2021/10/25 更新

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ミヤシタ アキノリ
宮下 哲典
MIYASHITA Akinori
所属
脳研究所 生命科学リソース研究センター 准教授
職名
准教授
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メールアドレス
外部リンク

学位

  • 博士(理学) ( 2000年3月   新潟大学 )

研究キーワード

  • APOE

  • FUS

  • トランスクリプトーム

  • オミックス

  • 疾患感受性遺伝子

  • SORL1

  • TREM2

  • 前頭側頭葉変性症

  • SNV

  • マイクロサテライトマーカー

  • Microsatellite

  • SNP<sub>s</sub>

  • アルツハイマー病

  • ゲノム

  • SNP

  • 認知症

  • 神経変性疾患

  • 筋萎縮性側索硬化症

  • 相分離

  • ヒト死後脳

  • ケースコントロールスタディー

  • 関連解析

  • ゲノムワイド関連解析

  • ストレス顆粒

  • RNA結合タンパク

研究分野

  • ライフサイエンス / 医化学  / 神経変性疾患

  • ライフサイエンス / 神経内科学  / 神経変性疾患

  • ライフサイエンス / 神経科学一般

  • ライフサイエンス / ゲノム生物学

  • ライフサイエンス / 遺伝学

経歴(researchmap)

  • 新潟大学   脳研究所遺伝子機能解析学分野   准教授

    2018年4月 - 現在

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  • トロント大学   Tanz神経変性疾患研究センター   博士研究員

    2014年4月 - 2017年3月

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  • 新潟大学   脳研究所遺伝子機能解析学分野   助教

    2006年4月 - 2018年3月

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  • 新潟大学   脳研究所遺伝子機能解析学分野   助手

    2002年4月 - 2006年3月

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  • 新潟大学   遺伝子実験施設   助手

    2000年4月 - 2002年3月

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経歴

  • 新潟大学   脳研究所 生命科学リソース研究センター   准教授

    2018年4月 - 現在

  • 新潟大学   脳研究所 生命科学リソース研究センター   助教

    2002年4月 - 2018年3月

学歴

  • 新潟大学   自然科学研究科   博士後期(博士)課程

    1997年4月 - 2000年3月

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  • 新潟大学   自然科学研究科   博士前期(修士)課程

    1995年4月 - 1997年3月

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    国名: 日本国

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  • 新潟大学   理学部   生物学科

    1991年4月 - 1995年3月

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    国名: 日本国

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所属学協会

留学歴

  • Tanz Centre for Research in Neurodegenerative Diseases, University of Toronto   Postdoctoral research fellow

    2014年4月 - 2017年3月

 

論文

  • Ethnic and trans-ethnic genome-wide association studies identify new loci influencing Japanese Alzheimer's disease risk. 査読 国際誌

    Daichi Shigemizu, Risa Mitsumori, Shintaro Akiyama, Akinori Miyashita, Takashi Morizono, Sayuri Higaki, Yuya Asanomi, Norikazu Hara, Gen Tamiya, Kengo Kinoshita, Takeshi Ikeuchi, Shumpei Niida, Kouichi Ozaki

    Translational psychiatry   11 ( 1 )   151 - 151   2021年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Alzheimer's disease (AD) has no cure, but early detection and risk prediction could allow earlier intervention. Genetic risk factors may differ between ethnic populations. To discover novel susceptibility loci of AD in the Japanese population, we conducted a genome-wide association study (GWAS) with 3962 AD cases and 4074 controls. Out of 4,852,957 genetic markers that passed stringent quality control filters, 134 in nine loci, including APOE and SORL1, were convincingly associated with AD. Lead SNPs located in seven novel loci were genotyped in an independent Japanese AD case-control cohort. The novel locus FAM47E reached genome-wide significance in a meta-analysis of association results. This is the first report associating the FAM47E locus with AD in the Japanese population. A trans-ethnic meta-analysis combining the results of the Japanese data sets with summary statistics from stage 1 data of the International Genomics of Alzheimer's Project identified an additional novel susceptibility locus in OR2B2. Our data highlight the importance of performing GWAS in non-European populations.

    DOI: 10.1038/s41398-021-01272-3

    PubMed

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  • Genetic Variations and Neuropathologic Features of Patients With PRKN Mutations. 査読 国際誌

    Naohiko Seike, Akio Yokoseki, Ryoko Takeuchi, Kento Saito, Hiroaki Miyahara, Akinori Miyashita, Tetsuhiko Ikeda, Izumi Aida, Takashi Nakajima, Masato Kanazawa, Masatoshi Wakabayashi, Yasuko Toyoshima, Hitoshi Takahashi, Riki Matsumoto, Tatsushi Toda, Osamu Onodera, Atsushi Ishikawa, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita

    Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society   2021年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: Mutations in PRKN are the most common cause of autosomal recessive juvenile parkinsonism. The objective of this study was to investigate the association between genotype and pathology in patients with PRKN mutations. METHODS: We performed a sequence and copy number variation analysis of PRKN, mRNA transcripts, Parkin protein expression, and neuropathology in 8 autopsied patients. RESULTS: All the patients harbored biallelic PRKN mutations. Two patients were homozygous and heterozygous, respectively, for the missense mutation p.C431F. Seven patients had exon rearrangements, including 2 patients from a single family who harbored a homozygous deletion of exon 4, and 3 patients who carried a homozygous duplication of exons 6-7, a homozygous duplication of exons 10-11, and a heterozygous duplication of exons 2-4. In the other 2 patients, we found a compound heterozygous duplication of exon 2, deletion of exon 3, and a heterozygous duplication of exon 2. However, sequencing of cDNA prepared from mRNA revealed 2 different transcripts derived from triplication of exon 2 and deletion of exons 2-3 and from duplication of exons 2-4 and deletion of exons 3-4. Western blotting and immunohistochemistry revealed faint or no expression of Parkin in their brains. In the substantia nigra pars compacta, a subfield-specific pattern of neuronal loss and mild gliosis were evident. Lewy bodies were found in 3 patients. Peripheral sensory neuronopathy was a feature. CONCLUSIONS: Genomic and mRNA analysis is needed to identify the PRKN mutations. Variable mutations may result in no or little production of mature Parkin and the histopathologic features may be similar.

    DOI: 10.1002/mds.28521

    PubMed

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  • Frequent Germline and Somatic Single Nucleotide Variants in the Promoter Region of the Ribosomal RNA Gene in Japanese Lung Adenocarcinoma Patients. 査読 国際誌

    Riuko Ohashi, Hajime Umezu, Ayako Sato, Tatsuya Abé, Shuhei Kondo, Kenji Daigo, Seijiro Sato, Norikazu Hara, Akinori Miyashita, Takeshi Ikeuchi, Teiichi Motoyama, Masashi Kishi, Tadahiro Nagaoka, Keiko Horiuchi, Atsushi Shiga, Shujiro Okuda, Tomoki Sekiya, Aya Ohtsubo, Kosuke Ichikawa, Hiroshi Kagamu, Toshiaki Kikuchi, Satoshi Watanabe, Jun-Ichi Tanuma, Peter Schraml, Takao Hamakubo, Masanori Tsuchida, Yoichi Ajioka

    Cells   9 ( 11 )   2020年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Ribosomal RNA (rRNA), the most abundant non-coding RNA species, is a major component of the ribosome. Impaired ribosome biogenesis causes the dysfunction of protein synthesis and diseases called "ribosomopathies," including genetic disorders with cancer risk. However, the potential role of rRNA gene (rDNA) alterations in cancer is unknown. We investigated germline and somatic single-nucleotide variants (SNVs) in the rDNA promoter region (positions -248 to +100, relative to the transcription start site) in 82 lung adenocarcinomas (LUAC). Twenty-nine tumors (35.4%) carried germline SNVs, and eight tumors (9.8%) harbored somatic SNVs. Interestingly, the presence of germline SNVs between positions +1 and +100 (n = 12; 14.6%) was associated with significantly shorter recurrence-free survival (RFS) and overall survival (OS) by univariate analysis (p < 0.05, respectively), and was an independent prognostic factor for RFS and OS by multivariate analysis. LUAC cell line PC9, carrying rDNA promoter SNV at position +49, showed significantly higher ribosome biogenesis than H1650 cells without SNV. Upon nucleolar stress induced by actinomycin D, PC9 retained significantly higher ribosome biogenesis than H1650. These results highlight the possible functional role of SNVs at specific sites of the rDNA promoter region in ribosome biogenesis, the progression of LUAC, and their potential prognostic value.

    DOI: 10.3390/cells9112409

    PubMed

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  • 神経疾患・精神疾患の鑑別における血漿炎症性サイトカインの有用性

    樋口 陽, 春日 健作, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 茂木 崇治, 福井 直樹, 横山 裕一, 染矢 俊幸, 小野寺 理, 池内 健

    臨床神経学   60 ( Suppl. )   S377 - S377   2020年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • バイオマーカーとリスク遺伝子で再考するアルツハイマー型認知症の臨床診断

    春日 健作, 月江 珠緒, 菊地 正隆, 原 範和, 宮下 哲典, 桑野 良三, 岩坪 威, 池内 健

    臨床神経学   60 ( Suppl. )   S338 - S338   2020年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 認知症と精神疾患の鑑別における血液バイオマーカーの有用性の検討

    樋口 陽, 春日 健作, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 茂木 崇治, 横山 裕一, 福井 直樹, 染矢 俊幸, 小野寺 理, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   527 - 527   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • データドリブンな軽度認知障害のサブタイピングおよびアルツハイマー病発症予測

    菊地 正隆, 小林 香織, 春日 健作, 宮下 哲典, 池内 健, 湯本 英二, 伏見 泰人, 武田 理宏, 真鍋 史朗, 上條 憲一, 松村 泰志

    Dementia Japan   34 ( 4 )   501 - 501   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • ヒト死後脳、ヒト培養細胞におけるAPOEの遺伝子発現解析

    Lixin Liu, 宮下 哲典, 村上 涼太, 原 範和, 菊地 正隆, Bin Zhu, 樋口 陽, Yusran Adyfitrah, 月江 珠緒, 長谷川 舞衣, 春日 健作, 赤津 裕康, 橋詰 良夫, 柿田 明美, 村山 繁雄, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   521 - 521   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 日本人コホートJGSCAD、J-ADNI、NCGG、ToMMoにおけるバリアント解析 APOE

    宮下 哲典, 原 範和, 春日 健作, Lixin Liu, 樋口 陽, Bin Zhu, 月江 珠緒, 長谷川 舞衣, Yusran Adyfitrah, 石黒 敬信, 村上 涼太, 菊地 正隆, 中谷 明弘, 尾崎 浩一, 新飯田 俊平, 赤澤 宏平, 桑野 良三, 岩坪 威, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   521 - 521   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • ヒト死後脳に由来するDNA、RNAの品質管理

    長谷川 舞衣, 宮下 哲典, 春日 健作, 原 範和, 月江 珠緒, 齋藤 祐子, 赤津 裕康, 橋詰 良夫, 柿田 明美, 吉田 眞理, 村山 繁雄, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   525 - 525   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • ABCA7、SORL1、TREM2におけるアルツハイマー病関連レアバリアントの探索

    原 範和, 宮下 哲典, 尾崎 浩一, 新飯田 俊平, Liu Lixin, 樋口 陽, 朱 斌, 月江 珠緒, 春日 健作, 桑野 良三, 岩坪 威, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   526 - 526   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • CSF1RバリアントのキナーゼアッセイによるCSF1R関連脳症の発症機序解析

    朱 斌, Liu Lixin, 樋口 陽, Yusran Adyfitrah, 三浦 健, 目崎 直美, 原 範和, 月江 珠緒, 今野 卓哉, 春日 健作, 宮下 哲典, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   526 - 526   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • ヒト死後脳に由来するDNA、RNAの品質管理

    長谷川 舞衣, 宮下 哲典, 春日 健作, 原 範和, 月江 珠緒, 齋藤 祐子, 赤津 裕康, 橋詰 良夫, 柿田 明美, 吉田 眞理, 村山 繁雄, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   525 - 525   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 認知症と精神疾患の鑑別における血液バイオマーカーの有用性の検討

    樋口 陽, 春日 健作, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 茂木 崇治, 横山 裕一, 福井 直樹, 染矢 俊幸, 小野寺 理, 池内 健

    Dementia Japan   34 ( 4 )   527 - 527   2020年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • Novel CHP1 mutation in autosomal-recessive cerebellar ataxia: autopsy features of two siblings. 査読 国際誌

    Rie Saito, Norikazu Hara, Mari Tada, Yoshiaki Honma, Akinori Miyashita, Osamu Onodera, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita

    Acta neuropathologica communications   8 ( 1 )   134 - 134   2020年8月

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  • Oculopharyngodistal myopathy with coexisting histology of systemic neuronal intranuclear inclusion disease: Clinicopathologic features of an autopsied patient harboring CGG repeat expansions in LRP12. 査読 国際誌

    Rie Saito, Hiroshi Shimizu, Takeshi Miura, Norikazu Hara, Naomi Mezaki, Yo Higuchi, Akinori Miyashita, Izumi Kawachi, Kazuhiro Sanpei, Yoshiaki Honma, Osamu Onodera, Takeshi Ikeuchi, Akiyoshi Kakita

    Acta neuropathologica communications   8 ( 1 )   75 - 75   2020年6月

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  • Author Correction: Human and mouse single-nucleus transcriptomics reveal TREM2-dependent and TREM2-independent cellular responses in Alzheimer's disease. 国際誌

    Yingyue Zhou, Wilbur M Song, Prabhakar S Andhey, Amanda Swain, Tyler Levy, Kelly R Miller, Pietro L Poliani, Manuela Cominelli, Shikha Grover, Susan Gilfillan, Marina Cella, Tyler K Ulland, Konstantin Zaitsev, Akinori Miyashita, Takeshi Ikeuchi, Makoto Sainouchi, Akiyoshi Kakita, David A Bennett, Julie A Schneider, Michael R Nichols, Sean A Beausoleil, Jason D Ulrich, David M Holtzman, Maxim N Artyomov, Marco Colonna

    Nature medicine   26 ( 6 )   981 - 981   2020年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    An amendment to this paper has been published and can be accessed via a link at the top of the paper.

    DOI: 10.1038/s41591-020-0922-4

    PubMed

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  • Sensitivity to gene dosage and gene expression affects genes with copy number variants observed among neuropsychiatric diseases. 査読 国際誌

    Maria Yamasaki, Takashi Makino, Seik-Soon Khor, Hiromi Toyoda, Taku Miyagawa, Xiaoxi Liu, Hitoshi Kuwabara, Yukiko Kano, Takafumi Shimada, Toshiro Sugiyama, Hisami Nishida, Nagisa Sugaya, Mamoru Tochigi, Takeshi Otowa, Yuji Okazaki, Hisanobu Kaiya, Yoshiya Kawamura, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Kiyoto Kasai, Hisashi Tanii, Tsukasa Sasaki, Makoto Honda, Katsushi Tokunaga

    BMC medical genomics   13 ( 1 )   55 - 55   2020年3月

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    記述言語:英語  

    BACKGROUND: Copy number variants (CNVs) have been reported to be associated with diseases, traits, and evolution. However, it is hard to determine which gene should have priority as a target for further functional experiments if a CNV is rare or a singleton. In this study, we attempted to overcome this issue by using two approaches: by assessing the influences of gene dosage sensitivity and gene expression sensitivity. Dosage sensitive genes derived from two-round whole-genome duplication in previous studies. In addition, we proposed a cross-sectional omics approach that utilizes open data from GTEx to assess the effect of whole-genome CNVs on gene expression. METHODS: Affymetrix Genome-Wide SNP Array 6.0 was used to detect CNVs by PennCNV and CNV Workshop. After quality controls for population stratification, family relationship and CNV detection, 287 patients with narcolepsy, 133 patients with essential hypersomnia, 380 patients with panic disorders, 164 patients with autism, 784 patients with Alzheimer disease and 1280 healthy individuals remained for the enrichment analysis. RESULTS: Overall, significant enrichment of dosage sensitive genes was found across patients with narcolepsy, panic disorders and autism. Particularly, significant enrichment of dosage-sensitive genes in duplications was observed across all diseases except for Alzheimer disease. For deletions, less or no enrichment of dosage-sensitive genes with deletions was seen in the patients when compared to the healthy individuals. Interestingly, significant enrichments of genes with expression sensitivity in brain were observed in patients with panic disorder and autism. While duplications presented a higher burden, deletions did not cause significant differences when compared to the healthy individuals. When we assess the effect of sensitivity to genome dosage and gene expression at the same time, the highest ratio of enrichment was observed in the group including dosage-sensitive genes and genes with expression sensitivity only in brain. In addition, shared CNV regions among the five neuropsychiatric diseases were also investigated. CONCLUSIONS: This study contributed the evidence that dosage-sensitive genes are associated with CNVs among neuropsychiatric diseases. In addition, we utilized open data from GTEx to assess the effect of whole-genome CNVs on gene expression. We also investigated shared CNV region among neuropsychiatric diseases.

    DOI: 10.1186/s12920-020-0699-9

    PubMed

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  • Disruption of a RAC1-centred network is associated with Alzheimer's disease pathology and causes age-dependent neurodegeneration. 査読 国際誌

    Masataka Kikuchi, Michiko Sekiya, Norikazu Hara, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Takeshi Ikeuchi, Koichi M Iijima, Akihiro Nakaya

    Human molecular genetics   29 ( 5 )   817 - 833   2020年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The molecular biological mechanisms of Alzheimer's disease (ad) involve disease-associated cross-talk through many genes and include a loss of normal as well as a gain of abnormal interactions among genes. A protein domain network (PDN) is a collection of physical bindings that occur between protein domains, and the states of the PDNs in patients with ad are likely to be perturbed compared to those in normal healthy individuals. To identify PDN changes that cause neurodegeneration, we analysed the PDNs that occur among genes co-expressed in each of three brain regions at each stage of ad. Our analysis revealed that the PDNs collapsed with the progression of ad stage and identified five hub genes, including Rac1, as key players in PDN collapse. Using publicly available as well as our own gene expression data, we confirmed that the mRNA expression level of the RAC1 gene was downregulated in the entorhinal cortex (EC) of ad brains. To test the causality of these changes in neurodegeneration, we utilized Drosophila as a genetic model and found that modest knockdown of Rac1 in neurons was sufficient to cause age-dependent behavioural deficits and neurodegeneration. Finally, we identified a microRNA, hsa-miR-101-3p, as a potential regulator of RAC1 in ad brains. As the Braak neurofibrillary tangle (NFT) stage progressed, the expression levels of hsa-miR-101-3p were increased specifically in the EC. Furthermore, overexpression of hsa-miR-101-3p in the human neuronal cell line SH-SY5Y caused RAC1 downregulation. These results highlight the utility of our integrated network approach for identifying causal changes leading to neurodegeneration in ad.

    DOI: 10.1093/hmg/ddz320

    PubMed

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  • Human and mouse single-nucleus transcriptomics reveal TREM2-dependent and TREM2-independent cellular responses in Alzheimer's disease. 査読 国際誌

    Yingyue Zhou, Wilbur M Song, Prabhakar S Andhey, Amanda Swain, Tyler Levy, Kelly R Miller, Pietro L Poliani, Manuela Cominelli, Shikha Grover, Susan Gilfillan, Marina Cella, Tyler K Ulland, Konstantin Zaitsev, Akinori Miyashita, Takeshi Ikeuchi, Makoto Sainouchi, Akiyoshi Kakita, David A Bennett, Julie A Schneider, Michael R Nichols, Sean A Beausoleil, Jason D Ulrich, David M Holtzman, Maxim N Artyomov, Marco Colonna

    Nature medicine   26 ( 1 )   131 - 142   2020年1月

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    記述言語:英語  

    Glia have been implicated in Alzheimer's disease (AD) pathogenesis. Variants of the microglia receptor triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) increase AD risk, and activation of disease-associated microglia (DAM) is dependent on TREM2 in mouse models of AD. We surveyed gene-expression changes associated with AD pathology and TREM2 in 5XFAD mice and in human AD by single-nucleus RNA sequencing. We confirmed the presence of Trem2-dependent DAM and identified a previously undiscovered Serpina3n+C4b+ reactive oligodendrocyte population in mice. Interestingly, remarkably different glial phenotypes were evident in human AD. Microglia signature was reminiscent of IRF8-driven reactive microglia in peripheral-nerve injury. Oligodendrocyte signatures suggested impaired axonal myelination and metabolic adaptation to neuronal degeneration. Astrocyte profiles indicated weakened metabolic coordination with neurons. Notably, the reactive phenotype of microglia was less evident in TREM2-R47H and TREM2-R62H carriers than in non-carriers, demonstrating a TREM2 requirement in both mouse and human AD, despite the marked species-specific differences.

    DOI: 10.1038/s41591-019-0695-9

    PubMed

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  • 脳脊髄液バイオマーカーによるAlzheimer's clinical syndromeの検討

    春日 健作, 月江 珠緒, 原 範和, 樋口 陽, 石黒 敬信, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 小野寺 理, 池内 健

    臨床神経学   59 ( Suppl. )   S217 - S217   2019年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 家族性アルツハイマー病で同定された新規PSEN1遺伝子変異の病的意義の検討

    三浦 健, 目崎 直実, Zhu Bin, 村上 涼太, Liu Lixin, 樋口 陽, 石黒 敬信, 月江 珠緒, 原 範和, 春日 健作, 宮下 哲典, 小野寺 理, 池内 健

    臨床神経学   59 ( Suppl. )   S352 - S352   2019年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • ヒト死後脳におけるAPP・APOEの遺伝子発現解析 査読

    Lixin Liu, 宮下 哲典, 村上 涼太, Bin Zhu, 原 範和, 菊地 正隆, 月江 珠緒, 樋口 陽, 春日 健作, 中谷 明弘, 赤津 裕康, 柿田 明美, 村山 繁雄, 池内 健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   519 - 519   2019年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 血漿炎症系サイトカインと脳脊髄液バイオマーカーとの関連

    樋口 陽, 春日 健作, Bin Zhu, Lixin Liu, 石黒 敬信, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 小野寺 理, 池内 健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   548 - 548   2019年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • Enhancer variants associated with Alzheimer's disease affect gene expression via chromatin looping. 査読 国際誌

    Masataka Kikuchi, Norikazu Hara, Mai Hasegawa, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Takeshi Ikeuchi, Akihiro Nakaya

    BMC medical genomics   12 ( 1 )   128 - 128   2019年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: Genome-wide association studies (GWASs) have identified single-nucleotide polymorphisms (SNPs) that may be genetic factors underlying Alzheimer's disease (AD). However, how these AD-associated SNPs (AD SNPs) contribute to the pathogenesis of this disease is poorly understood because most of them are located in non-coding regions, such as introns and intergenic regions. Previous studies reported that some disease-associated SNPs affect regulatory elements including enhancers. We hypothesized that non-coding AD SNPs are located in enhancers and affect gene expression levels via chromatin loops. METHODS: To characterize AD SNPs within non-coding regions, we extracted 406 AD SNPs with GWAS p-values of less than 1.00 × 10- 6 from the GWAS catalog database. Of these, we selected 392 SNPs within non-coding regions. Next, we checked whether those non-coding AD SNPs were located in enhancers that typically regulate gene expression levels using publicly available data for enhancers that were predicted in 127 human tissues or cell types. We sought expression quantitative trait locus (eQTL) genes affected by non-coding AD SNPs within enhancers because enhancers are regulatory elements that influence the gene expression levels. To elucidate how the non-coding AD SNPs within enhancers affect the gene expression levels, we identified chromatin-chromatin interactions by Hi-C experiments. RESULTS: We report the following findings: (1) nearly 30% of non-coding AD SNPs are located in enhancers; (2) eQTL genes affected by non-coding AD SNPs within enhancers are associated with amyloid beta clearance, synaptic transmission, and immune responses; (3) 95% of the AD SNPs located in enhancers co-localize with their eQTL genes in topologically associating domains suggesting that regulation may occur through chromatin higher-order structures; (4) rs1476679 spatially contacts the promoters of eQTL genes via CTCF-CTCF interactions; (5) the effect of other AD SNPs such as rs7364180 is likely to be, at least in part, indirect through regulation of transcription factors that in turn regulate AD associated genes. CONCLUSION: Our results suggest that non-coding AD SNPs may affect the function of enhancers thereby influencing the expression levels of surrounding or distant genes via chromatin loops. This result may explain how some non-coding AD SNPs contribute to AD pathogenesis.

