2025/09/18 更新

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ニシヤマ　アキヒト
西山　晃史
NISHIYAMA Akihito
所属
教育研究院 医歯学系 医学系列 講師
医歯学総合研究科 地域疾病制御医学専攻 講師
職名
講師
ホームページ
https://www.med-niigatauniv-bacteriol.org
外部リンク

代表的な業績

    • 【論文】 Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy.  2023年12月

    • 【論文】 Adduct Formation of Delamanid with NAD in Mycobacteria  2020年3月

    • 【論文】 C-terminal intrinsically disordered region-dependent organization of the mycobacterial genome by a histone-like protein  2018年12月

学位

  • 博士（農学） （ 2003年3月   東北大学 ）

研究キーワード

  • 結核

  • 細菌学

研究分野

  • ライフサイエンス / 細菌学

経歴（researchmap）

  • 新潟大学   大学院医歯学総合研究科細菌学分野   講師

    2010年7月 - 現在

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  • 新潟大学   大学院医歯学総合研究科細菌学分野   助教

    2007年3月 - 2010年6月

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  • フロリダ・アトランティック大学（米国）   Charles E. Schmidt College of Biomedical Sciences   Research Associate

    2003年9月 - 2007年1月

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  • イースト・カロライナ大学（米国）   Department of Physiology, the Brody School of Medicine   Research Associate

    2003年6月 - 2003年9月

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経歴

  • 新潟大学   医歯学総合研究科　地域疾病制御医学専攻   講師

    2010年7月 - 現在

  • 新潟大学   医歯学総合研究科　地域疾病制御医学専攻   助教

    2007年3月 - 2010年6月

学歴

  • 東北大学   大学院農学研究科   応用生命科学専攻

    2000年4月 - 2003年3月

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  • 東北大学   大学院農学研究科   応用生命科学専攻

    1998年4月 - 2000年3月

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  • 東北大学   農学部   応用生物化学科（生物化学系）

    1994年4月 - 1998年3月

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所属学協会

留学歴

  • フロリダ・アトランティック大学生物医学部（Charles E. Schmidt College of Biomedical Sciences, Florida Atlantic University）、米国   博士研究員

    2003年9月 - 2007年1月

  • イースト・カロライナ大学医学部（Brody School of Medicine at East Carolina University）, 米国   博士研究員

    2003年6月 - 2003年9月

 

論文

  • BCG-derived acellular membrane vesicles elicit antimycobacterial immunity and innate immune memory. 国際誌

    Takehiro Yamaguchi, Noriaki Samukawa, Sohkichi Matsumoto, Masayuki Shiota, Masaki Matsumoto, Ryoma Nakao, Satoru Hirayama, Yutaka Yoshida, Akihito Nishiyama, Yuriko Ozeki, Shuhei Tomita

    Frontiers in immunology   16   1534615 - 1534615   2025年

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Tuberculosis (TB) is one of the leading causes of death due to infectious disease. The sole established vaccine against TB is the Mycobacterium bovis Bacillus Calmette-Guerin (BCG) vaccine. However, owing to the lack of durable immunity with the BCG vaccine and its risk of infection, safer vaccines that can also be used as boosters are needed. Here, we examined whether membrane vesicles (MVs) from BCG (BCG-MVs) isolated from BCG statically cultured in nutrient-restricted Sauton's medium (s-MVs) and from BCG planktonically cultured in nutrient-rich medium commonly used in the laboratory (p-MVs) could be used as novel TB vaccines. MVs are extracellular vesicles produced by various bacteria, including mycobacteria. Differences in the culture conditions affected the morphology, contents, immunostimulatory activity and immunogenicity of BCG-MVs. s-MVs presented greater immunostimulatory activity than p-MVs via the induction of TLR2 signaling. Mouse immunization experiments revealed that s-MVs, but not p-MVs, induced mycobacterial humoral and mucosal immunity, especially when administered in combination with adjuvants. In a BCG challenge experiment using BCG Tokyo type I carrying pMV361-Km, subcutaneous vaccination with s-MVs reduced the bacterial burden in the mouse lung to a level similar to that after intradermal vaccination with live BCG. Furthermore, the administration of s-MVs induced a significant lipopolysaccharide-induced proinflammatory response in macrophages in vitro. These results indicate that BCG-MVs obtained from static culture in Sauton's medium induce not only humoral immunity against mycobacteria but also trained immunity, which can allow the clearance of infectious agents other than mycobacteria. Together, these findings highlight the immunological properties of BCG-MVs and the availability of acellular TB vaccines that confer broad protection against various infectious diseases.

    DOI： 10.3389/fimmu.2025.1534615

    PubMed

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  • Recombinant mycobacterial DNA-binding protein 1 with post-translational modifications boosts IFN-gamma production from BCG-vaccinated individuals' blood cells in combination with CpG-DNA. 国際誌

    Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Akihito Nishiyama, Yutaka Yoshida, Yukiko Ohara, Tsukasa Mashima, Chikako Tomiyama, Amina K Shaban, Atsuki Takeishi, Mayuko Osada-Oka, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Jun-Ichi Maeyama, Mariko Hakamata, Hiroshi Moro, Toshiaki Kikuchi, Daisuke Hayashi, Fumiko Suzuki, Toshiko Yamamoto, Sumiko Iho, Masato Katahira, Saburo Yamamoto, Sohkichi Matsumoto

    Scientific reports   14 ( 1 )   9141 - 9141   2024年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Tuberculosis remains a large health threat, despite the availability of the tuberculosis vaccine, BCG. As BCG efficacy gradually decreases from adolescence, BCG-Prime and antigen-booster may be an efficient strategy to confer vaccine efficacy. Mycobacterial DNA-binding protein 1 (MDP1, namely Rv2986c, hupB or HU) is a major Mycobacterium tuberculosis protein that induces vaccine-efficacy by co-administration with CpG DNA. To produce MDP1 for booster-vaccine use, we have created recombinant MDP1 produced in both Escherichia coli (eMDP1) and Mycolicibacterium smegmatis (mMDP1), an avirulent rapid-growing mycobacteria. We tested their immunogenicity by checking interferon (IFN)-gamma production by stimulated peripheral blood cells derived from BCG-vaccinated individuals. Similar to native M. tuberculosis MDP1, we observed that most lysin resides in the C-terminal half of mMDP1 are highly methylated. In contrast, eMDP1 had less post-translational modifications and IFN-gamma stimulation. mMDP1 stimulated the highest amount of IFN-gamma production among the examined native M. tuberculosis proteins including immunodominant MPT32 and Antigen 85 complex. MDP1-mediated IFN-gamma production was more strongly enhanced when combined with a new type of CpG DNA G9.1 than any other tested CpG DNAs. Taken together, these results suggest that the combination of mMDP1 and G9.1 possess high potential use for human booster vaccine against tuberculosis.

    DOI： 10.1038/s41598-024-58836-8

    PubMed

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  • Evaluation of cytokine profiles related to Mycobacterium tuberculosis latent antigens using a whole-blood assay in the Philippines 査読

    Ikkoh Yasuda, Naomi Ruth, D. Saludar, Ana Ria Sayo, Shuichi Suzuki, Akira Yokoyama, Yuriko Ozeki, Haruka Kobayashi, Akihito Nishiyama, Sohkichi Matsumoto, Sharon E Cox, Takeshi Tanaka, Yoshiro Yamashita

    15   2024年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3389/fimmu.2024.1330796

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  • Genetic engineering employing MPB70 and its promoter enables efficient secretion and expression of foreign antigen in bacillus Calmette Guérin (BCG) Tokyo

    Atsuki Takeishi, Amina K. Shaban, Taichi Kakihana, Hayato Takihara, Shujiro Okuda, Hidekazu Osada, Desak Nyoman Surya Suameitria Dewi, Yuriko Ozeki, Yutaka Yoshida, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Yuki Aizu, Yasushi Chuma, Kazuyo Onishi, Daisuke Hayashi, Saburo Yamamoto, Tetsu Mukai, Manabu Ato, Duong Huu Thai, Huynh Thi Thao Nhi, Tsuyoshi Shirai, Satoshi Shibata, Fumiko Obata, Jun Fujii, Seiya Yamayoshi, Maki Kiso, Sohkichi Matsumoto

    Microbiology and Immunology   2024年1月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Wiley  

    Abstract

    Vaccination is an important factor in public health. The recombinant bacillus Calmette Guérin (rBCG) vaccine, which expresses foreign antigens, is expected to be a superior vaccine against infectious diseases. Here, we report a new recombination platform in which the BCG Tokyo strain is transformed with nucleotide sequences encoding foreign protein fused with the MPB70 immunogenic protein precursor. By RNA‐sequencing, mpb70 was found to be the most transcribed among all known genes of BCG Tokyo. Small oligopeptide, namely, polyhistidine tag, was able to be expressed in and secreted from rBCG through a process in which polyhistidine tag fused with intact MPB70 were transcribed by an mpb70 promoter. This methodology was applied to develop an rBCG expressing the receptor binding domain (RBD) of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2. Immunoblotting images and mass spectrometry data showed that RBD was also secreted from rBCG. Sera from mice vaccinated with the rBCG showed a tendency of weak neutralizing capacity. The secretion was retained even after a freeze‐drying process. The freeze‐dried rBCG was administered to and recovered from mice. Recovered rBCG kept secreting RBD. Collectively, our recombination platform offers stable secretion of foreign antigens and can be applied to the development of practical rBCGs.

