Organization
Sado Island Center for Ecological Sustainability . Associate Professor
Title
Associate Professor
External link
OMORI Akihito
Degree
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博士（理学） ( 2011.3 東京大学 )
Research Interests
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Scoliorhapis dianthus
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body axis
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Anneissia japonica
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Invertebrates
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evolutionary developmental biology
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molecular phylogenetic analysis
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echinoderm
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feather star
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crinoid
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environmental DNA
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nervous system
Research Areas
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Life Science / Biodiversity and systematics
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Life Science / Developmental biology
-
Life Science / Ecology and environment
Research History (researchmap)
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Niigata University Marine Biological Station, Sado Island Center for Ecological Sustainability Associate Professor
2025.6
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Keio University Faculty of Science and Technology Part-time University Lecturer
2024.4
Country：Japan
-
Niigata University Marine Biological Station, Sado Island Center for Ecological Sustainability Assistant Professor
2019.4 - 2025.5
-
Niigata University Sado Marine Biological Station, Faculty of Science Assistant Professor
2017.7 - 2019.3
-
The University of Tokyo Misaki Marine Biological Station, School of Science Project Assistant Professor
2013.10 - 2017.6
-
The University of Tokyo Research Center for Marine Education Project Researcher
2011.4 - 2013.10
Research History
-
Niigata University Associate Professor
2025.6
-
Niigata University Sado Island Center for Ecological Sustainability Assistant Professor
2019.4
-
Niigata University Faculty of Science Marine Biological Station Assistant Professor
2017.7 - 2019.3
Education
-
The University of Tokyo Graduate School of Science Department of Biological Sciences
2005.4 - 2011.3
-
The University of Tokyo Faculty of Science Department of Biological Sciences
2001.4 - 2005.3
Professional Memberships
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日本海洋教育学会
2023.10
-
THE ZOOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN
2006
-
JAPANESE SOCIETY OF DEVELOPMENTAL BIOLOGISTS
2005
Papers
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Taxonomic status of the oreasterid sea star Bothriaster primigenius Döderlein, 1916 (Echinodermata, Asteroidea) Reviewed
Yoichi Kogure, Akihito Omori, Yoshihisa Fujita
Biogeography 25 13 - 18 2023.9
-
Hox Genes in Echinoderms Reviewed
Akihito Omori, Naoki Irie
Hox Modules in Evolution and Development 141 - 160 2023.3
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Sumio Udagawa, Akiko Nagai, Mani Kikuchi, Akihito Omori, Atsushi Tajika, MiekoSaito, Toru Miura, Naoki Irie, Yasuhiro Kamei, Mariko Kondo
Developmental Biology 492 71 - 78 2022.10
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Partial redescriptions of three holothurians with “hook papillae” (Apodida: Chiridotidae): Taeniogyrus japonicus (Marenzeller, 1882), T. dendyi (Mortensen, 1925), Scoliorhapis theelii (Heding, 1928) Reviewed International journal
YUSUKE YAMANA, FRANCISCO A SOLIS-MARIN, MASAKI YAMAMOTO, YUZO OTA, HISANORI KOHTSUKA, AKIHITO OMORI, KAZUMA IWASAKI, DAVIN H. E. SETIAMARGA
Zootaxa 5138 ( 4 ) 351 - 387 2022.5
-
Ramisyllis kingghidorahi n. sp., a new branching annelid from Japan Reviewed
M. Teresa Aguado, Guillermo Ponz-Segrelles, Christopher J. Glasby, Rannyele P. Ribeiro, Mayuko Nakamura, Kohei Oguchi, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka, Christian Fischer, Yuji Ise, Naoto Jimi, Toru Miura
Organisms Diversity & Evolution 22 ( 2 ) 377 - 405 2022.1
-
Derivedness Index for Estimating Degree of Phenotypic Evolution of Embryos: A Study of Comparative Transcriptomic Analyses of Chordates and Echinoderms Reviewed International journal