    DOI: 10.1186/s12920-019-0574-8

    PubMed

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  • <i>APOE</i> Promoter Polymorphism-219T/G is an Effect Modifier of the Influence of <i>APOE</i> ε4 on Alzheimer's Disease Risk in a Multiracial Sample. 査読 国際誌

    Choi KY, Lee JJ, Gunasekaran TI, Kang S, Lee W, Jeong J, Lim HJ, Zhang X, Zhu C, Won SY, Choi YY, Seo EH, Lee SC, Gim J, Chung JY, Chong A, Byun MS, Seo S, Ko PW, Han JW, McLean C, Farrell J, Lunetta KL, Miyashita A, Hara N, Won S, Choi SM, Ha JM, Jeong JH, Kuwano R, Song MK, An SSA, Lee YM, Park KW, Lee HW, Choi SH, Rhee S, Song WK, Lee JS, Mayeux R, Haines JL, Pericak-Vance MA, Choo ILH, Nho K, Kim KW, Lee DY, Kim S, Kim BC, Kim H, Jun GR, Schellenberg GD, Ikeuchi T, Farrer LA, Lee KH, Neuroimaging Initative AD

    Journal of clinical medicine   8 ( 8 )   2019年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/jcm8081236

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  • A rare functional variant of SHARPIN attenuates the inflammatory response and associates with increased risk of late-onset Alzheimer's disease. 査読 国際誌

    Yuya Asanomi, Daichi Shigemizu, Akinori Miyashita, Risa Mitsumori, Taiki Mori, Norikazu Hara, Kaoru Ito, Shumpei Niida, Takeshi Ikeuchi, Kouichi Ozaki

    Molecular medicine (Cambridge, Mass.)   25 ( 1 )   20 - 20   2019年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: Late-onset Alzheimer's disease (LOAD), the most common form of dementia, results from complicated interactions among multiple environmental and genetic factors. Despite recent advances in genetic analysis of LOAD, more than half of the heritability for the disease remains unclear. Although genetic studies in Caucasians found rare risk variants for LOAD with large effect sizes, these variants are hardly detectable in the Japanese population. METHODS: To identify rare variants possibly explaining part of the genetic architecture for LOAD in Japanese people, we performed whole-exome sequencing analyses of 202 LOAD individuals without the APOE ε4 risk allele, a major genetic factor for LOAD susceptibility. We also implemented in vitro functional analyses of the variant(s) to reveal possible functions associated with LOAD risk. RESULTS: Via step-by-step selection of whole-exome variants, we found seven candidate risk variants. We then conducted a case-control association study in a large Japanese cohort consisting of 4563 cases and 16,459 controls. We finally identified a rare nonsynonymous variant, rs572750141 (NM_030974.3:p.Gly186Arg), in SHARPIN that was potentially associated with increased risk of LOAD (corrected P = 8.05 × 10- 5, odds ratio = 6.1). The amino acid change in SHARPIN resulted in aberrant cellular localization of the variant protein and attenuated the activation of NF-κB, a central mediator of inflammatory and immune responses. CONCLUSIONS: Our work identified a rare functional SHARPIN variant as a previously unknown genetic risk factor for LOAD. The functional alteration in SHARPIN induced by the rare coding variant is associated with an attenuated inflammatory/immune response that may promote LOAD development.

    DOI: 10.1186/s10020-019-0090-5

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  • 統合失調症患者の脳内ゲノムにおけるコピー数変異の評価

    坂井 美和子, 渡部 雄一郎, 染矢 俊幸, 荒木 一明, 澁谷 雅子, 新里 和弘, 大島 健一, 國井 泰人, 矢部 博興, 松本 純弥, 和田 明, 日野 瑞城, 橋本 健志, 菱本 明豊, 北村 登, 入谷 修司, 白川 治, 前田 潔, 宮下 哲典, 丹羽 真一, 高橋 均, 柿田 明美, 桑野 良三, 那波 宏之

    精神神経学雑誌   ( 2019特別号 )   S603 - S603   2019年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公社)日本精神神経学会  

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  • A variant at 9q34.11 is associated with HLA-DQB1*06:02 negative essential hypersomnia. 査読 国際誌

    Miyagawa T, Khor SS, Toyoda H, Kanbayashi T, Imanishi A, Sagawa Y, Kotorii N, Kotorii T, Ariyoshi Y, Hashizume Y, Ogi K, Hiejima H, Kamei Y, Hida A, Miyamoto M, Ikegami A, Wada Y, Takami M, Higashiyama Y, Miyake R, Kondo H, Fujimura Y, Tamura Y, Taniyama Y, Omata N, Tanaka Y, Moriya S, Furuya H, Kato M, Kawamura Y, Otowa T, Miyashita A, Kojima H, Saji H, Shimada M, Yamasaki M, Kobayashi T, Misawa R, Shigematsu Y, Kuwano R, Sasaki T, Ishigooka J, Wada Y, Tsuruta K, Chiba S, Tanaka F, Yamada N, Okawa M, Kuroda K, Kume K, Hirata K, Uchimura N, Shimizu T, Inoue Y, Honda Y, Mishima K, Honda M, Tokunaga K

    Journal of human genetics   63 ( 12 )   1259 - 1267   2018年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s10038-018-0518-8

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  • Enhancer variants associated with Alzheimer's disease affect gene expression via chromatin looping

    Masataka Kikuchi, Norikazu Hara, Mai Hasegawa, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Takeshi Ikeuchi, Akihiro Nakaya

    bioRxiv   2018年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • The physiological and pathological biophysics of phase separation and gelation of RNA binding proteins in amyotrophic lateral sclerosis and fronto-temporal lobar degeneration. 査読

    St George-Hyslop P, Lin JQ, Miyashita A, Phillips EC, Qamar S, Randle SJ, Wang G

    Brain research   1693 ( Pt A )   11 - 23   2018年8月

  • FUS Phase Separation Is Modulated by a Molecular Chaperone and Methylation of Arginine Cation-π Interactions. 査読

    Qamar S, Wang G, Randle SJ, Ruggeri FS, Varela JA, Lin JQ, Phillips EC, Miyashita A, Williams D, Ströhl F, Meadows W, Ferry R, Dardov VJ, Tartaglia GG, Farrer LA, Kaminski Schierle GS, Kaminski CF, Holt CE, Fraser PE, Schmitt-Ulms G, Klenerman D, Knowles T, Vendruscolo M, St George-Hyslop P

    Cell   173 ( 3 )   720 - 734.e15   2018年4月

  • A variant in CRAT is associated with HLA-DQB1*06:02 negative essential hypersomnia (narcolepsy without cataplexy and idiopathic hypersomnia without long sleep time) 査読

    Miyagawa T, Khor S-S, Toyoda H, Kanbayashi T, Imanishi A, Sagawa Y, Kotorii N, Kotorii T, Ariyoshi Y, Hashizume Y, Ogi K, Hiejima H, Kamei Y, Hida A, Miyamoto M, Ikegami A, Wada Y, Takami M, Higashiyama Y, Miyake R, Kondo H, Fujimura Y, Tamura Y, Taniyama Y, Omata N, Tanaka Y, Moriya S, Furuya H, Kato M, Kawamura Y, Otowa T, Miyashita A, Kojima H, Saji H, Shimada M, Yamasaki M, Kobayashi T, Misawa R, Kuwano R, Sasaki T, Ishigooka J, Wada Y, Tsuruta K, Chiba S, Tanaka F, Yamada N, Okawa M, Kuroda K, Kume K, Hirata K, Uchimura N, Shimizu T, Inoue Y, Honda Y, Mishima K, Honda M, Tokunaga K

    Journal of Human Genetics   (in press)   2018年

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  • Serum microRNA miR-501-3p as a potential biomarker related to the progression of Alzheimer's disease 査読

    Norikazu Hara, Masataka Kikuchi, Akinori Miyashita, Hiroyuki Hatsuta, Yuko Saito, Kensaku Kasuga, Shigeo Murayama, Takeshi Ikeuchi, Ryozo Kuwano

    ACTA NEUROPATHOLOGICA COMMUNICATIONS   5 ( 1 )   10   2017年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BIOMED CENTRAL LTD  

    MicroRNAs (miRNAs) are attractive molecules to utilize as one of the blood-based biomarkers for neurodegenerative disorders such as Alzheimer's disease (AD) because miRNAs are relatively stable in biofluid, including serum or plasma. To determine blood miRNA biomarkers for AD with next-generation sequencing genome-wide, we first surveyed 45 serum samples. These came from 27 AD patients and 18 controls (discovery set) that underwent autopsy within two weeks after their serum sampling and were neuropathologically diagnosed. We found that three miRNAs, hsa-miR-501-3p, hsa-let-7f-5p, and hsa-miR-26b-5p, were significantly deregulated between the AD samples and the controls. The deregulation for hsa-miR-501-3p was further confirmed by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (PCR) in a validation set composed of 36 clinically diagnosed AD patients and 22 age-matched cognitively normal controls with a sensitivity and specificity of 53% and 100%, respectively (area under the curve = 0.82). Serum hsa-miR-501-3p levels were downregulated in AD patients, and its lower levels significantly correlated with lower Mini-Mental State Examination scores. Contrary to its serum levels, we found that hsa-miR-501-3p was remarkably upregulated in the same donors' AD brains obtained at autopsy from the discovery set. The hsa-miR-501-3p overexpression in cultured cells, which mimicked the hsa-miR-501-3p upregulation in the AD brains, induced significant downregulation of 128 genes that overrepresented the Gene Ontology terms, DNA replication, and the mitotic cell cycle. Our results suggest that hsa-miR-501-3p is a novel serum biomarker that presumably corresponds to pathological events occurring in AD brains.

    DOI: 10.1186/s40478-017-0414-z

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  • Evaluation of polygenic risks for narcolepsy and essential hypersomnia 査読

    Maria Yamasaki, Taku Miyagawa, Hiromi Toyoda, Seik-Soon Khor, Xiaoxi Liu, Hitoshi Kuwabara, Yukiko Kano, Takafumi Shimada, Toshiro Sugiyama, Hisami Nishida, Nagisa Sugaya, Mamoru Tochigi, Takeshi Otowa, Yuji Okazaki, Hisanobu Kaiya, Yoshiya Kawamura, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Kiyoto Kasai, Hisashi Tanii, Tsukasa Sasaki, Yutaka Honda, Makoto Honda, Katsushi Tokunaga

    JOURNAL OF HUMAN GENETICS   61 ( 10 )   873 - 878   2016年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    In humans, narcolepsy is a sleep disorder that is characterized by sleepiness, cataplexy and rapid eye movement (REM) sleep abnormalities. Essential hypersomnia (EHS) is another type of sleep disorder that is characterized by excessive daytime sleepiness without cataplexy. A human leukocyte antigen (HLA) class II allele, HLA-DQB1*06:02, is a major genetic factor for narcolepsy. Almost all narcoleptic patients are carriers of this HLA allele, while 30-50% of EHS patients and 12% of all healthy individuals in Japan carry this allele. The pathogenesis of narcolepsy and EHS is thought to be partially shared. To evaluate the contribution of common single-nucleotide polymorphisms (SNPs) to narcolepsy onset and to assess the common genetic background of narcolepsy and EHS, we conducted a polygenic analysis that included 393 narcoleptic patients, 38 EHS patients with HLA-DQB1*06:02, 119 EHS patients without HLA-DQB1*06:02 and 1582 healthy individuals. We also included 376 individuals with panic disorder and 213 individuals with autism to confirm whether the results were biased. Polygenic risks in narcolepsy were estimated to explain 58.1% (PHLA-DQB1*06:02 = 2.30 x 10(-48), Pwhole genome without HLA-DQB1*06:02 = 6.73 x 10(-2)) including HLA-DQB1*06:02 effects and 1.3% (Pwhole genome without HLA-DQB1*06:02 = 2.43 x 10(-2)) excluding HLA-DQB1*06:02 effects. The results also indicated that small-effect SNPs contributed to the development of narcolepsy. Reported susceptibility SNPs for narcolepsy in the Japanese population, CPT1B (carnitine palmitoyltransferase 1B), TRA@ (T-cell receptor alpha) and P2RY11 (purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 11), were found to explain 0.8% of narcolepsy onset (P-whole genome without (HLA-DQB1*06:02) = 9.74 x 10(-2)). EHS patients with HLA-DQB1*06:02 were estimated to have higher shared genetic background to narcoleptic patients than EHS patients without HLA-DQB1*06:02 even when the effects of HLA-DQB1*06:02 were excluded (EHS with HLA-DQB1*06:02: 40.4%, PHLA-DQB1*06:02 = 7.02 x 10(-14), Pwhole genome without HLA-DQB1*06:02 = 1.34 x 10(-1), EHS without HLA-DQB1*06:02: 0.4%, Pwhole genome without HLA-DQB1*06:02 = 3.06 x 10(-1)). Meanwhile, the polygenic risks for narcolepsy could not explain the onset of panic disorder and autism, suggesting that our results were reasonable.

    DOI: 10.1038/jhg.2016.65

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  • Candidate genes in panic disorder: meta-analyses of 23 common variants in major anxiogenic pathways 査読

    A. S. Howe, H. N. Buttenschon, A. Bani-Fatemi, E. Maron, T. Otowa, A. Erhardt, E. B. Binder, N. O. Gregersen, O. Mors, D. P. Woldbye, K. Domschke, A. Reif, J. Shlik, S. Koks, Y. Kawamura, A. Miyashita, R. Kuwano, K. Tokunaga, H. Tanii, J. W. Smoller, T. Sasaki, D. Koszycki, V. De Luca

    MOLECULAR PSYCHIATRY   21 ( 5 )   665 - 679   2016年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    The utilization of molecular genetics approaches in examination of panic disorder (PD) has implicated several variants as potential susceptibility factors for panicogenesis. However, the identification of robust PD susceptibility genes has been complicated by phenotypic diversity, underpowered association studies and ancestry-specific effects. In the present study, we performed a succinct review of case-control association studies published prior to April 2015. Meta-analyses were performed for candidate gene variants examined in at least three studies using the Cochrane Mantel-Haenszel fixed-effect model. Secondary analyses were also performed to assess the influences of sex, agoraphobia co-morbidity and ancestry-specific effects on panicogenesis. Meta-analyses were performed on 23 variants in 20 PD candidate genes. Significant associations after correction for multiple testing were observed for three variants, TMEM132D rs7370927 (T allele: odds ratio (OR) = 1.27, 95% confidence interval (CI): 1.15-1.40, P = 2.49 x 10(-6)), rs11060369 (CC genotype: OR = 0.65, 95% CI: 0.53-0.79, P = 1.81 x 10(-5)) and COMT rs4680 (Val (G) allele: OR = 1.27, 95% CI: 1.14-1.42, P = 2.49 x 10(-5)) in studies with samples of European ancestry. Nominal associations that did not survive correction for multiple testing were observed for NPSR1 rs324891 (T allele: OR = 1.22, 95% CI: 1.07-1.38, P = 0.002), TPH1 rs1800532 (AA genotype: OR = 1.46, 95% CI: 1.14-1.89, P = 0.003) and HTR2A rs6313 (T allele: OR = 1.19, 95% CI: 1.07-1.33, P = 0.002) in studies with samples of European ancestry and for MAOA-uVNTR in female PD (low-active alleles: OR = 1.21, 95% CI: 1.07-1.38, P = 0.004). No significant associations were observed in the secondary analyses considering sex, agoraphobia co-morbidity and studies with samples of Asian ancestry. Although these findings highlight a few associations, PD likely involves genetic variation in a multitude of biological pathways that is diverse among populations. Future studies must incorporate larger sample sizes and genome-wide approaches to further quantify the observed genetic variation among populations and subphenotypes of PD.

    DOI: 10.1038/mp.2015.138

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  • Polymorphisms in the TMEM132D region are associated with panic disorder in HLA-DRB1*13:02-negative individuals of a Japanese population. 査読

    Shimada-Sugimoto M, Otowa T, Miyagawa T, Khor SS, Omae Y, Toyo-Oka L, Sugaya N, Kawamura Y, Umekage T, Miyashita A, Kuwano R, Kaiya H, Kasai K, Tanii H, Okazaki Y, Tokunaga K, Sasaki T

    Human genome variation   3   16001   2016年

  • ALS/FTD Mutation-Induced Phase Transition of FUS Liquid Droplets and Reversible Hydrogels into Irreversible Hydrogels Impairs RNP Granule Function 査読

    Tetsuro Murakami, Seema Qamar, Julie Qiaojin Lin, Gabriele S. Kaminski Schierle, Eric Rees, Akinori Miyashita, Ana R. Costa, Roger B. Dodd, Fiona T. S. Chan, Claire H. Michel, Deborah Kronenberg-Versteeg, Yi Li, Seung-Pil Yang, Yosuke Wakutani, William Meadows, Rodylyn Rose Ferry, Liang Dong, Gian Gaetano Tartaglia, Giorgio Favrin, Wen-Lang Lin, Dennis W. Dickson, Mei Zhen, David Ron, Gerold Schmitt-Ulms, Paul E. Fraser, Neil A. Shneider, Christine Holt, Michele Vendruscolo, Clemens F. Kaminski, Peter St George-Hyslop

    NEURON   88 ( 4 )   678 - 690   2015年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:CELL PRESS  

    The mechanisms by which mutations in FUS and other RNA binding proteins cause ALS and FTD remain controversial. We propose a model in which low-complexity (LC) domains of FUS drive its physiologically reversible assembly into membrane-free, liquid droplet and hydrogel-like structures. ALS/FTD mutations in LC or non-LC domains induce further phase transition into poorly soluble fibrillar hydrogels distinct from conventional amyloids. These assemblies are necessary and sufficient for neurotoxicity in a C. elegans model of FUS-dependent neurodegeneration. They trap other ribonucleoprotein (RNP) granule components and disrupt RNP granule function. One consequence is impairment of new protein synthesis by cytoplasmic RNP granules in axon terminals, where RNP granules regulate local RNA metabolism and translation. Nuclear FUS granules may be similarly affected. Inhibiting formation of these fibrillar hydrogel assemblies mitigates neurotoxicity and suggests a potential therapeutic strategy that may also be applicable to ALS/FTD associated with mutations in other RNA binding proteins.

    DOI: 10.1016/j.neuron.2015.10.030

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  • A polymorphism in CCR1/CCR3 is associated with narcolepsy 査読

    Hiromi Toyoda, Taku Miyagawa, Asako Koike, Takashi Kanbayashi, Aya Imanishi, Yohei Sagawa, Nozomu Kotorii, Tatayu Kotorii, Yuji Hashizume, Kimihiro Ogi, Hiroshi Hiejima, Yuichi Kamei, Akiko Hida, Masayuki Miyamoto, Makoto Imai, Yota Fujimura, Yoshiyuki Tamura, Azusa Ikegami, Yamato Wada, Shunpei Moriya, Hirokazu Furuya, Masaki Takeuchi, Yohei Kirino, Akira Meguro, Elaine F. Remmers, Yoshiya Kawamura, Takeshi Otowa, Akinori Miyashita, Koichi Kashiwase, Seik-Soon Khor, Maria Yamasaki, Ryozo Kuwano, Tsukasa Sasaki, Jun Ishigooka, Kenji Kuroda, Kazuhiko Kume, Shigeru Chiba, Naoto Yamada, Masako Okawa, Koichi Hirata, Nobuhisa Mizuki, Naohisa Uchimura, Tetsuo Shimizu, Yuichi Inoue, Yutaka Honda, Kazuo Mishima, Makoto Honda, Katsushi Tokunaga

    BRAIN BEHAVIOR AND IMMUNITY   49   148 - 155   2015年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE  

    Etiology of narcolepsy-cataplexy involves multiple genetic and environmental factors. While the human leukocyte antigen (HLA)-DRB1*15:01-DQB1*06:02 haplotype is strongly associated with narcolepsy, it is not sufficient for disease development. To identify additional, non-HLA susceptibility genes, we conducted a genome-wide association study (GWAS) using Japanese samples.
    An initial sample set comprising 409 cases and 1562 controls was used for the GWAS of 525,196 single nucleotide polymorphisms (SNPs) located outside the HLA region. An independent sample set comprising 240 cases and 869 controls was then genotyped at 37 SNPs identified in the GWAS. We found that narcolepsy was associated with a SNP in the promoter region of chemokine (C-C motif) receptor 1 (CCR1) (rs3181077, P = 1.6 x 10(-5), odds ratio [OR] = 1.86). This rs3181077 association was replicated with the independent sample set (P = 0.032, OR = 1.36). We measured mRNA levels of candidate genes in peripheral blood samples of 38 cases and 37 controls. CCR1 and CCR3 mRNA levels were significantly lower in patients than in healthy controls, and CCR1 mRNA levels were associated with rs3181077 genotypes. In vitro chemotaxis assays were also performed to measure monocyte migration. We observed that monocytes from carriers of the rs3181077 risk allele had lower migration indices with a CCR1 ligand.
    CCR1 and CCR3 are newly discovered susceptibility genes for narcolepsy. These results highlight the potential role of CCR genes in narcolepsy and support the hypothesis that patients with narcolepsy have impaired immune function. (C) 2015 Elsevier Inc. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bbi.2015.05.003

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  • Alzpathway, an updated map of curated signaling pathways: Towards deciphering Alzheimer's disease pathogenesis 査読

    Soichi Ogishima, Satoshi Mizuno, Masataka Kikuchi, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Hiroshi Tanaka, Jun Nakaya

    Systems Biology of Alzheimer's Disease   1303   423 - 432   2015年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Springer New York  

    Alzheimer's disease (AD) is a complex neurodegenerative disorder in which loss of neurons and synaptic function causes dementia in the elderly. To clarify AD pathogenesis and develop drugs for AD, thousands of studies have elucidated signaling pathways involved. However, knowledge of AD signaling pathways has not been compiled as a pathway map. In this chapter, we introduce the manual construction of a pathway map in AD which we call "AlzPathway", that comprehensively catalogs signaling pathways in the field of AD. We have collected and manually curated over 100 review articles related to AD, and have built the AD pathway map. AlzPathway is currently composed of thousands of molecules and reactions in neurons, brain blood barrier, presynaptic, postsynaptic, astrocyte, and microglial cells, with their cellular localizations. AlzPathway provides a systems-biology platform of comprehensive AD signaling and related pathways which is expected to contribute to clarification of AD pathogenesis and AD drug development.

    DOI: 10.1007/978-1-4939-2627-5_25

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  • Network-based analysis for uncovering mechanisms underlying Alzheimer's disease 査読

    Masataka Kikuchi, Soichi Ogishima, Satoshi Mizuno, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Jun Nakaya, Hiroshi Tanaka

    Systems Biology of Alzheimer's Disease   1303   479 - 491   2015年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Springer New York  

    Alzheimer's disease (AD) is known to be a multifactorial neurodegenerative disorder, and is one of the main causes of dementia in the elderly. Many studies have demonstrated molecules involved in the pathogenesis of AD, however its underlying mechanisms remain obscure. It may be simplistic to try to explain the disease based on the role of a few genes only. Accumulating new, huge amount of information from e.g. genome, proteome and interactome datasets and new knowledge, we are now able to clarify and characterize diseases essentially as a result of dysfunction of molecular networks. Recent studies have indicated that relevant genes affected in human diseases concentrate in a part of the network, often called as "disease module." In the case of AD, some disease-associated pathways seem different, but some of them are clearly disease-related and coherent. This suggests the existence of a common pathway that negatively drives from healthy state to disease state (i.e., the disease module(s)). Additionally, such disease modules should dynamically change through AD progression. Thus, network-level approaches are indispensable to address unknown mechanisms of AD. In this chapter, we introduce network strategies using gene co-expression and protein interaction networks.

