Kyoto University   Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research   Program-Specific Researcher

2015.6 - 2017.3

（株）島津製作所   田中耕一記念質量分析研究所   研究員（嘱託）

2014.10 - 2015.3

（株）島津製作所   田中最先端研究所   研究員（嘱託）

2014.4 - 2014.9

（株）島津製作所   田中最先端研究所   内閣府FIRSTプログラム研究員（嘱託）

2011.4 - 2014.3

The University of Tokushima   The Institute for Enzyme Research   Researcher   Program-specific Assisntant Professor

2009.1 - 2011.3

National Institute of Advanced Industrial Science and Technology

2007.4 - 2008.12

Seisen College   Lecturer (part-time)

1995.4 - 1997.3

Kyoto Women's University   Faculty of Arts / Junior College Department / Liberal Arts Education   Lecturer (part-time)

1992.10 - 2007.3

Kyoto Women's University   Faculty of Arts   Lecturer (part-time)

1991.10 - 1992.3

The jPOST environment: an integrated proteomics data repository and database. Reviewed

Moriya Y, Kawano S, Okuda S, Watanabe Y, Matsumoto M, Takami T, Kobayashi D, Yamanouchi Y, Araki N, Yoshizawa AC, Tabata T, Iwasaki M, Sugiyama N, Tanaka S, Goto S, Ishihama Y

Nucleic acids research   47 ( D1 )   D1218 - D1224   2019.1

Meeting Report of the International Life Science Integration Workshop 2018 Reviewed International coauthorship International journal

[No authors listed: Contributors] Yamada I, Akase S, Angata K, Aoki NP, Arita M, Campbell MP, Edwards N, Fujita A, Garcia L, Goto S, Henrissat B, Hosoda M, Ishihama Y, Kawasaki T, Kuoka T, Kurisu G, Lee S, Lisacek F, Mariethoz J, Narimatsu H, Neelamegham S, Okuda S, Ono T, Packer NH, Ranzinger R, Shinmachi D, Shiota M, Toukach P, Tsuchiya S, Watanabe Y, Yoshizawa AC, Aoki-Kinoshita KF

Glycobiology   28 ( 8 )   552 - 555   2018.8

jPOSTrepo: an international standard data repository for proteomes Reviewed

Okuda S, Watanabe Y, Moriya Y, Kawano S, Yamamoto T, Matsumoto M, Takami T, Kobayashi D, Araki N, Yoshizawa AC, Tabata T, Sugiyama N, Goto S and Ishihama Y

Nucleic acids research   45 ( D1 )   D1107 - D1111   2017.1

Identification of human basic fetoprotein as glucose-6-phosphate isomerase by using N- and C-terminal sequence tags and terminal tag database. Reviewed

Kuyama H, Yoshizawa AC, Nakajima C, Hosako M, Tanaka K

Journal of pharmaceutical and biomedical analysis   112   116 - 125   2015.8

GlycanAnalysis Plug-in: a database search tool for N-glycan structures using mass spectrometry. Reviewed

Morimoto K, Nishikaze T, Yoshizawa AC, Kajihara S, Aoshima K, Oda Y, Tanaka K

Bioinformatics (Oxford, England)   31 ( 13 )   2217 - 2219   2015.7

Computational survey of sequence specificity for protein terminal tags covering nine organisms and its application to protein identification. Reviewed

Yoshizawa AC, Fukuyama Y, Kajihara S, Kuyama H, Tanaka K

Journal of proteome research   14 ( 2 )   756 - 767   2015.2

A simple peak detection and label-free quantitation algorithm for chromatography-mass spectrometry Reviewed

Aoshima K, Takahashi K, Ikawa M, Kimura T, Fukuda M, Tanaka S, Parry HE, Fujita Y, Yoshizawa AC, Utsunomiya S, Kajihara S, Tanaka K, Oda Y

BMC Bioinformatics   15   376   2014.11

Computational Proteomics : Database-run Identification of Post-Translational Modification Invited

Yoshizawa AC, Tabata T, Kimura T, Aoshima K, Fukuyama Y, Kajihara S, Kuyama H, Oda Y, Tanaka K

128 ( 10 )   504 - 509   2014.10

Mass plus plus : A Visualization and Analysis Tool for Mass Spectrometry Reviewed

Tanaka S, FujitaY, Parry HE, Yoshizawa AC, Morimoto K, Murase M, Yamada Y, Yao J, Utsunomiya S, Kajihara S, Fukuda M, Ikawa M, Tabata T, Takahashi K, Aoshima K, Nihei Y, