2021/10/20 更新

写真a

オオモリ アキヒト
大森 紹仁
OMORI Akihito
所属
佐渡自然共生科学センター 海洋領域 助教
職名
助教
外部リンク

学位

  • 博士(理学) ( 2011年3月   東京大学 )

研究キーワード

  • ウミシダ

  • ウミユリ類

  • 環境DNA

  • 神経系

  • 棘皮動物

  • サドナデシコナマコ

  • 体軸

  • ニッポンウミシダ

  • 無脊椎動物

  • 進化発生学

  • 分子系統解析

研究分野

  • ライフサイエンス / 多様性生物学、分類学

  • ライフサイエンス / 発生生物学

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学

経歴(researchmap)

  • 新潟大学   佐渡自然共生科学センター臨海実験所   助教

    2019年4月 - 現在

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  • 新潟大学   理学部附属臨海実験所   助教

    2017年7月 - 2019年3月

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  • 東京大学   大学院理学系研究科附属臨海実験所   特任助教

    2013年10月 - 2017年6月

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  • 東京大学   海洋教育促進研究センター   特任研究員

    2011年4月 - 2013年10月

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経歴

  • 新潟大学   佐渡自然共生科学センター   助教

    2019年4月 - 現在

  • 新潟大学   臨海実験所   助教

    2017年7月 - 2019年3月

学歴

  • 東京大学   理学系研究科   生物科学専攻

    2005年4月 - 2011年3月

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  • 東京大学   理学部   生物学科

    2001年4月 - 2005年3月

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所属学協会

 

論文

  • Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameral symmetry in Echinoderms 査読

    Yongxin Li, Akihito Omori, Rachel L. Flores, Sheri Satterfield, Christine Nguyen, Tatsuya Ota, Toko Tsurugaya, Tetsuro Ikuta, Kazuho Ikeo, Mani Kikuchi, Jason C. K. Leong, Adrian Reich, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yaondong Ren, Si Zhang, Tao Zeng, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Xueyan Li, Tomoko F. Shibata, Takahiro Bino, Kota Ogawa, Shuji Shigenobu, Mariko Kondo, Fayou Wang, Luonan Chen, Gary Wessel, Hidetoshi Saiga, R. Andrew Cameron, Brian Livingston, Cynthia Bradham, Wen Wang, Naoki Irie

    Communications Biology   3 ( 1 )   2020年12月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1038/s42003-020-1091-1

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    その他リンク: http://www.nature.com/articles/s42003-020-1091-1

  • Gene expression analysis of three homeobox genes throughout early and late development of a feather star Anneissia japonica 査読

    Akihito Omori, Tomoko F. Shibata, Koji Akasaka

    Development Genes and Evolution   230   305 - 314   2020年7月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media {LLC}  

    DOI: 10.1007/s00427-020-00665-6

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  • 島根県隠岐諸島で得られたハナウスラヒトデ(棘皮動物門,海星綱,アカヒトデ目)の記録

    幸塚久典, 大森紹仁, 吉田真明

    ホシザキグリーン財団研究報告   ( 22 )   209 - 213   2019年3月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • A new species of Xenoturbella from the western Pacific Ocean and the evolution of Xenoturbella 査読

    Hiroaki Nakano, Hideyuki Miyazawa, Akiteru Maeno, Toshihiko Shiroishi, Keiichi Kakui, Ryo Koyanagi, Miyuki Kanda, Noriyuki Satoh, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka

    BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY   17   245   2017年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BIOMED CENTRAL LTD  

    Background: Xenoturbella is a group of marine benthic animals lacking an anus and a centralized nervous system. Molecular phylogenetic analyses group the animal together with the Acoelomorpha, forming the Xenacoelomorpha. This group has been suggested to be either a sister group to the Nephrozoa or a deuterostome, and therefore it may provide important insights into origins of bilaterian traits such as an anus, the nephron, feeding larvae and centralized nervous systems. However, only five Xenoturbella species have been reported and the evolutionary history of xenoturbellids and Xenacoelomorpha remains obscure.
    Results: Here we describe a new Xenoturbella species from the western Pacific Ocean, and report a new xenoturbellid structure - the frontal pore. Non-destructive microCT was used to investigate the internal morphology of this soft-bodied animal. This revealed the presence of a frontal pore that is continuous with the ventral glandular network and which exhibits similarities with the frontal organ in acoelomorphs.
    Conclusions: Our results suggest that large size, oval mouth, frontal pore and ventral glandular network may be ancestral features for Xenoturbella. Further studies will clarify the evolutionary relationship of the frontal pore and ventral glandular network of xenoturbellids and the acoelomorph frontal organ. One of the habitats of the newly identified species is easily accessible from a marine station and so this species promises to be valuable for research on bilaterian and deuterostome evolution.