    DOI: 10.1007/978-1-4939-2627-5_29

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  • Assessment of copy number variations in the brain genome of schizophrenia patients 査読

    Miwako Sakai, Yuichiro Watanabe, Toshiyuki Someya, Kazuaki Araki, Masako Shibuya, Kazuhiro Niizato, Kenichi Oshima, Yasuto Kunii, Hirooki Yabe, Junya Matsumoto, Akira Wada, Mizuki Hino, Takeshi Hashimoto, Akitoyo Hishimoto, Noboru Kitamura, Shuji Iritani, Osamu Shirakawa, Kiyoshi Maeda, Akinori Miyashita, Shin-ichi Niwa, Hitoshi Takahashi, Akiyoshi Kakita, Ryozo Kuwano, Hiroyuki Nawa

    MOLECULAR CYTOGENETICS   8   46   2015年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BIOMED CENTRAL LTD  

    Background: Cytogenomic mutations and chromosomal abnormality are implicated in the neuropathology of several brain diseases. Cell heterogeneity of brain tissues makes their detection and validation difficult, however. In the present study, we analyzed gene dosage alterations in brain DNA of schizophrenia patients and compared those with the copy number variations (CNVs) identified in schizophrenia patients as well as with those in Asian lymphocyte DNA and attempted to obtain hints at the pathological contribution of cytogenomic instability to schizophrenia.
    Results: Brain DNA was extracted from postmortem striatum of schizophrenia patients and control subjects (n = 48 each) and subjected to the direct two color microarray analysis that limits technical data variations. Disease-associated biases of relative DNA doses were statistically analyzed with Bonferroni's compensation on the premise of brain cell mosaicism. We found that the relative gene dosage of 85 regions significantly varied among a million of probe sites. In the candidate CNV regions, 26 regions had no overlaps with the common CNVs found in Asian populations and included the genes (i.e., ANTXRL, CHST9, DNM3, NDST3, SDK1, STRC, SKY) that are associated with schizophrenia and/or other psychiatric diseases. The majority of these candidate CNVs exhibited high statistical probabilities but their signal differences in gene dosage were less than 1.5-fold. For test evaluation, we rather selected the 10 candidate CNV regions that exhibited higher aberration scores or larger global effects and were thus confirmable by PCR. Quantitative PCR verified the loss of gene dosage at two loci (1p36.21 and 1p13.3) and confirmed the global variation of the copy number distributions at two loci (11p15.4 and 13q21.1), both indicating the utility of the present strategy. These test loci, however, exhibited the same somatic CNV patterns in the other brain region.
    Conclusions: The present study lists the candidate regions potentially representing cytogenomic CNVs in the brain of schizophrenia patients, although the significant but modest alterations in their brain genome doses largely remain to be characterized further.

    DOI: 10.1186/s13039-015-0144-5

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  • Systematic review and meta-analysis of Japanese familial Alzheimer's disease and FTDP-17 査読

    Kensaku Kasuga, Masataka Kikuchi, Takayoshi Tokutake, Akihiro Nakaya, Toshiyuki Tezuka, Tamao Tsukie, Norikazu Hara, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Takeshi Ikeuchi

    JOURNAL OF HUMAN GENETICS   60 ( 5 )   281 - 283   2015年5月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    Mutations in APP, PSEN1 and PSEN2 as the genetic causes of familial Alzheimer's disease (FAD) have been found in various ethnic populations. A substantial number of FAD pedigrees with mutations have been reported in the Japanese population; however, it remains unclear whether the genetic and clinical features of FAD in the Japanese population differ from those in other populations. To address this issue, we conducted a systematic review and meta-analysis of Japanese FAD and frontotemporal dementia with parkinsonism linked to chromosome 17 (FTDP-17) by literature search. Using this analysis, we identified 39 different PSEN1 mutations in 140 patients, 5 APP mutations in 35 patients and 16 MAPT mutations in 84 patients. There was no PSEN2 mutation among Japanese patients. The age at onset in Japanese FAD patients with PSEN1 mutations was significantly younger than that in patients with APP mutations. Kaplan-Meier analysis revealed that patients with MAPT mutations showed a shorter survival than patients with PSEN1 or APP mutations. Patients with mutations in different genes exhibit characteristic clinical presentations, suggesting that mutations in causative genes may modify the clinical presentations. By collecting and cataloging genetic and clinical information on Japanese FAD and FTDP-17, we developed an original database designated as Japanese Familial Alzheimer's Disease Database, which is accessible at http://alzdb.bri. niigata-u.ac.jp/.

    DOI: 10.1038/jhg.2015.15

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  • Immune-related pathways including HLA-DRB1(∗)13:02 are associated with panic disorder. 査読

    Shimada-Sugimoto M, Otowa T, Miyagawa T, Khor SS, Kashiwase K, Sugaya N, Kawamura Y, Umekage T, Kojima H, Saji H, Miyashita A, Kuwano R, Kaiya H, Kasai K, Tanii H, Okazaki Y, Tokunaga K, Sasaki T

    Brain, behavior, and immunity   46   96 - 103   2015年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbi.2015.01.002

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  • Role of the p.E66Q variant of GLA in the progression of chronic kidney disease 査読

    Hirofumi Watanabe, Shin Goto, Akinori Miyashita, Hiroki Maruyama, Minako Wakasugi, Akio Yokoseki, Ryozo Kuwano, Ichiei Narita

    CLINICAL AND EXPERIMENTAL NEPHROLOGY   19 ( 2 )   225 - 230   2015年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:SPRINGER  

    The p.E66Q variant of the alpha-galactosidase A gene (GLA) is frequently found during screening for Fabry disease in dialysis patients in Japan. However, recent reports suggest that the p.E66Q variant is not a disease-causing mutation but is a risk factor for cerebral small-vessel occlusion. To evaluate the role of the p.E66Q in the progression of renal diseases, we performed a genetic association study in patients with chronic kidney disease (CKD).
    In this study, we enrolled 1651 chronic hemodialysis and 941 non-dialysis patients who attended medical institutions in the Niigata Prefecture, Japan. The frequency of the p.E66Q allele was compared between hemodialysis and non-dialysis patients, with data from a previously published study of Japanese male newborns. In addition, we compared estimated glomerular filtration rates (eGFR) in the presence or absence of the p.E66Q variant in non-dialysis patients.
    Of the 2233 alleles in hemodialysis and 1447 alleles in non-dialysis patients, 21 and nine harbored p.E66Q, respectively. However, p.E66Q allele frequencies did not differ between the two patient groups (0.90 versus 0.62 %, P = 0.35), and no significant difference in p.E66Q allele frequency was observed between male hemodialysis patients and the general Japanese population (0.52 versus 0.63 %, P = 0.67). Moreover, eGFR did not significantly differ between non-dialysis patients with the p.E66Q variant and patients with the wild-type allele (65.5 +/- A 10.7 versus 62.7 +/- A 16.6 mL/min/1.73 m(2), P = 0.69).
    This study indicated that the p.E66Q variant of GLA does not affect the progression of CKD.

    DOI: 10.1007/s10157-014-0969-y

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  • Reduced plasma desmosterol-to-cholesterol ratio and longitudinal cognitive decline in Alzheimer's disease 査読

    Yoshiaki Sato, Francois Bernier, Yasukazu Yamanaka, Ken Aoshima, Yoshiya Oda, Martin Ingelsson, Lars Lannfelt, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Takeshi Ikeuchi

    Alzheimer's and Dementia: Diagnosis, Assessment and Disease Monitoring   1 ( 1 )   67 - 74   2015年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier Inc.  

    Background: We here examined whether plasma desmosterol-to-cholesterol ratio (DES/CHO) is decreased in patients with Alzheimer's disease (AD) and investigated the association between plasma DES/CHO and longitudinal cognitive decline. Methods: Plasma DES/CHO of AD patients and age-matched controls in a Japanese cross-sectional cohort was determined. Plasma DES/CHO at baseline and follow-up visits was assessed in relation to cognitive decline in Japanese and Swedish longitudinal cohorts. Results: Plasma DES/CHO was significantly reduced in Japanese AD patients and significantly correlated with Mini-Mental State Examination (MMSE) score. The longitudinal analysis revealed that plasma DES/CHO in AD patients shows a significant decrease at follow-up intervals. The decline in plasma DES/CHO is larger in the AD group with rapid progression than in that with slow progression. The changes in plasma DES/CHO significantly correlated with changes in the MMSE score. Conclusion: Plasma DES/CHO is decreased in AD patients and may serve as a longitudinal surrogate marker associated with cognitive decline.

    DOI: 10.1016/j.dadm.2014.11.009

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  • Genes associated with the progression of neurofibrillary tangles in Alzheimer's disease 査読

    A. Miyashita, H. Hatsuta, M. Kikuchi, A. Nakaya, Y. Saito, T. Tsukie, N. Hara, S. Ogishima, N. Kitamura, K. Akazawa, A. Kakita, H. Takahashi, S. Murayama, Y. Ihara, T. Ikeuchi, R. Kuwano

    TRANSLATIONAL PSYCHIATRY   4   e396   2014年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    The spreading of neurofibrillary tangles (NFTs), intraneuronal aggregates of highly phosphorylated microtubule-associated protein tau, across the human brain is correlated with the cognitive severity of Alzheimer's disease (AD). To identify genes relevant to NFT expansion defined by the Braak stage, we conducted whole-genome exon array analysis with an exploratory sample set consisting of 213 human post-mortem brain tissue specimens from the entorinal, temporal and frontal cortices of 71 brain-donor subjects: Braak NFT stages 0 (N = 13), I-II (N = 20), III-IV (N = 19) and V-VI (N = 19). We identified eight genes, RELN, PTGS2, MYO5C, TRIL, DCHS2, GRB14, NPAS4 and PHYHD1, associated with the Braak stage. The expression levels of three genes, PHYHD1, MYO5C and GRB14, exhibited reproducible association on real-time quantitative PCR analysis. In another sample set, including control subjects (N = 30), and in patients with late-onset AD (N = 37), dementia with Lewy bodies (N = 17) and Parkinson disease (N = 36), the expression levels of two genes, PHYHD1 and MYO5C, were obviously associated with late-onset AD. Protein-protein interaction network analysis with a public database revealed that PHYHD1 interacts with MYO5C via POT1, and PHYHD1 directly interacts with amyloid beta-peptide 42. It is thus likely that functional failure of PHYHD1 and MYO5C could lead to AD development.

    DOI: 10.1038/tp.2014.35

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  • Clinical and neuroimaging features of patient with early-onset Parkinson's disease with dementia carrying SNCA p.G51D mutation 査読

    Takayoshi Tokutake, Atsuhi Ishikawa, Nahoko Yoshimura, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Masatoyo Nishizawa, Takeshi Ikeuchi

    PARKINSONISM & RELATED DISORDERS   20 ( 2 )   262 - 264   2014年2月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:ELSEVIER SCI LTD  

    DOI: 10.1016/j.parkreldis.2013.11.008

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  • Lack of genetic association between TREM2 and late-onset Alzheimer's disease in a Japanese population. 査読 国際誌

    Akinori Miyashita, Yanan Wen, Nobutaka Kitamura, Etsuro Matsubara, Takeshi Kawarabayashi, Mikio Shoji, Naoki Tomita, Katsutoshi Furukawa, Hiroyuki Arai, Takashi Asada, Yasuo Harigaya, Masaki Ikeda, Masakuni Amari, Haruo Hanyu, Susumu Higuchi, Masatoyo Nishizawa, Masaichi Suga, Yasuhiro Kawase, Hiroyasu Akatsu, Masaki Imagawa, Tsuyoshi Hamaguchi, Masahito Yamada, Takashi Morihara, Masatoshi Takeda, Takeo Takao, Kenji Nakata, Ken Sasaki, Ken Watanabe, Kenji Nakashima, Katsuya Urakami, Terumi Ooya, Mitsuo Takahashi, Takefumi Yuzuriha, Kayoko Serikawa, Seishi Yoshimoto, Ryuji Nakagawa, Yuko Saito, Hiroyuki Hatsuta, Shigeo Murayama, Akiyoshi Kakita, Hitoshi Takahashi, Haruyasu Yamaguchi, Kohei Akazawa, Ichiro Kanazawa, Yasuo Ihara, Takeshi Ikeuchi, Ryozo Kuwano

    Journal of Alzheimer's disease : JAD   41 ( 4 )   1031 - 8   2014年

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    記述言語:英語  

    Rare non-synonymous variants of TREM2 have recently been shown to be associated with Alzheimer's disease (AD) in Caucasians. We here conducted a replication study using a well-characterized Japanese sample set, comprising 2,190 late-onset AD (LOAD) cases and 2,498 controls. We genotyped 10 non-synonymous variants (Q33X, Y38C, R47H, T66M, N68K, D87N, T96K, R98W, H157Y, and L211P) of TREM2 reported by Guerreiro et al. (2013) by means of the TaqMan and dideoxy sequencing methods. Only three variants, R47H, H157Y, and L211P, were polymorphic (range of minor allele frequency [MAF], 0.0002-0.0059); however, no significant association with LOAD was observed in these variants. Considering low MAF of variants examined and our study sample size, further genetic analysis with a larger sample set is needed to firmly evaluate whether or not TREM2 is associated with LOAD in Japanese.

    DOI: 10.3233/JAD-140225

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  • Identification of Unstable Network Modules Reveals Disease Modules Associated with the Progression of Alzheimer's Disease 査読

    Masataka Kikuchi, Soichi Ogishima, Tadashi Miyamoto, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Jun Nakaya, Hiroshi Tanaka

    PLOS ONE   8 ( 11 )   e76162   2013年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PUBLIC LIBRARY SCIENCE  

    Alzheimer's disease (AD), the most common cause of dementia, is associated with aging, and it leads to neuron death. Deposits of amyloid beta and aberrantly phosphorylated tau protein are known as pathological hallmarks of AD, but the underlying mechanisms have not yet been revealed. A high-throughput gene expression analysis previously showed that differentially expressed genes accompanying the progression of AD were more down-regulated than up-regulated in the later stages of AD. This suggested that the molecular networks and their constituent modules collapsed along with AD progression. In this study, by using gene expression profiles and protein interaction networks (PINs), we identified the PINs expressed in three brain regions: the entorhinal cortex (EC), hippocampus (HIP) and superior frontal gyrus (SFG). Dividing the expressed PINs into modules, we examined the stability of the modules with AD progression and with normal aging. We found that in the AD modules, the constituent proteins, interactions and cellular functions were not maintained between consecutive stages through all brain regions. Interestingly, the modules were collapsed with AD progression, specifically in the EC region. By identifying the modules that were affected by AD pathology, we found the transcriptional regulation-associated modules that interact with the proteasome-associated module via UCHL5 hub protein, which is a deubiquitinating enzyme. Considering PINs as a system made of network modules, we found that the modules relevant to the transcriptional regulation are disrupted in the EC region, which affects the ubiquitin-proteasome system.

    DOI: 10.1371/journal.pone.0076162

    Web of Science

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  • A Map of Alzheimer's Disease-Signaling Pathways: A Hope for Drug Target Discovery 査読

    S. Ogishima, S. Mizuno, M. Kikuchi, A. Miyashita, R. Kuwano, H. Tanaka, J. Nakaya

    CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS   93 ( 5 )   399 - 401   2013年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    Alzheimer's disease (AD) is a complex neurodegenerative condition, and its drug therapy is challenging. To inform AD drug discovery, we developed the "AlzPathway," a prototype of a comprehensive map of AD-related signaling pathways, from information obtained through studies in the public domain. The AlzPathway provides an integrated platform for systems analyses of AD-signaling pathways and networks.

    DOI: 10.1038/clpt.2013.37

    Web of Science

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  • SORL1 is Genetically Associated with Neuropathologically Characterized Late-Onset Alzheimer's Disease 査読

    Yanan Wen, Akinori Miyashita, Nobutaka Kitamura, Tamao Tsukie, Yuko Saito, Hiroyuki Hatsuta, Shigeo Murayama, Akiyoshi Kakita, Hitoshi Takahashi, Hiroyasu Akatsu, Takayuki Yamamoto, Kenji Kosaka, Haruyasu Yamaguchi, Kohei Akazawa, Yasuo Ihara, Ryozo Kuwano

    JOURNAL OF ALZHEIMERS DISEASE   35 ( 2 )   387 - 394   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:IOS PRESS  

    SORL1 was shown to be genetically associated with late-onset Alzheimer's disease (LOAD) in a large-scale genome-wide association study (GWAS) involving clinically verified subjects. Here, we attempted to replicate the association of SORL1 in Japanese neuropathologically characterized brain donor subjects (LOAD, 213; control, 370) through a single-nucleotide polymorphism (SNP)-based genetic study involving 19 SNPs: 11 SNPs were selected from the initial study reported by Rogaeva et al. (2007), and the other eight were from our GWAS. Among these SNPs, five exhibited a significant association with LOAD after multiple test correction (p &lt; 2.63E-03 [=0.05/19]), which was supported by means of multiple logistic regression analysis with adjustment for age, gender, and carrier status of the APOE epsilon 4 allele. Three of these SNPs (rs985421, rs12364988 [Rogaeva's SNP 7], and rs4598682) were encompassed by a 5' linkage disequilibrium (LD) region, and the remaining two (rs3781834 and rs3781836) by a 3' LD region. Strong LD among SNPs was observed within each LD region, implying that there are two genomic regions showing association with LOAD in SORL1. Case-control haplotype analysis demonstrated that some haplotypes are associated with LOAD in both LD regions. Our replication study strongly supports the preceding evidence that SORL1 is likely one of the genes associated with LOAD.

    DOI: 10.3233/JAD-122395

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  • SORL1 is genetically associated with late-onset Alzheimer's disease in Japanese, Koreans and Caucasians. 査読 国際誌

    Akinori Miyashita, Asako Koike, Gyungah Jun, Li-San Wang, Satoshi Takahashi, Etsuro Matsubara, Takeshi Kawarabayashi, Mikio Shoji, Naoki Tomita, Hiroyuki Arai, Takashi Asada, Yasuo Harigaya, Masaki Ikeda, Masakuni Amari, Haruo Hanyu, Susumu Higuchi, Takeshi Ikeuchi, Masatoyo Nishizawa, Masaichi Suga, Yasuhiro Kawase, Hiroyasu Akatsu, Kenji Kosaka, Takayuki Yamamoto, Masaki Imagawa, Tsuyoshi Hamaguchi, Masahito Yamada, Takashi Morihara, Masatoshi Takeda, Takeo Takao, Kenji Nakata, Yoshikatsu Fujisawa, Ken Sasaki, Ken Watanabe, Kenji Nakashima, Katsuya Urakami, Terumi Ooya, Mitsuo Takahashi, Takefumi Yuzuriha, Kayoko Serikawa, Seishi Yoshimoto, Ryuji Nakagawa, Jong-Won Kim, Chang-Seok Ki, Hong-Hee Won, Duk L Na, Sang Won Seo, Inhee Mook-Jung, Peter St George-Hyslop, Richard Mayeux, Jonathan L Haines, Margaret A Pericak-Vance, Makiko Yoshida, Nao Nishida, Katsushi Tokunaga, Ken Yamamoto, Shoji Tsuji, Ichiro Kanazawa, Yasuo Ihara, Gerard D Schellenberg, Lindsay A Farrer, Ryozo Kuwano

    PloS one   8 ( 4 )   e58618   2013年

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    記述言語:英語  

    To discover susceptibility genes of late-onset Alzheimer's disease (LOAD), we conducted a 3-stage genome-wide association study (GWAS) using three populations: Japanese from the Japanese Genetic Consortium for Alzheimer Disease (JGSCAD), Koreans, and Caucasians from the Alzheimer Disease Genetic Consortium (ADGC). In Stage 1, we evaluated data for 5,877,918 genotyped and imputed SNPs in Japanese cases (n = 1,008) and controls (n = 1,016). Genome-wide significance was observed with 12 SNPs in the APOE region. Seven SNPs from other distinct regions with p-values <2×10(-5) were genotyped in a second Japanese sample (885 cases, 985 controls), and evidence of association was confirmed for one SORL1 SNP (rs3781834, P = 7.33×10(-7) in the combined sample). Subsequent analysis combining results for several SORL1 SNPs in the Japanese, Korean (339 cases, 1,129 controls) and Caucasians (11,840 AD cases, 10,931 controls) revealed genome wide significance with rs11218343 (P = 1.77×10(-9)) and rs3781834 (P = 1.04×10(-8)). SNPs in previously established AD loci in Caucasians showed strong evidence of association in Japanese including rs3851179 near PICALM (P = 1.71×10(-5)) and rs744373 near BIN1 (P = 1.39×10(-4)). The associated allele for each of these SNPs was the same as in Caucasians. These data demonstrate for the first time genome-wide significance of LOAD with SORL1 and confirm the role of other known loci for LOAD in Japanese. Our study highlights the importance of examining associations in multiple ethnic populations.

    DOI: 10.1371/journal.pone.0058618

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  • Meta-analysis of genome-wide association studies for panic disorder in the Japanese population 査読

    T. Otowa, Y. Kawamura, N. Nishida, N. Sugaya, A. Koike, E. Yoshida, K. Inoue, S. Yasuda, Y. Nishimura, X. Liu, Y. Konishi, F. Nishimura, T. Shimada, H. Kuwabara, M. Tochigi, C. Kakiuchi, T. Umekage, T. Miyagawa, A. Miyashita, E. Shimizu, J. Akiyoshi, T. Someya, T. Kato, T. Yoshikawa, R. Kuwano, K. Kasai, N. Kato, H. Kaiya, K. Tokunaga, Y. Okazaki, H. Tanii, T. Sasaki

    TRANSLATIONAL PSYCHIATRY   2   e186   2012年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    Panic disorder (PD) is a moderately heritable anxiety disorder whose pathogenesis is not well understood. Due to the lack of power in previous association studies, genes that are truly associated with PD might not be detected. In this study, we conducted a genome-wide association study (GWAS) in two independent data sets using the Affymetrix Mapping 500K Array or Genome-Wide Human SNP Array 6.0. We obtained imputed genotypes for each GWAS and performed a meta-analysis of two GWAS data sets (718 cases and 1717 controls). For follow-up, 12 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were tested in 329 cases and 861 controls. Gene ontology enrichment and candidate gene analyses were conducted using the GWAS or meta-analysis results. We also applied the polygenic score analysis to our two GWAS samples to test the hypothesis of polygenic components contributing to PD. Although genome-wide significant SNPs were not detected in either of the GWAS nor the meta-analysis, suggestive associations were observed in several loci such as BDKRB2 (P = 1.3 x 10(-5), odds ratio = 1.31). Among previous candidate genes, supportive evidence for association of NPY5R with PD was obtained (gene-wise corrected P = 6.4 x 10(-4)). Polygenic scores calculated from weakly associated SNPs (P&lt;0.3 and 0.4) in the discovery sample were significantly associated with PD status in the target sample in both directions (sample I to sample II and vice versa) (P&lt;0.05). Our findings suggest that large sets of common variants of small effects collectively account for risk of PD.

    DOI: 10.1038/tp.2012.89

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  • Alteration of POLDIP3 Splicing Associated with Loss of Function of TDP-43 in Tissues Affected with ALS 査読

    Atsushi Shiga, Tomohiko Ishihara, Akinori Miyashita, Misaki Kuwabara, Taisuke Kato, Norihiro Watanabe, Akie Yamahira, Chigusa Kondo, Akio Yokoseki, Masuhiro Takahashi, Ryozo Kuwano, Akiyoshi Kakita, Masatoyo Nishizawa, Hitoshi Takahashi, Osamu Onodera

    PLOS ONE   7 ( 8 )   e43120   2012年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:PUBLIC LIBRARY SCIENCE  

    Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is an adult-onset neurodegenerative disease caused by selective loss of motor neurons. In the ALS motor neurons, TAR DNA-binding protein of 43 kDa (TDP-43) is dislocated from the nucleus to cytoplasm and forms inclusions, suggesting that loss of a nuclear function of TDP-43 may underlie the pathogenesis of ALS. TDP-43 functions in RNA metabolism include regulation of transcription, mRNA stability, and alternative splicing of pre-mRNA. However, a function of TDP-43 in tissue affected with ALS has not been elucidated. We sought to identify the molecular indicators reflecting on a TDP-43 function. Using exon array analysis, we observed a remarkable alteration of splicing in the polymerase delta interacting protein 3 (POLDIP3) as a result of the depletion of TDP-43 expression in two types of cultured cells. In the cells treated with TDP-43 siRNA, wild-type POLDIP3 (variant-1) decreased and POLDIP3 lacking exon 3 (variant-2) increased. The RNA binding ability of TDP-43 was necessary for inclusion of POLDIP3 exon 3. Moreover, we found an increment of POLDIP3 variant-2 mRNA in motor cortex, spinal cord and spinal motor neurons collected by laser capture microdissection with ALS. Our results suggest a loss of TDP-43 function in tissues affected with ALS, supporting the hypothesis that a loss of function of TDP-43 underlies the pathogenesis of ALS.

    DOI: 10.1371/journal.pone.0043120

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  • AlzPathway: a comprehensive map of signaling pathways of Alzheimer's disease 査読

    Satoshi Mizuno, Risa Iijima, Soichi Ogishima, Masataka Kikuchi, Yukiko Matsuoka, Samik Ghosh, Tadashi Miyamoto, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Hiroshi Tanaka

    BMC SYSTEMS BIOLOGY   6   52   2012年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BIOMED CENTRAL LTD  

    Background: Alzheimer's disease (AD) is the most common cause of dementia among the elderly. To clarify pathogenesis of AD, thousands of reports have been accumulating. However, knowledge of signaling pathways in the field of AD has not been compiled as a database before.
    Description: Here, we have constructed a publicly available pathway map called "AlzPathway" that comprehensively catalogs signaling pathways in the field of AD. We have collected and manually curated over 100 review articles related to AD, and have built an AD pathway map using CellDesigner. AlzPathway is currently composed of 1347 molecules and 1070 reactions in neuron, brain blood barrier, presynaptic, postsynaptic, astrocyte, and microglial cells and their cellular localizations. AlzPathway is available as both the SBML (Systems Biology Markup Language) map for CellDesigner and the high resolution image map. AlzPathway is also available as a web service (online map) based on Payao system, a community-based, collaborative web service platform for pathway model curation, enabling continuous updates by AD researchers.
    Conclusions: AlzPathway is the first comprehensive map of intra, inter and extra cellular AD signaling pathways which can enable mechanistic deciphering of AD pathogenesis. The AlzPathway map is accessible at http://alzpathway.org/.