    DOI： 10.1111/1348-0421.13116

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  • Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy. 査読 国際誌

    Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Tomoyuki Narita, Noriyuki Kodera, Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Mariko Hakamata, Amina Kaboso Shaban, Yoshitaka Tateishi, Kosuke Ito, Sohkichi Matsumoto

    Nucleic acids research   2023年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Mycobacteria are the major human pathogens with the capacity to become dormant persisters. Mycobacterial DNA-binding protein 1 (MDP1), an abundant histone-like protein in dormant mycobacteria, induces dormancy phenotypes, e.g. chromosome compaction and growth suppression. For these functions, the polycationic intrinsically disordered region (IDR) is essential. However, the disordered property of IDR stands in the way of clarifying the molecular mechanism. Here we clarified the molecular and structural mechanism of DNA compaction by MDP1. Using high-speed atomic force microscopy, we observed that monomeric MDP1 bundles two adjacent DNA duplexes side-by-side via IDR. Combined with coarse-grained molecular dynamics simulation, we revealed the novel dynamic DNA cross-linking model of MDP1 in which a stretched IDR cross-links two DNA duplexes like double-sided tape. IDR is able to hijack HU function, resulting in the induction of strong mycobacterial growth arrest. This IDR-mediated reversible DNA cross-linking is a reasonable model for MDP1 suppression of the genomic function in the resuscitable non-replicating dormant mycobacteria.

    DOI： 10.1093/nar/gkad1149

    PubMed

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  • Limited proteolysis of mycobacterial DNA-binding protein 1 with an extended, lysine-rich, intrinsically disordered region to unveil posttranslational modifications 査読

    Yutaka Yoshida, Akihito Nishiyama, Desak Nyoman Surya, Suameitria Dewi, Tomoya Yamazaki, Akira Yokoyama, Daiki Kobayashi, Hitoshi Kondo, Yuriko Ozeki, Sohkichi Matsumoto

    Biochemical and Biophysical Research Communications   681   111 - 119   2023年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2023.09.028

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  • Mycobacterial DNA-binding protein 1 is critical for BCG survival in stressful environments and simultaneously regulates gene expression. 国際誌

    Amina K Shaban, Gebremichal Gebretsadik, Mariko Hakamata, Hayato Takihara, Erina Inouchi, Akihito Nishiyama, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Yukiko Nishiuchi, Takehiro Yamaguchi, Naoya Ohara, Shujiro Okuda, Sohkichi Matsumoto

    Scientific reports   13 ( 1 )   14157 - 14157   2023年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Survival of the live attenuated Bacillus Calmette-Guérin (BCG) vaccine amidst harsh host environments is key for BCG effectiveness as it allows continuous immune response induction and protection against tuberculosis. Mycobacterial DNA binding protein 1 (MDP1), a nucleoid associated protein, is essential in BCG. However, there is limited knowledge on the extent of MDP1 gene regulation and how this influences BCG survival. Here, we demonstrate that MDP1 conditional knockdown (cKD) BCG grows slower than vector control in vitro, and dies faster upon exposure to antibiotics (bedaquiline) and oxidative stress (H2O2 and menadione). MDP1-cKD BCG also exhibited low infectivity and survival in THP-1 macrophages and mice indicating possible susceptibility to host mediated stress. Consequently, low in vivo survival resulted in reduced cytokine (IFN-gamma and TNF-alpha) production by splenocytes. Temporal transcriptome profiling showed more upregulated (81-240) than downregulated (5-175) genes in response to MDP1 suppression. Pathway analysis showed suppression of biosynthetic pathways that coincide with low in vitro growth. Notable was the deferential expression of genes involved in stress response (sigI), maintenance of DNA integrity (mutT1), REDOX balance (WhiB3), and host interactions (PE/PE_PGRS). Thus, this study shows MDP1's importance in BCG survival and highlights MDP1-dependent gene regulation suggesting its role in growth and stress adaptation.

    DOI： 10.1038/s41598-023-40941-9

    PubMed

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  • Antibodies against native proteins of Mycobacterium tuberculosis can detect pulmonary tuberculosis patients

    Desak Nyoman Surya Suameitria Dewi, Ni Made Mertaniasih, Soedarsono, Kimika Hagino, Tomoya Yamazaki, Yuriko Ozeki, Wayan Tunas Artama, Haruka Kobayashi, Erina Inouchi, Yutaka Yoshida, Satoshi Ishikawa, Amina Kaboso Shaban, Yoshitaka Tateishi, Akihito Nishiyama, Manabu Ato, Sohkichi Matsumoto

    Scientific Reports   2023年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    <jats:title>Abstract</jats:title><jats:p>Accurate point-of-care testing (POCT) is critical for managing tuberculosis (TB). However, current antibody-based diagnosis shows low specificity and sensitivity. To find proper antigen candidates for TB diagnosis by antibodies, we assessed IgGs responsiveness to <jats:italic>Mycobacterium tuberculosis</jats:italic> proteins in pulmonary TB (PTB) patients. We employed major secreted proteins, such as Rv1860, Ag85C, PstS1, Rv2878c, Ag85B, and Rv1926c that were directly purified from <jats:italic>M. tuberculosis</jats:italic>. In the first screening, we found that IgG levels were significantly elevated in PTB patients only against Rv1860, PstS1, and Ag85B among tested antigens. However, recombinant PstS1 and Ag85B from <jats:italic>Escherichia coli (E. coli)</jats:italic> couldn’t distinguish PTB patients and healthy controls (HC). Recombinant Rv1860 was not checked due to its little expression. Then, the 59 confirmed PTB patients from Soetomo General Academic Hospital, Surabaya, Indonesia, and 102 HC were tested to Rv1860 and Ag85B only due to the low yield of the PstS1 from <jats:italic>M. tuberculosis</jats:italic>. The ROC analysis using native Ag85B and Rv1860 showed an acceptable area under curve for diagnosis, which is 0.812 (95% CI 0.734–0.890, <jats:italic>p</jats:italic> &lt; 0.0001) and 0.821 (95% CI 0.752–0.890, <jats:italic>p</jats:italic> &lt; 0.0001). This study indicates that taking consideration of native protein structure is key in developing TB’s POCT by antibody-based diagnosis.</jats:p>

    DOI： 10.1038/s41598-023-39436-4

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  • Virulence of Mycobacterium intracellulare clinical strains in a mouse model of lung infection - role of neutrophilic inflammation in disease severity. 国際誌

    Yoshitaka Tateishi, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Mari Miki, Ryoji Maekura, Hiroshi Kida, Sohkichi Matsumoto

    BMC microbiology   23 ( 1 )   94 - 94   2023年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    BACKGROUND: Mycobacterium intracellulare is a major etiological agent of Mycobacterium avium-intracellulare pulmonary disease (MAC-PD). However, the characteristics of the virulence of M. intracellulare and the in vivo chemotherapeutic efficacy remain unclear. In this study, we examined the virulence of nine M. intracellulare strains with different clinical phenotypes and genotypes in C57BL/6 mice. RESULTS: We classified three types of virulence phenotypes (high, intermediate, and low) based on the kinetics of the bacterial load, histological lung inflammation, and neutrophilic infiltration. High virulence strains showed more severe neutrophilic infiltration in the lungs than intermediate and low virulence strains, with 6.27-fold and 11.0-fold differences of the average percentage of neutrophils in bronchoalveolar lavage fluid, respectively. In particular, the high virulence strain M.i.198 showed the highest mortality in mice, which corresponded to the rapid progression of clinical disease. In mice infected with the drug-sensitive high virulence strain M019, clarithromycin-containing chemotherapy showed the highest efficacy. Monotherapy with rifampicin exacerbated lung inflammation with increased lymphocytic and neutrophilic infiltration into the lungs. CONCLUSIONS: The virulence phenotypes of clinical strains of M. intracellulare were diverse, with high virulence strains being associated with neutrophilic infiltration and disease progression in infected mice. These high virulence strains were proposed as a useful subject for in vivo chemotherapeutic experiments.

    DOI： 10.1186/s12866-023-02831-y

    PubMed

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  • Monitoring IgG against <i>Mycobacterium tuberculosis</i> proteins in an Asian elephant cured of tuberculosis that developed from long-term latency 査読 国際誌

    Satoshi Ishikawa, Yuriko Ozeki, Satomi Suga, Yasuhiko Mukai, Haruka Kobayashi, Erina Inouchi, Shaban A. Kaboso, Gebremichal Gebretsadik, Desak Nyoman Surya, Suameitria Dewi, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Hayato Takihara, Shujiro Okuda, Shiomi Yoshida, Naoaki Misawa, Sohkichi Matsumoto

    Scientific Reports   12 ( 1 )   4310 - 4310   2022年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-022-08228-7

    PubMed

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    その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41598-022-08228-7

  • Lysocin E Targeting Menaquinone in the Membrane of Mycobacterium tuberculosis Is a Promising Lead Compound for Antituberculosis Drugs. 査読 国際誌

    Geberemichal Geberetsadik, Akane Inaizumi, Akihito Nishiyama, Takehiro Yamaguchi, Hiroshi Hamamoto, Suresh Panthee, Aki Tamaru, Manabu Hayatsu, Yusuke Mizutani, Shaban Amina Kaboso, Mariko Hakamata, Aleksandr Ilinov, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Kazuhisa Sekimizu, Sohkichi Matsumoto

    Antimicrobial agents and chemotherapy   66 ( 9 )   e0017122   2022年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/aac.00171-22

    PubMed

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  • Identification and functional analysis of a new type of <i>Z,E</i> ‐mixed prenyl reductase from mycobacteria 査読 国際誌

    Tohru Abe, Mariko Hakamata, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Sohkichi Matsumoto, Hisashi Hemmi, Daijiro Ueda, Tsutomu Sato

    The FEBS Journal   289 ( 16 )   4981 - 4997   2022年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/febs.16412

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    その他リンク： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/febs.16412

  • 抗酸菌の新しいタイプのZ、E混成型プレニル基還元酵素の同定と機能解析(Identification and functional analysis of a new type of Z,E-mixed prenyl reductase from mycobacteria)

