Hakamata, Satoshi Hokari, Yasuyoshi Ohshima, Masayo Kagami, Sakae Saito, Ikuko N Motoike, Taiki Abe, Nobumasa Aoki, Masachika Hayashi, Satoshi Watanabe, Toshiyuki Koya, Toshiaki Kikuchi

    Internal medicine (Tokyo, Japan)   60 ( 12 )   1921 - 1926   2021年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    A 31-year-old woman who was clinically diagnosed with Silver-Russell syndrome (SRS) in childhood was admitted with complaints of dyspnea. She had hypercapnic respiratory failure accompanied by nocturnal hypoventilation. Computed tomography revealed systemic muscle atrophy and superior mesenteric artery syndrome; however, the bilateral lung fields were normal. She was treated with nocturnal noninvasive positive pressure ventilation and showed improvement of respiratory failure. In this case, loss of methylation on chromosome 11p15 and maternal uniparental disomy of chromosome 7, which are the common causes of SRS, were not detected. This is a rare case of adult SRS manifesting as chronic hypercapnic respiratory failure.

    DOI： 10.2169/internalmedicine.5479-20

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  • Extracellular DNA of slow growers of mycobacteria and its contribution to biofilm formation and drug tolerance. 国際誌

    Aleksandr Ilinov, Akihito Nishiyama, Hiroki Namba, Yukari Fukushima, Hayato Takihara, Chie Nakajima, Anna Savitskaya, Gebremichal Gebretsadik, Mariko Hakamata, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Shujiro Okuda, Yasuhiko Suzuki, Yuri S Vinnik, Sohkichi Matsumoto

    Scientific reports   11 ( 1 )   10953 - 10953   2021年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DNA is basically an intracellular molecule that stores genetic information and carries instructions for growth and reproduction in all cellular organisms. However, in some bacteria, DNA has additional roles outside the cells as extracellular DNA (eDNA), which is an essential component of biofilm formation and hence antibiotic tolerance. Mycobacteria include life-threating human pathogens, most of which are slow growers. However, little is known about the nature of pathogenic mycobacteria's eDNA. Here we found that eDNA is present in slow-growing mycobacterial pathogens, such as Mycobacterium tuberculosis, M. intracellulare, and M. avium at exponential growth phase. In contrast, eDNA is little in all tested rapid-growing mycobacteria. The physiological impact of disrupted eDNA on slow-growing mycobacteria include reduced pellicle formation, floating biofilm, and enhanced susceptibility to isoniazid and amikacin. Isolation and sequencing of eDNA revealed that it is identical to the genomic DNA in M. tuberculosis and M. intracellulare. In contrast, accumulation of phage DNA in eDNA of M. avium, suggests that the DNA released differs among mycobacterial species. Our data show important functions of eDNA necessary for biofilm formation and drug tolerance in slow-growing mycobacteria.

    DOI： 10.1038/s41598-021-90156-z

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 岩本 朋忠, 田丸 亜貴, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 菊地 利明, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    結核   96 ( 3 )   83 - 86   2021年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会  

    [目的]全ゲノム解析を用いて,早期発症者と長期潜伏後発症者から分離した結核菌北京株のゲノム変異を解析した。[方法]1999年に中学校で発生した結核集団感染の接触者と二次感染者のうち2009年までに結核を発症した患者より分離した結核菌北京株6株と,別の事例で初発時と再発時の患者より分離した結核菌北京株2株の計8株の全ゲノム解析を行った。結核菌の突然変異率は,初発から1年以内に発症した早期発症者と1年以上の潜伏期を経てから発症または再燃した長期潜伏後発症者の2群間で比較した。[結果]結核菌北京株の突然変異率は,Lineage 4に属する結核菌よりも高く,結核菌北京株の高い病原性や薬剤耐性の要因である可能性が示唆された。遺伝子多型解析では,酸化的損傷に起因すると推定されている突然変異が長期潜伏後発症群のほうに多く,潜伏期間中にも薬剤耐性変異が起こる可能性が示唆された。[結論]結核菌北京株の高頻度の薬剤耐性化を防ぐためには,感染した結核菌の系統により治療法を検討する必要性も考えられた。今後,結核菌系統の特性を理解し,治療法を工夫することで結核の薬剤耐性化や重篤化を防ぐ有効な対策の構築につながることが期待される。(著者抄録)

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  • Efficacy of the new β-D-glucan measurement kit for diagnosing invasive fungal infections, as compared with that of four conventional kits. 国際誌