Jason Cheok Kuan Leong, Yongxin Li, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Akihito Omori, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yandong Ren, Si Zhang, Tao Zeng, Fayou Wang, Luonan Chen, Gary Wessel, Brian T. Livingston, Cynthia Bradham, Wen Wang, Naoki Irie
Frontiers in Cell and Developmental Biology 9 749963 - 749963 2021.11
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Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameral symmetry in Echinoderms Reviewed
Yongxin Li, Akihito Omori, Rachel L. Flores, Sheri Satterfield, Christine Nguyen, Tatsuya Ota, Toko Tsurugaya, Tetsuro Ikuta, Kazuho Ikeo, Mani Kikuchi, Jason C. K. Leong, Adrian Reich, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yaondong Ren, Si Zhang, Tao Zeng, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Xueyan Li, Tomoko F. Shibata, Takahiro Bino, Kota Ogawa, Shuji Shigenobu, Mariko Kondo, Fayou Wang, Luonan Chen, Gary Wessel, Hidetoshi Saiga, R. Andrew Cameron, Brian Livingston, Cynthia Bradham, Wen Wang, Naoki Irie
Communications Biology 3 ( 1 ) 371 2020.12
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Gene expression analysis of three homeobox genes throughout early and late development of a feather star Anneissia japonica Reviewed
Akihito Omori, Tomoko F. Shibata, Koji Akasaka
Development Genes and Evolution 230 ( 4 ) 305 - 314 2020.7
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Hisanori KOHTSUKA, Akihito OMORI, Masa-aki YOSHIDA
Bulletin of the Hoshizaki Green Foundation ( 22 ) 209 - 213 2019.3
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Larval and Adult Body Axes in Echinoderms Reviewed
Akihito Omori
Reproductive and Developmental Strategies 2018
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A new species of Xenoturbella from the western Pacific Ocean and the evolution of Xenoturbella Reviewed
Hiroaki Nakano, Hideyuki Miyazawa, Akiteru Maeno, Toshihiko Shiroishi, Keiichi Kakui, Ryo Koyanagi, Miyuki Kanda, Noriyuki Satoh, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka
BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY 17 245 2017.12
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Hisanori Kohtsuka, Mamoru Sekifuji, Akihito Omori, Masanori Okanishi
Bulletin of the Biogeographical Society of Japan 71 229 - 235 2017.1
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Early stalked stages in ontogeny of the living isocrinid sea lily Metacrinus rotundus Reviewed
Shonan Amemiya, Akihito Omori, Toko Tsurugaya, Taku Hibino, Masaaki Yamaguchi, Ritsu Kuraishi, Masato Kiyomoto, Takuya Minokawa
ACTA ZOOLOGICA 97 ( 1 ) 102 - 116 2016.1
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JAMBIO Coastal Organism Joint Surveys reveals undiscovered biodiversity around Sagami Bay Reviewed
Hiroaki Nakano, Keiichi Kakui, Hiroshi Kajihara, Michitaka Shimomura, Naoto Jimi, Shinri Tomioka, Hayate Tanaka, Hiroshi Yamasaki, Masaatsu Tanaka, Takato Izumi, Masanori Okanishi, Yutaro Yamada, Hideo Shinagawa, Toshihiko Sato, Yasutaka Tsuchiya, Akihito Omori, Mamoru Sekifuji, Hisanori Kohtsuka
REGIONAL STUDIES IN MARINE SCIENCE 2 ( sup ) 77 - 81 2015.11
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Geochemistry of two shallow CO2 seeps in Shikine Island (Japan) and their potential for ocean acidification research Reviewed
Sylvain Agostini, Shigeki Wada, Koetsu Kon, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka, Hiroyuki Fujimura, Yasutaka Tsuchiya, Toshihiko Sato, Hideo Shinagawa, Yutaro Yamada, Kazuo Inaba
REGIONAL STUDIES IN MARINE SCIENCE 2 ( sup ) 45 - 53 2015.11
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Patterning of anteroposterior body axis displayed in the expression of Hox genes in sea cucumber Apostichopus japonicus Reviewed
Mani Kikuchi, Akihito Omori, Daisuke Kurokawa, Koji Akasaka
DEVELOPMENT GENES AND EVOLUTION 225 ( 5 ) 275 - 286 2015.9
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A new genus and new species of family Antedonidae (Echinodermata: Crinoidea) from southern Japan Reviewed
Masami Obuchi, Akihito Omori
ZOOTAXA 3972 ( 3 ) 441 - 449 2015.6
-
Shallow−water Comatulids from Sado Island, Niigata Prefecture, Japan (Echinodermata: Crinoidea)
Hisanori Kohtsuka, Akihito Omori, Satoshi Awata, Toyokazu Shimotani, Masumi Nozaki
Bulletin of the Hoshizaki Green Foundation ( 18 ) 75 - 89 2015.5
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Anterior-posterior axis formation and nervous system development in crinoids; implications for evolution of the echinoderm bodyplan.