    阿部 透, 袴田 真理子, 西山 晃史, 立石 善隆, 松本 壮吉, 邊見 久, 上田 大次郎, 佐藤 努

    日本細菌学雑誌   77 ( 1 )   68 - 68   2022年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • Extracellular DNA of slow growers of mycobacteria and its contribution to biofilm formation and drug tolerance 査読 国際誌

    Ilinov A, Nishiyama A, Namba H, Fukushima Y, Takihara H, Nakajima C, Savitskaya A, Gebretsadik G, Hakamata M, Ozeki Y, Tateishi Y, Okuda S, Suzuki Y, Vinnik YS, Matsumoto S

    Scientific Reports   11 ( 1 )   10953 - 10953   2021年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-021-90156-z

    PubMed

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 岩本 朋忠, 田丸 亜貴, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 菊地 利明, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    結核   96 ( 3 )   83 - 86   2021年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会  

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  • Comparative genomic analysis of Mycobacterium intracellulare: Implications for clinical taxonomic classification in pulmonary Mycobacterium avium-intracellulare complex disease 査読

    Yoshitaka Tateishi, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Mari Miki, Ryoji Maekura, Yukari Fukushima, Chie Nakajima, Yasuhiko Suzuki, Sohkichi Matsumoto

    BMC Microbiology   In press   2021年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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  • 病原因子と生態防御(感染モデル・寄生・免疫・ワクチン)/病原体と感染症 組織透明化/3次元イメージング「CUBIC」による抗酸菌感染の生体内モニタリング

    袴田 真理子, 井内 絵梨奈, 横山 晃, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 大橋 璃子, 菊地 利明, 田井中 一貴, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   59 - 59   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 低酸素環境と疾患(がん、感染症)の分子論 低酸素休眠抗酸菌の主要タンパク質Mycobacterial DNA-binding protein 1(My cobacterial DNA-binding protein 1, a major protein in hypoxic dormant mycobacteria)

    西山 晃史, 古寺 哲幸, 清水 将裕, Savitskaya Anna, Enany Shymaa, 真柳 浩太, 山口 雄大, 尾関 百合子, 立石 善隆, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   57 - 57   2021年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 世界結核デーにちなんで、世界の結核・抗酸菌症研究のこれまでと今 結核菌北京株のゲノム解析と組織透明化/3次元イメージング「CUBIC」による抗酸菌感染の生体内モニタリング

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 大橋 璃子, 奥田 修二郎, 田井中 一貴, 菊地 利明, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   65 - 65   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • Correction: Significance of a histone-like protein with its native structure for the diagnosis of asymptomatic tuberculosis. 国際誌

    Yukiko Ohara, Yuriko Ozeki, Yoshitaka Tateishi, Tsukasa Mashima, Fumio Arisaka, Yasuo Tsunaka, Yoshie Fujiwara, Akihito Nishiyama, Yutaka Yoshida, Kengo Kitadokoro, Haruka Kobayashi, Yukihiro Kaneko, Ichiro Nakagawa, Ryoji Maekura, Saburo Yamamoto, Masato Katahira, Sohkichi Matsumoto

    PloS one   16 ( 8 )   e0256946   2021年

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    記述言語：英語  

    [This corrects the article DOI: 10.1371/journal.pone.0204160.].

    DOI： 10.1371/journal.pone.0256946

    PubMed

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  • Genome-wide identification of essential genes in Mycobacterium intracellulare by transposon sequencing — Implication for metabolic remodeling 査読

    Yoshitaka Tateishi, Yusuke Minato, Anthony D. Baughn, Hiroaki Ohnishi, Akihito Nishiyama, Yuriko Ozeki, Sohkichi Matsumoto

    Scientific Reports   10 ( 1 )   5449   2020年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-020-62287-2

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    その他リンク： http://www.nature.com/articles/s41598-020-62287-2

  • Higher genome mutation rates of Beijing lineage of Mycobacterium tuberculosis during human infection 査読 国際誌

    Mariko Hakamata, Hayato Takihara, Tomotada Iwamoto, Aki Tamaru, Atsushi Hashimoto, Takahiro Tanaka, Shaban A. Kaboso, Gebremichal Gebretsadik, Aleksandr Ilinov, Akira Yokoyama, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Yoshitaka Tateishi, Hiroshi Moro, Toshiaki Kikuchi, Shujiro Okuda, Sohkichi Matsumoto

    Scientific Reports   10 ( 1 )   17997 - 17997   2020年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-020-75028-2

    PubMed

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    その他リンク： http://www.nature.com/articles/s41598-020-75028-2

  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 岩本 朋忠, 田丸 亜貴, 尾関 百合子, 西山 晃史, 菊地 利明, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    結核   95 ( 5 )   115 - 115   2020年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会  

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  • 尿プロテオミクスによる肺MAC症のバイオマーカー探索

    横山 晃, 平尾 嘉利, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 桑原 克弘, 菊地 利明, 山本 格, 松本 壮吉

    結核   95 ( 5 )   146 - 146   2020年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会  

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  • Adduct Formation of Delamanid with NAD in Mycobacteria 査読

    Mikayo Hayashi, Akihito Nishiyama, Ryuki Kitamoto, Yoshitaka Tateishi, Mayuko Osada-Oka, Yukiko Nishiuchi, Shaban A. Kaboso, Xiuhao Chen, Mamoru Fujiwara, Yusuke Inoue, Yoshikazu Kawano, Masanori Kawasaki, Tohru Abe, Tsutomu Sato, Kentaro Kaneko, Kimiko Itoh, Sohkichi Matsumoto, Makoto Matsumoto

    Antimicrobial Agents and Chemotherapy   64 ( 5 )   2020年3月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/aac.01755-19

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  • 病原性抗酸菌における細胞外DNAの存在と抗酸菌の生理におけるその役割(Existence of extracellular DNA in pathogenic mycobacteria and its role in mycobacterial physiology)

    イリノフ・アレクサンドル, シャバン・アミナ, 袴田 真理子, 西山 晃史, 尾関 百合子, 福島 由華里, 中島 千絵, 立石 善隆, 鈴木 定彦, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   74 - 74   2020年1月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 抗酸菌症治療薬を目指した標的蛋白質の発現と精製

    大原 由貴子, 小林 悠, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 奥田 修二郎, 神谷 重樹, 北所 健悟, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   74 - 74   2020年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異についての解析

    袴田 真理子, 瀧原 速仁, 岩本 朋忠, 田丸 亜貴, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 菊地 利明, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   129 - 129   2020年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 抗酸菌ヒストン様タンパク質の天然変性領域依存的なDNA凝集作用

    西山 晃史, 成田 知恕, 古寺 哲幸, 小林 瑶子, 武藤 寛亨, 渡辺 順也, 大原 直也, 尾関 百合子, 立石 善隆, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   132 - 132   2020年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • MDP1はM.tuberculosis var BCG株の生存を確固とするための代謝と複製を調節する(MDP1 regulates metabolism and replication ensuring the survival of M. tuberculosis var BCG)

    シャバン・アミナ, 西山 晃史, 立石 善隆, 山口 雄大, 西内 由紀子, 瀧原 速仁, 奥田 修二郎, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   88 - 88   2020年1月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 尿ウロテオミクスによる肺MAC症のバイオマーカー探索

    横山 晃, 平尾 嘉利, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 山本 格, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   117 - 117   2020年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 菌の休眠と覚醒のメカニズムと意義 休眠中のマイコバクテリアの主要タンパク質であるマイコバクテリアのヒストン様タンパク質MDP1の機能(The functions of mycobacterial histone-like protein MDP1, a major protein in dormant mycobacteria)

    西山 晃史, Savitskaya Anna, 山口 雄大, 大原 直也, 成田 知恕, 古寺 哲幸, 尾関 百合子, 立石 善隆, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   74 ( 1 )   8 - 8   2019年3月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • C-terminal intrinsically disordered region-dependent organization of the mycobacterial genome by a histone-like protein 査読

    Anna Savitskaya, Akihito Nishiyama, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Yuriko Ozeki, Masaaki Nameta, Tomohiro Kon, Shaban A. Kaboso, Naoya Ohara, Olga V. Peryanova, Sohkichi Matsumoto

    Scientific Reports   8 ( 1 )   8197   2018年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Nature Publishing Group  

    DOI： 10.1038/s41598-018-26463-9

    Scopus

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  • Significance of a histone-like protein with its native structure for the diagnosis of asymptomatic tuberculosis. 査読 国際誌

    Ohara Y, Ozeki Y, Tateishi Y, Mashima T, Arisaka F, Tsunaka Y, Fujiwara Y, Nishiyama A, Yoshida Y, Kitadokoro K, Kobayashi H, Kaneko Y, Nakagawa I, Maekura R, Yamamoto S, Katahira M, Matsumoto S

    PLoS One   13 ( 10 )   e0204160   2018年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1371/journal.pone.0204160

    PubMed

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  • Mycobacterial DNA-binding protein 1 is critical for long term survival of Mycobacterium smegmatis and simultaneously coordinates cellular functions 査読

    Shymaa Enany, Yutaka Yoshida, Yoshitaka Tateishi, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Anna Savitskaya, Takehiro Yamaguchi, Yukiko Ohara, Tadashi Yamamoto, Manabu Ato, Sohkichi Matsumoto

    SCIENTIFIC REPORTS   7   6810   2017年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-017-06480-w

    Web of Science

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  • Emergence of Panton-Valentine leukocidin-positive ST59 methicillin-susceptible Staphylococcus aureus with high cytolytic peptide expression in association with community-acquired pediatric osteomyelitis complicated by pulmonary embolism 査読