    DOI: 10.1186/s12862-017-1080-2

    Web of Science

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  • 神奈川県三崎で得られたセノテヅルモヅルの幼体の記録 査読

    幸塚 久典, 関藤 守, 大森 紹仁, 岡西 政典

    日本生物地理学会会報   71   229 - 235   2017年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Early stalked stages in ontogeny of the living isocrinid sea lily Metacrinus rotundus 査読

    Shonan Amemiya, Akihito Omori, Toko Tsurugaya, Taku Hibino, Masaaki Yamaguchi, Ritsu Kuraishi, Masato Kiyomoto, Takuya Minokawa

    ACTA ZOOLOGICA   97 ( 1 )   102 - 116   2016年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-BLACKWELL  

    The early stalked stages of an isocrinid sea lily, Metacrinus rotundus, were examined up to the early pentacrinoid stage. Larvae induced to settle on bivalve shells and cultured in the laboratory developed into late cystideans. Three-dimensional (3D) images reconstructed from very early to middle cystideans indicated that 15 radial podia composed of five triplets form synchronously from the crescent-shaped hydrocoel. The orientation of the hydrocoel indicated that the settled postlarvae lean posteriorly. In very early cystideans, the orals, radials, basals and infrabasals, with five plates each in the crown, about five columnals in the stalk, and five terminal stem plates in the attachment disc, had already formed. In mid-cystideans, an anal plate appeared in the crown. Late cystideans cultured in the field developed into pentacrinoids about 5 months after settlement. These pentacrinoids shared many crown structures with adult sea lilies. On the other hand, many features of the stalk differed from those in adult isocrinids, while sharing many characteristics with the stalk of feather star pentacrinoids, including disc-like proximal columnals, high and slender median columnals, synarthrial articulations developmentally derived from the symplexial articulations, limited formation of cirri only in the proximal columnal(s), and an attachment disc. On the basis of these findings, phylogenetic relationships among extant crinoid orders are discussed.

    DOI: 10.1111/azo.12109

    Web of Science

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  • JAMBIO Coastal Organism Joint Surveys reveals undiscovered biodiversity around Sagami Bay 査読

    Hiroaki Nakano, Keiichi Kakui, Hiroshi Kajihara, Michitaka Shimomura, Naoto Jimi, Shinri Tomioka, Hayate Tanaka, Hiroshi Yamasaki, Masaatsu Tanaka, Takato Izumi, Masanori Okanishi, Yutaro Yamada, Hideo Shinagawa, Toshihiko Sato, Yasutaka Tsuchiya, Akihito Omori, Mamoru Sekifuji, Hisanori Kohtsuka

    REGIONAL STUDIES IN MARINE SCIENCE   2 ( sup )   77 - 81   2015年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    JAMBIO, Japanese Association for Marine Biology, has been organizing JAMBIO Coastal Organism Joint Surveys at Shimoda Marine Research Center, University of Tsukuba, and Misaki Marine Biological Station, the University of Tokyo. The aims of the Surveys are to uncover the benthic marine fauna of the coastal areas in and around Sagami Bay, and to form a collaborative network between marine biologists across Japan. We have so far performed six surveys, with over 100 participants in total, using common equipment such as dredges, bottom mud samplers, and epibenthic sleds. Even in Sagami Bay, one of the most intensively studied marine environments in the world, we have succeeded in collecting about 50 probable undescribed species. Other species were collected for the first time from Sagami Bay or found from previously unreported depth. The Surveys could be useful for ecological and environmental studies as well. We plan to continue the JAMBIO Coastal Organism Joint Surveys to further reveal the rich biodiversity within and around Sagami Bay and to accelerate nationwide research collaborations. We also hope to expand the Surveys to include plants and protists, and to perform them at other areas in Japan. Through the Surveys, we aim to develop new cross-disciplinary research areas and to record the long-term transition of biota along the Japanese coast. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.rsma.2015.05.003