Akihito Omori
The University of Tokyo 2011.3
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Gene expression analysis of Six3, Pax6, and Otx in the early development of the stalked crinoid Metacrinus rotundus Reviewed
Akihito Omori, Koji Akasaka, Daisuke Kurokawa, Shonan Amemiya
GENE EXPRESSION PATTERNS 11 ( 1-2 ) 48 - 56 2011.1
Books
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Hox Modules in Evolution and Development Reviewed
Akihito Omori, Naoki Irie（ Role： Joint author , Chapter 7: Hox Genes in Echinoderms）
CRC Press 2023.4 （ ISBN:9781003057215 ）
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Reproductive and Developmental Strategies, The Continuity of Life Reviewed
Akihito Omori, Mani Kikuchi, Mariko Kondo（ Role： Joint author , Chapter 34: Larval and Adult Body Axes in Echinoderms）
Splinger 2018.6 （ ISBN:9784431566090 ）
MISC
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Ramisyllis kingghidorahi n. sp., a new branching annelid from Japan (Jan, 10.1007/s13127-021-00538-4, 2022)
M. Teresa Aguado, Guillermo Ponz-Segrelles, Christopher J. Glasby, Rannyele P. Ribeiro, Mayuko Nakamura, Kohei Oguchi, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka, Christian Fischer, Yuji Ise, Naoto Jimi, Toru Miura
ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION 22 ( 2 ) 407 - 407 2022.6
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Author Correction: Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameral symmetry in Echinoderms. International journal
Yongxin Li, Akihito Omori, Rachel L Flores, Sheri Satterfield, Christine Nguyen, Tatsuya Ota, Toko Tsurugaya, Tetsuro Ikuta, Kazuho Ikeo, Mani Kikuchi, Jason C K Leong, Adrian Reich, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yaondong Ren, Si Zhang, Tao Zeng, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Xueyan Li, Tomoko F Shibata, Takahiro Bino, Kota Ogawa, Shuji Shigenobu, Mariko Kondo, Fayou Wang, Luonan Chen, Gary Wessel, Hidetoshi Saiga, R Andrew Cameron, Brian Livingston, Cynthia Bradham, Wen Wang, Naoki Irie
Communications biology 4 ( 1 ) 459 - 459 2021.4
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Correction to: A new species of Xenoturbella from the western Pacific Ocean and the evolution of Xenoturbella. International journal
Hiroaki Nakano, Hideyuki Miyazawa, Akiteru Maeno, Toshihiko Shiroishi, Keiichi Kakui, Ryo Koyanagi, Miyuki Kanda, Noriyuki Satoh, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka
BMC evolutionary biology 18 ( 1 ) 83 - 83 2018.6
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Research on crinoids and marine education in Misaki
Akihito Omori
Aquabiology 35 ( 4 ) 433 - 433 2013.8
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Primitive central nervous system of stalked crinoids (M-rotundus)
Koji Akasaka, Akihito Omori, Shonan Amemiya
ZOOLOGICAL SCIENCE 22 ( 12 ) 1389 - 1389 2005.12
Presentations
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Examination of the BMP and Nodal signaling related genes in the development of a feather star Anneissia japonica
Akihito Omori, Yongxin Li, Wen Wang, Hisanori Kohtsuka, Naoki Irie, Mariko Kondo
17th International Echinoderm Conference & 2nd International Hemichordate Meeting 2024.7
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Microhabitat of Scoliodota japonica at the muddy sandy coasts of Sado island
Itsuki Umeta, Akihito Omori
The 93rd Annual Meeting of the Zoological Society of Japan 2022.9