    Emi Sawanobori, Wei-Chun Hung, Tomomi Takano, Koji Hachuda, Tadahiro Horiuchi, Wataru Higuchi, Wei-Wen Hung, Yasuhisa Iwao, Akihito Nishiyama, Ivan Reva, Galina Reva, Lee-Jene Teng, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF MICROBIOLOGY IMMUNOLOGY AND INFECTION   48 ( 5 )   565 - 573   2015年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.jmii.2014.04.015

    Web of Science

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  • Elderly infection in the community due to ST5/SCCmecII methicillin-resistant Staphylococcus aureus (the New York/Japan clone) in Japan: Panton-Valentine leukocidin-negative necrotizing pneumonia 査読

    Olga Khokhlova, Yusuke Tomita, Wei-Chun Hung, Tomomi Takano, Yasuhisa Iwao, Wataru Higuchi, Akihito Nishiyama, Ivan Reva, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF MICROBIOLOGY IMMUNOLOGY AND INFECTION   48 ( 3 )   335 - 339   2015年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.jmii.2012.09.004

    Web of Science

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  • Virulence gene and expression analysis of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus causing iliopsoas abscess and discitis with thrombocytopenia 査読

    Wei-Chun Hung, Hiromitsu Mori, Sayaka Tsuji, Yasuhisa Iwao, Tomomi Takano, Akihito Nishiyama, Ivan Reva, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   19 ( 5 )   1004 - 1008   2013年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-013-0561-5

    Web of Science

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  • A new local variant (ST764) of the globally disseminated ST5 lineage of hospital-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) carrying the virulence determinants of community-associated MRSA 査読

    Tomomi Takano, Wei-Chun Hung, Michiko Shibuya, Wataru Higuchi, Yasuhisa Iwao, Akihito Nishiyama, Ivan Reva, Olga E. Khokhlova, Shizuka Yabe, Kyoko Ozaki, Misao Takano, Tatsuo Yamamoto

    Antimicrobial Agents and Chemotherapy   57 ( 4 )   1589 - 1595   2013年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/AAC.01147-12

    Scopus

    PubMed

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  • Genetic nature and virulence of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus 招待 査読

    Tatsuo Yamamoto, Wei-Chun Hung, Tomomi Takano, Akihito Nishiyama

    BioMedicine (Netherlands)   3 ( 1 )   2 - 18   2013年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.biomed.2012.12.001

    Scopus

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  • Recurrence of pelvic abscess from PantonValentine leukocidin-positive community-acquired ST30 methicillin-resistant Staphylococcus aureus 査読

    Hirokazu Isobe, Dai Miyasaka, Tomoyuki Ito, Tomomi Takano, Akihito Nishiyama, Yasuhisa Iwao, Olga E. Khokhlova, Takeshi Okubo, Naoto Endo, Tatsuo Yamamoto

    PEDIATRICS INTERNATIONAL   55 ( 1 )   120 - 123   2013年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1442-200X.2012.03612.x

    Web of Science

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  • Anti-Helicobacter pylori actions of CV-6209, a platelet-activating factor receptor antagonist 査読

    Yasuhisa Iwao, Tomomi Takano, Ikue Taneike, Ivan Reva, Hirokazu Isobe, Hui-Min Zhang, Akihito Nishiyama, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF GENERAL AND APPLIED MICROBIOLOGY   59 ( 2 )   147 - 152   2013年

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.2323/jgam.59.147

    Web of Science

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  • Accumulation of staphylococcal Panton-Valentine leukocidin in the detergent-resistant membrane microdomains on the target cells is essential for its cytotoxicity 査読

    Akihito Nishiyama, Hirokazu Isobe, Yasuhisa Iwao, Tomomi Takano, Wei-Chun Hung, Ikue Taneike, Saori Nakagawa, Soshi Dohmae, Nobuhiro Iwakura, Tatsuo Yamamoto

    FEMS IMMUNOLOGY AND MEDICAL MICROBIOLOGY   66 ( 3 )   343 - 352   2012年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1574-695X.2012.01027.x

    Web of Science

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  • Evolution and virulence of Panton-Valentine leukocidin-positive ST30 methicillin-resistant Staphylococcus aureus in the past 30 years in Japan 査読

    Hirokazu Isobe, Tomomi Takano, Akihito Nishiyama, Wei-Chun Hung, Shuichi Kuniyuki, Yasuhiro Shibuya, Ivan Reva, Shizuka Yabe, Yasuhisa Iwao, Wataru Higuchi, Olga E. Khokhlova, Takeshi Okubo, Tatsuo Yamamoto

    BIOMEDICAL RESEARCH-TOKYO   33 ( 2 )   97 - 109   2012年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.2220/biomedres.33.97

    Web of Science

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  • Super-sticky familial infections caused by Panton-Valentine leukocidin-positive ST22 community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Japan 査読

    Tatsuo Yamamoto, Tomomi Takano, Shizuka Yabe, Wataru Higuchi, Yasuhisa Iwao, Hirokazu Isobe, Kyoko Ozaki, Misao Takano, Ivan Reva, Akihito Nishiyama

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   18 ( 2 )   187 - 198   2012年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-011-0316-0

    Web of Science

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  • The emerging ST8 methicillin-resistant Staphylococcus aureus clone in the community in Japan: associated infections, genetic diversity, and comparative genomics 査読

    Yasuhisa Iwao, Rumiko Ishii, Yusuke Tomita, Yasuhiro Shibuya, Tomomi Takano, Wei-Chun Hung, Wataru Higuchi, Hirokazu Isobe, Akihito Nishiyama, Mio Yano, Tetsuya Matsumoto, Kikuyo Ogata, Takeshi Okubo, Olga Khokhlova, Pak-Leung Ho, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   18 ( 2 )   228 - 240   2012年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-012-0379-6

    Web of Science

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  • Reduction of Overall Helicobacter pylori Colonization Levels in the Stomach of Mongolian Gerbil by Lactobacillus johnsonii La1 (LC1) and Its in Vitro Activities against H. pylori Motility and Adherence 査読

    Hirokazu Isobe, Akihito Nishiyama, Tomomi Takano, Wataru Higuchi, Saori Nakagawa, Ikue Taneike, Yoichi Fukushima, Tatsuo Yamamoto

    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY   76 ( 4 )   850 - 852   2012年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1271/bbb.110921

    Web of Science

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  • Isolation and molecular characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus from public transport 査読

    Yasuhisa Iwao, Shizuka Yabe, Tomomi Takano, Wataru Higuchi, Akihito Nishiyama, Tatsuo Yamamoto

    MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY   56 ( 1 )   76 - 82   2012年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1348-0421.2011.00397.x

    Web of Science

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  • Helicobacter pylori Eradication by Sitafloxacin-Lansoprazole Combination and Sitafloxacin Pharmacokinetics in Mongolian Gerbils and Its In Vitro Activity and Resistance Development 査読

    Tatsuo Yamamoto, Tomomi Takano, Wataru Higuchi, Akihito Nishiyama, Ikue Taneike, Kumi Yoshida, Hiroko Kanda, Yuichiro Imamura

    ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY   55 ( 9 )   4261 - 4266   2011年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/AAC.01105-10

    Web of Science

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  • Chitin particles induce size-dependent but carbohydrate-independent innate eosinophilia 査読

    Mari Kogiso, Akihito Nishiyama, Tsutomu Shinohara, Masataka Nakamura, Emiko Mizoguchi, Yoshinori Misawa, Elisabeth Guinet, Mahyar Nouri-Shirazi, C. Kathleen Dorey, Ruth Ann Henriksen, Yoshimi Shibata

    JOURNAL OF LEUKOCYTE BIOLOGY   90 ( 1 )   167 - 176   2011年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1189/jlb.1110624

    Web of Science

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  • Emergence of the community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus USA300 clone in a Japanese child, demonstrating multiple divergent strains in Japan 査読

    Wataru Higuchi, Shigenao Mimura, Yoshihiro Kurosawa, Tomomi Takano, Yasuhisa Iwao, Shizuka Yabe, Olga Razvina, Akihito Nishiyama, Yurika Ikeda-Dantsuji, Fuminori Sakai, Hideaki Hanaki, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   16 ( 4 )   292 - 297   2010年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-010-0051-y

    Web of Science

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  • Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus: community transmission, pathogenesis, and drug resistance 招待 査読

    Tatsuo Yamamoto, Akihito Nishiyama, Tomomi Takano, Shizuka Yabe, Wataru Higuchi, Olga Razvina, Da Shi

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   16 ( 4 )   225 - 254   2010年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-010-0045-9

    Web of Science

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  • Molecular typing of Campylobacter jejuni and C-coli from chickens and patients with gastritis or Guillain-Barre syndrome based on multilocus sequence types and pulsed-field gel electrophoresis patterns 査読

    Shizuka Yabe, Wataru Higuchi, Yasuhisa Iwao, Tomomi Takano, Olga Razvina, Ivan Reva, Akihito Nishiyama, Tatsuo Yamamoto

    MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY   54 ( 6 )   362 - 367   2010年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1348-0421.2010.00222.x

    Web of Science

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  • Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae at the initial stage of influenza 査読

    Misao Takano, Kyoko Ozaki, Yoshiyuki Nitahara, Wataru Higuchi, Tomomi Takano, Akihito Nishiyama, Tatsuo Yamamoto

    PEDIATRICS INTERNATIONAL   51 ( 5 )   687 - 695   2009年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1442-200X.2009.02861.x

    Web of Science

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  • Capture of heat-killed Mycobacterium bovis bacillus Calmette-Guerin by intelectin-1 deposited on cell surfaces 査読

    Shoutaro Tsuji, Makiko Yamashita, Donald R. Hoffman, Akihito Nishiyama, Tsutomu Shinohara, Takashi Ohtsu, Yoshimi Shibata