    Yuuki Bamba, Kei Nagano, Hiroshi Moro, Hideyuki Ogata, Mariko Hakamata, Satoshi Shibata, Takeshi Koizumi, Nobumasa Aoki, Yasuyoshi Ohshima, Satoshi Watanabe, Takeshi Nakamura, Sugako Kobayashi, Yoshiki Hoshiyama, Toshiyuki Koya, Toshinori Takada, Toshiaki Kikuchi

    PloS one   16 ( 8 )   e0255172   2021年

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    BACKGROUND: Each of the currently available (1→3)-β-D-glucan (BDG) measurement kits follows a different measurement method and cut-off value. Comparisons of diagnostic performance for invasive fungal infections (IFIs) are desirable. Additionally, ecological considerations are becoming increasingly important in the development of new measurement kits. METHODS: The plasma BDG levels in clinical samples were measured using the following currently available kits: the Fungitec G test MKII, the Fungitec G test ES, Fungitell, the β-Glucan test Wako, and the newly developed Wako kit (Wako-Eu). Wako-Eu uses a pre-treatment solution that conforms to European regulations for the registration, evaluation, authorisation, and restriction of chemicals. The values obtained for the samples using each kit were studied and compared. RESULTS: Of the 165 patients evaluated, 12 had IFIs, including pneumocystis pneumonia, aspergillosis, and candidiasis. BDG values obtained using the kits were moderately correlated with each other. Clinical diagnoses of the evaluated cases indicated that 21 false positives were diagnosed by at least one kit. The sensitivity of the Fungitell kit was relatively low, but those of the other four were over 90%. The specificity was above 90% for all kits. For positive predictive value, the Wako and the Wako-Eu methods were superior to the others owing to fewer false positive results. CONCLUSIONS: The newly developed Wako-Eu method, which considers ecological concerns, shows diagnostic performance equivalent to that of its predecessor. To improve the diagnostic accuracy of IFIs, it is necessary to interpret the results carefully, giving due consideration to the characteristics of each measurement kit.

    DOI： 10.1371/journal.pone.0255172

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  • 外科的肺生検でも診断が困難であったEBV陽性びまん性大細胞型B細胞リンパ腫の1剖検症例

    袴田 真理子, 林 正周, 朝川 勝明, 渡邊 伸, 石川 大輔, 菊地 利明

    日本呼吸器学会誌   9 ( 6 )   458 - 462   2020年11月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本呼吸器学会  

    症例は74歳男性。発熱と咳嗽を契機に胸部異常影を指摘された。胸部CTで両側多発結節影、すりガラス影を認め、外科的肺生検を施行したが、確定診断に至らなかった。ステロイドパルス療法によりすりガラス影と結節影は改善したが、ステロイドの漸減に伴い呼吸不全が進行し死亡した。剖検で両下葉に多発腫瘤とEpstein-Barr virus(EBV)陽性の異型細胞を認め、EBV陽性びまん性大細胞型B細胞リンパ腫と診断した。ステロイドの漸減に伴い多発腫瘤影を呈する際は、リンパ増殖性疾患の可能性に注意する必要がある。(著者抄録)

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  • Higher genome mutation rates of Beijing lineage of Mycobacterium tuberculosis during human infection. 国際誌

    Mariko Hakamata, Hayato Takihara, Tomotada Iwamoto, Aki Tamaru, Atsushi Hashimoto, Takahiro Tanaka, Shaban A Kaboso, Gebremichal Gebretsadik, Aleksandr Ilinov, Akira Yokoyama, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Hiroshi Moro, Toshiaki Kikuchi, Shujiro Okuda, Sohkichi Matsumoto

    Scientific reports   10 ( 1 )   17997 - 17997   2020年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains of Beijing lineage have caused great concern because of their rapid emergence of drug resistance and worldwide spread. DNA mutation rates that reflect evolutional adaptation to host responses and the appearance of drug resistance have not been elucidated in human-infected Beijing strains. We tracked and obtained an original Mtb isolate of Beijing lineage from the 1999 tuberculosis outbreak in Japan, as well as five other isolates that spread in humans, and two isolates from the patient caused recurrence. Three isolates were from patients who developed TB within one year after infection (rapid-progressor, RP), and the other three isolates were from those who developed TB more than one year after infection (slow-progressor, SP). We sequenced genomes of these isolates and analyzed the propensity and rate of genomic mutations. Generation time versus mutation rate curves were significantly higher for RP. The ratio of oxidative versus non-oxidation damages induced mutations was higher in SP than RP, suggesting that persistent Mtb are exposed to oxidative stress in the latent state. Our data thus demonstrates that higher mutation rates of Mtb Beijing strains during human infection is likely to account for the higher adaptability and an emergence ratio of drug resistance.