    DOI: 10.1186/1752-0509-6-52

    Web of Science

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  • [Genetic diagnosis and imaging genetics of Alzheimer's disease]. 査読

    Miyashita A, Kuwano R

    Nihon rinsho. Japanese journal of clinical medicine   69 Suppl 8   565 - 569   2011年10月

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  • [Laboratory diagnosis and biomarkers of Alzheimer's disease]. 査読

    Kuwano R, Miyashita A, Tsukie T

    Nihon rinsho. Japanese journal of clinical medicine   69 Suppl 8   476 - 483   2011年10月

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  • [Apolipoprotein E gene]. 査読

    Kuwano R, Miyashita A

    Nihon rinsho. Japanese journal of clinical medicine   69 Suppl 8   93 - 97   2011年10月

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  • Evidence for a Common Founder and Clinical Characteristics of Japanese Families with the MAPT R406W Mutation. 査読 国際誌

    Takeshi Ikeuchi, Toru Imamura, Yasuhiro Kawase, Yoshimi Kitade, Miyuki Tsuchiya, Takayoshi Tokutake, Kensaku Kasuga, Ryuji Yajima, Tamao Tsukie, Akinori Miyashita, Morihiro Sugishita, Ryozo Kuwano, Masatoyo Nishizawa

    Dementia and geriatric cognitive disorders extra   1 ( 1 )   267 - 75   2011年1月

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    記述言語:英語  

    BACKGROUND/AIM: Mutations in MAPT cause frontotemporal dementia with parkinsonism linked to chromosome 17 (FTDP-17). Patients with the MAPT R406W mutation were reported to show phenotypic heterogeneity in different ethnic backgrounds. We here report the clinical and genetic characteristics of Japanese families with the R406W mutation. METHODS: We examined the clinical and neuroimaging features of 6 patients from three families with the R406W mutation. We determined the genotypes of intragenic MAPT single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and the flanking microsatellite markers to search for a common founder. RESULTS: The initial symptom was memory loss with the average age at onset being 54 years. Anterograde amnesia with episodic memory impairment was the predominant phenotype. Behavioral and personality changes or parkinsonism is not a prominent feature. A brain MRI study revealed marked atrophy of the medial temporal lobe. Genetic analysis of SNPs and microsatellite markers revealed that the affected members of the three families share common genotypes. CONCLUSION: The findings of the affected members in this study, which corroborate previously reported findings of European families, suggest that the R406W mutation may represent a phenotype of predominant anterograde amnesia in FTLD-17. Our genetic data suggest that a founder effect may account for some families with the R406W mutation.

    DOI: 10.1159/000331243

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  • Neuroblastoma amplified sequence gene is associated with a novel short stature syndrome characterised by optic nerve atrophy and Pelger-Huët anomaly. 査読

    Maksimova N, Hara K, Nikolaeva I, Chun-Feng T, Usui T, Takagi M, Nishihira Y, Miyashita A, Fujiwara H, Oyama T, Nogovicina A, Sukhomyasova A, Potapova S, Kuwano R, Takahashi H, Nishizawa M, Onodera O

    Journal of medical genetics   47 ( 8 )   538 - 548   2010年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1136/jmg.2009.074815

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  • Sporadic four-repeat tauopathy with frontotemporal lobar degeneration, Parkinsonism, and motor neuron disease: a distinct clinicopathological and biochemical disease entity 査読

    Yong-Juan Fu, Yasushi Nishihira, Shigetoshi Kuroda, Yasuko Toyoshima, Tomohiko Ishihara, Makoto Shinozaki, Akinori Miyashita, Yue-Shan Piao, Chun-Feng Tan, Takashi Tani, Ryoko Koike, Keisuke Iwanaga, Mitsuhiro Tsujihata, Osamu Onodera, Ryozo Kuwano, Masatoyo Nishizawa, Akiyoshi Kakita, Takeshi Ikeuchi, Hitoshi Takahashi

    ACTA NEUROPATHOLOGICA   120 ( 1 )   21 - 32   2010年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:SPRINGER  

    Tau is the pathological protein in several neurodegenerative disorders classified as frontotemporal lobar degeneration (FTLD), including corticobasal degeneration (CBD) and progressive supranuclear palsy (PSP). We report an unusual tauopathy in three Japanese patients presenting with Parkinsonism and motor neuron disease (neuroimaging revealed frontotemporal cerebral atrophy in two patients who were examined). At autopsy, all cases showed FTLD with the most severe neuronal loss and gliosis evident in the premotor and precentral gyri. Although less severe, such changes were also observed in other brain regions, including the basal ganglia and substantia nigra. In the spinal cord, loss of anterior horn cells and degeneration of the corticospinal tract were evident. In addition, the affected regions exhibited neuronal cytoplasmic inclusions resembling neurofibrillary tangles. Immunostaining using antibodies against hyperphosphorylated tau and 4-repeat tau revealed widespread occurrence of neuronal and glial cytoplasmic inclusions in the central nervous system; the astrocytic tau lesions were unique, and different in morphology from astrocytic plaques in CBD, or tufted astrocytes in PSP. However, immunoblotting of frozen brain samples available in two cases revealed predominantly 4R tau, with the approximately 37-kDa and 33-kDa low-molecular mass tau fragments characteristic of CBD and PSP, respectively. No mutations were found in the tau gene in either of the two cases. Based on these clinicopathological, biochemical, and genetic findings, we consider that the present three patients form a distinct 4R tauopathy associated with sporadic FTLD.

    DOI: 10.1007/s00401-010-0649-2

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  • Neuropathological Asymmetry in Argyrophilic Grain Disease 査読

    Tadashi Adachi, Yuko Saito, Hiroyuki Hatsuta, Sayaka Funabe, Aya M. Tokumaru, Kenji Ishii, Tomio Arai, Motoji Sawabe, Kazutomi Kanemaru, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Kenji Nakashima, Shigeo Murayama

    JOURNAL OF NEUROPATHOLOGY AND EXPERIMENTAL NEUROLOGY   69 ( 7 )   737 - 744   2010年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS  

    The presence of argyrophilic grains in the neuropil is associated with a form of dementia. We investigated morphological asymmetry in 653 consecutive autopsy patients from a general geriatric hospital (age [mean +/- SD] = 81.1 T 8.9 years), focusing on those from patients with advanced argyrophilic grain disease. Paraffin sections of the bilateral posterior hippocampi were immunostained with antiYphosphorylated tau and antiY4-repeat tau antibodies and by the Gallyas-Braak method. In a side-to-side comparison, asymmetry was defined when either the extent or the density of argyrophilic grains was different. Of the 653 subjects, 65 (10%) had Stage 3 argyrophilic grain disease, and 59 (90.8%) showed histopathological asymmetry. Antemortem computed tomographic images (n = 24), magnetic resonance imaging scans (n = 8), and combined computed tomographic and magnetic resonance images (n = 15) were available; images from 20 of the 47 subjects showed asymmetry that correlated with the histopathological asymmetry. Cerebral cortical asymmetry consistent with the histopathology was also visible in N-isopropyl-123I-piodoamphetamine single photon emission computed tomographic images from 6 patients and 18 F-labeled fluorodeoxyglucose positron emission tomographic images from 2 patients. Thus, asymmetric involvement of the medial temporal lobe in patients with advanced argyrophilic grain disease may represent a diagnostic feature and contribute to distinguishing dementia with grains from Alzheimer disease.

    DOI: 10.1097/NEN.0b013e3181e5ae5c

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  • TRPM7 Is Not Associated With Amyotrophic Lateral Sclerosis-Parkinsonism Dementia Complex in the Kii Peninsula of Japan 査読

    Kenju Hara, Yasumasa Kokubo, Hiroyuki Ishiura, Yuko Fukuda, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Ryogen Sasaki, Jun Goto, Masatoyo Nishizawa, Shigeki Kuzuhara, Shoji Tsuji

    AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART B-NEUROPSYCHIATRIC GENETICS   153B ( 1 )   310 - 313   2010年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-LISS  

    Amyotrophic lateral sclerosis-parkinsonism dementia complex (ALS/PDC) is a distinct neurodegenerative disorder characterized by ALS pathology with neurofibrillary tangles (NFTs) in the spinal cord and brain. Recent clinical studies have revealed a high incidence and a high familial occurrence of ALS/PDC in both Guam and the Kii peninsula of Japan, suggesting a strong genetic predisposition to this disorder. The T1482I variant (rs8042919) of TRPM7 gene which is suggested to play roles in regulating the cellular homeostasis of Ca(2+), Mg(2+), and trace metals, has recently been reported to be associated with Guamanian patients with ALS/PDC. To investigate whether TRPM7 is associated with Kii ALS/PDC, we conducted parametric linkage analyses of the TRPM7 locus in a large extended family with ALS/PDC. Linkage analysis did not reveal any evidence supporting the linkage to the TRPM7 locus. Resequencing of the entire coding region of TRPM7 did not reveal any pathogenic mutations in an affected individual in this family. The allele frequencies of the T1482I in affected individuals in this family or in those from other families are not significantly different from those in regional controls or those in HapMap-JPT samples. These results indicate that TRPM7 is not associated with ALS/PDC in the Kii peninsula of Japan. (C) 2009 Wiley-Liss, Inc.

    DOI: 10.1002/ajmg.b.30966

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  • Genetic Deficiency of Plasma Lipoprotein-Associated Phospholipase A(2) (PLA2G7 V297F Null Mutation) and Risk of Alzheimer&apos;s Disease in Japan 査読

    Beena Koshy, Akinori Miyashita, Pamela St Jean, Heide Stirnadel, Toshihiko Kaise, Justin P. Rubio, Vincent Mooser, Ryozo Kuwano, Michael C. Irizarry

    JOURNAL OF ALZHEIMERS DISEASE   21 ( 3 )   775 - 780   2010年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:IOS PRESS  

    High plasma lipoprotein phospholipase A(2) activity (Lp-PLA(2)) is reported to be a risk factor for dementia. A loss of function polymorphism in the Lp-PLA(2) gene - PLA2G7 V279F - is found almost exclusively in Asians. In 1,952 subjects with late-onset AD and 2,079 non-demented controls recruited from Japan, the PLA2G7 null allele was not associated with risk or age at onset of AD: logistic regression OR 0.98 (95% CI 0.86-1.12, p = 0.81) per additional null allele, adjusted for age/age at onset, gender, and APOE epsilon 4. Genetic deficiency of Lp-PLA(2) activity is not associated with a reduced risk of AD in the Japanese population.

    DOI: 10.3233/JAD-2010-100513

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  • Identification of independent APP locus duplication in Japanese patients with early-onset Alzheimer disease 査読

    K. Kasuga, T. Shimohata, A. Nishimura, A. Shiga, T. Mizuguchi, J. Tokunaga, T. Ohno, A. Miyashita, R. Kuwano, N. Matsumoto, O. Onodera, M. Nishizawa, T. Ikeuchi

    JOURNAL OF NEUROLOGY NEUROSURGERY AND PSYCHIATRY   80 ( 9 )   1050 - 1052   2009年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:B M J PUBLISHING GROUP  

    Background: The occurrence of duplications of the amyloid precursor protein gene (APP) has been described in European families with early-onset familial Alzheimer disease (EO-FAD) and cerebral amyloid angiopathy. However, the contribution of APP duplication to the development of AD in other ethnic populations remains undetermined.
    Methods: The occurrence of APP duplication in probands from 25 families with FAD and 11 sporadic EO-AD cases in the Japanese population was examined by quantitative PCR and microarray-based comparative genomic hybridisation analyses. APP expression level was determined by real-time quantitative reverse-transcription (RT) PCR analysis using mRNA extracted from the peripheral blood of the patients.
    Results: We identified APP locus duplications in two unrelated EO-FAD families. The duplicated genomic regions in two patients of these families differed from each other. No APP duplication was found in the late-onset FAD families or sporadic EO-AD patients. The patients with APP duplication developed insidious memory disturbance in their fifties without intracerebral haemorrhage and epilepsy. Quantitative RT-PCR analysis showed the increased APP mRNA expression levels in these patients compared with those in age- and sex-matched controls.
    Conclusions: Our results suggest that APP duplication should be considered in patients with EO-FAD in various ethnic groups, and that increased APP mRNA expression level owing to APP duplication contributes to AD development.

    DOI: 10.1136/jnnp.2008.161703

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  • Depression and psychiatric symptoms preceding onset of dementia in a family with early-onset Alzheimer disease with a novel PSEN1 mutation 査読

    Kensaku Kasuga, Tsukasa Ohno, Tomohiko Ishihara, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Osamu Onodera, Masatoyo Nishizawa, Takeshi Ikeuchi

    JOURNAL OF NEUROLOGY   256 ( 8 )   1351 - 1353   2009年8月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:DR DIETRICH STEINKOPFF VERLAG  

    DOI: 10.1007/s00415-009-5096-4

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  • [Genetic basis for dementia]. 査読

    Kuwano R, Takei N, Miyashita A

    Nihon rinsho. Japanese journal of clinical medicine   67 ( 6 )   1078 - 1082   2009年6月

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  • GAB2 is not associated with late-onset Alzheimer&apos;s disease in Japanese 査読

    Akinori Miyashita, Hiroyuki Arai, Takashi Asada, Masaki Imagawa, Mikio Shoji, Susumu Higuchi, Katsuya Urakami, Shinichi Toyabe, Kohei Akazawa, Ichiro Kanazawa, Yasuo Ihara, Ryozo Kuwano

    EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS   17 ( 5 )   682 - 686   2009年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    The epsilon 4 allele of the apolipoprotein E gene (APOE) is unequivocally recognized as a genetic risk factor for late-onset Alzheimer&apos;s disease (LOAD). Recently, single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of the GRB2-associated binding protein 2 gene (GAB2) were shown to be associated with LOAD in Caucasians carrying the APOE-epsilon 4 allele through a genome-wide association study. Here, we attempted to replicate the finding by genotyping these SNPs in a large clinical cohort of Japanese. We observed no association of any of the SNPs with LOAD. GAB2 may not be a disease susceptibility gene for LOAD in Japanese.

    DOI: 10.1038/ejhg.2008.181

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  • Genetic association study on in and around the APOE in late-onset Alzheimer disease in Japanese 査読

    Norihiro Takei, Akinori Miyashita, Tarriao Tsukie, Hiroyuki Arai, Takashi Asada, Masaki Imagawa, Mikio Shoji, Susumu Higuchi, Katsuya Urakami, Hideo Kimura, Akiyoshi Kakita, Hitoshi Takahashi, Shoji Tsuji, Ichiro Kanazawa, Yasuo Ihara, Shoji Odani, Ryozo Kuwano

    GENOMICS   93 ( 5 )   441 - 448   2009年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE  

    DOI: 10.1016/j.ygeno.2009.01.003

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  • Association of HTRA1 Mutations and Familial Ischemic Cerebral Small-Vessel Disease 査読

    Kenju Hara, Atsushi Shiga, Toshio Fukutake, Hiroaki Nozaki, Akinori Miyashita, Akio Yokoseki, Hirotoshi Kawata, Akihide Koyama, Kunimasa Arima, Toshiaki Takahashi, Mari Ikeda, Hiroshi Shiota, Masato Tamura, Yutaka Shimoe, Mikio Hirayama, Takayo Arisato, Sohei Yanagawa, Akira Tanaka, Imaharu Nakano, Shu-ichi Ikeda, Yutaka Yoshida, Tadashi Yamamoto, Takeshi Ikeuchi, Ryozo Kuwano, Masatoyo Nishizawa, Shoji Tsuji, Osamu Onodera

    NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE   360 ( 17 )   1729 - 1739   2009年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MASSACHUSETTS MEDICAL SOC  

    BACKGROUND
    The genetic cause of cerebral autosomal recessive arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy (CARASIL), which is characterized by ischemic, non-hypertensive, cerebral small-vessel disease with associated alopecia and spondylosis, is unclear.
    METHODS
    In five families with CARASIL, we carried out linkage analysis, fine mapping of the region implicated in the disease, and sequence analysis of a candidate gene. We also conducted functional analysis of wild-type and mutant gene products and measured the signaling by members of the transforming growth factor beta (TGF-beta) family and gene and protein expression in the small arteries in the cerebrum of two patients with CARASIL.
    RESULTS
    We found linkage of the disease to the 2.4-Mb region on chromosome 10q, which contains the HtrA serine protease 1 (HTRA1) gene. HTRA1 is a serine protease that represses signaling by TGF-beta family members. Sequence analysis revealed two nonsense mutations and two missense mutations in HTRA1. The missense mutations and one of the nonsense mutations resulted in protein products that had comparatively low levels of protease activity and did not repress signaling by the TGF-beta family. The other nonsense mutation resulted in the loss of HTRA1 protein by nonsense-mediated decay of messenger RNA. Immunohistochemical analysis of the cerebral small arteries in affected persons showed increased expression of the extra domain-A region of fibronectin and versican in the thickened tunica intima and of TGF-beta 1 in the tunica media.
    CONCLUSIONS
    CARASIL is associated with mutations in the HTRA1 gene. Our findings indicate a link between repressed inhibition of signaling by the TGF-beta family and ischemic cerebral small-vessel disease, alopecia, and spondylosis.

    DOI: 10.1056/NEJMoa0801560

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  • SNP HiTLink: a high-throughput linkage analysis system employing dense SNP data 査読

    Yoko Fukuda, Yasuo Nakahara, Hidetoshi Date, Yuji Takahashi, Jun Goto, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Hiroki Adachi, Eiji Nakamura, Shoji Tsuji

    BMC BIOINFORMATICS   10   121   2009年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BIOMED CENTRAL LTD  

    Background: During this recent decade, microarray-based single nucleotide polymorphism (SNP) data are becoming more widely used as markers for linkage analysis in the identification of loci for disease-associated genes. Although microarray-based SNP analyses have markedly reduced genotyping time and cost compared with microsatellite-based analyses, applying these enormous data to linkage analysis programs is a time-consuming step, thus, necessitating a high-throughput platform.
    Results: We have developed SNP HiTLink (SNP High Throughput Linkage analysis system). In this system, SNP chip data of the Affymetrix Mapping 100 k/500 k array set and Genome-Wide Human SNP array 5.0/6.0 can be directly imported and passed to parametric or model-free linkage analysis programs; MLINK, Superlink, Merlin and Allegro. Various marker-selecting functions are implemented to avoid the effect of typing-error data, markers in linkage equilibrium or to select informative data.
    Conclusion: The results using the 100 k SNP dataset were comparable or even superior to those obtained from analyses using microsatellite markers in terms of LOD scores obtained. General personal computers are sufficient to execute the process, as runtime for whole-genome analysis was less than a few hours. This system can be widely applied to linkage analysis using microarray-based SNP data and with which one can expect high-throughput and reliable linkage analysis.

    DOI: 10.1186/1471-2105-10-121

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  • Programs for calculating the statistical powers of detecting susceptibility genes in case-control studies based on multistage designs 査読

    Nobutaka Kitamura, Kouhei Akazawa, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Shin-ichi Toyabe, Junichiro Nakamura, Norihito Nakamura, Tatsuhiko Sato, M. Aminul Hoque

    BIOINFORMATICS   25 ( 2 )   272 - 273   2009年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    Motivation: A two-stage association study is the most commonly used method among multistage designs to efficiently identify disease susceptibility genes. Recently, some SNP studies have utilized more than two stages to detect disease genes. However, there are few available programs for calculating statistical powers and positive predictive values (PPVs) of arbitrary n-stage designs.
    Results: We developed programs for a multistage case-control association study using R language. In our programs, input parameters include numbers of samples and candidate loci, genome-wide false positive rate and proportions of samples and loci to be selected at the k-th stage (k = 1,..., n). The programs output statistical powers, PPVs and numbers of typings in arbitrary n-stage designs. The programs can contribute to prior simulations under various conditions in planning a genome-wide association study.

    DOI: 10.1093/bioinformatics/btn616

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  • Sample-size properties of a case-control association analysis of multistage SNP studies for identifying disease susceptibility genes 査読

    Nobutaka Kitamura, Kouhei Akazawa, Shin-ichi Toyabe, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Junichiro Nakamura

    JOURNAL OF HUMAN GENETICS   53 ( 5 )   390 - 400   2008年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    A two-stage association study is the most commonly used method to efficiently identify disease susceptibility genes. However, some recent single nucleotide polymorphism (SNP) studies recently utilized three-stage designs. The purpose of this study was to investigate the practical properties of statistical powers and positive predictive values (PPVs) of replication-based analysis (RBA) and the joint analysis (JA) in multistage designs. For this purpose, a program for multistage designs was developed to calculate these performance indicators under various conditions of the number of samples, alleles of candidates, alleles remaining in the final stage, and genotypings. The results showed that the powers and PPVs of RBA and JA in three-stage designs were higher than those in two-stage designs in the range of a smaller proportion of sample size than 0.5 at the first stage. This tendency was more remarkable in JA. In conclusion, researchers who perform SNP studies for identifying disease susceptibility genes need to take account of three-stage case-control association studies, corresponding to study conditions such as the total numbers of samples, alleles, and genotypings. Furthermore, the program developed in this study is useful for estimating powers and PPVs in planning multistage association studies.

    DOI: 10.1007/s10038-008-0258-2

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  • Prediction of Disease-associated Single Nucleotide Polymorphisms Using Virtual Genomes Constructed from a Public Haplotype Database 査読

    S. Toyabe, A. Miyashita, N. Kitamura, R. Kuwano, K. Akazowa

    METHODS OF INFORMATION IN MEDICINE   47 ( 6 )   522 - 528   2008年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:SCHATTAUER GMBH-VERLAG MEDIZIN NATURWISSENSCHAFTEN  

    Objectives: Simultaneous dealing of hundreds of thousands of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genome-wide association studies is laborious. The aim of our study is to develop a method to decrease the number of candidate SNPs prior to the genotyping of study subjects.
    Methods. We created virtual genotype data on case and control subjects from data of the International HapMap Project by using haplotype-based simulation method. We repeated virtual case-control association studies and selected candidate SNPs. We applied the selected SNPs to previously published genetic case-control studies. Sensitivity to detect association with causative genes using our method was compared to the original studies and results using tag SNPs.
    Results. We found a discrete distribution pattern of SNPs, which was able to produce significant results in case-control association studies. The number of candidate SNPs that we selected was 24.7% of the number of the original set of SNPs, We applied this method to previously published genetic case-control studies and found that the use of candidate SNPs improved the sensitivity for detecting significant alleles, both compared to the original studies and to the use of tag SNPs. The results were not affected by the difference of the diseases and genes involved.
    Conclusions. Our simulation-based approach has advantages of reducing costs and improving performance to detect significant alleles. This method can be used without considering the specific disease and genes involved.

    DOI: 10.3414/ME9129

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  • Mutational analysis in early-onset familial dementia in the Japanese population 査読

    Takeshi Ikeuchi, Hiroyuki Kaneko, Akinori Miyashita, Hiroaki Nozaki, Kensaku Kasuga, Tamao Tsukie, Miyuki Tsuchiya, Toru Imamura, Hideki Ishizu, Kenju Aoki, Atsushi Ishikawa, Osamu Onodera, Ryozo Kuwano, Masatoyo Nishizawa

    DEMENTIA AND GERIATRIC COGNITIVE DISORDERS   26 ( 1 )   43 - 49   2008年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:KARGER  

    Background: Three major causative genes have been implicated as the cause of early-onset familial Alzheimer's disease (AD): the amyloid precursor protein gene (APP), presenilin-1 (PSEN1) and PSEN2. Although rare, a tau-related dementia with mutations in the microtubule-associated protein tau gene (MAPT) has been identified in patients showing clinical presentations similar to those of AD. Methods: We performed mutational analysis of APP, PSEN1, PSEN2, and MAPT in 10 Japanese families with early-onset dementia clinically diagnosed as probable Alzheimer's disease. Results: In 4 index patients, we identified 4 missense PSEN1 mutations, namely, L286V, G378E, L381V, and L392V. The mean age at onset in the patients with PSEN1 mutations was 39 years. In 2 families, we found the R406W mutation in MAPT. The mean age at onset of the patients carrying the R406W mutation was 52 years, and they presented with the peculiar AD-like phenotype without apparent behavioral or language problems. Conclusion: These observations suggest that although PSEN1 mutations are the most frequent cause, the MAPT R406W mutation is an important cause of early-onset familial dementia clinically diagnosed as AD. Differentiation of patients with the MAPT mutation from AD patients by genetic testing would be meaningful, considering that a different therapeutic approach should be applied. Copyright (c) 2008 S. Karger AG, Basel.