    GLYCOBIOLOGY   19 ( 5 )   518 - 526   2009年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/glycob/cwp013

    Web of Science

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  • Genotypes, intrafamilial transmission, and virulence potential of nasal methicillin-resistant Staphylococcus aureus from children in the community 査読

    Kyoko Ozaki, Misao Takano, Wataru Higuchi, Tomomi Takano, Shizuka Yabe, Yoshiyuki Nitahara, Akihito Nishiyama, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   15 ( 2 )   84 - 91   2009年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-009-0668-x

    Web of Science

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  • A rapid screening method for Panton-Valentine leucocidin-positive community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus belonging to multilocus sequence type 30 and its related clone using a combination of multiplex PCR and pulsed-field gel electrophoresis 査読

    Ivan Reva, Wataru Higuchi, Tomomi Takano, Olga Singur, Kyoko Ozaki, Hirokazu Isobe, Shizuka Yabe, Kohei Saito, Tatiana Baranovich, Symaa Enany, Taketo Otsuka, Vladimir Potapov, Akihito Nishiyama, Tatsuo Yamamoto

    JOURNAL OF INFECTION AND CHEMOTHERAPY   15 ( 2 )   75 - 83   2009年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10156-009-0667-y

    Web of Science

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  • Depletion of cellular cholesterol enhances macrophage MAPK activation by chitin microparticles but not by heat-killed Mycobacterium bovis BCG 査読

    Akihito Nishiyama, Tsutomu Shinohara, Traci Pantuso, Shoutaro Tsuji, Makiko Yamashita, Shizuka Shinohara, Quentin N. Myrvik, Ruth Ann Henriksen, Yoshimi Shibata

    AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-CELL PHYSIOLOGY   295 ( 2 )   C341 - C349   2008年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1152/ajpcell.00446.2007

    Web of Science

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  • Catalytically inactive cyclooxygenase 2 and absence of prostaglandin E-2 biosynthesis in murine peritoneal macrophages following in vivo phagocytosis of heat-killed Mycobacterium bovis bacillus Calmette-Guerin 査読

    Makiko Yamashita, Tsutomu Shinohara, Shoutaro Tsuji, Quentin N. Myrvik, Akihito Nishiyama, Ruth Ann Henriksen, Yoshimi Shibata

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   179 ( 10 )   7072 - 7078   2007年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.4049/jimmunol.179.10.7072

    Web of Science

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  • Differential structure and activity between human and mouse intelectin-1: Human intelectin-1 is a disulfide-linked trimer, whereas mouse homologue is a monomer 査読

    Shoutaro Tsuji, Makiko Yamashita, Akihito Nishiyama, Tsutomu Shinohara, Zhongwei Li, Quentin N. Myrvik, Donald R. Hoffman, Ruth Ann Henriksen, Yoshimi Shibata

    GLYCOBIOLOGY   17 ( 10 )   1045 - 1051   2007年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/gob/cwm075

    Web of Science

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  • Differential subcellular localization of COX-2 in macrophages phagocytosing heat-killed Mycobacterium bovis BCG 査読

    Makiko Yamashita, Shoutaro Tsuji, Akihito Nishiyama, Quentin N. Myrvik, Ruth Ann Henriksen, Yoshimi Shibata

    AMERICAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY-CELL PHYSIOLOGY   293 ( 1 )   C184 - C190   2007年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1152/ajpcell.00346.2006

    Web of Science

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  • Immunologic response enhances atherosclerosis - type 1 helper T cell (Th1)-to-type 2 helper T cell (Th2) shift and calcified atherosclerosis in bacillus Calmette-Guerin (BCG)-treated apolipoprotein E-knockout (apo E-/-) mice 査読

    Yoshimi Shibata, Hiroyoshi Ohata, Makiko Yamashita, Shoutaro Tsuji, John F. Bradfield, Akihito Nishiyama, Ruth Ann Henriksen, Quentin N. Myrvik

    TRANSLATIONAL RESEARCH   149 ( 2 )   62 - 69   2007年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.trsl.2006.08.008

    Web of Science

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  • Heat-killed BCG induces biphasic cyclooxygenase 2(+) splenic macrophage formation - role of IL-10 and bone marrow precursors 査読

    Yoshimi Shibata, Jon Gabbard, Makiko Yamashita, Shoutaro Tsuji, Mike Smith, Akihito Nishiyama, Ruth Ann Henriksen, Quentin N. Myrvik

    JOURNAL OF LEUKOCYTE BIOLOGY   80 ( 3 )   590 - 598   2006年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1189/jlb.1205737

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  • Assembly of staphylococcal leukocidin into a pore-forming oligomer on detergent-resistant membrane microdomains, lipid rafts, in human polymorphonuclear leukocytes 査読

    Akihito Nishiyama, Jun Kaneko, Masahiko Harata, Yoshiyuki Kamio

    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY   70 ( 6 )   1300 - 1307   2006年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1271/bbb.50499

    Web of Science

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  • Phagocytosis of N-acetyl-D-glucosamine particles, a Th1 adjuvant, by RAW 264.7 cells results in MAPK activation and TNF-α, but not IL-10, production 査読

    Nishiyama A, Tsuji S, Tsuji MY, Henriksen R, Myrvik QN, Shibata Y

    Cell Immunol   239 ( 2 )   103 - 112   2006年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.cellimm.2006.04.003

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  • Differential effects of IL-10 on prostaglandin H synthase-2 expression and prostaglandin E-2 biosynthesis between spleen and bone marrow macrophages 査読

    Y Shibata, A Nishiyama, H Ohata, J Gabbard, QN Myrvik, RA Henriksen

    JOURNAL OF LEUKOCYTE BIOLOGY   77 ( 4 )   544 - 551   2005年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1189/jlb.0504311

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  • Identification of serine138 residue in the 4-residue segment K135K136I137S138 of LukS-I component of Staphylococcus intermedius leukocidin crucial for the LukS-I-specific function of staphylococcal leukocidin 査読

    A Nishiyama, MARV Guerra, N Sugawara, K Yokota, J Kaneko, Y Kamio

    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY   66 ( 2 )   328 - 335   2002年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1271/bbb.66.328

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  • Phosphorylation of LukS by protein kinase A is crucial for the LukS-specific function of the staphylococcal leukocidin on human polymorphonuclear leukocytes 査読

    A Nishiyama, H Nariya, Y Kamio

    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY   62 ( 9 )   1834 - 1838   1998年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1271/bbb.62.1834

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  • Identification of the minimum segment in which the threonine(246) residue is a potential phosphorylated site by protein kinase A for the LukS-specific function of staphylococcal leukocidin 査読

    H Nariya, A Nishiyama, Y Kamio

    FEBS LETTERS   415 ( 1 )   96 - 100   1997年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/S0014-5793(97)01100-9

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書籍等出版物

  • BCG 2nd Edition -TB vaccine- Application against tuberculosis and other diseases

    西山晃史, 松本壮吉（ 担当： 共著 ,  範囲: Chapter 14. Bacterial factors regulating M. tuberculosis infection and persistence）

    公益財団法人結核予防会  2022年 

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    担当ページ：212-234   記述言語：英語 著書種別：学術書

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  • 病原微生物学 基礎と臨床

    荒川宜親, 神谷茂, 柳雄介 編（ 担当： 共著 ,  範囲: 3.3 抗酸菌と放線菌（西山晃史、松本壮吉 著））

    東京化学同人  2014年 

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    担当ページ：120-130   記述言語：日本語 著書種別：学術書

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  • 病原菌の今日的意味 改訂4版

    松本慶蔵（ 担当： 共著 ,  範囲: 下痢性大腸菌（diarrheagenic E. coli）（山本達男、西山晃史、高野智洋 著））

    医薬ジャーナル社  2011年 

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    担当ページ：445 – 472   記述言語：日本語 著書種別：学術書

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  • MRSA –基礎・臨床・対策-

    河野茂 編（ 担当： 共著 ,  範囲: 市中感染型MRSA（山本達男、西山晃史、高野智洋、樋口渉 著））

    医薬ジャーナル社  2010年 

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    担当ページ：202-212   記述言語：日本語 著書種別：学術書

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MISC

  • 野生型結核菌抗原を用いた抗体検出による活動性結核の診断と発症予測法の検討

    山崎 智也, 石川 智史, 田村 敏生, 塚本 裕美子, Nyoman Desak, 吉田 豊, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   78 ( 1 )   69 - 69   2023年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • E-及びZ-イソプレンユニットを還元する新しいタイプの酵素の同定

    阿部透, 若松のぞみ, 西山晃史, 立石善隆, 松本壮吉, 上田大次郎, 佐藤努

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2023   2023年

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  • E-及びZ-イソプレンユニットを還元する新しいタイプの酵素の同定

    阿部透, 若松のぞみ, 西山晃史, 立石善隆, 松本壮吉, 上田大次郎, 佐藤努

    イソプレノイド研究会例会講演要旨集   32nd   2022年

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  • マイコバクテリア由来新規Z,E混成型プレニル基還元酵素の機能解析

    阿部透, 袴田真理子, 西山晃史, 立石善隆, 松本壮吉, 邊見久, 上田大次郎, 佐藤努

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2022   2022年

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  • マイコバクテリア由来新規Z,E混成型プレニル基還元酵素の機能解析

    阿部透, 袴田真理子, 西山晃史, 立石善隆, 松本壮吉, 邊見久, 上田大次郎, 佐藤努

    日本放線菌学会大会講演要旨集   35th (CD-ROM)   2021年

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  • マイコバクテリア由来新規Z,E混成型プレニル基還元酵素の機能解析によるセスクアテルペン生合成の洞察