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佐渡島沿岸に特徴的な海産底生無脊椎動物数種の生態
大森 紹仁
日本海３大学部局間連携協定 Kick off Symposium 2022.3
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佐渡島の希少な海産無脊椎動物
大森 紹仁
佐渡自然共生科学センター シンポジウム2022「島の稀少な生きものを記録する」 2022.3
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Distribution and reproductive ecology of an apodid sea cucumber Scoliorhapis dianthus
Takashi Nakajima, Akihito Omori
91st Annual Meeting of the Zoological Society of Japan 2020.9
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Evolution of the body axes in crinoid echinoderms
Akihito Omori
The 1st Asian International Conference in Science 2019.11
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Development and differentiation of mesenchyme cells in feather star
2023.9
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佐渡島の海洋生物を記録する
大森 紹仁
佐渡自然共生科学センター シンポジウム2023「デジタル時代の自然共生科学」 2023.3
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佐渡発の新種キングギドラシリスの棲息環境調査
三浦徹, 幸塚久典, 小口晃平, 佐藤大介, 自見直人, 大森紹仁
佐渡ジオパークフォーラム 2023.2
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Examination of the dorsal-ventral and left-right patterning related genes in the development of a feather star Anneissia japonica
Akihito Omori, Yongxin Li, Wen Wang, Naoki Irie, Mariko Kondo
52nd Annual Meeting of JSDB 2019.5
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Are the color patterns of a feather star Anneissia japonica inheritable? International conference
Akihito Omori, Toko Tsurugaya, Hisanori Kohtsuka
16th International Echinoderm Conference 2018.5
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Taxonomic re-examination of the Colobometridae feather stars of Japanese shallow water
Aoi Tsuyuki, Hisanori Kohtsuka, Akihito Omori
The 88th Annual Meeting of the Zoological Society of Japan 2017.9
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Micro-CT observation in feather stars; implications for morphology, taxonomy, developmental biology and evolutionary studies. International conference
Akihito Omori, Akiteru Maeno, Hisanori Kohtsuka, Toshihiko Shiroishi, Mariko Kondo
Joint meeting of the 22nd International Congress of Zoology & the 87th meeting of the Zoological Society of Japan 2016.11
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Micro-computed tomography with molecular analyses; methodological study for molecular phylogeny and developmental biology of echinoderms. International conference
Akihito Omori, Akiteru Maeno, Hisanori Kohtsuka, Toshihiko Shiroishi, Mariko Kondo
15th International Echinoderm Conference 2015.5
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Immunohistochemical and molecular biological analysis on the adult nervous systems of the feather star Oxycomanthus japonicus International conference
Akihito Omori, Daisuke Kurokawa, Koji Akasaka
14th International Echinoderm Conference 2012.8
Research Projects
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Nanoporeシーケンサーを用いた日本近海産Anneissia属ウミシダ類の分類学・系統地理学的研究
Grant number：R06-1041
2024.6 - 2025.3
System name：内田エネルギー科学振興財団試験研究費助成
Awarding organization：公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団
Authorship：Principal investigator
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祖先型棘皮動物ウミシダにおける間充織細胞の発生と分化
2022.7 - 2023.3
System name：研究費助成
Awarding organization：一般財団法人 中辻創智社
Authorship：Principal investigator
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半月周性産卵リズムの形成機構：潮汐を伝える体内時計の関わりと分子基盤の解明