    Web of Science

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  • Geochemistry of two shallow CO2 seeps in Shikine Island (Japan) and their potential for ocean acidification research 査読

    Sylvain Agostini, Shigeki Wada, Koetsu Kon, Akihito Omori, Hisanori Kohtsuka, Hiroyuki Fujimura, Yasutaka Tsuchiya, Toshihiko Sato, Hideo Shinagawa, Yutaro Yamada, Kazuo Inaba

    REGIONAL STUDIES IN MARINE SCIENCE   2 ( sup )   45 - 53   2015年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    Shallow CO2 seeps, where CO2 gas is venting underwater, offer great potential for studies into the effects of ocean acidification at the ecosystem level. To our knowledge, only two tropical system and two temperate systems of such seeps have been described worldwide. Here we describe two new temperate systems: the Mikama Bay and Ashitsuke sites, located on Shikine Island, Japan. The Mikama Bay site is located in a shallow bay. Investigation of the gas and water chemistry showed that the gas contained 98% CO2 and up to 90 ppm H2S. Total alkalinity was constant in time and space with an average of 2265 +/- 10 mu mol kg(-1). Mapping of Eh and pH showed that the low pH zones were the largest when currents were moderate. Under moderate currents, Eh values were globally higher and total sulfides concentration lower, supporting that a longer residence time of the bay water allow the oxidation of the sulfides to sulfates. Zones suitable for acidification studies: with a pH lower than 8.0, low saturation state of calcite and aragonite, and non-detectable sulfide concentration, can be defined a few meters from the main venting zone. The second site, Ashitsuke, is located in the inter-tidal zone on a shore composed of boulders. Several areas showed reduced pH sometimes restricted to a few meters and up to 20 m long along the shoreline. Temperature was higher in some of the reduced pH zones suggesting the presence of hot springs in addition to vents. This paper also highlights the need for discovering additional CO2 seeps, which by their nature often lack comparable replicates and can be confounded by factors other than CO2. In this regard, Japan offers great potential as it is home to numerous active volcanoes, representing potential venting sites in climates ranging from tropical to sub-polar. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.rsma.2015.07.004

    Web of Science

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  • Patterning of anteroposterior body axis displayed in the expression of Hox genes in sea cucumber Apostichopus japonicus 査読

    Mani Kikuchi, Akihito Omori, Daisuke Kurokawa, Koji Akasaka

    DEVELOPMENT GENES AND EVOLUTION   225 ( 5 )   275 - 286   2015年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:SPRINGER  

    The presence of an anteroposterior body axis is a fundamental feature of bilateria. Within this group, echinoderms have secondarily evolved pentameral symmetric body plans. Although all echinoderms present bilaterally symmetric larval stages, they dramatically rearrange their body axis and develop a pentaradial body plan during metamorphosis. Therefore, the location of their anteroposterior body axis in adult forms remains a contentious issue. Unlike other echinoderms, sea cucumbers present an obvious anteroposterior axis not rearranged during metamorphosis, thus representing an interesting group to study their anteroposterior axis patterning. Hox genes are known to play a broadly conserved role in anteroposterior axis patterning in deuterostomes. Here, we report the expression patterns of Hox genes from early development to pentactula stage in sea cucumber. In early larval stages, five Hox genes (AjHox1, AjHox7, AjHox8, AjHox11/13a, and AjHox11/13b) were expressed sequentially along the archenteron, suggesting that the role of anteroposterior patterning of the Hox genes is conserved in bilateral larvae of echinoderms. In doliolaria and pentactula stages, eight Hox genes (AjHox1, AjHox5, AjHox7, AjHox8, AjHox9/10, AjHox11/13a, AjHox11/13b, and AjHox11/13c) were expressed sequentially along the digestive tract, following a similar expression pattern to that found in the visceral mesoderm of other bilateria. Unlike other echinoderms, pentameral expression patterns of AjHox genes were not observed in sea cucumber. Altogether, we concluded that AjHox genes are involved in the patterning of the digestive tract in both larvae and metamorphosis of sea cucumbers. In addition, the anteroposterior axis in sea cucumbers might be patterned like that of other bilateria.