    DOI: 10.1159/000141483

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  • Genetic association of CTNNA3 with late-onset Alzheimer's disease in females. 査読 国際誌

    Akinori Miyashita, Hiroyuki Arai, Takashi Asada, Masaki Imagawa, Etsuro Matsubara, Mikio Shoji, Susumu Higuchi, Katsuya Urakami, Akiyoshi Kakita, Hitoshi Takahashi, Shinichi Toyabe, Kohei Akazawa, Ichiro Kanazawa, Yasuo Ihara, Ryozo Kuwano

    Human molecular genetics   16 ( 23 )   2854 - 69   2007年12月

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    記述言語:英語  

    Alzheimer's disease (AD), the most common form of dementia in the elderly, was found to exhibit a trend toward a higher risk in females than in males through epidemiological studies. Therefore, we hypothesized that gender-related genetic risks could exist. To reveal the ones for late-onset AD (LOAD), we extended our previous genetic work on chromosome 10q (genomic region, 60-107 Mb), and single nucleotide polymorphism (SNP)-based genetic association analyses were performed on the same chromosomal region, where the existence of genetic risk factors for plasma Abeta42 elevation in LOAD was implied on a linkage analysis. Two-step screening of 1140 SNPs was carried out using a total of 1408 subjects with the APOE-epsilon3*3 genotype: we first genotyped an exploratory sample set (LOAD, 363; control, 337), and then genotyped some associated SNPs in a validation sample set (LOAD, 336; control, 372). Seven SNPs, spanning about 38 kb, in intron 9 of CTNNA3 were found to show multiple-hit association with LOAD in females, and exhibited more significant association on Mantel-Haenszel test (allelic P-values(MH-F) = 0.000005945-0.0007658). Multiple logistic regression analysis of a total of 2762 subjects (LOAD, 1313; controls, 1449) demonstrated that one of the seven SNPs directly interacted with the female gender, but not with the male gender. Furthermore, we found that this SNP exhibited no interaction with the APOE-epsilon4 allele. Our data suggest that CTNNA3 may affect LOAD through a female-specific mechanism independent of the APOE-epsilon4 allele.

    DOI: 10.1093/hmg/ddm244

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  • Enhanced accumulation of phosphorylated alpha-synuclein and elevated beta-amyloid 42/40 ratio caused by expression of the presenilin-1 Delta T440 mutant associated with familial Lewy body disease and variant Alzheimer's disease 査読

    Hiroyuki Kaneko, Akiyoshi Kakita, Kensaku Kasuga, Hiroaki Nozaki, Atsushi Ishikawa, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Genta Ito, Takeshi Iwatsubo, Hitoshi Takahashi, Masatoyo Nishizawa, Osamu Onodera, Sangram S. Sisodia, Takeshi Ikeuchi

    JOURNAL OF NEUROSCIENCE   27 ( 48 )   13092 - 13097   2007年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:SOC NEUROSCIENCE  

    Mutations in the PSEN1 gene encoding presenilin 1 ( PS1) are linked to a vast majority of pedigrees with early- onset, autosomal dominant forms of familial Alzheimer's disease ( FAD). Lewy body ( LB) pathology is frequently found in the brains of FAD patients harboring PSEN1 mutations. We recently reported on a novel PS1 mutation with the deletion of threonine at codon 440 (Delta T440) in a familial case diagnosed as having the neocortical type of dementia with LBs ( DLB) and variant AD. In this report, we investigated the possible involvement of PS1 Delta T440 mutation in aberrant alpha-synuclein accumulation. We established cell lines that stably express either wild- type ( WT) PS1 or the FAD- linked PS1 H163R, E280A, Delta E9, and PS1 Delta T440 mutants and now demonstrate that the expression of the PS1 Delta T440 mutant led to a marked elevation in the ratio of beta-amyloid (A beta) 42/40 peptides in a conditioned medium. More importantly, we report here that the levels of phosphorylated alpha-synuclein increase in neuronal and non- neuronal cells expressing the PS1 Delta T440 mutant compared with cells that express WT PS1 or the PS1 H163R and E280A variants that are not associated with LB pathology. This finding is consistent with our demonstration of elevated levels of phosphorylated alpha-synuclein in the detergent-resistant fraction prepared from a patient's brain with PS1 Delta T440 mutation. These observations raise the intriguing suggestion that the mechanism( s) by which the PS1 Delta T440 mutant causes DLB and variant AD are by enhancing the phosphorylation of alpha-synuclein and the ratio of A beta(42/40) peptides, respectively, in the brain.

    DOI: 10.1523/JNEUROSCI.4244-07.2007

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  • [Molecular genetic analysis of amyotrophic lateral sclerosis/parkinsonism-dementia complex (ALS/PDC) in the Kii peninsula]. 査読

    Hara K, Kuwano R, Miyashita A, Kokubo Y, Sasaki R, Nakahara Y, Goto J, Nishizawa M, Kuzuhara S, Tsuji S

    Rinsho shinkeigaku = Clinical neurology   47 ( 11 )   974 - 976   2007年11月

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    掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Novel locus for benign hereditary chorea with adult onset maps to chromosome 8q21.3 q23.3. 査読

    Shimohata Takayoshi, Hara Kenju, Sanpei Kazuhiro, Nunomura Jin-ichi, Maeda Tetsuya, Kawachi Izumi, Kanazawa Masato, Kasuga Kensaku, Miyashita Akinori, Kuwano Ryozo, Hirota Koichi, Tsuji Shoji, Onodera Osamu, Nishizawa Masatoyo, Honma Yoshiaki

    Brain   130 ( Pt 9 )   2302 - 2309   2007年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Autosomal dominant choreas are genetically heterogeneous disorders including Huntington disease (HD), Huntington disease like 1 (HDL1), Huntington disease like 2 (HDL2), dentatorubro-pallidoluysian atrophy (DRPLA), spinocerebellar ataxia type 17 (SCA17) and benign hereditary chorea (BHC). We identified two Japanese families with adult-onset benign chorea without dementia inherited in an autosomal dominant pattern. All affected individuals presented slowly progressive choreic movements in their upper and lower extremities, trunk and head with an age of onset ranging from 40 to 66 (average 54.3), which were markedly improved by haloperidol. The affected individuals also developed reduced muscle tones in their extremities. The findings obtained in the brain CT or MRI studies of nine affected individuals were normal. These clinical features resemble those of the so-called &#039;senile chorea&#039;. HD, HDL1, HDL2, DRPLA, SCA17 and BHC caused by mutations in the TITF-1 gene were excluded by mutational and linkage analyses. A genome-wide linkage analysis revealed linkage to chromosome 8q21.3-q23.3 with a maximum cumulative two-point log of the odds (LOD) score of 4.74 at D8S1784 (theta = 0.00). H

    DOI: 10.1093/brain/awm036

    Web of Science

    PubMed

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  • Novel locus for benign hereditary chorea with adult onset maps to chromosome 8q21.3 q23.3. 査読 国際誌

    Takayoshi Shimohata, Kenju Hara, Kazuhiro Sanpei, Jin-ichi Nunomura, Tetsuya Maeda, Izumi Kawachi, Masato Kanazawa, Kensaku Kasuga, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Koichi Hirota, Shoji Tsuji, Osamu Onodera, Masatoyo Nishizawa, Yoshiaki Honma

    Brain : a journal of neurology   130 ( Pt 9 )   2302 - 9   2007年9月

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    記述言語:英語  

    Autosomal dominant choreas are genetically heterogeneous disorders including Huntington disease (HD), Huntington disease like 1 (HDL1), Huntington disease like 2 (HDL2), dentatorubro-pallidoluysian atrophy (DRPLA), spinocerebellar ataxia type 17 (SCA17) and benign hereditary chorea (BHC). We identified two Japanese families with adult-onset benign chorea without dementia inherited in an autosomal dominant pattern. All affected individuals presented slowly progressive choreic movements in their upper and lower extremities, trunk and head with an age of onset ranging from 40 to 66 (average 54.3), which were markedly improved by haloperidol. The affected individuals also developed reduced muscle tones in their extremities. The findings obtained in the brain CT or MRI studies of nine affected individuals were normal. These clinical features resemble those of the so-called 'senile chorea'. HD, HDL1, HDL2, DRPLA, SCA17 and BHC caused by mutations in the TITF-1 gene were excluded by mutational and linkage analyses. A genome-wide linkage analysis revealed linkage to chromosome 8q21.3-q23.3 with a maximum cumulative two-point log of the odds (LOD) score of 4.74 at D8S1784 (theta = 0.00). Haplotype analysis of both the families defined the candidate region as 21.5 Mb interval flanked by M9267 and D8S1139. We named this adult-onset dominant inherited chorea 'benign hereditary chorea type 2 (BHC2)'.

    DOI: 10.1093/brain/awm036

    PubMed

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  • New locus for benign hereditary chorea with adult-onset maps to chromosome 8q22.2-q23.3 査読

    Kenju Hara, Takayoshi Shimohata, Sanpei Kazuhiro, Jin-ichi Nunomura, Izumi Kawachi, Masato Kanazawa, Kensaku Kasuga, Akinori Miyashita, Ryozo Kuwano, Koichi Hirota, Shoji Tsuji, Osamu Onodera, Masatoyo Nishizawa, Yoshiaki Honma

    NEUROLOGY   68 ( 12 )   A326 - A327   2007年3月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS  

    Web of Science

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  • Dynamin-binding protein gene on chromosome 10q is associated with late-onset Alzheimer's disease (共著). 査読

    KUWANO R, MIYASHITA A, ARAI H, ASADA T, IMAGAWA M, SHOJI M, HIGUCHI S, URAKAMI K, KAKITA A, TAKAHASHI H, TSUKIE T, TOYABE S, AKAZAWA K, KANAZAWA I, IHARA Y

    Hum Mol Genet.   15 ( 13 )   2170 - 2182   2006年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/hmg/ddl142

    Web of Science

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  • [Molecular genetics of Alzheimer's disease]. 査読

    Akinori M, Ryozo K

    Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme   50 ( 16 Suppl )   2122 - 2127   2005年12月

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  • A mutant PSEN1 causes dementia with Lewy bodies and variant Alzheimer's disease (共著). 査読

    ISHIKAWA A, PIAO Ys, MIYASHITA A, KUWANO R, ONODERA O, OHTAKE H, SUZUKI M, NISHIZAWA M, TAKAHASHI H

    Ann Neurol   57 ( 3 )   429 - 434   2005年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/ana.20393

    Web of Science

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  • A rare case of hypohidrotic ectodermal dysplasia caused by compound heterozygous mutations in the EDAR gene. (共著) 査読

    SHIMOMURA Y, SATO N, MIYASHITA A, HASHIMOTO T, ITO M, KUWANO R

    J Invest Dermatol.   123 ( 4 )   649 - 655   2004年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.0022-202X.2004.23405.x

    Web of Science

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  • Japanese SCA families with a distinct phenotype linked to a locus overlapping with SCA15 locus (共著)

    Neurology   62 ( 4 )   648 - 651   2004年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Web of Science

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  • Five different genes, Eif4a1, Cd68, supl15h, sox15 and Fxr2h, are clustered in a 40 kb region of mouse chromosome 11.(共著)

    MIYASHITA A, SHIMIZU N, ENDO N, HANYUU T, ITOH Y, SHIRAI M, NAKAJIMA T, ODANI S, KUWANO R

    Gene   237 ( 1 )   53 - 60   1999年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/S0378-1119(99)00301-7

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  • Molecular Cloning of a novel 130-kDa cytoplasmic Protein, ankhzn, containing ankyrin repeats hooked to a zinc finger motif.(共著)

    ITO K, ISHII N, MIYASHITA A, TOMINAGA K, KURIYAMA H, MARUYAMA H, SHIRAI M, NAITO M, KUWANO R

    Biochem.Biophys. Res.Commun   257 ( 1 )   206 - 213   1999年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1006/bbrc.1999.0430

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  • A gene trap strategy for identifying the gene expressed in the embryonic nervous system 査読

    M Shirai, A Miyashita, N Ishii, Y Itoh, Satokata, I, YG Watanabe, R Kuwano

    ZOOLOGICAL SCIENCE   13 ( 2 )   277 - 283   1996年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ZOOLOGICAL SOC JAPAN  

    An efficient gene trap strategy was devised for identifying the genes that are expressed in the mouse developing nervous system. Mouse embryonic stem (ES) cell lines that carried independent integrations of a gene trap vector, pSneolNlacZA, were allowed to differentiate in a suspension culture system. To select cells containing neurons, astrocytes or neuron-glia precursors, cell lines were immunohistochemically examined with antibodies against neuron-specific proteins (neurofilament protein 150 kD and microtubule associated protein 2), glial fibrillary acidic protein or nestin. Three cell clones (GT3-8, 11 and 12) were immunoreactive to either of the antibodies employed and at the same time positive for beta-galactosidase activity. When chimeric embryos were generated by the use of the above 3 cell lines, some cells in their nervous system showed X-gal staining. Thus the major advantage of the present gene trap method lies in its prescreening step of manipulated ES cells prior to generation of chimeric animals. This method holds promise as a useful tool for investigating the genes involved in the development of the nervous system.

    DOI: 10.2108/zsj.13.277

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MISC

  • 遺伝・ゲノム学 日本人におけるアルツハイマー病感受性遺伝子 招待

    宮下 哲典, 原 範和, 尾崎 浩一

    医学のあゆみ   274 ( 8 )   675 - 676   2020年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:医歯薬出版(株)  

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  • アルツハイマー病の原因遺伝子と感受性遺伝子 我々の取り組みと国内外の最新事情

    宮下 哲典, 原 範和, 春日 健作, 池内 健

    新潟医学会雑誌   134 ( 1 )   13 - 18   2020年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

    認知症の半数以上を占めるアルツハイマー病(Alzheimer's Disease:AD)はガン、糖尿病、高血圧などと同じく「ありふれた疾患」である。個々人の遺伝的素因を背景に環境要因(ライフスタイル、食生活、運動など)が加わって潜行性に発症し、緩徐に不可逆的に進行する。遺伝要因、環境要因の寄与率はそれぞれおよそ6割、4割を占めることがこれまでに明らかにされている。マイクロサテライトマーカーを用いた連鎖解析、ジーンチップによるゲノムワイド関連解析(Genome-Wide Association Study:GWAS)、次世代シーケンサーを駆使したターゲットリシーケンシング、全エクソーム解析、全ゲノム解析によって、家族性AD、孤発性ADに関与する遺伝子や病的・保護的バリアントが続々と見出されている。1990年代に若年性の家族性ADの原因遺伝子として報告されたAPP、PSEN1、PSEN2のバリアント解析は、今では臨床診断を確定する際に極めて有効である。同じく1990年代に孤発性ADの感受性遺伝子として初めて報告されたAPOEは、その周辺領域を含めゲノムワイドなレベルで非常に強力にADと関連することが2000年代のGWASで確証された。認知機能、脳画像、液性バイオマーカー(アミロイドベータタンパクやタウタンパク)などの量的形質とも強い関連を示す。そのため孤発性ADの病態を解明し、その治療戦略を考える上で無視できない重要な感受性遺伝子としての地位が確立した。これまでのところ、APOEのインパクトを凌ぐAD感受性遺伝子やバリアントは報告されていない。本稿では講演内容の一部を抜粋し、ADの原因遺伝子、感受性遺伝子にフォーカスして論を進める。この機会にADの遺伝要因に関する理解を深め、今後の更なる研究展開に向けた糧としたい。(著者抄録)

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    その他リンク: https://search.jamas.or.jp/index.php?module=Default&action=Link&pub_year=2020&ichushi_jid=J00990&link_issn=&doc_id=20201223030003&doc_link_id=http%3A%2F%2Fhdl.handle.net%2F10191%2F00052024&url=http%3A%2F%2Fhdl.handle.net%2F10191%2F00052024&type=%90V%8A%83%91%E5%8Aw%81F%90V%8A%83%91%E5%8Aw%8Aw%8Fp%83%8A%83%7C%83W%83g%83%8A_Nuar&icon=https%3A%2F%2Fjk04.jamas.or.jp%2Ficon%2F80230_3.gif

  • アルツハイマー病マルチオミックスデータを用いたシステム生物学的研究

    菊地正隆, 関谷倫子, 関谷倫子, 原範和, 宮下哲典, 桑野良三, 池内健, 飯島浩一, 飯島浩一, 中谷明弘

    日本生化学会大会(Web)   93rd   2020年

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  • 【認知症の遺伝子研究のこれまでとこれから】各論 アルツハイマー病に関与する遺伝子 ゲノムワイド関連解析で見いだされた感受性遺伝子 招待

    宮下 哲典, 原 範和, 劉 李きん, 春日 健作, 池内 健

    老年精神医学雑誌   30 ( 11 )   1226 - 1235   2019年11月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   出版者・発行元:(株)ワールドプランニング  

    アルツハイマー病(AD)は糖尿病などと同じく「ありふれた疾患」である。遺伝的素因を背景にさまざまな環境要因が加わって潜行性に発症し、緩徐に不可逆的に進行する。ADは認知症全体のおよそ6〜7割を占め、最も頻度が高い。加齢が最大のリスク要因ではあるが、遺伝要因の寄与率はおよそ6割と見積もられている。これは、先天的な疾患感受性要因としてバリアント情報を軽視できないことを意味している。本稿では、AD感受性遺伝子について最新の知見を概説した。(著者抄録)

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  • 家族性アルツハイマー病で同定された新規PSEN1遺伝子変異の病的意義の検討

    三浦 健, 目崎 直実, Zhu Bin, 村上 涼太, Liu Lixin, 樋口 陽, 石黒 敬信, 月江 珠緒, 原 範和, 春日 健作, 宮下 哲典, 小野寺 理, 池内 健

    臨床神経学   59 ( Suppl. )   S352 - S352   2019年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 脳脊髄液バイオマーカーによるAlzheimer's clinical syndromeの検討

    春日 健作, 月江 珠緒, 原 範和, 樋口 陽, 石黒 敬信, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 小野寺 理, 池内 健

    臨床神経学   59 ( Suppl. )   S217 - S217   2019年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • SORL1レアバリアントとアルツハイマー病発症リスクとの遺伝的関連

    月江珠緒, 原範和, 宮下哲典, LIU Lixin, 樋口陽, ZHU Bin, 春日健作, 桑野良三, 桑野良三, 岩坪威, 池内健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   524   2019年10月

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    記述言語:日本語  

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  • ALSP患者において同定されたCSF1R変異の機能アッセイ

    朱斌, LIU Lixin, 三浦健, 樋口陽, 原範和, 月江珠緒, 今野卓哉, 春日健作, 宮下哲典, 池内健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   548   2019年10月

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    記述言語:日本語  

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  • 日本人集団におけるアルツハイマー病ポリジェニック解析

    菊地正隆, 宮下哲典, 原範和, 重水大智, 尾崎浩一, 新飯田俊平, 池内健, 中谷明弘

    Dementia Japan   33 ( 4 )   562   2019年10月

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    記述言語:日本語  

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  • 日本人集団におけるABCA7機能喪失型変異とアルツハイマー病発症リスクとの関連

    原範和, 宮下哲典, LIU Lixin, 樋口陽, 朱斌, 月江珠緒, 春日健作, 桑野良三, 岩坪威, 池内健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   547   2019年10月

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    記述言語:日本語  

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  • 日本人におけるAPOEのコモン・レアバリアント解析

    宮下哲典, 原範和, 春日健作, LIU Lixin, 樋口陽, ZHU Bin, 月江珠緒, 石黒敬信, 村上涼太, 菊地正隆, 中谷明弘, 尾崎浩一, 新飯田俊平, 赤澤宏平, 桑野良三, 桑野良三, 岩坪威, 岩坪威, 池内健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   519   2019年10月

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    記述言語:日本語  

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  • 認知症と遺伝 アルツハイマー病におけるレアバリアントの役割とその解析意義 招待

    宮下哲典, 劉李歆, 原範和

    Brain and Nerve   71 ( 10 )   1071‐1079   2019年10月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

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  • 血漿炎症系サイトカインと脳脊髄液バイオマーカーとの関連

    樋口 陽, 春日 健作, Bin Zhu, Lixin Liu, 石黒 敬信, 徳武 孝允, 宮下 哲典, 小野寺 理, 池内 健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   548 - 548   2019年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • ヒト死後脳におけるAPP・APOEの遺伝子発現解析

    Lixin Liu, 宮下 哲典, 村上 涼太, Bin Zhu, 原 範和, 菊地 正隆, 月江 珠緒, 樋口 陽, 春日 健作, 中谷 明弘, 赤津 裕康, 柿田 明美, 村山 繁雄, 池内 健

    Dementia Japan   33 ( 4 )   519 - 519   2019年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 統合失調症患者の脳内ゲノムにおけるコピー数変異の評価

    坂井 美和子, 渡部 雄一郎, 染矢 俊幸, 荒木 一明, 澁谷 雅子, 新里 和弘, 大島 健一, 國井 泰人, 矢部 博興, 松本 純弥, 和田 明, 日野 瑞城, 橋本 健志, 菱本 明豊, 北村 登, 入谷 修司, 白川 治, 前田 潔, 宮下 哲典, 丹羽 真一, 高橋 均, 柿田 明美, 桑野 良三, 那波 宏之

    精神神経学雑誌   ( 2019特別号 )   S603 - S603   2019年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公社)日本精神神経学会  

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  • 統合失調症として長期入院していた特発性基底核石灰化症(Fahr病)の臨床病理学的特徴

    伊藤 陽, 吉田 浩樹, 清水 敬三, 長谷川 まこと, 今野 公和, 中原 亜紗, 原 範和, 宮下 哲典, 池内 健, 豊島 靖子, 柿田 明美

    精神医学 = Clinical psychiatry   61 ( 5 )   595 - 603   2019年5月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:医学書院  

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  • 認知症性疾患のバイオリソースの構築と活用:新潟大学脳研究所における取り組み

    宮下哲典, 月江珠緒, 原範和, 廣瀬美香, 小林智子, 佐藤怜奈, 河合麗子, 平井香織, 高殿恵子, 春日健作, 池内健

    Dementia Japan   32 ( 3 )   450   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • 認知症臨床ゲノム情報データベース構築に関する開発研究

    池内健, 新飯田俊平, 佐々木貴史, 宮下哲典, 尾崎浩一, 広瀬信義, 中谷明弘, 柿田明美, 鈴木一詩, 齋藤祐子, 村山繁雄, 橋詰良夫, 寺田整司, 吉田真理, 嶋田裕之, 三村将, 岡野栄之, 岩坪威, 秋山治彦, 森啓

    Dementia Japan   32 ( 3 )   462   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • ポリジェニックハザードスコアを用いたアルツハイマー病発症年齢解析

    菊地正隆, 宮下哲典, 池内健, 中谷明弘

    Dementia Japan   32 ( 3 )   433   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • アルツハイマー病剖検脳を用いたAPOE遺伝型とミエリン関連遺伝子発現との関連

    原範和, 宮下哲典, 柿田明美, 池内健

    Dementia Japan   32 ( 3 )   429   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • 家族性アルツハイマー病で同定された新規PSEN1変異の病的意義の検討

    ZHU Bin, 村上涼太, LIU Lixin, 樋口陽, 石黒敬信, 三浦健, 目崎直美, 月江珠緒, 原範和, 春日健作, 宮下哲典

    Dementia Japan   32 ( 3 )   448   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • アルツハイマー病の原因遺伝子と感受性遺伝子:我々の取り組みと国内外の最新情報

    宮下哲典, 原範和, 菊地正隆, 月江珠緒, 春日健作, 中谷明弘, 池内健

    Dementia Japan   32 ( 3 )   365   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • 脳脊髄液バイオマーカーAT(N)systemをもちいた認知症関連疾患の再考

    春日健作, 月江珠緒, 石黒敬信, 石黒敬信, 三浦健, 目崎直実, 徳武孝允, 宮下哲典, 小野寺理, 池内健

    Dementia Japan   32 ( 3 )   417   2018年9月

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    記述言語:日本語  

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  • 多数例のエクソーム解析データに基づいた新規アルツハイマー病関連遺伝子の同定