    阿部透, 袴田真理子, 西山晃史, 立石善隆, 松本壮吉, 邊見久, 上田大次郎, 佐藤努

    イソプレノイド研究会例会講演要旨集   31st (CD-ROM)   2021年

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  • 結核菌北京株のゲノム解析と組織透明化/3次元イメージング「CUBIC」による抗酸菌感染の生体内モニタリング

    袴田真理子, 袴田真理子, 瀧原速仁, 尾関百合子, 西山晃史, 立石善隆, 大橋璃子, 奥田修二郎, 田井中一貴, 菊地利明, 松本壮吉

    日本細菌学雑誌(Web)   76 ( 1 )   2021年

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析

    袴田真理子, 袴田真理子, 瀧原速仁, 岩本朋忠, 岩本朋忠, 田丸亜貴, 尾関百合子, 西山晃史, 立石善隆, 菊地利明, 奥田修二郎, 松本壮吉

    結核(Web)   96 ( 3 )   2021年

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  • 抗酸菌症治療薬を目指した標的蛋白質の発現と精製

    大原 由貴子, 小林 悠, 尾関 百合子, 西山 晃史, 立石 善隆, 奥田 修二郎, 神谷 重樹, 北所 健悟, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   75 ( 1 )   74 - 74   2020年1月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異解析

    袴田真理子, 袴田真理子, 瀧原速仁, 岩本朋忠, 田丸亜貴, 尾関百合子, 西山晃史, 菊地利明, 奥田修二郎, 松本壮吉

    結核(Web)   95 ( 5 )   2020年

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  • 早期発症者と長期潜伏後発症者より分離した結核菌北京株のゲノム変異についての解析

    袴田真理子, 袴田真理子, 瀧原速仁, 岩本朋忠, 田丸亜貴, 尾関百合子, 西山晃史, 立石善隆, 菊地利明, 奥田修二郎, 松本壮吉

    日本細菌学雑誌(Web)   75 ( 1 )   2020年

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  • 潜在期結核菌抗原の精製と感染診断への応用

    大原 由貴子, 尾関 百合子, 立石 善隆, 西山 晃史, 山本 三郎, 中川 一路, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   73 ( 1 )   64 - 64   2018年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 誘導型発現制御系を用いた抗酸菌mycobacterial DNA-binding protein 1の機能解析(Conditional control of mycobacterial DNA-binding protein 1 expression in mycobacteria)

    Savitskaya Anna, 西山 晃史, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   73 ( 1 )   97 - 97   2018年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 抗酸菌における誘導発現系を用いたmycobacterial DNA-binding protein 1の機能解析(Conditional expression of mycobacterial DNA-binding protein 1 function in mycobacteria)

    Savitskaya Anna G, 西山 晃史, 大原 直也, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   72 ( 1 )   97 - 97   2017年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 潜在期結核菌抗原の精製と感染診断への応用(Significance of the histone-like protein with the native structure for diagnosis of asymptomatic tuberculosis)

    西田 由貴子, 尾関 百合子, 立石 善隆, 西山 晃史, 山本 三郎, 中川 一路, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   72 ( 1 )   161 - 161   2017年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 抗酸菌の長期の生存に必須な細胞機能のヒストン様タンパク質依存的な制御(Histone-like protein-dependent control of mycobacterial functions critical for long-term survival)

    西山 晃史, Enany Shymaa, 立石 善隆, 尾関 百合子, Savitskaya Anna G, 山口 雄大, 西田 由貴子, 阿戸 学, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   72 ( 1 )   97 - 97   2017年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • MDP1によるマイコバクテリア代謝抑制(Mycobacterial metabolism repression by MDP1)

    Enany Shymaa, 西山 晃史, 立石 善隆, 松本 壮吉

    感染症学雑誌   90 ( 臨増 )   303 - 303   2016年3月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：(一社)日本感染症学会  

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  • 結核・抗酸菌症に関する最近のprovocativeな研究 ルシフェラーゼ発現リコンビナントBCGによる新規結核薬の迅速スクリーニング系の確立と実践(Latest provocative studies on tuberculosis and mycobacterial infections A new screen for TB drug candidates utilizing a luciferase-expressing recombinant BCG)

    尾関 百合子, 山口 雄大, Enany Shymaa, 五十嵐 雅之, 西内 由紀子, 岡 真優子, 岩本 朋忠, 小椋 義俊, 林 哲也, 立石 善隆, 西山 晃史, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   71 ( 1 )   40 - 40   2016年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 抗酸菌のタンパク質の抗原性と機能の分析(Analysis of antigenicity and functions of mycobacterial proteins)

    Enany Shymaa, 尾関 百合子, 西山 晃史, Savitskaya Anna, 立石 善隆, 阿戸 学, 山本 格, 松本 壮吉

    日本細菌学雑誌   71 ( 1 )   65 - 65   2016年2月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • プロバイオティクス医療を視野に入れたヨーグルトの抗菌効果の検討

    田島 陽介, 岡部 康之, 立石 善隆, 西山 晃史, 尾関 百合子, 亀山 仁史, 松本 壮吉, 若井 俊文

    新潟医学会雑誌   129 ( 10 )   593 - 600   2015年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

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    その他リンク： http://hdl.handle.net/10191/44215

  • 【持続感染・潜伏感染の機序と病態】 結核菌の潜伏感染に関わるメカニズムと新しい結核制御技術の可能性

    松本 壮吉, 西山 晃史, 尾関 百合子

    化学療法の領域   31 ( 9 )   1863 - 1870   2015年8月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)医薬ジャーナル社  

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  • 電子顕微鏡でみたHelicobacter pylori感染症(蛋白漏出性胃症など) (シンポジウム 『Helicobacter pylori感染症』・その基礎と臨床)

    山本 達男, 高野 智洋, 西山 晃史

    新潟医学会雑誌   127 ( 2 )   71 - 76   2013年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

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    その他リンク： http://search.jamas.or.jp/link/ui/2013320239

  • 5 新興多剤耐性グラム陰性菌の周辺情報NDM-1産生大腸菌の細菌学的特徴(感染メカニズム)(シンポジウム メタロ-β-ラクタマーゼと多剤耐性グラム陰性菌感染症, 第662回新潟医学会特別集会)

    山本 達男, 高野 智洋, 岩尾 泰久, 樋口 渉, 西山 晃史, Yamamoto Tatsuo, Takano Tomomi, Iwao Yasuhisa, Higuchi Wataru, Nishiyama Akihito

    新潟医学会雑誌   126 ( 8 )   410 - 413   2012年8月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

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  • ロシアへの夏期学生訪問 : 再開後の5年そして平成22年度 (心の交流, レベルアップ, そして新潟からロシアへ)

    野崎 あさみ, 遠藤 由香, 松尾 良子, 三石 淳之, 塚本 健二, Reva Ivan, 高野 智洋, 岩尾 泰久, 樋口 渉, 西山 晃史, 山本 達男, Nozaki Asami, Endo Yuka, Matsuo Ryoko, Mitsuishi Atsuyuki, Tsukamoto Kenji, Reva Ivan, Takano Tomomi, Iwao Yasuhisa, Higuchi Wataru, Nishiyama Akihito, Yamamoto Tatsuo

    新潟医学会雑誌   125 ( 12 )   686 - 690   2011年12月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

    平成17年度から山本正治医学部長 (当時) の支援のもと, 日露学生交流を従来の直流から交流に変えるべく, 学生の訪ロ計画を再開した. 内山聖医学部長 (当時) のもとではレベルアップとchangeに取り組み, 高橋姿医学部長のもとでは最大規模の日露ワークショップを開催した. 活動の基本方針 (キーワード) は強い信念と最低限の費用. この方向性のもとで, 学生交流については部活の趣を前面にだし, 学生は学生目線でロシアを見つめてきた. 活動6年間の軌跡をまとめた.

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  • 腎移植 Q & A

    Kiselev Ilia, Protopopova Elena, Shermatova Ksenia, 斎藤 和英, 高橋 公太, 岩尾 泰久, 樋口 渉, Reva Ivan, Razvina Olga, 高野 智洋, 西山 晃史, 山本 達男, Kiselev Ilia, Protopopova Elena, Shermatova Ksenia, Saito Kazuhide, Takahashi Kota, Iwao Yasuhisa, Higuchi Wataru, Reva Ivan, Razvina Olga, Takano Tomomi, Nishiyama Akihito, Yamamoto Tatsuo

    新潟医学会雑誌   125 ( 10 )   571 - 574   2011年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

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  • ロシア及び日本の小児白血病, パーキンソン病, そして癌手術について

    Podkaura Oxana, Gavrikova Valeria, Korneev Stanislav, 今井 千速, 内山 聖, 村上 博淳, 増田 浩, 黒羽 泰子, 小池 亮子, 内山 政二, 小杉 伸一, 畠山 勝義, Razvina Olga, Reva Ivan, 髙野 智洋, 西山 晃史, 山本 達男, Podkaura Oxana, Gavrikova Valeria, Korneev Stanislav, Imai Chihaya, Uchiyama Makoto, Murakami Hiroatsu, Masuda Hiroshi, Kuroha Yasuko, Koike Ryoko, Uchiyama Seiji, Kosugi Shinichi, Hatakeyama Katsuyoshi, Razvina Olga, Reva Ivan, Takano Tomomi, Nishiyama Akihito, Yamamoto Tatsuo

    新潟医学会雑誌   124 ( 4 )   228 - 234   2010年4月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

    The aim of young doctor exchange program was to exchange Japanese and Russian young doctors who have just graduated and to share experiences and knowledge in both clinical and basic fields. Oxana Podkaura (from Vladivostok), Valeria Gavrikova (from Krasnoyarsk) and Stanislav Korneev (from Khabarovsk) took part in this program held in Niigata from September 4 to 18, and studied children's leukemia and its treatment, Parkinson's disease and its treatment, and surgical treatment of liver, gastric and intestine cancer, respectively. They also attended two international symposia, CHRO2009 in Niigata and 2009 Tripartite symposium (Russia-United States-Japan Symposium on Cardiovascular Disease and Cancer) in Osaka.