    DOI: 10.1007/s00427-015-0510-7

    Web of Science

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  • A new genus and new species of family Antedonidae (Echinodermata: Crinoidea) from southern Japan 査読

    Masami Obuchi, Akihito Omori

    ZOOTAXA   3972 ( 3 )   441 - 449   2015年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MAGNOLIA PRESS  

    A new genus and new species of antedonid comatulid is described from southern Japan. Belonometra n. gen. has a unique appearance with ten long arms, numerous cirri, and remarkably long and crowded pinnules. The new genus shares some characters with subfamily Heliometrinae. However, the comparative length of pinnules, which is a diagnostic character to determine subfamily Antedonidae, is different. The subfamily into which the new genus should be placed is unclear.

    DOI: 10.11646/zootaxa.3972.3.9

    Web of Science

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  • 新潟県佐渡島の浅海産ウミシダ類(棘皮動物門:ウミユリ綱)

    幸塚 久典, 大森 紹仁, 安房田 智司, 下谷 豊和, 野崎 眞澄

    ホシザキグリーン財団研究報告   ( 18 )   75 - 89   2015年5月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 祖先型棘皮動物ウミユリ類の前後軸および神経系の進化に関する研究

    大森 紹仁

    東京大学   2011年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:学位論文(博士)  

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  • Gene expression analysis of Six3, Pax6, and Otx in the early development of the stalked crinoid Metacrinus rotundus 査読

    Akihito Omori, Koji Akasaka, Daisuke Kurokawa, Shonan Amemiya

    GENE EXPRESSION PATTERNS   11 ( 1-2 )   48 - 56   2011年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    The stalked crinoid, Metacrinus rotundus, is one of the most basal extant echinoderms. Here, we show the expression patterns of Six3, Pax6, and Otx in the early development of M. rotundus. All three genes are highly expressed in stages from the gastrula to the auricularia larval stage. Ectodermal expression of MrOtx appears to be correlated with development of the ciliary band. These three genes are expressed sequentially along the embryonic body axis in the anterior and middle walls of the archenteron in the order of MrPax6, MrSix3, and MrOtx. The anterior, middle, and posterior parts of the archenteron in the late gastrula differentiate into the axo-hydrocoel, the enteric sac, and somatocoels at later stages, respectively. The three genes are expressed sequentially from the tip of the axo-hydrocoel to the bottom of enteric sac in the order of MrSix3, MrPax6, and MrOtx at the later stages. This suggests that these genes are involved in patterning of the larval endo-mesoderm in stalked crinoids. The present results suggest that radical alterations have occurred in the expression and function of homeobox genes in basal echinoderms. (c) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.gep.2010.09.002

    Web of Science

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書籍等出版物

  • Reproductive and Developmental Strategies, The Continuity of Life

    Akihito Omori, Mani Kikuchi, Mariko Kondo( 担当: 共著 ,  範囲: Chapter 34 Larval and Adult Body Axes in Echinoderms)

    Splinger  2018年6月 

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MISC

  • 三崎でのウミユリ研究と海洋教育

    大森 紹仁

    海洋と生物   35 ( 4 )   433 - 433   2013年8月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

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  • Primitive central nervous system of stalked crinoids (M-rotundus)

    Koji Akasaka, Akihito Omori, Shonan Amemiya

    ZOOLOGICAL SCIENCE   22 ( 12 )   1389 - 1389   2005年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:ZOOLOGICAL SOC JAPAN  

    Web of Science

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講演・口頭発表等

  • ニッポンウミシダ発生過程における背腹および左右パターニング関連遺伝子の解析

    大森 紹仁, Yongxin Li, Wen Wang, 入江 直樹, 近藤 真理子

    日本発生生物学会第52回大会  2019年5月 

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    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

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  • Are the color patterns of a feather star Anneissia japonica inheritable? 国際会議