    DOI： 10.1038/s41598-020-75028-2

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  • 深在性真菌症診断における国内3種の(1→3)β-D-グルカン測定試薬の比較

    番場 祐基, 茂呂 寛, 永野 啓, 袴田 真理子, 島津 翔, 尾方 英至, 小泉 健, 張 仁美, 青木 信将, 林 正周, 佐藤 瑞穂, 坂上 亜希子, 小屋 俊之, 菊地 利明

    感染症学雑誌   93 ( 4 )   500 - 506   2019年7月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

    [目的]国内3種の(1→3)-β-D-グルカン(以下β-D-グルカン)測定試薬における測定結果と患者の臨床背景を比較し,深在性真菌症の診断における有用性および試薬間での測定結果の乖離,偽陽性の要因について評価する.[方法]新潟大学医歯学総合病院において2017年8月から2017年11月にかけてβ-D-グルカン検査が提出された患者を対象とし,測定残余血漿を用いて以下の3試薬について測定した.(1)ファンギテックGテストMKII「ニッスイ」(以下MKII法),(2)ファンギテックGテストES「ニッスイ」(以下ES法),(3)β-グルカンテストワコー(以下ワコー法).[成績]171患者,245検体が対象となった.深在性真菌症患者は疑診を含め7例であった.β-D-グルカン測定値は,同一検体間の比較でMKII法が最も高く,次いでES法,ワコー法の順であったが,互いに有意に相関していた.感度,特異度,陽性的中率,陰性的中率などの診断特性は各試薬によって異なっていた.MKII法で偽陽性を比較的多く認めたものの,深在性真菌症(疑診含む)診断におけるROC曲線下面積には有意差はなかった.いずれかの試薬による偽陽性を呈した14例について,階層型クラスター分析を用いて分類したところ,偽陽性のパターンに一定の傾向が認められた.[結論]各測定試薬によるβ-D-グルカン測定の結果は概ね相関しているが,測定値は大きく異なっており,異なる試薬同士の比較は困難である.深在性真菌症診断における差は小さいが,それぞれの試薬の診断特性を理解し使用するべきである.また試薬によって偽陽性の原因が異なる可能性が示唆された.(著者抄録)

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    その他リンク： https://search-tp.jamas.or.jp/index.php?module=Default&action=Link&pub_year=2019&ichushi_jid=J00276&link_issn=&doc_id=20190821320003&doc_link_id=10.11150%2Fkansenshogakuzasshi.93.500&url=https%3A%2F%2Fdoi.org%2F10.11150%2Fkansenshogakuzasshi.93.500&type=J-STAGE&icon=https%3A%2F%2Fjk04.jamas.or.jp%2Ficon%2F00007_3.gif

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書籍等出版物

  • 特集 呼吸器画像診断-疾患理解が深まる読解のコツ Ⅰ.感染性疾患 肺結核･肺非結核性抗酸菌症

    袴田 真理子, 菊地 利明

    株式会社 医学書院  2023年8月 

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  • 【結核を考える-肺結核を中心に】結核の分子疫学検査

    袴田真理子, 茂呂寛, 松本壮吉, 菊地利明

    呼吸器内科・科学評論社  2020年5月 

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MISC

  • Mycolicibacterium neoaurum血流感染症の1例

    袴田 真理子, 尾方 英至, 菅野 直人, 鈴木 明日美, 山岸 郁美, 佐藤 和茂, 宇井 雅博, 霍間 勇人, 番場 祐基, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 柴田 怜, 青木 信将, 茂呂 寛, 菊地 利明

    感染症学雑誌   98 ( 1 )   97 - 97   2024年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 大腸菌による感染性硬膜下血腫の1例

    鈴木 明日美, 袴田 真理子, 菅野 直人, 山岸 郁美, 佐藤 和茂, 宇井 雅博, 霍間 勇人, 番場 祐基, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 菊地 利明

    感染症学雑誌   98 ( 1 )   120 - 121   2024年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 当院における腹膜透析(PD)関連抗酸菌感染症について

    山岸 郁美, 佐藤 和茂, 袴田 真理子, 番場 祐基, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本感染症学会総会・学術講演会・日本化学療法学会学術集会合同学会プログラム・抄録集   97回・71回   O - 048   2023年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本感染症学会・日本化学療法学会  