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  • 感染制御のための微生物学講座 細菌 ブドウ球菌毒素

    西山 晃史, 高野 智洋, 樋口 渉

    感染制御   6 ( 1 )   33 - 38   2010年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：EDIXi出版部  

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    その他リンク： http://search.jamas.or.jp/link/ui/2010163447

  • 6 ホスホマイシンの新しい作用の探索(I.一般演題,第47回新潟化学療法研究会)

    西山 晃史, 近 幸吉, 田邊 嘉也, 下条 文武, 山本 達男

    新潟医学会雑誌   123 ( 6 )   323 - 323   2009年6月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

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  • 5 ヒト免疫細胞に対するホスホマイシンの作用(I.一般演題,第46回新潟化学療法研究会)

    大久保 猛司, 近 幸吉, 西山 晃史, 田邊 嘉也, 下条 文武, 山本 達男

    新潟医学会雑誌   123 ( 6 )   319 - 320   2009年6月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

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  • Helicobacter pyloriロシア株が持つcagA遺伝子EPIYAモチーフの解析

    Makhinov Konstantin, Iwan Reva, 樋口 渉, 高野 智洋, 西山 晃史, 山本 達男, Higuchi Wataru, Takano Tomomi, Nishiyama Akihito, Yamamoto Tatsuo

    新潟医学会雑誌   122 ( 10 )   585 - 588   2008年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：新潟医学会  

    Helicobacter pyloriは胃癌の細菌性リスク因子で, H. pyloriが分泌するCagAタンパク質のEPIYAモチーフでのリン酸化レベルがH. pyloriの発癌作用に関連すると考えられている. 今回, H. pyloriロシア株のCagAタンパク質EPIYAモチーフについてDNA解析した結果, 日本(新潟)のH. pylori株と同様の結果が得られた. ロシア株は日本株と同様で, 発癌能力の高い強毒株である可能性がある.

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  • Catalytically inactive cyclooxygenase 2 (COX-2) and absence of PGE2 biosynthesis in murine peritoneal macrophages following in vivo phagocytosis of heat-killed Mycobacterium bovis BCG

    Yoshimi Shibata, Tsutomu Shinohara, Shoutaro Tsuji, Ruth Ann Henriksen, Akihito Nishiyama, Quentin N. Myrvik, Makiko Yamashita

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   178   2007年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Differential regulation of cyclooxygenase (COX) isoforms in alveolar (AM) and peritoneal macrophages (PM) from heat-killed Mycobacterium bovis BCG treated mice

    Tsutomu Shinohara, Makiko Yamashita, Akihito Nishiyama, Shoutaro Tsuji, Ruth Ann Henriksen, Quentin N. Myrvik

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   178   2007年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • The effect of cellular cholesterol depletion on marine macrophage activation induced by phagocytosis of chitin

    Akihito Nishiyama, Shoutaro Tsuji, Makiko Yamashita Tsuji, Ruth Ann Henriksen, Quentin N. Myrvik, Yoshimi Shibata

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   176   S178 - S178   2006年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Mechanism of BCG-induced high anti-HSP65 antibody formation and development of advanced atherosclerosis in apolipoprotein E-/-mice

    Yoshimi Shibata, Hiroyoshi Ohata, Makiko Yamashita Tsuji, Shoutaro Tsuji, Ruth Ann Henriksen, Akihito Nishiyama, Quentin N. Myrvik

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   176   S134 - S135   2006年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Molecular structure of human and mouse interlectin-1 and comparison of binding to a mycobacterial galactofuranosyl residue

    Shoutaro Tsuji, Makiko Yamashita Tsuji, Akihito Nishiyama, Yoshimi Shibata

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   176   S87 - S87   2006年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Heat-killed BCG induces biphasic cyclooxygenase-2 (COX-2) splenic macrophage formation - differential intracellular compartmentalization of COX-2 correlates with PGE(2) biosynthesis

    Makiko Yamashita Tsuji, Shoutaro Tsuji, Akihito Nishiyama, Ruth Ann Henriksen, Quentin N. Myrvik, Yoshimi Shibata

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   176   S6 - S6   2006年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • N-acetyl-beta-D-glucosamine polymer particle-induced Th1 and Th2 cytokine production by murine macrophage-like RAW264.7 cells are differentially regulated by p38, JNK, and Erk 1/2

    A Nishiyama, J Gabbard, H Ohara, RA Henriksen, QN Myrvik, Y Shibata

    FASEB JOURNAL   19 ( 4 )   A374 - A374   2005年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Biphasic expression of Cox-2 by splenic macrophages (MO) in BCG-immunized mice

    Y Shibata, H Ohata, A Nishiyama, J Gabbard, QN Myrvik, RA Henriksen

    FASEB JOURNAL   19 ( 4 )   A964 - A964   2005年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Mycobacteria-induced osteoclastogenesis and PGE(2)-releasing macrophage formation in the mouse spleen

    H Ohata, A Nishiyama, RA Henriksen, QN Myrvik, Y Shibata

    FASEB JOURNAL   18 ( 4 )   A625 - A625   2004年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Mechanism of phagocytosed particle-induced IL-12 production in macrophage

    A Nishiyama, H Ohata, RA Henriksen, QN Myrvik, Y Shibata

    FASEB JOURNAL   18 ( 5 )   A1026 - A1026   2004年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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  • Marrow-derived splenic macrophages expressing Cox-2 may contribute to increased PGE(2) production in BCG-immunized mice

    Y Shibata, M Smith, QN Myrvik, H Ohata, A Nishiyama, RA Henriksen

    FASEB JOURNAL   18 ( 4 )   A460 - A460   2004年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）  

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講演・口頭発表等

  • Dynamic action of an intrinsically disordered histone-like protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy

    Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Tomoyuki Narita, Noriyuki Kodera, Ozeki Yuriko, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Sohkichi Matsumoto

    The U.S.-Japan Cooperative Medical Sciences Program: Mycobacterial Diseases Panel Meeting 2024  2024年4月 

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    開催年月日： 2024年4月

    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Lysocin E Targeting Menaquinone in the Membrane of Mycobacterium tuberculosis Is a Promising Lead Compound for Antituberculosis Drugs

    Geberetsadik G, Inaizumi A, Nishiyama A, Yamaguchi T, Hamamoto H, Panthee S, Tamaru A, Mizutani Y, Kaboso SA, Hakamata M, Ilinov A, Ozeki Y, Tateishi Y, Sekimizu K, Matsumoto S

    The 15th Korea-Japan International Symposium on Microbiology  2022年10月 

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    開催年月日： 2022年10月

    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy 招待

    Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Tomoyuki Narita, Noriyuki Kodera, Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Sohkichi Matsumoto

    The 15th Korea-Japan International Symposium on Microbiology  2022年10月 

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    開催年月日： 2022年10月

    記述言語：英語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • 抗酸菌の天然変性ヒストン様蛋白質 -その機能と休眠菌形成における役割- 招待

    西山晃史, 清水将裕, 古寺哲幸, 尾関百合子, 真柳浩太, 山口雄大, 立石善隆, 吉田 豊, 松本壮吉

    第99 回日本結核・非結核性抗酸菌症学会学術講演会  2024年5月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • 抗酸菌の天然変性ヒストン様タンパク質 -その機能と休眠菌形成における役割- 招待

    西山晃史, 清水将裕, 古寺哲幸, 尾関百合子, 真柳浩太, 山口雄大, 松本壮吉

    日本生物物理学会第61回年会  2023年11月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • 抗酸菌の休眠誘導に関わる天然変性ヒストン様タンパク質によるDNA凝集の動的メカニズムの解析

    西山晃史, 清水将裕, 成田知恕, 古寺哲幸, Anna Savitskaya, 尾関百合子, 横山 晃, 真柳浩太, 山口雄大, 立石善隆, 松本壮吉

    第23回日本蛋白質学科学年会  2023年7月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 抗酸菌ヒストン様タンパク質は天然変性領域を介して核酸との相分離を誘導する

    西山晃史, 目黒佳未, 真鍋陸, 加藤成祥, 尾関百合子, 立石善隆, 松本壮吉

    第96回日本細菌学会総会  2023年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Inactivation of DNA function by intrinsically disordered histone-like protein in mycobacteria 招待

    Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Noriyuki Kodera, Anna Savitskaya, Yuriko Ozeki, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Sohkichi Matsumoto

    第95回日本細菌学会総会  2022年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • 抗酸菌ヒストン様蛋白質による天然変性領域を介した新規のDNA凝集メカニズム

    西山晃史, 清水将裕, 成田知恕, 古寺哲幸, 尾関百合子, 横山 晃, 真柳浩太, 山口雄大, 袴田真理子, 立石善隆, 松本壮吉

    第58回日本細菌学会中部支部総会  2021年11月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Mycobacterial DNA-binding protein 1, a major protein in hypoxic dormant mycobacteria

    Akihito Nishiyama, Noriyuki Kodera, Masahiro Shimizu, Anna Savitskaya, Shymaa Enany, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Yoshitaka Tateishi, Sohkichi Matsumoto

    第94回日本細菌学会総会  2021年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • Adduct formation of delamanid with NAD in mycobacteria

    Akihito Nishiyama, Mikayo Hayashi, Ryuki Kitamoto, Yoshitaka Tateishi, Mayuko Osada-Oka, Yukiko Nishiuchi, Xiuhao Chen, Kentaro Kaneko, Makoto Matsumoto, Sohkichi Matsumoto

    第94回日本細菌学会総会  2021年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 抗酸菌ヒストン様タンパク質の天然変性領域依存的なDNA凝集作用