    田中 真生, 新見 淳, 石浦 浩之, 三井 純, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 辻 省次

    Dementia Japan   32 ( 3 )   449 - 449   2018年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • APOE遺伝型はAPPの遺伝子発現量に影響を及ぼすか? ヒト死後脳における検証

    村上 涼太, 朱 斌, 原 範和, 菊地 正隆, 月江 珠緒, 春日 健作, 宮下 哲典, 中谷 明弘, 赤津 裕康, 柿田 明美, 村山 繁雄, 池内 健

    Dementia Japan   32 ( 3 )   429 - 429   2018年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 筋疾患・神経疾患のジェネティクス アルツハイマー病

    原範和, 宮下哲典, 池内健

    Clinical Neuroscience   36 ( 2 )   222‐226   2018年2月

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    記述言語:日本語  

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  • 【ニューロジェネティクス新時代 次世代シークエンサーが拓く新しい世界】 筋疾患・神経疾患のジェネティクス アルツハイマー病

    原 範和, 宮下 哲典, 池内 健

    Clinical Neuroscience   36 ( 2 )   222 - 226   2018年2月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)中外医学社  

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  • 染色体高次構造を介したアルツハイマー病リスクバリアントの影響

    菊地正隆, 原範和, 長谷川舞衣, 宮下哲典, 桑野良三, 池内健, 中谷明弘

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   41st   2018年

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  • アルツハイマー病関連ノンコーディングバリアントの染色体高次構造解析

    菊地 正隆, 原 範和, 長谷川 舞衣, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 中谷 明弘

    生命科学系学会合同年次大会   2017年度   [2P - 1343]   2017年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:生命科学系学会合同年次大会運営事務局  

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  • エクソーム解析データに基づく孤発性アルツハイマー病における疾患関連遺伝子の検討

    新見 淳, 田中 真生, 石浦 浩之, 三井 純, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 辻 省次

    Dementia Japan   31 ( 4 )   612 - 612   2017年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病GWASデータを用いたポリジェニック解析

    菊地 正隆, 宮下 哲典, 池内 健, 中谷 明弘

    Dementia Japan   31 ( 4 )   570 - 570   2017年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病剖検脳を用いたRNA-seq解析

    原 範和, 宮下 哲典, 菊地 正隆, 中谷 明弘, 柿田 明美, 池内 健

    Dementia Japan   31 ( 4 )   571 - 571   2017年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • エクソーム解析データに基づくY染色体欠失の検出とアルツハイマー病との関連性の検討

    田中 真生, 石浦 浩之, 三井 純, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 辻 省次

    Dementia Japan   31 ( 4 )   612 - 612   2017年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病の遺伝学的リスク (特集 認知症の発症,病状進行,治療反応性に関与するさまざまな因子) 招待

    宮下 哲典, 原 範和, 春日 健作, 菊地 正隆, 中谷 明弘, 池内 健

    老年精神医学雑誌   28 ( 7 )   754 - 765   2017年7月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)   出版者・発行元:ワールドプランニング  

    CiNii Article

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  • 末梢血・網羅的RNA-Seq解析により示されたアルツハイマー病に特徴的な遺伝子発現変動

    原 範和, 石黒 敬信, 目崎 直実, 三浦 健, 春日 健作, 月江 珠緒, 宮下 哲典, 池内 健

    Dementia Japan   30 ( 4 )   599 - 599   2016年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 【認知症の診断と治療:最近の進歩】ゲノム解析による認知症の臨床・病態解明

    原 範和, 春日 健作, 宮下 哲典, 池内 健

    臨床精神医学   45 ( 4 )   395 - 403   2016年4月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)アークメディア  

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  • ゲノム解析による認知症の臨床・病態解明 (特集 認知症の診断と治療 : 最近の進歩)

    原 範和, 春日 健作, 宮下 哲典, 池内 健

    臨床精神医学   45 ( 4 )   395 - 403   2016年4月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:アークメディア  

    CiNii Article

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  • 日本人アルツハイマー病に関連するコピー数変異のゲノム配列中での構造と分布

    中谷 明弘, 菊地 正隆, 宮下 哲典, 原 範和, 春日 健作, 西田 奈央, 徳永 勝士, 桑野 良三, 池内 健

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   88回・38回   [2P1263] - [2P1263]   2015年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公社)日本生化学会  

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  • アルツハイマー病感受性領域が近接する染色体領域の同定

    菊地 正隆, 原 範和, 長谷川 舞衣, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 中谷 明弘

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   88回・38回   [1P1213] - [1P1213]   2015年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公社)日本生化学会  

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  • 本邦における家族性アルツハイマー病データベース(JFADdb)の構築

    春日 健作, 菊地 正隆, 徳武 孝允, 手塚 敏之, 月江 珠緒, 原 範和, 宮下 哲典, 中谷 明弘, 桑野 良三, 池内 健

    臨床神経学   55 ( Suppl. )   S424 - S424   2015年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • アルツハイマー病の血清バイオマーカーとしてのマイクロRNA解析

    原 範和, 菊地 正隆, 宮下 哲典, 初田 裕幸, 齊藤 祐子, 村山 繁雄, 春日 健作, 池内 健, 桑野 良三

    Dementia Japan   29 ( 3 )   338 - 338   2015年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病感受性領域が近接する染色体領域の同定

    菊地 正隆, 原 範和, 長谷川 舞衣, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 中谷 明弘

    Dementia Japan   29 ( 3 )   421 - 421   2015年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • DNA保存高齢者連続剖検2000例におけるアルツハイマー型老年性変化の検討

    初田 裕幸, 高尾 昌樹, 中野 雄太, 内野 彰子, 野上 茜, 隅蔵 大幸, 齊藤 祐子, 新井 冨生, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 村山 繁雄

    臨床神経学   54 ( Suppl. )   S135 - S135   2014年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • DNA保存高齢者連続剖検2000例におけるアルツハイマー型老年性変化の検討

    初田 裕幸, 高尾 昌樹, 中野 雄太, 内野 彰子, 隅蔵 大幸, 齊藤 祐子, 宮下 哲典, 桑野 良三, 池内 健, 村山 繁雄

    Dementia Japan   28 ( 4 )   519 - 519   2014年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病における生体分子間ネットワーク解析手法の提案

    菊地 正隆, 原 範和, 宮下 哲典, 初田 裕幸, 齊藤 祐子, 村山 繁雄, 池内 健, 桑野 良三

    Dementia Japan   28 ( 4 )   476 - 476   2014年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • ヒト剖検脳を用いたアルツハイマー病関連マイクロRNAの解析

    原 範和, 菊地 正隆, 宮下 哲典, 初田 裕幸, 齊藤 祐子, 村山 繁雄, 赤津 裕康, 池内 健, 桑野 良三

    Dementia Japan   28 ( 4 )   476 - 476   2014年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 本邦・家族性アルツハイマー病のデータベース(JFADdb)の構築

    春日 健作, 菊地 正隆, 徳武 孝允, 手塚 敏之, 月江 珠緒, 原 範和, 宮下 哲典, 中谷 明弘, 桑野 良三, 池内 健

    Dementia Japan   28 ( 4 )   485 - 485   2014年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 【神経症候群(第2版)-その他の神経疾患を含めて-】 変性疾患 認知症症状を主とする疾患 アルツハイマー病 家族性アルツハイマー病

    池内 健, 春日 健作, 宮下 哲典

    日本臨床   別冊 ( 神経症候群II )   7 - 11   2014年3月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)日本臨床社  

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  • 細胞特異的な染色体高次構造は遺伝子発現を調節するのか?

    菊地正隆, 長谷川舞衣, 原範和, 宮下哲典, 中谷明弘, 池内健, 桑野良三

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   37th   2P-0351 (WEB ONLY)   2014年

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    記述言語:日本語  

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  • 疾患感受性遺伝子からみたAlzheimer病の病態機序 (第1土曜特集 神経変性疾患 : 研究と診療の進歩) -- (神経変性疾患の病態機序の解明)

    宮下 哲典, 桑野 良三

    医学のあゆみ   247 ( 5 )   451 - 456   2013年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:医歯薬出版  

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  • 【神経変性疾患-研究と診療の進歩】 神経変性疾患の病態機序の解明 疾患感受性遺伝子からみたAlzheimer病の病態機序

    宮下 哲典, 桑野 良三

    医学のあゆみ   247 ( 5 )   451 - 456   2013年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:医歯薬出版(株)  

    がんの家系、糖尿病の家系、脳卒中の家系…と古くから病気は遺伝が影響するのではないかと疑われてきた。Alzheimer病(AD)も遺伝素因の関与が強く示唆され、常染色体優性遺伝形式をとる単一遺伝子病の報告に続いて孤発性ADについても多くの遺伝的感受性遺伝子が同定された。とりわけApolipoprotein E遺伝子は民族を超えて強力なリスク遺伝子である。AD関連遺伝子の解析法もこの10年間で、家系をベースとした連鎖解析、同胞対解析、細胞生物学的機能から推測した候補遺伝子アプローチ、SNPベースの大規模GWAS(Genome-wide association study)、客観的バイオマーカーの中間表現型と遺伝型解析、解析も数千を超える検体数、と大きく進化した。(著者抄録)

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  • 家族性および早発型アルツハイマー病症例におけるAPP重複変異の探索

    池内 健, 温 雅南, 針谷 康夫, 宮下 哲典, 中谷 明弘, 月江 珠緒, 春日 健作, 田中 晋, 西澤 正豊, 桑野 良三

    Dementia Japan   27 ( 4 )   487 - 487   2013年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病における体液中バイオマーカーの解析 J-ADNI研究

    月江 珠緒, 菊地 正隆, 中谷 明弘, 宮下 哲典, 池内 健, 桑野 良三, 岩坪 威, J-ADNI

    Dementia Japan   27 ( 4 )   480 - 480   2013年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 晩期発症型アルツハイマー病とTREM2の関連解析

    宮下 哲典, 温 雅楠, 初田 裕幸, 村山 繁雄, 山口 晴保, 赤津 裕康, 柿田 明美, 高橋 均, 井原 康夫, 池内 健, 桑野 良三, JGSCAD(The Japanese Genetic Study Consortium for Alzheimer's Disease)

    Dementia Japan   27 ( 4 )   483 - 483   2013年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病におけるタンパク質ドメイン間相互作用ネットワーク解析

    菊地 正隆, 宮下 哲典, 初田 裕幸, 齊藤 祐子, 村山 繁雄, 池内 健, 桑野 良三

    Dementia Japan   27 ( 4 )   485 - 485   2013年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 慢性透析患者におけるα-ガラクトシダーゼA(α-Gal)p.E66Q変異の検討

    渡辺 博文, 後藤 眞, 宮下 哲典, 桑野 良三, 丸山 弘樹, 成田 一衛

    日本腎臓学会誌   55 ( 3 )   377 - 377   2013年4月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本腎臓学会  

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  • 細胞特異的なゲノム高次構造解析法の検討

    長谷川舞衣, 原範和, 菊地正隆, 宮下哲典, 中谷明弘, 池内健, 桑野良三

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   36th   3P-0021 (WEB ONLY)   2013年

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    記述言語:日本語  

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  • AD/GD CNVdb:アルツハイマー病のコピー数変異データベース

    中谷明弘, 宮下哲典, 菊地正隆, 長谷川舞衣, 原範和, 西田奈央, 徳永勝士, 井原康夫, 池内健, 桑野良三

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   36th   1P-0913 (WEB ONLY)   2013年

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    記述言語:日本語  

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  • C-Pittsburg Compound B(PIB)集積と、病理学的アミロイドβ(Aβ)沈着の、解剖学的部位別検討 6剖検例における検討

    初田 裕幸, 石井 賢二, 高尾 昌樹, 金丸 和富, 新井 冨生, 齊藤 祐子, 宮下 哲典, 桑野 良三, 須原 哲也, 島田 斉, 篠遠 仁, 村山 繁雄

    臨床神経学   52 ( 12 )   1401 - 1401   2012年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • アルツハイマー病とSORL1の関連解析

    宮下 哲典, 温 雅楠, 月江 珠緒, 桑野 良三

    Dementia Japan   26 ( 4 )   513 - 513   2012年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 脳脊髄液中のアミロイドβ1-42、総タウ、リン酸化タウの測定 J-ADNI研究

    月江 珠緒, 宮下 哲典, 池内 健, 中谷 明弘, 桑野 良三, 岩坪 威

    Dementia Japan   26 ( 4 )   481 - 481   2012年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病のコピー数多型解析

    中谷明弘, 宮下哲典, 西田奈央, 徳永勝士, 井原康夫, 井原康夫, 桑野良三

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   35th   2012年

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  • 後部帯状回と楔前部におけるアミロイドβ沈着

    初田 裕幸, 高尾 昌樹, 伊藤 慎治, 杉山 美紀子, 新井 冨生, 沢辺 元司, 石井 賢二, 宮下 哲典, 桑野 良三, 齊藤 祐子, 村山 繁雄

    臨床神経学   51 ( 12 )   1210 - 1210   2011年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 【認知症学(上)-その解明と治療の最新知見-】 臨床編 認知症診断に用いられる検査診断学とバイオマーカー 各論 遺伝子診断とイメージング・ジェネティクス

    宮下 哲典, 桑野 良三

    日本臨床   69 ( 増刊8 認知症学(上) )   565 - 569   2011年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)日本臨床社  

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  • 脳脊髄液中のアミロイドβ、総タウ、リン酸化タウの測定 J-ADNI研究

    月江 珠緒, 宮下 哲典, 池内 健, 中谷 明弘, 桑野 良三, 岩坪 威

    Dementia Japan   25 ( 3 )   345 - 345   2011年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • アルツハイマー病脳の遺伝子発現プロファイリング

    宮下 哲典, 齊藤 祐子, 初田 裕幸, 月江 珠緒, 村山 繁雄, 井原 康夫, 中谷 明弘, 桑野 良三

    Dementia Japan   25 ( 3 )   345 - 345   2011年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 【認知症学(上)-その解明と治療の最新知見-】 基礎編 認知症関連分子生物学 各論 Apolipoprotein E遺伝子

    桑野 良三, 宮下 哲典

    日本臨床   69 ( 増刊8 認知症学(上) )   93 - 97   2011年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)日本臨床社  

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  • 【認知症学(上)-その解明と治療の最新知見-】 臨床編 認知症診断に用いられる検査診断学とバイオマーカー 検査診断学とバイオマーカー:概論

    桑野 良三, 宮下 哲典, 月江 珠緒

    日本臨床   69 ( 増刊8 認知症学(上) )   476 - 483   2011年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)日本臨床社  

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  • Genome-wide association study of late-onset Alzheimer's disease in Japanese

    Ryozo Kuwano, Akinori Miyashita, Asako Koike, Nao Nishida, Katsusi Tokunaga, Ken Yamamoto, Shoji Tsuji, Yasuo Ihara

    NEUROSCIENCE RESEARCH   71   E290 - E290   2011年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:ELSEVIER IRELAND LTD  

    DOI: 10.1016/j.neures.2011.07.1266

    Web of Science

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  • CARASILの原因遺伝子HTRA1の同定と機能解析

    原 賢寿, 志賀 篤, 福武 敏夫, 宮下 哲典, 横関 明男, 高橋 俊昭, 田村 正人, 下江 豊, 平山 幹夫, 有里 敬代, 柳川 宗平, 中野 今治, 池田 修一, 吉田 豊, 池内 健, 桑野 良三, 西澤 正豊, 辻 省次, 小野寺 理

    臨床神経学   50 ( 12 )   1075 - 1075   2010年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 健忘主体の臨床型を呈するタウ遺伝子R406W変異を伴う家族性認知症の臨床遺伝学的解析

    池内 健, 春日 健作, 宮下 哲典, 川瀬 康裕, 杉下 守弘, 桑野 良三, 西澤 正豊

    臨床神経学   50 ( 12 )   1080 - 1080   2010年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 楔前部と後部帯状回におけるアミロイドβ沈着

    初田 裕幸, 足立 正, 舟辺 さやか, 杉山 美紀子, 沢辺 元司, 石井 賢二, 宮下 哲典, 桑野 良三, 村山 繁雄

    臨床神経学   50 ( 12 )   1224 - 1224   2010年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • TDP-43の喪失により、細胞内膜系関連遺伝子のスプライシング異常が起こる(TDP-43 depletion causes aberrant splicing in the genes associated with endomembrane system)

    志賀 篤, 石原 智彦, 宮下 哲典, 横尾 麻理子, 有泉 優子, 横関 明男, 桑野 良三, 西澤 正豊, 小野寺 理

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集   83回・33回   2P - 0916   2010年12月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:(公社)日本生化学会  

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  • 認知症のイメージングゲノミクス (第1土曜特集 認知症--研究・臨床の最先端) -- (最新研究動向)

    宮下 哲典, 桑野 良三

    医学のあゆみ   235 ( 6 )   663 - 667   2010年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:医歯薬出版  

    CiNii Article

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  • 【認知症 研究・臨床の最先端】 最新研究動向 認知症のイメージングゲノミクス

    宮下 哲典, 桑野 良三

    医学のあゆみ   235 ( 6 )   663 - 667   2010年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:医歯薬出版(株)  

    精神・神経疾患の病態解析の新しい手法として核磁気共鳴画像法やポジトロン断層法などの脳画像データとゲノム配列情報を統合する&quot;イメージングゲノミクス&quot;が注目されている。高次脳機能を解剖学的・生理学的変化として客観的にとらえ、個人ゲノムの多様性と関連づけることで、発症前診断や病気の進行を評価・予測することが将来的に可能となる。イメージングゲノミクスは統合失調症で先行して研究され、Alzheimer病(AD)でも成果が出はじめている。ADの強力な感受性遺伝子であるAPOEのε4アレルは、海馬や嗅内野の萎縮、βアミロイド蛋白の脳内沈着量と相関していた。ゲノムワイドSNP解析と合わせることで、海馬灰白質の萎縮に関連する遺伝子(C20orf132、ZBP1)があらたに見出された。このように、高次精神・神経活動の中間表現型としての脳画像を個人ゲノムの多様性と関連づけるイメージングゲノミクスは、新しい臨床-ゲノム科学として確立しつつある。(著者抄録)

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  • アルツハイマー病脳組織におけるSORL1の遺伝子発現解析

    温雅楠, 宮下哲典, 月江珠緒, 齊藤祐子, 初田裕幸, 村山繁雄, 柿田明美, 高橋均, 北村信隆, 赤澤宏平, 井原康夫, 桑野良三

    Dement Jpn   24 ( 3 )   191   2010年9月

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    記述言語:日本語  

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  • アルツハイマー病脳組織におけるSORL1の遺伝子発現解析

    温 雅楠, 宮下 哲典, 月江 珠緒, 齊藤 祐子, 初田 裕幸, 村山 繁雄, 柿田 明美, 高橋 均, 北村 信隆, 赤澤 宏平, 井原 康夫, 桑野 良三

    Dementia Japan   24 ( 3 )   389 - 389   2010年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 後部帯状回と楔前部におけるアミロイドβ沈着

    初田 裕幸, 齊藤 祐子, 伊藤 慎治, 杉山 美紀子, 舟辺 さやか, 新井 冨生, 沢辺 元司, 金丸 和富, 石井 賢二, 宮下 哲典, 桑野 良三, 村山 繁雄

    Dementia Japan   24 ( 3 )   306 - 306   2010年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 脳脊髄液中のアミロイドβ、総タウ、リン酸化タウ測定条件の検討

    月江 珠緒, 宮下 哲典, 池内 健, 角田 伸人, 高橋 智, 桑野 良三

    Dementia Japan   24 ( 3 )   309 - 309   2010年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 死後脳におけるアルツハイマー病関連遺伝子の発現プロファイリング

    宮下 哲典, 齊藤 祐子, 初田 裕幸, 月江 珠緒, 村山 繁雄, 井原 康夫, 桑野 良三

    Dementia Japan   24 ( 3 )   389 - 389   2010年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • An autopsy case of familial Alzheimer&apos;s disease with an L381V substitution in the presenilin 1 gene

    T. Kosaka, Y. J. Fu, A. Ishikawa, T. Ikeuchi, A. Miyashita, R. Kuwano, A. Kakita, H. Takahashi

    BRAIN PATHOLOGY   20   17 - 17   2010年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:WILEY-BLACKWELL PUBLISHING, INC  

    Web of Science

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  • 【認知症診療マニュアル】 認知症性疾患の遺伝子と病態 認知症の遺伝子異常

    宮下 哲典, 桑野 良三

    神経内科   72 ( Suppl.6 )   40 - 45   2010年2月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(有)科学評論社  

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  • 【疾患遺伝子の探索と超高速シークエンス パーソナルゲノム時代の疾患解明と治療戦略】 ゲノム医学と医療応用の最前線 アルツハイマー病の遺伝素因

    桑野 良三, 宮下 哲典

    実験医学   27 ( 12 )   1848 - 1853   2009年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)羊土社  

    世界的にみると7秒に1人が認知症になっている。感染症や治療可能な病気を克服して高齢社会に突入した人類は、新しい病魔と向き合うことになった。認知症の大半を占めるアルツハイマー病は、ゆっくりであるが不可逆的に進行する。アルツハイマー病と気付いたときの脳病変はすでにもとに戻れない状態になっている。健康寿命を延ばすためには、脳機能が正常な段階でアルツハイマー病予備軍を探して、適切な予防対策を立てることである。個人を特徴づけるゲノム情報は、発症前診断として有効と考えられる。(著者抄録)

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  • アルツハイマー病のバイオマーカー探索 ヒト死後脳の網羅的な遺伝子発現解析による試み

    宮下 哲典, 齊藤 祐子, 初田 裕幸, 村山 繁雄, 井原 康夫, 桑野 良三

    Dementia Japan   23 ( 2 )   182 - 182   2009年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 晩期発症型アルツハイマー病とSORL1の相関解析

    温 雅楠, 宮下 哲典, 北村 信隆, 赤澤 宏平, 井原 康夫, 桑野 良三

    Dementia Japan   23 ( 2 )   182 - 182   2009年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 紀伊半島のALS/パーキンソン認知症複合におけるTRPM7遺伝子変異に関する検討

    小久保 康昌, 原 賢寿, 石浦 浩之, 福田 陽子, 宮下 哲典, 桑野 良三, 佐々木 良元, 後藤 順, 西澤 正豊, 葛原 茂樹, 辻 省次

    Dementia Japan   23 ( 2 )   217 - 217   2009年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 健忘を主体とする特異な臨床型を呈するタウ遺伝子(MAPT)R406W変異を伴う家族性認知症の臨床分子遺伝学的解析

    池内 健, 春日 健作, 宮下 哲典, 川瀬 康裕, 小野寺 理, 杉下 守弘, 桑野 良三, 西澤 正豊

    Dementia Japan   23 ( 2 )   175 - 175   2009年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 【ゲノム研究最前線 疾患ゲノム研究の現状と展望】 疾患領域別ゲノム研究 認知症

    桑野 良三, 武井 教展, 宮下 哲典

    日本臨床   67 ( 6 )   1078 - 1082   2009年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)日本臨床社  

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  • アルツハイマー病のパスウェイデータベースAlzPathwayの構築とリスク候補遺伝子の抽出

    飯島里紗, 荻島創一, 菊地正隆, 宮下哲典, 桑野良三, 田中博

    日本分子生物学会年会講演要旨集   32nd ( Vol.3 )   56   2009年

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    記述言語:日本語  

    J-GLOBAL

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  • APOEを含む200kb領域の全SNPsを用いた相関解析および連鎖不平衡解析

    武井 教展, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   122 ( 12 )   690 - 690   2008年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 2 APOEを含む200kb 領域の全SNPsを用いた相関解析および連鎖不平衡解析(I.一般演題,第8回新潟ゲノム医学研究会)

    武井 教展, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   122 ( 12 )   690 - 690   2008年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 死後脳を用いた晩期発症型アルツハイマー病の網羅的遺伝子発現解析

    宮下 哲典, 斉藤 佑子, 柿田 明美, 荻島 創一, 田中 博, 村山 繁雄, 高橋 均, 井原 康夫, 桑野 良三

    Dementia Japan   22 ( 2 )   176 - 176   2008年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 【認知症のゲノミクス】 認知症の関連解析

    宮下 哲典, 桑野 良三

    Cognition and Dementia   7 ( 3 )   215 - 222   2008年7月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)メディカルレビュー社  