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  • 有機リン中毒患者に合併した肺炎の起因菌に関する後方視的検討

    番場 祐基, 山岸 郁美, 佐藤 和茂, 青木 志門, 袴田 真理子, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本感染症学会総会・学術講演会・日本化学療法学会学術集会合同学会プログラム・抄録集   97回・71回   P - 138   2023年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本感染症学会・日本化学療法学会  

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  • 肺アスペルギルス症診断における血清アスペルギルスIgG抗体の有用性

    番場 祐基, 山岸 郁美, 佐藤 和茂, 袴田 真理子, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本感染症学会東日本地方会学術集会・日本化学療法学会東日本支部総会合同学会プログラム・抄録集   71回・69回   116 - 116   2022年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本感染症学会東日本地方会・日本化学療法学会東日本支部  

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  • チゲサイクリン、ミノサイクリンが有効であったClostridioides difficileによる股関節炎の1例

    佐藤 和茂, 山岸 郁美, 袴田 真理子, 番場 祐基, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本感染症学会東日本地方会学術集会・日本化学療法学会東日本支部総会合同学会プログラム・抄録集   71回・69回   145 - 145   2022年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本感染症学会東日本地方会・日本化学療法学会東日本支部  

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  • 肺胞低換気と上腸間膜動脈症候群を呈し、ALPL遺伝子変異を認めたSilver-Russell症候群の成人例

    渡辺裕介, 穂苅諭, 袴田真理子, 大嶋康義, 島賢次郎, 青木信将, 渡部聡, 小屋俊之, 菊地利明, 鏡雅代

    医学生・研修医の日本内科学会ことはじめ2022   2022年4月

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  • 医療介護関連肺炎のADLによる死亡率の変化の検討

    小泉 健, 島津 翔, 山岸 郁美, 佐藤 和茂, 青木 志門, 宇井 雅博, 番場 祐基, 袴田 真理子, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 小屋 俊之, 菊地 利明, 近 幸吉, 原 勝人

    感染症学雑誌   96 ( 臨増 )   149 - 149   2022年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 抗酸菌の新しいタイプのZ、E混成型プレニル基還元酵素の同定と機能解析(Identification and functional analysis of a new type of Z,E-mixed prenyl reductase from mycobacteria)

    阿部 透, 袴田 真理子, 西山 晃史, 立石 善隆, 松本 壮吉, 邊見 久, 上田 大次郎, 佐藤 努

    日本細菌学雑誌   77 ( 1 )   68 - 68   2022年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • マイコバクテリア由来新規Z、E混成型プレニル基還元酵素の機能解析

    阿部 透, 袴田 真理子, 西山 晃史, 立石 善隆, 松本 壮吉, 邊見 久, 上田 大次郎, 佐藤 努

    日本放線菌学会大会講演要旨集   35回   55 - 55   2021年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本放線菌学会  

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  • 世界結核デーにちなんで、世界の結核・抗酸菌症研究のこれまでと今 結核菌北京株のゲノム解析と組織透明化/3次元イメージング「CUBIC」による抗酸菌感染の生体内モニタリング

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 大橋 璃子, 奥田 修二郎, 田井中 一貴, 菊地 利明, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   65 - 65   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 病原因子と生態防御(感染モデル・寄生・免疫・ワクチン)/病原体と感染症 組織透明化/3次元イメージング「CUBIC」による抗酸菌感染の生体内モニタリング

    袴田 真理子, 井内 絵梨奈, 横山 晃, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 大橋 璃子, 菊地 利明, 田井中 一貴, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   59 - 59   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 当施設における肺非結核抗酸菌症の状況 治療の状況を中心に

    青木 志門, 小泉 健, 阿部 静太郎, 袴田 真理子, 永野 啓, 柴田 怜, 青木 信将, 茂呂 寛, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本内科学会雑誌   110 ( Suppl. )   150 - 150   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本内科学会  

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 岩本 朋忠, 田丸 亜貴, 尾関 百合子, 西山 晃史, 菊地 利明, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    結核   95 ( 5 )   115 - 115   2020年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会  

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  • 呼吸器感染症における黄色ブドウ球菌の毒素発現について

    永野 啓, 青木 信将, 袴田 真理子, 尾方 英至, 柴田 怜, 小泉 健, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 茂呂 寛, 菊地 利明