    西山晃史, 成田知恕, 古寺哲幸, 小林瑶子, 武藤寛亨, 渡辺順也, 大原直也, 尾関百合子, 立石善隆, 松本壮吉

    第93回日本細菌学会総会  2020年2月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • The functions of mycobacterial histone-like protein MDP1, a major protein in dormant mycobacteria 招待

    西山晃史, Anna Savitskaya, Shymaa Enany, 山口雄大, 大原直也, 成田知恕, 清水将裕, 古寺哲幸, 尾関百合子, 立石善隆, 松本壮吉

    第92回日本細菌学会総会  2019年4月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • 潜在期結核菌抗原の精製と感染診断への応用

    大原由貴子, 尾関百合子, 立石善隆, 真嶋 司, 有坂文雄, 津中康央, 藤原芳江, 西山晃史, 吉田 豊, 北所健悟, 小林 悠, 金子幸弘, 中川一路, 前倉亮治, 山本三郎, 片平正人, 松本壮吉

    第55回日本細菌学会中部支部総会  2018年10月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 抗酸菌ヒストン様タンパク質による染色体制御における天然変性領域の役割

    西山晃史, Anna Savitskaya, 山口雄大, 大原直也, 尾関百合子, 立石善隆, 松本壮吉

    第55回日本細菌学会中部支部総会  2018年10月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Mycobacterial DNA-binding protein 1 is critical for long term survival of Mycobacterium smegmatis and simultaneously coordinates cellular functions 国際会議

    Shymaa Enany, Yutaka Yoshida, Yoshitaka Tateishi, Yuriko Ozeki, Akihito Nishiyama, Anna Savitskaya, Takehiro Yamaguchi, Yukiko Ohara, Tadashi Yamamoto, Manabu Ato, Sohkichi Matsumoto

    The 52nd US-Japan Mycobacteria Panel Meeting  2018年3月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Conditional control of mycobacterial DNA-binding protein 1 expression in mycobacteria

    Anna Savitskaya, 西山晃史, 松本壮吉

    第91回日本細菌学会総会  2018年3月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • The analysis of mycobacterial DNA-binding protein 1 function in mycobacteria using conditional expression system

    Anna Savitskaya, 西山晃史, 松本壮吉

    第2回抗酸菌研究会  2017年10月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 抗酸菌の長期生存とヒストン様核様体結合タンパク質によるグローバルな細胞機能制御

    西山晃史, Shymaa Enany、Anna Savitskaya, 吉田 豊, 山本 格, 阿戸 学, 松本壮吉

    第54回日本細菌学会中部支部総会  2017年10月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • Conditional expression of mycobacterial DNA-binding protein 1 function in mycobacteria

    Anna Savitskaya, Akihito Nishiyama, Naoya Ohara, Sohkichi Matsumoto

    2017年3月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • Histone-like protein-dependent control of mycobacterial functions critical for long-term survival

    Akihito Nishiyama, Shymaa Enany, Yoshitaka Tateishi, Yuriko Ozeki, Anna Savitskaya, Takehiro Yamaguchi, Yukiko Nishida, Manabu Ato, Sohkichi Matsumoto

    第90回日本細菌学会総会  2017年3月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 抗酸菌の遅延発育、長期生存及び薬剤抵抗性におけるヒストン様タンパク質の役割

    西山晃史, Shymaa Enany、Anna Savitskaya, 吉田 豊, 立石善隆, 尾関百合子, 山口雄大, 西田由貴子, 山本 格, 大原直也, 阿戸 学, 松本壮吉

    日米医学協力計画 抗酸菌症部会国内会議  2017年1月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • The crucial role of the C-terminal region of mycobacterial DNA-binding protein 1 in DNA compaction, growth suppression, and drug tolerance

    Anna Savitskaya, Akihito Nishiyama, Sohkichi Matsumoto

    第１回抗酸菌研究会  2016年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • ヒストン様DNA結合タンパク質による結核菌の増殖抑制作用

    西山晃史, Anna Savitskaya, 松本壮吉

    第10回細菌学若手コロッセウム  2016年7月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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共同研究・競争的資金等の研究

  • 結核菌天然変性蛋白質-核酸凝集の分子機序の解明と核酸医薬への応用

    研究課題/領域番号：24K10216

    2024年4月 - 2027年3月

    制度名：科学研究費助成事業

    研究種目：基盤研究(C)

    提供機関：日本学術振興会

    西山 晃史

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    担当区分：研究代表者 

    配分額：4550000円 （ 直接経費：3500000円 、 間接経費：1050000円 ）

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  • 天然変性蛋白質(IDP)を標的とする、中分子化合物による、新しい創薬フィールドの開拓

    研究課題/領域番号：22gm1610009h0001

    2022年10月 - 2028年3月

    制度名：革新的先端研究開発支援事業

    研究種目：ユニットタイプ「AMED-CREST」研究開発領域

    提供機関：国立研究開発法人日本医療研究開発機構AMED

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    担当区分：研究分担者 

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  • 結核の発病予測向上と治療期間 短縮を目指した生物学的要因の 探索（研究分担者）

    2019年4月 - 2022年3月

    制度名：感染症実用化 研究事業・新 興・再興感染 症に対する革 新的医薬品等 開発推進研究 事業

    提供機関：AMED

    慶長直人

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    資金種別：競争的資金

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  • 細菌における天然変性蛋白質のヒストンコード機構による形質制御の証明

    2017年4月 - 2020年3月

    制度名：科学研究費補助金（基盤C一般・代表）

    提供機関：日本学術振興会

    西山晃史

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

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  • 結核菌の潜在化機構の解析と、潜在化の維持による結核制圧戦略の構築

    2016年4月 - 2019年3月

    制度名：科学研究費補助金(基盤B一般・分担）

    提供機関：日本学術振興会

    松本壮吉

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    資金種別：競争的資金

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  • 結核菌抗原による形質細胞様樹状細胞の活性化を介する新しい結核防御免疫機構の解明

    2015年4月 - 2018年3月

    制度名：科学研究費補助金（基盤C一般・分担）

    提供機関：日本学術振興会

    鈴木史子

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    資金種別：競争的資金

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  • Panton-Valentineロイコシジンの毒素活性発現メカニズムの解明

    研究課題/領域番号：20790331

    2008年4月 - 2010年3月

    制度名：科学研究費補助金

    研究種目：若手研究(B)

    提供機関：日本学術振興会

    西山晃史

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    担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

    本研究では市中感染型メチシリン耐性黄色ブドウ球菌の産生する病原因子Panton-Valentineロイコシジン(PVL)の細胞膜マイクロドメインlipid rafts依存的な細胞障害メカニズムを明らかにした。Lipid rafts はPVLの膜孔形成に必須であるが、標的細胞認識に影響せず、従来のガングリオシドGM1とは異なる新規レセプター分子の存在が示唆された。この、新規レセプターは毒素活性の中和に主眼をおいた創薬ターゲットとなる。

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  • 黄色ブドウ球菌の産生するロイコシジンのヒト好中球崩壊機構の解明

    研究課題/領域番号：00J06222

    2000年 - 2002年

    制度名：科学研究費助成事業

    研究種目：特別研究員奨励費

    提供機関：日本学術振興会

    西山 晃史

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    配分額：3000000円 （ 直接経費：3000000円 ）

    黄色ブドウ球菌の産生する白血球崩壊毒素ロイコシジン(Luk)はLukS、LukFからなり、ヒト及びウサギ白血球を特異的に崩壊する。崩壊活性の発現にはLukSのリン酸化、及び両成分による膜孔形成が必須である。本研究はLukの白血球崩壊機構の全容を解明することを目的とする。そこで最終年度である本年度は以下のことを行った。
    1.LukS reseptorのスクリーニング
    前年度までに酵母を用いたtwo-hybrid systemにおいてLukSのリン酸化部位を含むC末端領域をプローブとして、このLukSに結合性を示すクローンをヒト末梢血白血球cDNA libraryからスクリーニングした結果、toll-like receptor 4の細胞外ドメインに結合する膜表層タンパク質MD-2を取得した。MD-2をコードするcDNAをpET-22b(+)にクローニングし、大腸菌を形質転換し、C末端にHis-tagを付加させたMD-2(MD-2-6His)を発現させた。現在、MD-2-6Hisを精製し、LukSとのin vitroでの結合を検討中である。
    2.Lukのヒト白血球崩壊活性に対するraftの関与の検討
    LukSのヒト白血球の認識にGM1が関与すること、及び白血球に結合したLukSが非イオン性界面活性剤によって可溶化されないことから、Lukのヒト白血球崩壊活性に細胞膜マイクロドメインraftが関与していることが示唆された。そこで、raftを崩壊させるmethyl-β-cyclodextrin(MBCD)の効果を検討したところ、MBCDによってLukの活性が阻害された。また、毒素処理したヒト白血球をBrij 35で可溶化した後、lysateをショ糖密度勾配法で分画した結果、毒素成分がraftの含まれる画分に分画された。以上の結果、Lukのヒト白血球崩壊活性にraftが関与している可能性が強く示唆された。

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担当経験のある授業科目（researchmap）

  • 微生物学

    2020年7月
    -
    現在
    機関名：新潟県立十日町看護専門学校

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  • 感染と免疫（細菌学総論）

    機関名：新潟大学大学院医歯学総合研究科医学科専攻（修士課程）

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  • 生体防御と感染（細菌学）

    機関名：新潟大学医学部医学科

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担当経験のある授業科目

  • 感染と免疫

    2014年5月
    -
    2023年
    機関名：新潟大学

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    科目区分：大学院専門科目 

  • 生体防御と感染(細菌学)

    2013年
    -
    現在
    機関名：新潟大学