    認知症も多くの疾患と同じくゲノム情報を基盤に、生体内あるいは外部の環境要因が加わって生理機能に破綻をきたして発症すると考えられている。認知症は少数の若年発症の家族性単一遺伝病と大多数を占める孤発性認知症が知られている。65歳以上の高齢者では7〜10%がアルツハイマー病(AD)に罹患している。全ゲノム上のSNP位置、連鎖不平衡ブロックなどの公開データベースの充実、高密度SNPを搭載したSNPタイピングが可能となり、大規模相関解析が精度高く実施できる環境が整った。AD危険因子探索研究は、全ゲノムタイピングによる網羅的解析の激しい国際競争の「うねり」の中にある。候補遺伝子アプローチならびに染色体ワイドおよびゲノムワイド相関解析から新しいリスク遺伝子が同定されている。(著者抄録)

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  • アルツハイマー病の性差依存的なリスク遺伝子

    宮下 哲典, 桑野 良三

    治療   90 ( 4 )   1582 - 1585   2008年4月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:南山堂  

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  • 染色体10qにおけるアルツハイマー病のリスク遺伝子相互作用解析

    宮下 哲典, 朝倉 まどか, 郷野 辰行, 武井 教展, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   122 ( 2 )   116 - 116   2008年2月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 1 染色体10qにおけるアルツハイマー病のリスク遺伝子相互作用解析(I.一般演題,第7回新潟ゲノム医学研究会)

    宮下 哲典, 朝倉 まどか, 郷野 辰行, 武井 教展, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   122 ( 2 )   2008年2月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 6. マイクロサテライトマーカーを用いたFS・GEFS+・SMEIにおける新規責任遺伝子の網羅的検索(第1報)(一般演題,第1回日本てんかん学会東北地方会)

    吉田 秀一, 桑野 良三, 宮下 哲典, 小島 俊男, 佐々木 智美, 朱 剛, 金井 数明, 伊藤 正利, 藤田 浩史, 廣瀬 伸一, 兼子 直, てんかん, 熱性けいれん遺伝子解析グループ

    てんかん研究   25 ( 4 )   480 - 481   2008年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本てんかん学会  

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  • 【アルツハイマー病 基礎研究から予防・治療の新しいパラダイム】 基礎編 アルツハイマー病の病理・病態 アルツハイマー病の危険因子 関連遺伝子の探索 候補遺伝子アプローチ

    月江 珠緒, 宮下 哲典, 桑野 良三

    日本臨床   66 ( 増刊1 アルツハイマー病 )   163 - 168   2008年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)日本臨床社  

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  • アルツハイマー病の危険因子 関連遺伝子の探索--候補遺伝子アプローチ (アルツハイマー病--基礎研究から予防・治療の新しいパラダイム) -- (アルツハイマー病の病理・病態)

    月江 珠緒, 宮下 哲典, 桑野 良三

    日本臨床   66 ( 0 )   163 - 168   2008年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本臨床社  

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  • マイクロサテライトマーカーを用いたFS・GEFS+・SMEIにおける新規責任遺伝子の網羅的検索(第1報)

    吉田 秀一, 桑野 良三, 宮下 哲典, 小島 俊男, 佐々木 智美, 朱 剛, 金井 数明, 伊藤 正利, 藤田 浩史, 廣瀬 伸一, 兼子 直

    てんかん研究   25 ( 4 )   480 - 481   2008年1月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本てんかん学会  

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  • アルツハイマー病1500例におけるNeprilysinの多型解析

    後藤 順, 岸野 敦志, 高橋 祐二, 宮下 哲典, 桑野 良三, 辻 省次

    臨床神経学   47 ( 12 )   1158 - 1158   2007年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 西太平洋地域の筋萎縮性側索硬化症/パーキンソン痴呆複合(ALS/PDC)と関連神経変性疾患 紀伊ALS/PDCの分子遺伝学的解析

    原 賢寿, 桑野 良三, 宮下 哲典, 小久保 康昌, 佐々木 良元, 中原 康雄, 後藤 順, 西澤 正豊, 葛原 茂樹, 辻 省次

    臨床神経学   47 ( 11 )   974 - 976   2007年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • O2-13 マイクロサテライトマーカーを用いたFS・GEFS+・SMEIにおける新規責任遺伝子の網羅的探索(遺伝1,一般演題(口演),てんかん制圧:新たなステージに向けて,第41回日本てんかん学会)

    吉田 秀一, 桑野 良三, 宮下 哲典, 小島 俊男, 佐々木 智美, 朱 剛, 金井 数明, 伊藤 正利, 藤田 浩史, 小国 弘量, 廣瀬 伸一, 兼子 直, てんかん遺伝子解析グループ

    てんかん研究   25 ( 3 )   2007年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本てんかん学会  

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  • マイクロサテライトマーカーを用いたFS・GEFS+・SMEIにおける新規責任遺伝子の網羅的探索

    吉田 秀一, 桑野 良三, 宮下 哲典, 小島 俊男, 佐々木 智美, 朱 剛, 金井 数明, 伊藤 正利, 藤田 浩史, 小国 弘量, 廣瀬 伸一, 兼子 直

    てんかん研究   25 ( 3 )   293 - 293   2007年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本てんかん学会  

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  • 3 アルツハイマー病の疾患感受性遺伝子探索 : 染色体10番長腕での試み(第6回新潟ゲノム医学研究会)

    宮下 哲典, 月江 珠緒, 菅井 貴裕, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   121 ( 6 )   2007年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • ロシアのヤクーツク地方に多発する劣性遺伝性小人症のゲノムワイド連鎖解析と原因遺伝子同定

    原 賢寿, Maximova Nadya R, 宮下 哲典, 桑野 良三, 西澤 正豊, 小野寺 理

    新潟医学会雑誌   121 ( 6 )   362 - 362   2007年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 6 ロシアのヤクーツク地方に多発する劣性遺伝性小人症のゲノムワイド連鎖解析と原因遺伝子同定(第6回新潟ゲノム医学研究会)

    原 賢寿, Maximova Nadya R, 宮下 哲典, 桑野 良三, 西澤 正豊, 小野寺 理

    新潟医学会雑誌   121 ( 6 )   2007年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • アルツハイマー病の疾患感受性遺伝子探索 染色体10番長腕での試み

    宮下 哲典, 月江 珠緒, 菅井 貴裕, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   121 ( 6 )   361 - 361   2007年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 第8番染色体長腕に連鎖する成人発症良性遺伝性舞踏病

    原 賢寿, 下畑 享良, 三瓶 一弘, 河内 泉, 金澤 雅人, 春日 健作, 宮下 哲典, 桑野 良三, 辻 省次, 小野寺 理, 西澤 正豊, 本間 義章

    臨床神経学   46 ( 12 )   1119 - 1119   2006年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 【アルツハイマー病のdisease-modifying therapyをめぐって】 Genetic riskとpatient selection

    桑野 良三, 宮下 哲典

    Cognition and Dementia   5 ( 4 )   307 - 315   2006年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)メディカルレビュー社  

    認知症の最も大きなリスクファクターは加齢である。長生きと引き換えに人類は新しい難病と向き合うこととなった。世界が高齢化に向かう現在、高齢社会にある日本は先導的に研究が行えるし、行う必要がある。認知症の3分の2を占めるアルツハイマー病の病因解明の糸口の1つに、遺伝的危険因子の同定がある。とりわけ全ゲノムをスクリーニングして新しいリスク遺伝子を発見することは、これまでに予想しなかった発病・進行に関わる分子に遭遇することが期待される。遺伝子型解析に際して、最も重要なことは、疾患と正常とを明確に区別することである。両親から受け継いだゲノム構造は、基本的には生まれてから死ぬまで普遍であるので、地域、性別、年齢、教育、治療、介入、食事、ライフスタイルなどの環境が発病や病型に修飾を与えている点に注意を払って、遺伝的危険因子の解析に取り組む必要がある。(著者抄録)

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  • 遺伝性Lewy小体病を表現型としたpresenilin-1変異(ΔT440)によるin vivoおよびin vitroにおけるα-synuclein蓄積の検討

    金子 博之, 池内 健, 石川 厚, 柿田 明美, 宮下 哲典, 桑野 良三, 伊藤 弦太, 岩坪 威, 高橋 均, 西澤 正豊, 小野寺 理

    Dementia Japan   20 ( 2 )   168 - 168   2006年8月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本認知症学会  

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  • 【アルツハイマー病診断・治療の新しい展開】 病理過程の新しい理解 アルツハイマー病のリスク遺伝子

    宮下 哲典, 桑野 良三

    Pharma Medica   24 ( 7 )   13 - 17   2006年7月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)メディカルレビュー社  

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  • アルツハイマー病の分子遺伝学 (ゲノムから生命システムへ) -- (ゲノムから医学)

    宮下 哲典, 桑野 良三

    蛋白質核酸酵素   50 ( 16 )   2122 - 2127   2005年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:共立出版  

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  • 【ゲノムから生命システムへ】 ゲノムから医学 アルツハイマー病の分子遺伝学

    宮下 哲典, 桑野 良三

    蛋白質・核酸・酵素   50 ( 16 )   2122 - 2127   2005年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:共立出版(株)  

    アルツハイマー病は,家族性と孤発性に分けられる.常染色体優性遺伝形式をとる家族性の早期発症型アルツハイマー病の遺伝解析が行なわれ,3つの原因遺伝子APP,PSEN1,PSEN2が同定された.孤発性のアルツハイマー病に関しては,染色体19q13のapolipoprotein E(APOE)が民族をこえた遺伝的危険因子として唯一認められている.しかし,APOEで説明がつくのは全体の30%以下であるので,そのほかに危険因子の存在が示唆されている.一方,モデルマウスを用いてゲノムをベースに環境因子関連の研究が進んでいる(著者抄録)

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  • PS1遺伝子変異によりレビー小体型痴呆と変異型アルツハイマー病を合併した1家系

    石川 厚, 朴 月善, 宮下 哲典, 桑野 良三, 小野寺 理, 西澤 正豊, 高橋 均

    臨床神経学   45 ( 12 )   1097 - 1097   2005年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 禿頭と変形性脊椎症を伴う劣性遺伝性白質脳症(CARASIL)の連鎖解析

    原 賢寿, 小野寺 理, 宮下 哲典, 福武 敏夫, 宮野 悟, 塩田 宏嗣, 田村 正人, 藤野 泰祐, 下江 豊, 平山 幹生, 有里 敬代, 柳川 宗平, 桑野 良三, 西澤 正豊, 辻 省次

    臨床神経学   45 ( 12 )   1147 - 1147   2005年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 4 アルツハイマー病の疾患感受性遺伝子探索(I.一般演題,第5回新潟ゲノム医学研究会)

    宮下 哲典, 武井 教展, 月江 珠緒, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   119 ( 11 )   2005年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 3 禿頭と変形性脊椎症を伴う劣性遺伝性白質脳症(CARASIL)の連鎖解析(I.一般演題,第5回新潟ゲノム医学研究会)

    原 賢寿, 小野寺 理, 宮下 哲典, 福武 敏夫, 宮野 悟, 塩田 宏嗣, 田村 正人, 藤野 泰祐, 下江 豊, 平山 幹生, 有里 敬代, 柳川 宗平, 桑野 良三, 西澤 正豊, 辻 省次

    新潟医学会雑誌   119 ( 11 )   2005年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 禿頭と変形性脊椎症を伴う劣性遺伝性白質脳症(CARASIL)の連鎖解析

    原 賢寿, 小野寺 理, 宮下 哲典, 福武 敏夫, 宮野 悟, 塩田 宏嗣, 田村 正人, 藤野 泰祐, 下江 豊, 平山 幹生, 有里 敬代, 柳川 宗平, 桑野 良三, 西澤 正豊, 辻 省次

    新潟医学会雑誌   119 ( 11 )   695 - 695   2005年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • アルツハイマー病の疾患感受性遺伝子探索

    宮下 哲典, 武井 教展, 月江 珠緒, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   119 ( 11 )   695 - 695   2005年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 単一遺伝子病とゲノム--テーマ1 脳神経変性疾患(1)アルツハイマー病

    宮下 哲典, 桑野 良三

    ゲノム医学   5 ( 2 )   197 - 203   2005年4月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:メディカルレビュー社  

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  • 単一遺伝子病とゲノム 脳神経変性疾患 1.アルツハイマー病

    宮下 哲典, 桑野 良三

    ゲノム医学   5 ( 2 )   197 - 203   2005年4月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)メディカルレビュー社  

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  • CARASIL, autosomal recessive vascular dementia with alopecia and spondylosis deformans maps to chromosome 10q

    K Hara, O Onodera, T Fukutake, S Miyano, H Shioda, Y Fujino, Y Shimoe, M Hirayama, T Arisato, S Yanagawa, S Ikeda, A Miyashita, R Kuwano, M Nishizawa, S Tsuji

    ANNALS OF NEUROLOGY   58   S57 - S57   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:WILEY-LISS  

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  • 3 IgA腎症における第6染色体上一塩基多型の解析(第4回新潟ゲノム医学研究会)

    佐藤 文則, 近藤 大介, 成田 一衛, 後藤 眞, 小川 麻, 齋藤 徳子, 坂爪 実, 宮下 哲典, 桑野 良三, 下条 文武

    新潟医学会雑誌   118 ( 12 )   2004年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • IgA腎症における第6染色体上一塩基多型の解析

    佐藤 文則, 近藤 大介, 成田 一衛, 後藤 眞, 小川 麻, 齋藤 徳子, 坂爪 実, 宮下 哲典, 桑野 良三, 下条 文武

    新潟医学会雑誌   118 ( 12 )   713 - 713   2004年12月

  • 家族性多系統萎縮症のnon-parametric連鎖解析

    原 賢寿, 小野寺 理, 西澤 正豊, 宮下 哲典, 桑野 良三, 山田 光則, 高橋 均, 登木口 進, 平澤 基之, 水野 美邦, 後藤 順, 辻 省次

    臨床神経学   44 ( 12 )   1193 - 1193   2004年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • Japanese SCA families with an unusual phenotype linked to a locus overlapping with SCA15 locus

    K Hara, T Fukushima, T Suzuki, T Shimohata, M Oyake, H Ishiguro, K Hirota, A Miyashita, R Kuwano, H Kurisaki, H Yomono, J Goto, Kanazawa, I, S Tsuji

    NEUROLOGY   62 ( 4 )   648 - 651   2004年2月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS  

    The authors identified two Japanese spinocerebellar ataxia (SCA) families characterized by postural and action tremor and a very slow progression rate. A genome-wide linkage analysis revealed linkage to chromosome 3p26.1-25.3 with the highest multipoint lod score at D3S3728 (Zmax=3.31 at theta=0.00). The candidate region was 14.7. cM flanked by D3S1620 and D3S3691, which was partly overlapping with the locus of SCA15 characterized by pure cerebellar ataxia. Despite the difference in phenotypes, there remains a possibility that the causative gene for these Japanese SCA is allelic to SCA15.

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  • 孤発性ALSの疾患感受性遺伝子同定のための全ゲノム領域を対象とした関連解析

    福島 隆男, 中野 亮一, 菊川 公紀, 犬塚 貴, 宮下 哲典, 桑野 良三, 辻 省次

    臨床神経学   43 ( 12 )   1084 - 1084   2003年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 家族性多系統萎縮症の臨床像と連鎖解析

    原 賢寿, 宮下 哲典, 桑野 良三, 柿田 明美, 高橋 均, 登木口 進, 平澤 基之, 水野 美邦, 後藤 順, 辻 省次

    臨床神経学   43 ( 12 )   933 - 933   2003年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 5 晩発性アルツハイマー型痴呆症の疾患感受性遺伝子(座)同定へ向けて : マイクロサテライトマーカーを用いた試み(I.一般演題,第3回新潟ゲノム医学研究会)

    宮下 哲典, 武井 教典, 月江 珠緒, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   117 ( 10 )   602 - 603   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 2 IgA腎症における第6染色体上一塩基置換多型の解析(I.一般演題,第3回新潟ゲノム医学研究会)

    近藤 大介, 佐藤 文則, 滝口 純, 宮下 哲典, 後藤 真, 成田 一衛, 桑野 良三, 下条 文武

    新潟医学会雑誌   117 ( 10 )   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 4 多系統萎縮症(MSA)の疾患遺伝子同定へのアプローチ(I.一般演題,第3回新潟ゲノム医学研究会)

    原 賢寿, 福島 隆男, 下畑 光輝, 寺島 健史, 宮下 哲典, 桑野 良三, 柿田 明美, 高橋 均, 若林 孝一, 登木口 進, 平澤 基之, 水野 美邦, 後藤 順, 辻 省次

    新潟医学会雑誌   117 ( 10 )   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • マイクロサテライト解析による病因遺伝子の網羅的探索 (特集 アルツハイマー病へのゲノムからのアプローチ)

    桑野 良三, 宮下 哲典

    ゲノム医学   3 ( 5 )   523 - 528   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:メディカルレビュー社  

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  • 【アルツハイマー病へのゲノムからのアプローチ】 マイクロサテライト解析による病因遺伝子の網羅的探索

    桑野 良三, 宮下 哲典

    ゲノム医学   3 ( 5 )   523 - 528   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)メディカルレビュー社  

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  • 晩発性アルツハイマー型痴呆症の疾患感受性遺伝子(座)同定へ向けて マイクロサテライトマーカーを用いた試み

    宮下 哲典, 武井 教典, 月江 珠緒, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   117 ( 10 )   602 - 603   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • IgA腎症における第6染色体上一塩基置換多型の解析

    近藤 大介, 佐藤 文則, 滝口 純, 宮下 哲典, 後藤 真, 成田 一衛, 桑野 良三, 下条 文武

    新潟医学会雑誌   117 ( 10 )   601 - 601   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 多系統萎縮症(MSA)の疾患遺伝子同定へのアプローチ

    原 賢寿, 福島 隆男, 下畑 光輝, 寺島 健史, 宮下 哲典, 桑野 良三, 柿田 明美, 高橋 均, 若林 孝一, 登木口 進, 平澤 基之, 水野 美邦, 後藤 順, 辻 省次

    新潟医学会雑誌   117 ( 10 )   602 - 602   2003年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 神経疾患の分子機構の解明と治療法開発に関する研究 ゲノム多型解析を基盤とする疾患感受性遺伝子の探索と同定

    桑野 良三, 宮下 哲典, 福島 隆男, 中野 亮一, 辻 省次

    厚生労働省精神・神経疾患研究委託費研究報告集   平成14年度   548 - 548   2003年6月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:国立精神・神経センター  

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  • 孤発性ALSの全ゲノム領域を対象とした関連解析

    福島 隆男, 中野 亮一, 辻 省次, 菊川 公紀, 犬塚 貴, 宮下 哲典, 桑野 良三

    臨床神経学   42 ( 12 )   1403 - 1403   2002年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(一社)日本神経学会  

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  • 8 染色体6q22-23領域におけるIgA腎症の疾患関連遺伝子の同定(第2回新潟ゲノム医学研究会)

    後藤 眞, 成田 一衛, 大森 健太郎, 宋 進, 坂爪 実, 斎藤 徳子, 上野 光博, 西 慎一, 下条 文武, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 9 孤発性ALSの全ゲノム領域を対象とした関連解析(第2回新潟ゲノム医学研究会)

    福島 隆男, 中野 亮一, 辻 省次, 菊川 公紀, 犬塚 貴, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   571 - 572   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 11 これからの大規模連鎖解析 : 遺伝性脊髄小脳変性症の新しい遺伝子座の同定(第2回新潟ゲノム医学研究会)

    原 賢寿, 福島 隆男, 下畑 亨良, 小宅 睦郎, 辻 省次, 廣田 紘一, 宮下 哲典, 桑野 良三, 栗崎 博司, 後藤 順, 金澤 一郎

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • 2 増幅によるゲノムDNAの不死化(第2回新潟ゲノム医学研究会)

    武井 教展, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟大学  

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  • これからの大規模連鎖解析 遺伝性脊髄小脳変性症の新しい遺伝子座の同定

    原 賢寿, 福島 隆男, 下畑 亨良, 小宅 睦郎, 辻 省次, 廣田 紘一, 宮下 哲典, 桑野 良三, 栗崎 博司, 後藤 順, 金澤 一郎

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   572 - 572   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 増幅によるゲノムDNAの不死化

    武井 教展, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   569 - 569   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 染色体6p22-23領域におけるIgA腎症の疾患関連遺伝子の同定

    後藤 眞, 成田 一衛, 大森 健太郎, 宋 進, 坂爪 実, 斎藤 徳子, 上野 光博, 西 慎一, 下条 文武, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   571 - 571   2002年11月

  • 孤発性ALSの全ゲノム領域を対象とした関連解析

    福島 隆男, 中野 亮一, 辻 省次, 菊川 公紀, 犬塚 貴, 宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   116 ( 11 )   571 - 572   2002年11月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • A genome-wide association study of sporadic amyotrophic lateral sclerosis in Japan.

    T Fukushima, R Nakano, K Kikugawa, T Inuzuka, A Miyashita, R Kuwano, S Tsuji

    AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS   71 ( 4 )   468 - 468   2002年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:UNIV CHICAGO PRESS  

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  • 脳のゲノム・遺伝子研究の最先端 マイクロサテライト(dinucleotide repeat)の検出法とその応用例

    桑野 良三, 宮下 哲典

    Clinical Neuroscience   20 ( 5 )   502 - 503   2002年5月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(株)中外医学社  

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  • A novel autosomal dominant cerebellar ataxia linked to choromosome 3p26

    K Hara, T Fukusihima, T Shimohata, M Oyake, H Ishiguro, K Hirota, A Miyashita, R Kuwano, H Kurisaki, J Gotoh, Kanazawa, I, S Tsuji

    NEUROLOGY   58 ( 7 )   A35 - A35   2002年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:LIPPINCOTT WILLIAMS & WILKINS  

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  • 10)疾患遺伝子のゲノム網羅的解析の立ち上げ(一般演題, 新潟ゲノム医学研究会)

    宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   115 ( 10 )   546 - 547   2001年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • 疾患遺伝子のゲノム網羅的解析の立ち上げ

    宮下 哲典, 桑野 良三

    新潟医学会雑誌   115 ( 10 )   546 - 547   2001年10月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:新潟医学会  

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  • ジーントラップ系統マウスGT3-11のトラップ遺伝子と表現型について

    宮下 哲典, 清水 信子, 遠藤 直哉, 羽入 貴子, 石井 直也, 小谷 昌司, 桑野 良三

    日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   21   1998年12月

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    記述言語:日本語  

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  • ジーントラッピング法で同定されたAnkhzn遺伝子の解析

    石井 直也, 伊藤 一寿, 栗山 英之, 富永 桂, 宮下 哲典, 丸山 裕, 内藤 真, 渡辺 勇一, 桑野 良三

    日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   21   1998年12月

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    記述言語:日本語  

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  • ジーントラップ法で得られた新規蛋白Ankhznの細胞内存在様式

    富永 桂, 栗山 英之, 石井 直也, 伊藤 一寿, 宮下 哲典, 小谷 昌司, 桑野 良三

    日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   21   1998年12月

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    記述言語:日本語  

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  • ジーントラップ系統マウスGT3-11におけるmacrosialin遺伝子の発現, 機能解析

    清水 信子, 宮下 哲典, 内藤 真, 大森 斉, 森 將晏, 中島 民雄, 桑野 良三

    日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   21   1998年12月

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    記述言語:日本語  

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  • ジーントラップ法で得られたGT3-11,12系統マウスの解析

    宮下 哲典, 伊藤 康宏, 桑野 良三

    神経化学   35 ( 3 )   690 - 691   1996年9月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本神経化学会  

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  • ジーントラップ法で得られたGT3-12系統マウスの解析

    斉藤 宏, 宮下 哲典, 白井 学, 伊藤 一寿, 羽入 貴子, 伊藤 康宏, 石井 直也, 里方 一郎, 小谷 昌司, 桑野 良三

    日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   19   1996年8月

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    記述言語:日本語  

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  • ジーントラップ法で得られたGT3-11系統マウスの解析

    宮下 哲典, 白井 学, 斉藤 宏, 伊藤 一寿, 羽入 貴子, 伊藤 康宏, 石井 直也, 里方 一郎, 小谷 昌司, 桑野 良三

    日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集   19   1996年8月

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    記述言語:日本語  

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  • ジーントラップ法で得られたGT3-11系統マウスの解析

    宮下 哲典

    生化学   68 ( 7 )   702 - 702   1996年7月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公社)日本生化学会  

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  • A gene trap strategy for identifying the gene expressed in the embryonic nervous system

    M Shirai, A Miyashita, N Ishii, Y Itoh, Satokata, I, YG Watanabe, R Kuwano

    ZOOLOGICAL SCIENCE   13 ( 2 )   277 - 283   1996年4月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:ZOOLOGICAL SOC JAPAN  

    An efficient gene trap strategy was devised for identifying the genes that are expressed in the mouse developing nervous system. Mouse embryonic stem (ES) cell lines that carried independent integrations of a gene trap vector, pSneolNlacZA, were allowed to differentiate in a suspension culture system. To select cells containing neurons, astrocytes or neuron-glia precursors, cell lines were immunohistochemically examined with antibodies against neuron-specific proteins (neurofilament protein 150 kD and microtubule associated protein 2), glial fibrillary acidic protein or nestin. Three cell clones (GT3-8, 11 and 12) were immunoreactive to either of the antibodies employed and at the same time positive for beta-galactosidase activity. When chimeric embryos were generated by the use of the above 3 cell lines, some cells in their nervous system showed X-gal staining. Thus the major advantage of the present gene trap method lies in its prescreening step of manipulated ES cells prior to generation of chimeric animals. This method holds promise as a useful tool for investigating the genes involved in the development of the nervous system.