    感染症学雑誌   94 ( 2 )   248 - 248   2020年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 市中病院の医療介護関連肺炎入院症例のADLと死亡率の検討

    小泉 健, 島津 翔, 幸田 敦, 袴田 真理子, 永野 啓, 尾方 英至, 柴田 怜, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 青木 信将, 茂呂 寛, 菊地 利明, 近 幸吉, 原 勝人, 堀 好寿, 田邊 嘉也

    感染症学雑誌   94 ( 臨増 )   282 - 282   2020年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • Existence of extracellular DNA in pathogenic mycobacteria and its role in mycobacterial physiology(和訳中)

    イリノフ・アレクサンドル, シャバン・アミナ, 袴田 真理子, 西山 晃史, 尾関 百合子, 福島 由華里, 中島 千絵, 立石 善隆, 鈴木 定彦, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   74 - 74   2020年1月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異についての解析

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 岩本 朋忠, 田丸 亜貴, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 菊地 利明, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   129 - 129   2020年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 誤嚥性肺炎の禁食期間と予後の検討

    小泉 健, 近 幸吉, 原 勝人, 島津 翔, 尾方 英至, 永野 啓, 里方 真理子, 番場 祐基, 張 仁美, 青木 信将, 佐藤 瑞穂, 坂上 亜希子, 茂呂 寛, 菊地 利明, 長谷川 隆志, 鈴木 榮一, 田邊 嘉也, 塚田 弘樹

    感染症学雑誌   93 ( 臨増 )   336 - 336   2019年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 壊死性気管気管支炎の病像を呈した気管気管支アスペルギルス症の2例

    尾方 英至, 青木 信将, 袴田 真理子, 永野 啓, 島津 翔, 番場 祐基, 小泉 健, 張 仁美, 佐藤 瑞穂, 坂上 亜希子, 茂呂 寛, 菊地 利明, 中枝 武司, 和田 庸子, 成田 一衛

    感染症学雑誌   93 ( 1 )   104 - 104   2019年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 準高齢者・高齢者・超高齢者の肺炎入院症例の予後の検討

    島津 翔, 小泉 健, 袴田 真理子, 永野 啓, 尾方 英至, 張 仁美, 青木 信将, 佐藤 瑞穂, 坂上 亜希子, 茂呂 寛, 菊地 利明, 長谷川 隆志, 鈴木 榮一, 近 幸吉, 原 勝人, 石塚 修, 田邊 嘉也, 西堀 武明, 塚田 弘樹

    感染症学雑誌   93 ( 1 )   84 - 84   2019年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 臨床検体を用いた血中(1-3)-β-D-グルカン測定キット国内外4種類の比較検討

    永野 啓, 番場 祐基, 尾方 英至, 袴田 真理子, 島津 翔, 小泉 健, 青木 信将, 茂呂 寛, 菊地 利明

    感染症学雑誌   93 ( 1 )   103 - 103   2019年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

    J-GLOBAL

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  • 拘束性換気障害を呈したSilver-Russell症候群の一例

    加藤 諄一, 大嶋 康義, 里方 真理子, 藤戸 信宏, 森谷 梨加, 韮澤 紀文, 上路 拓美, 木村 慎二

    日本呼吸ケア・リハビリテーション学会誌   28 ( Suppl. )   233s - 233s   2018年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本呼吸ケア・リハビリテーション学会  

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  • 免疫チェックポイント阻害剤による薬剤性肺障害の気管支肺胞洗浄所見の検討

    里方 真理子, 近藤 利恵, 青木 信将, 市川 紘将, 林 正周, 大嶋 康義, 渡部 聡, 坂上 拓郎, 小屋 俊之, 菊地 利明

    気管支学   40 ( Suppl. )   S377 - S377   2018年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(NPO)日本呼吸器内視鏡学会  

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  • 高齢者肺炎入院症例のADL低下の原因の検討

    小泉 健, 近 幸吉, 里方 真理子, 尾方 英至, 番場 祐基, 青木 信将, 張 仁美, 津畑 千佳子, 坂上 亜希子, 佐藤 瑞穂, 茂呂 寛, 田邊 嘉也, 塚田 弘樹, 長谷川 隆志, 鈴木 榮一, 菊地 利明

    感染症学雑誌   92 ( 3 )   460 - 460   2018年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 真菌血流感染症における敗血症バイオマーカーPresepsinの挙動とその有用性