    Akihito Omori, Toko Tsurugaya, Hisanori Kohtsuka

    16th International Echinoderm Conference  2018年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • 日本産浅海性イボアシウミシダ科ウミシダ類の分類再検討

    露木 葵唯, 幸塚 久典, 大森 紹仁

    日本動物学会第88回大会  2017年9月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Micro-CT observation in feather stars; implications for morphology, taxonomy, developmental biology and evolutionary studies. 国際会議

    Akihito Omori, Akiteru Maeno, Hisanori Kohtsuka, Toshihiko Shiroishi, Mariko Kondo

    Joint meeting of the 22nd International Congress of Zoology & the 87th meeting of the Zoological Society of Japan  2016年11月 

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    記述言語:英語   会議種別:ポスター発表  

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  • Micro-computed tomography with molecular analyses; methodological study for molecular phylogeny and developmental biology of echinoderms. 国際会議

    Akihito Omori, Akiteru Maeno, Hisanori Kohtsuka, Toshihiko Shiroishi, Mariko Kondo

    15th International Echinoderm Conference  2015年5月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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  • Immunohistochemical and molecular biological analysis on the adult nervous systems of the feather star Oxycomanthus japonicus 国際会議

    Akihito Omori, Daisuke Kurokawa, Koji Akasaka

    14th International Echinoderm Conference  2012年8月 

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    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

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共同研究・競争的資金等の研究

  • 佐渡島固有種サドナデシコナマコの生息状況および生殖生態の解明

    2018年4月 - 2020年3月

    公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団  内田エネルギー科学振興財団試験研究費助成 

    大森 紹仁

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

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担当経験のある授業科目(researchmap)

  • 農学入門Ⅰ・Ⅱ

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学フィールド科学人材育成プログラム

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  • 海洋フィールド生物学実習

    2019年
    -
    現在
    機関名:新潟大学フィールド科学人材育成プログラム

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  • 水圏生態学

    2019年
    -
    現在
    機関名:新潟大学フィールド科学人材育成プログラム

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  • 系統動物学

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学理学部生物学プログラム

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  • 系統分類学

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学フィールド科学人材育成プログラム

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  • 環境生物学野外実習C

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学理学部自然環境科学プログラム

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  • フィールド安全論

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学フィールド科学人材育成プログラム

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  • 面接授業「海洋生物の多様性と適応進化」

    2018年
    機関名:放送大学

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  • 生物学総合演習

    2017年
    -
    現在
    機関名:新潟大学理学部生物学プログラム

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  • 臨海実習Ⅰ

    2017年
    -
    現在
    機関名:新潟大学理学部生物学プログラム

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  • 野外実習

    2016年
    機関名:東邦大学理学部

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  • 科学英語演習

    2015年
    機関名:東京大学理学部生物学科

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  • 特別臨海実習

    2014年
    -
    2017年
    機関名:東京大学理学部生物学科

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  • 生物科学共通実習

    2014年
    -
    2017年
    機関名:東京大学理学部生物学科

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  • 生物学実験集中

    2014年
    -
    2016年
    機関名:慶應義塾大学理工学部

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  • 全学体験ゼミナール「海で学ぶ」

    2012年
    -
    2016年
    機関名:東京大学

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担当経験のある授業科目

  • 課題研究II(生物学)

    2021年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 環境生物学野外実習C

    2021年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 臨海実習II

    2021年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 農学入門Ⅰ

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 卒業論文Ⅰ

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 農学入門Ⅱ

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 卒業論文Ⅱ

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 水圏生態学

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 海洋フィールド生物学実習

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 卒業論文

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 生物学総合演習

    2020年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 先端臨海実習

    2019年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 系統分類学

    2019年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 環境生物学野外実習B

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 動物生理学III

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 系統動物学

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 海洋生物学実験

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • フィールド安全論

    2018年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 総合力アクティブ・ラーニング

    2018年
    機関名:新潟大学

  • 森・里・海フィールド実習

    2018年
    機関名:新潟大学

  • 臨海実習I

    2017年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 内分泌学演習

    2017年
    -
    現在
    機関名:新潟大学

  • 課題研究I(生物学)

    2017年
    機関名:新潟大学

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