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  • CONSTRUCTION OF THE GENE TRAP VECTOR FOR GENETIC-ANALYSIS OF DEVELOPING BRAIN

    M SHIRAI, Y ITOH, A MIYASHITA, SATOKATA, I, YG WATANABE, R KUWANO

    JOURNAL OF NEUROCHEMISTRY   65   S99 - S99   1995年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:LIPPINCOTT-RAVEN PUBL  

    Web of Science

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共同研究・競争的資金等の研究

  • APOEのミスセンスレアバリアント解析:脂質代謝とアルツハイマー病の関連を探る

    研究課題/領域番号:21K07271  2021年4月 - 2024年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    宮下 哲典

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    配分額:4030000円 ( 直接経費:3100000円 、 間接経費:930000円 )

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  • 網羅的ゲノム解析とインフォマティクス統合解析による認知症の新規病態解析

    2019年4月 - 2022年3月

    国立研究開発法人日本医療研究開発機構  日本医療研究開発機構研究費:認知症研究開発事業(一次公募) 

    池内 健

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    資金種別:競争的資金

    配分額:312000000円 ( 直接経費:105000000円 、 間接経費:31500000円 )

    研究分担者(研究分野・主:ゲノム生物学)

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  • 剖検脳・罹患組織を用いたマルチオミックス解析による神経変性タウオパチーの病態解明と創薬標的の同定

    2018年4月 - 2021年3月

    国立研究開発法人日本医療研究開発機構  日本医療研究開発機構研究費:難治性疾患等実用化研究事業・難治性疾患実用化研究事業 

    池内 健

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    資金種別:競争的資金

    配分額:92040000円 ( 直接経費:70800000円 、 間接経費:21240000円 )

    研究分担者(研究分野・主:神経内科学)

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  • 血液バイオマーカーを用いた認知症と精神・神経疾患の簡易鑑別診断システムの構築

    2017年4月 - 2020年3月

    国立研究開発法人日本医療研究開発機構  日本医療研究開発機構研究費:認知症研究開発事業(一次公募) 

    池内 健

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    資金種別:競争的資金

    配分額:55000000円 ( 直接経費:42350000円 、 間接経費:12650000円 )

    研究協力者(研究分野・主:神経内科学、研究分野・副:精神神経科学)

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  • アルツハイマー病脳で生じるインスリン抵抗性に関する実証的研究

    研究課題/領域番号:15H04839  2015年4月 - 2018年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    池内 健, 徳武 孝允, 豊島 靖子, 春日 健作, 里 直行, 手塚 敏行, 斎藤 健智, 宮下 哲典, 原 範和, 月江 珠緒

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    資金種別:競争的資金

    配分額:17550000円 ( 直接経費:13500000円 、 間接経費:4050000円 )

    2型糖尿病がアルツハイマー病の発症に関与することが多くの疫学研究で示されている。しかし,その詳細な分子機序は不明である。研究代表者らは,培養細胞アッセイ系を用いた解析により,中枢神経におけるインスリン抵抗性がアルツハイマー病の病態に関与することを示唆する知見を蓄積してきた。本研究課題では,ヒト剖検脳を用いた網羅的な遺伝子発現解析を行い,生体内で生じるインスリンシグナル伝達ネットワークの破綻を実証することを試みた。アルツハイマー病脳では,インスリンシグナル関連分子群の遺伝子発現が有意に変動しており,中枢神経におけるインスリン抵抗性の関与について実証することができた。

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  • アルツハイマー病に特徴的な病巣が脳内に伝搬する分子機序の解明

    研究課題/領域番号:26640122  2014年4月 - 2016年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究  挑戦的萌芽研究

    桑野 良三, 宮下 哲典, 中谷 明弘

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    資金種別:競争的資金

    配分額:3900000円 ( 直接経費:3000000円 、 間接経費:900000円 )

    アルツハイマー病(AD)は病理組織学的に不可逆に進行する脳の変性疾患である。その病巣の進行は、脳全体に沈着するアミロイド斑(SP)と解剖学的に連続した脳部位が侵されていく神経原線維変化(NFT)の2大特徴がある。剖検時にSP とNFTの程度と拡がりによって病理学的にBraak分類された(SP;0, A, B, C, および NFT: 0, I, II, III, IV, V, VI)脳の3箇所(嗅内皮質、側頭葉、前頭葉)からRNAを抽出して解析した。AD病巣の伝搬に関する分子としてexosome由来のmiRNAに注目して、脳部位別にBraak分類に伴って発現変動を見い出した。

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  • アルツハイマー病のゲノム解析に向けた日本人のコピー数多型データベース

    研究課題/領域番号:25430181  2013年4月 - 2016年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    中谷 明弘, 桑野 良三, 宮下 哲典

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    資金種別:競争的資金

    配分額:5460000円 ( 直接経費:4200000円 、 間接経費:1260000円 )

    アルツハイマー病(AD)患者を含む2,000名以上の日本人検体群のコピー数変異(CNV)のデータベース(AD/GD CNVdb)を構築した。非発症検体群(約1,000名)に加えて、2つの発症群である早期発症群(EOAD, 約300名)と晩期発症群(LOAD, 約1,000名)が含まれる。アフィメトリクス社製マイクロアレイ(SNP 6.0)の約180万箇所のマーカを用いて3つの検体群でのCNV頻度を評価し、検体群内で閾値以上のCNV頻度のマーカが連続している領域を抽出した。得られたCNV領域を発症群と非発症群との間で比較を行ったところ、発症群においてCNVが拡がっていることを示唆する結果を得た。

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  • アルツハイマー病の発症と進行を説明する脳内ターゲット分子の探索

    研究課題/領域番号:24310144  2012年4月 - 2015年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    桑野 良三, 池内 健, 宮下 哲典, 中谷 明弘

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    資金種別:競争的資金

    配分額:21060000円 ( 直接経費:16200000円 、 間接経費:4860000円 )

    アルツハイマー病脳の2大特徴である老人斑と神経原線維変化を指標にして分類された71人の凍結脳(嗅内野、側頭葉、前頭葉)の213箇所からRNAを抽出した。 エクソンアレイ法によるmRNA半定量、次世代シークエンサーによる非翻訳RNA解析を行い、健康脳から病巣の進展に伴って変動する8種類のmRNAおよび5種類の非翻訳RNAを同定した。リスクSNPがイントロンや遺伝子の外にあることを理解するために、SK-N-SHならびにU-251を用いて、染色体上離れた遺伝子間相互作用を検出するゲノム高次構造解析のTethered Conformation Capture法の基盤技術を確立した。

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  • 末梢血におけるアルツハイマー病脳関連遺伝子のエピジェネティック・遺伝子発現解析

    研究課題/領域番号:24510275  2012年4月 - 2014年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    宮下 哲典, 池内 健

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:5460000円 ( 直接経費:4200000円 、 間接経費:1260000円 )

    ヒト脳疾患の進展を末梢血のエピゲノムやトランスクリプトームの変化として捉えられるか?本研究プロジェクトではアルツハイマ ー病(AD)の抹消血に着目し、特定遺伝子のエピジェネティックな変化と遺伝子発現の変動を調べることを目的とする。これまでに行ったヒト死後脳の遺伝子発現データを用いて、ADに特徴的な脳病変である「神経原線維変化(NFT)」の進展と関連する遺伝子群を同定する。その中から遺伝子を選抜し、DNAのシトシンメチル化レベル(5-mC)と遺伝子発現レベルを解析する。ADの進行が末梢血の変化に反映されていれば、侵襲度の低いバイオマーカーとしての可能性が期待でき、研究の更なる展開につながると考えられる 。
    平成25年度はヒト死後脳(村山繁雄博士提供)の嗅内野、側頭葉、前頭葉に由来する全RNAを用いたエクソンアレイデータ(Affymetrix社)から、NFTの進展(Braak NFTステージ分類)と関連するNFT関連遺伝子を同定し論文化した(印刷中)。一部のNFT関連遺伝子についてはTaqMan法による定量的リア ルタイムPCR(qPCR)によって再現性を確認した。各遺伝子の機能や末梢血での発現量をデータベースで検索し、精査した 上でさらに遺伝子を絞り込み、本研究プロジェクトの解析対象遺伝子として限定した(宮下・中谷・桑野・池内)。臨床被検体のリクルート は新潟大学病院の物忘れ外来で実施し、採血はインフォームド・コンセントを経て行った(池内)。その際、統計解析に必要な臨床情報(認知機能テスト情報など)も合わせて取得した(池内)。血液から全RNAを抽出し、qPCRによって遺伝子発現量を定量した(宮下)。NFT関連遺伝子として同定された遺伝子は末梢血で発現しているのか?脳と末梢血の間で遺伝子発現量に相関はあるか?また、エピジェネティックな変化はどうか?などが今後の解析課題である。

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  • 疾患感受性領域の検出に特化した核内染色体空間配置決定法の開発

    研究課題/領域番号:24651221  2012年4月 - 2014年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究  挑戦的萌芽研究

    長谷川 舞衣, 桑野 良三, 中谷 明弘, 宮下 哲典

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    資金種別:競争的資金

    配分額:4030000円 ( 直接経費:3100000円 、 間接経費:930000円 )

    ゲノムワイド関連解析(GWAS)で見いだされる疾患感受性の一塩基多型(SNP)のうち、非コード領域に位置するものについては、疾患への関与機序が不明なものが多い。本研究では、これらのSNP 周辺の配列が、ゲノム配列上離れて位置する遺伝子の調節配列である可能性に着目し、ポストGWAS解析に特化した核内ゲノムDNA の高次構造解析法の開発を行った。ゲノムワイドな高次構造解析法であるtethered conformation capture (TCC)とビオチン化RNA プローブを用いた疾患感受性SNP 周辺配列のプルダウンを併用することで、空間的に近接する部位の効率的な検出が可能であることを示した。

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  • パーソナルゲノムの高次構造に基づくアルツハイマー病発症病態の解析

    研究課題/領域番号:22129004  2010年4月 - 2015年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 新学術領域研究(研究領域提案型)  新学術領域研究(研究領域提案型)

    桑野 良三, 柿田 明美, 宮下 哲典

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    資金種別:競争的資金

    配分額:125840000円 ( 直接経費:96800000円 、 間接経費:29040000円 )

    双子研究および罹患同胞相対危険率(λs=5.0)から、アルツハイマー病は遺伝的危険因子が関与すると考えられる。SNPベースの全ゲノム相関解析が精力的に行われたが、リスクSNPの効果は小さく家系を基盤とするゲノム解析の重要性が見直された。次世代シークエンサーは、家族内多発家系の稀な変異を検出する新しい解析手段として有効であった。次にエクソンアレイ法や次世代シークエンサーを用いて、老人斑と神経原線維変化を指標に病理診断されたヒト凍結脳における遺伝子発現解析を行った。遺伝子発現制御の解明にむけて、染色体上離れた遺伝子間相互作用またはマイクロRNAを含む非翻訳RNAの機能を取り入れるべきであろう。

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  • アルツハイマー病感受性遺伝子座APOE周辺領域が制御する遺伝子群とその発現解析

    2010年4月 - 2012年3月

    科学研究費補助金:若手研究(B) 

    宮下 哲典

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:4030000円 ( 直接経費:3100000円 、 間接経費:930000円 )

    研究代表者(研究分野:人類遺伝学)

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  • アルツハイマー病感受性遺伝子座APOE周辺領域が制御する遺伝子群とその発現解析

    研究課題/領域番号:22790331  2010年 - 2011年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

    宮下 哲典

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    配分額:4030000円 ( 直接経費:3100000円 、 間接経費:930000円 )

    アルツハイマー病(AD)の病態に関与する遺伝子(群)を同定するために、ヒト死後脳を用いた遺伝子発現解析を行った。Braakらの老人斑(SP)、及び神経原線維変化(NFT)ステージ分類を指標に、AD以外の顕著な脳病変を認めないヒト死後脳71症例を用いた。遺伝子発現解析に加え、APOE、一塩基多型、コピー数多型の遺伝型を決定した。Braak SP・NFTステージに依存して発現変動する遺伝子を複数同定し、アノテーション情報の整理、APOE遺伝型の寄与等の解析を行なった。これら遺伝子の機能とAD脳病理との関連を、文献情報を加味して検討した。

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  • 疾患関連遺伝子発見のための症例対照研究における統計学的問題とその解決策の検討

    2007年4月 - 2009年3月

    科学研究費補助金:基盤研究(B) 

    赤澤 宏平

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    資金種別:競争的資金

    配分額:11700000円 ( 直接経費:9000000円 、 間接経費:2700000円 )

    研究分担者(研究分野:統計科学)

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  • 疾患関連遺伝子発見のための症例対照研究における統計学的問題とその解決策の検討

    研究課題/領域番号:19300095  2007年 - 2008年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    赤澤 宏平, 鳥谷部 真一, 桑野 良三, 宮下 哲典

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    配分額:11700000円 ( 直接経費:9000000円 、 間接経費:2700000円 )

    本研究では、SNPsデータを用いて疾患関連遺伝子を同定するための多段階デザイン症例-対照相関解析の統計学的性質を詳細に検討した。研究成果として以下が挙げられる。1. R言語を使い、多段階デザイン症例-対照研究の検出力を推定するプログラムを開発した。2. 3段階法において、各ステージの症例割合を種々変化させたときの検出力とタイピング数を調べた. これらの結果は、国際学術誌Bioinformatics、Journal of Human Geneticsに掲載された。

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  • アルツハイマー病を中心とした神経系疾患の多型タイピング体制確立と応用

    2005年4月 - 2010年3月

    科学研究費補助金:特定領域研究 

    桑野 良三

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    資金種別:競争的資金

    配分額:181300000円 ( 直接経費:181300000円 )

    研究分担者(審査区分:生物系)

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  • アルツハイマー病の疾患感受性遺伝子探索

    2005年 - 2009年

    科学研究費補助金 

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    資金種別:競争的資金

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  • アルツハイマー病を中心とした神経系疾患の多型タイピング体制確立と応用

    研究課題/領域番号:17020004  2005年 - 2009年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 特定領域研究  特定領域研究

    桑野 良三, 宮下 哲典

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    配分額:181300000円 ( 直接経費:181300000円 )

    病気は遺伝素因に環境因子が影響して発症すると考えられる。病気に罹りやすい遺伝子型を決めるタイピングシステム体制を確立した。その技術を神経疾患に応用した研究支援活動並びにアルツハイマー病の遺伝的危険因子探索の2本柱で研究を進めた。研究支援依頼があった家族性認知症やその他の神経疾患に関する原因遺伝子及び候補遺伝子領域を同定した。大規模検体を対象としてアルツハイマー病リスク遺伝子の候補領域を見出した。

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  • アルツハイマー病診断・治療薬の開発:βアミロイド結合分子探索からのアプローチ

    研究課題/領域番号:16650081  2004年 - 2006年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 萌芽研究  萌芽研究

    橘 正芳, 宮下 哲典, 野中 裕美

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    資金種別:競争的資金

    配分額:2300000円 ( 直接経費:2300000円 )

    アルツハイマー病は、我が国においても近年増加の傾向をたどり大きな社会問題となっている。アルツハイマー病の原因物質はアミロイドベーターであることが明らかになってきたが、本研究の最終的な目的はアミロイドベーターに結合する化合物を創出してアルツハイマー病の早期診断ひいては治療に役立つ物質を創出しようとするものである。本研究はその第一歩としてアミロイドベーターと小分子の結合をとらえるシステムの開発を試みた。
    独自に開発したElectro spray deposition(ESD)装置(フューエンス社)を用い、アミロイドベーター1-42(BACHEM社 H-1368)を高電圧負荷時に発生する静電力を利用してマイクロフィルムに噴出し一定の強度をもつ膜を作製した。次にこの膜をアミロイドベーターの凝集に関与するとされている亜鉛2価イオンと作用させ、フューエンス社と共同開発したメカノケミカル(MC1型)装置(フューエンス社、橘で共同特許申請中)に装着し膜の張力の増加や減弱を検討した。その結果、アミロイドベーターと亜鉛2価イオンを結合させるアミロイドベーター膜の張力が増加することが判明した。さらにアミロイドベーター結合性のRNAアプタマーを作製し、これを併用して作用させるとこの亜鉛によるアミロイドベーター膜張力の増強の程度が減じることが証明された。すなわちこのアプタマーとアミロイドベーターとの結合がin vitroで証明された。今後培養系およびマウスを用いてアミロイドベーター結合性分子とアミロイドベーターとの分子間作用を検討している。

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  • 成熟マウス大脳皮質に潜む未分化細胞の同定とその運命

    2002年4月 - 2005年3月

    科学研究費補助金:基盤研究(B) 

    桑野 良三

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    資金種別:競争的資金

    配分額:15100000円 ( 直接経費:15100000円 )

    研究分担者(研究分野:神経化学・神経薬理学)

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  • アンチセンス転写で形質発現に破綻をきたすダブルジーントラップマウスの開発

    2002年4月 - 2004年3月

    科学研究費補助金:萌芽研究 

    桑野 良三

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    資金種別:競争的資金

    配分額:3400000円 ( 直接経費:3400000円 )

    研究分担者(研究分野:実験動物学)

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  • 成熟マウス大脳皮質に潜む未分化細胞の同定とその運命

    研究課題/領域番号:14380357  2002年 - 2004年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    桑野 良三, 宮下 哲典

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    配分額:15100000円 ( 直接経費:15100000円 )

    研究は、脳の発達と機能維持の解明を目的とした基盤研究である。脳の初期発生から形態形成を経て高次脳機能を獲得する過程を理解することは、成熟脳における脳機能維持の解明につながる。神経成長円錐を発達時期や部位に共通の機能ユニットと仮定して、成長円錐構成膜タンパクを網羅的に分析した。その結果、脳形成期に一過性に発現し成熟と共に消失するgmp46/CAR(Growth cone Membrane Protein with a molecular mass 46kDa/Coxsakievirus Adenovirus Receptor)を発見した。ウイルス受容体としてではなくgmp46/CARの生理機能は、イムノグロブリンスーパーファミリーに属する新しい細胞接着分子としての機能である。タンパク構造の特徴としてC末にPDZ結合ドメインのSer-Ile-Val配列があり、イーストTwo-hyrid法でPDZ結合タンパクであるPSD95を見つけた。gmp46/CAR cDNAを強制発現したC6培養細胞の実験から、細胞が接着する突起や面にgmp46/CARが集積することを観察した。gmp46/CARの細胞表面の局在は、おそらくC末のSer-Ile-Valに結合したPSD95を介していると思われた。脳の形成期に一過性に発現するgmp46/CARが成熟脳においても、神経細胞新生の場所である海馬、脳室下帯、嗅脳に発現していた。個体レベルで解析するためにgmp46/CARノックアウトマウスを作出したが、初期に致死となり充分な解析ができなかった。gmp46/CARは圧倒的に脳に発現しているが、心臓、骨、腎臓にも僅かであるが存在し、これらの臓器において、実験的心筋炎モデル動物、骨折-修復モデル動物や腎炎モデル動物で、組織修復時にgmp46/CARmRNA及びタンパクが再び出現している結果を得た。

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  • アンチセンス転写で形質発現に破綻をきたすダブルジーントラップマウスの開発

    研究課題/領域番号:14658271  2002年 - 2003年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 萌芽研究  萌芽研究

    桑野 良三, 宮下 哲典

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    配分額:3400000円 ( 直接経費:3400000円 )

    [ジーントラップ系統マウスGT3-11の再作出]
    既報のジーントラップ系統マウスGT3-11(Zoolog Sci.,1996,13:277-283)の生殖系列キメラマウスを複数匹得るために、GT3-11 ES細胞(129系統マウス由来)を用いて再作出を試みした。この系統ではジーントラップベクター(GTV)挿入部位において、その上流に位置するEif4al遺伝子と下流に位置するFxr2h遺伝子から、収束性の転写(センス-アンチセンス転写)が認められている(Gene,1999,237:53-60;第25回日本分子生物学会,プログラム・講演要旨集,P679,2002)。従って、この系統マウスは本研究プロジェクトのモデルマウスと位置付けることができると考えられ、再作出により上記収束性転写の再現性が確認できると思われる。
    その結果、GT3-11ES細胞を注入した118個の胚盤胞をICR (CRJ Inc.)偽妊娠マウスに移植し、28匹のキメラマウス(♂:♀:21:7)を得た。C57BL/6J (CRJ Inc.)と交配し、生殖系列キメラマウスと確認されたものは8匹(♂:♀=7:1)であった。そのうち高率な生殖系列キメラマウス4匹.(全て♂)をC57BL/6J♀と交配し、得られた胎児を用いて以下の実験を遂行し、今現在解析を進めている。
    1)RT-PCR法
    2)ノーザン法
    3)X-ga1染色
    4)胎齢13.5日胚由来初代線維芽細胞を用いたネオマイシン耐性実験

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  • マウス胚性幹細胞を用いたジーントラップ法によるゲノム欠失型疾患モデルマウスの作出

    2001年4月 - 2003年3月

    科学研究費補助金:若手研究(B) 

    宮下 哲典

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:2200000円 ( 直接経費:2200000円 )

    研究代表者(研究分野:実験動物学)

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  • マウス胚性幹細胞を用いたジーントラップ法によるゲノム欠失型疾患モデルマウスの作出

    研究課題/領域番号:13780660  2001年 - 2002年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

    宮下 哲典

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    配分額:2200000円 ( 直接経費:2200000円 )

    新規ジーントラップベクターの構築と機能確認
    マウス胚性幹(ES)細胞ゲノムに欠失(数kb〜数百kb)を引き起こすための新規ジーントラップベクターを4種類構築した(GT-a、-b、-c、-d)。レポーター遺伝子としてはLacZとEGFPを用い、薬剤耐性遺伝子としてはネオマイシン耐性遺伝子neoとハイグロマイシン耐性遺伝子Hygを用いた。Neo-LacZでセンス転写ユニット(IRESを介したdicistron)を成し、Hyg-EGFP(融合遺伝子)でアンチセンス転写ユニットを構成している。本研究では、シングルジーントラップのみならず、ダブルジーントラップも想定している。従って、上記4種類のベクターの1つ『GT-a』にはneo-LacZユニットとHyg-EGFPユニットのどちらにもプロモーターを付していない。『GT-b』〜『GT-d』は『GT-a』のコントロールベクターである。『GT-b』と『GT-c』については片方のユニットそれぞれにプロモーターを付けてあり、『GT-d』にはどちらのユニットにもプロモーターを付けてある。
    マウスES細胞へ遺伝子導入する前に、構築したベクターが細胞内できちんと機能するかどうかを調べるための実験を行った。ラットアストログリオーマ由来のC6細胞に、リポフェクション法によって一過性及び永久的にそれぞれ遺伝子導入した。その結果、『GT-b』『GT-c』のベクターを用いた実験から、センス及びアンチセンス転写ユニットはどちらも機能的であることが分かった。また、『GT-d』を用いた実験から、両ユニットが各プロモーターでダブルドライブされた場合にもセンス-アンチセンス転写ユニットは同時に独立して機能することが分かった。また、ノーザン解析、鎖特異的RT-PCR解析によっても、両ユニットの適切な転写を確認した。
    従って、本研究の遂行に必要なベクターの構築が確認され、レポーター遺伝子(LacZ、EGFP)や薬剤耐性遺伝子(neo、Hyg)が機能することが分かった。これらベクターを用いて実際にES細胞に遺伝子導入し、ゲノム欠失を伴った細胞株の樹立を目指す。

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  • Genome-Wide Approach of Neuronal Degenerative Disorder

    2000年 - 2005年

    Millennium Project 

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    資金種別:競争的資金

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  • 神経疾患のゲノム網羅的な解析

    2000年 - 2005年

    ミレニアム・プロジェクト 

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    資金種別:競争的資金

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担当経験のある授業科目

  • 病気と遺伝学

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学