    番場 祐基, 茂呂 寛, 里方 真理子, 尾方 英至, 小泉 健, 青木 信将, 林 正周, 坂上 拓郎, 小屋 俊之, 菊地 利明

    感染症学雑誌   92 ( 3 )   475 - 475   2018年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 自己免疫疾患に対して免疫抑制療法中の患者におけるサイトメガロウイルス感染のリスク因子の検討

    尾方 英至, 里方 真理子, 番場 祐基, 小泉 健, 青木 信将, 津畑 千佳子, 坂上 亜希子, 佐藤 瑞穂, 茂呂 寛, 菊地 利明

    日本化学療法学会雑誌   66 ( Suppl.A )   292 - 292   2018年4月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(公社)日本化学療法学会  

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  • 深在性真菌症における各β-D-グルカン測定試薬の比較

    番場 祐基, 茂呂 寛, 里方 真理子, 尾方 英至, 小泉 健, 青木 信将, 林 正周, 坂上 拓郎, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本化学療法学会雑誌   66 ( Suppl.A )   342 - 342   2018年4月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(公社)日本化学療法学会  

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  • 市中病院における医療介護関連肺炎の治療状況

    小泉 健, 近 幸吉, 里方 真理子, 尾方 英至, 番場 祐基, 青木 信将, 張 仁美, 津畑 千佳子, 坂上 亜希子, 佐藤 瑞穂, 茂呂 寛, 田邊 嘉也, 塚田 弘樹, 長谷川 隆志, 鈴木 榮一, 菊地 利明

    日本化学療法学会雑誌   66 ( Suppl.A )   325 - 325   2018年4月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(公社)日本化学療法学会  

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  • NPPV導入を必要としたSilver-Russell症候群の一例

    里方 真理子, 大嶋 康義, 西山 佑樹, 森谷 梨加, 才田 優, 市川 紘将, 朝川 勝明, 青木 信将, 渡部 聡, 坂上 拓郎, 小屋 俊之, 菊地 利明

    日本呼吸器学会誌   7 ( 増刊 )   336 - 336   2018年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本呼吸器学会  

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  • 小腸転移による急性腹症を来したALK陽性肺癌の2例

    里方 真理子, 渡部 聡, 佐藤 美由紀, 穂苅 諭, 渡邊 伸, 林 正周, 近藤 利恵, 市川 紘将, 阿部 徹哉, 小屋 俊之, 菊地 利明, 小山 建一, 田中 洋史

    肺癌   56 ( 6 )   858 - 858   2016年11月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(NPO)日本肺癌学会  

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  • 胆管癌肝切除、肝嚢胞開窓術後の再発性肝嚢胞に対し経十二指腸的超音波内視鏡下嚢胞ドレナージが有用であった1例

    里方 真理子, 古川 浩一, 酒井 規裕, 小川 雅裕, 大崎 暁彦, 佐藤 宗広, 米山 靖, 相場 恒男, 和栗 暢生, 五十嵐 健太郎, 横山 直行, 佐藤 大輔, 高橋 祐輔, 松澤 夏未, 橋立 英樹, 三尾 圭司, 渋谷 宏行

    新潟市民病院医誌   37 ( 1 )   95 - 95   2016年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟市民病院  

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受賞

  • 令和2年度新潟大学学生表彰

    2021年3月  

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  • 新潟大学若手医学研究賞

    2020年10月  

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  • 第95回日本結核・非結核性抗酸菌症学会 YoungAwards優秀賞

    2020年10月  

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  • 第4回抗酸菌研究会 ベストプレゼンテーション賞

    2019年11月  

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共同研究・競争的資金等の研究

  • 組織透明化/3次元イメージングCUBICによる抗酸菌感染の生体内モニタリング

    研究課題/領域番号：23K15363

    2023年4月 - 2025年3月

    制度名：科学研究費助成事業 若手研究

    研究種目：若手研究

    提供機関：日本学術振興会

    袴田 真理子

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    配分額：2990000円 （ 直接経費：2300000円 、 間接経費：690000円 ）

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  • 抗体を利用する、新しい結核の診断法と制御法の開発を目指した、国際共同研究

    研究課題/領域番号：21KK0136

    2021年10月 - 2025年3月

    制度名：科学研究費助成事業 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

    研究種目：国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

    提供機関：日本学術振興会

    松本 壮吉, 尾関 百合子, 袴田 真理子, 松村 隆之, 中村 梨沙, 大原 由貴子, 田中 崇裕

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    配分額：19240000円 （ 直接経費：14800000円 、 間接経費：4440000円 ）

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