Grant number：20H03288
2020.4 - 2024.3
System name：科学研究費助成事業
Research category：基盤研究(B)
Awarding organization：日本学術振興会
安東 宏徳, 豊田 賢治, 吉村 崇, 大森 紹仁
Grant amount：\18200000 （ Direct Cost: \14000000 、 Indirect Cost：\4200000 ）
本研究では、概潮汐時計の機能的分子基盤の解明を目指して、潮汐サイクルおよび月齢に同調して発現する遺伝子群を網羅的に探索すると共に、それらの遺伝子の発現抑制による半月周性の産卵行動リズムへの影響を検討する。また、概潮汐時計と概日時計から構成されると考えられるリズム発振機構による生殖神経内分泌系の周期的調節の機能形態学的基盤を解明する。さらに、より普遍的な生物リズムの研究としての展開を目指し、半月周性リズムのOntogenyを解明する。令和3年度は、次の3つの研究成果を得た。
1）潮汐サイクルと半月周性リズムに関連する遺伝子群を探索する試料として、産卵リズムの異なる伊豆川奈と佐渡姫津において、大潮と小潮の日の夕刻にクサフグ成魚を捕獲して脳を採取した。
2）潮汐サイクル/半月周性リズムを作る時計候補遺伝子の機能解析のため、Vivo-モルフォリノによる遺伝子発現抑制実験系を検討した。脳髄膜で作られる糖たんぱく質であるエペンジミン（EPN）を標的遺伝子として、Vivo-モルフォリノ(EPN-MO)の配列、投与量、投与方法を検討した。また、ウェスタンブロット法と免疫染色法を用いたEPNタンパク質の解析系を確立した。EPN-MOを投与した個体では、遊泳阻害が見られたが、EPNタンパク質量の変化は検出されなかった。
3）クサフグ仔稚魚に潮汐サイクルや月齢に同調したリズムがあるのかどうかを明らかにするため、産卵期に親魚を採集して人工授精を行い、仔稚魚を育成した。DanioVisionを用いて、クサフグ仔稚魚の自発行動リズムを解析した結果、成長段階によって明暗周期に関して自発行動リズムが異なることや明暗の切り替え時に自発行動量が高くなることなど、クサフグが独自の光応答性を持つ可能性が示された。さらに、EthoVision XTを用いたクサフグ幼魚の自発行動解析系を確立した。 -
佐渡島固有種サドナデシコナマコの生息状況および生殖生態の解明
2018.4 - 2020.3
System name：内田エネルギー科学振興財団試験研究費助成
Awarding organization：公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団
大森 紹仁
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
Teaching Experience (researchmap)
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科学英語演習
2022Institution name：新潟大学フィールド科学人材育成プログラム -
農学入門Ⅰ・Ⅱ
2020Institution name：新潟大学フィールド科学人材育成プログラム -
水圏生態学
2019Institution name：新潟大学フィールド科学人材育成プログラム -
海洋フィールド生物学実習
2019-2022Institution name：新潟大学フィールド科学人材育成プログラム -
系統動物学
2018Institution name：新潟大学理学部生物学プログラム -
フィールド安全論
2018Institution name：新潟大学フィールド科学人材育成プログラム -
環境生物学野外実習B
2018Institution name：新潟大学理学部自然環境科学プログラム -
環境生物学野外実習C
2018Institution name：新潟大学理学部自然環境科学プログラム -
面接授業「海洋生物の多様性と適応進化」
2018-2024 -
系統分類学
2018-2021Institution name：新潟大学フィールド科学人材育成プログラム -
生物学総合演習
2017Institution name：新潟大学理学部生物学プログラム -
臨海実習Ⅰ
2017Institution name：新潟大学理学部生物学プログラム -
野外実習
2016Institution name：東邦大学理学部 -
科学英語演習
2015Institution name：東京大学理学部生物学科 -
生物学実験集中
2014Institution name：慶應義塾大学理工学部 -
特別臨海実習
2014-2017Institution name：東京大学理学部生物学科 -
生物科学共通実習
2014-2017Institution name：東京大学理学部生物学科 -
全学体験ゼミナール「海で学ぶ」
2012-2016
Teaching Experience
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佐渡自然共生国際実習
2024Institution name：新潟大学 -
理学基礎演習
2022Institution name：新潟大学 -
課題研究II(生物学)
2021Institution name：新潟大学 -
臨海実習II
2021Institution name：新潟大学 -
卒業論文
2020Institution name：新潟大学 -
卒業論文Ⅰ
2020Institution name：新潟大学 -
卒業論文Ⅱ
2020Institution name：新潟大学 -
海洋フィールド生物学実習
2020-2022Institution name：新潟大学 -
農学入門Ⅰ
2020Institution name：新潟大学 -
農学入門Ⅱ
2020Institution name：新潟大学 -
水圏生態学
2019Institution name：新潟大学 -
先端臨海実習
2019Institution name：新潟大学 -
系統分類学
2019-2021Institution name：新潟大学 -
フィールド安全論
2018Institution name：新潟大学 -
環境生物学野外実習B
2018Institution name：新潟大学 -
動物生理学III
2018Institution name：新潟大学 -
系統動物学
2018Institution name：新潟大学 -
海洋生物学実験
2018Institution name：新潟大学 -
環境生物学野外実習C
2018Institution name：新潟大学 -
森・里・海フィールド実習
2018Institution name：新潟大学 -
総合力アクティブ・ラーニング
2018-2021Institution name：新潟大学 -
生物学総合演習
2017Institution name：新潟大学 -
臨海実習I
2017Institution name：新潟大学 -
内分泌学演習
2017Institution name：新潟大学 -
課題研究I(生物学)
2017Institution name：新潟大学
Social Activities
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佐渡の海岸環境と海洋ベントス
Role(s)： Lecturer
佐渡市社会教育課 令和5年度 佐渡市民大学講座 2023.12
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佐渡の海の無脊椎動物たち
Role(s)： Lecturer
佐渡市環境対策課 令和2年度 市民環境講座 2021.1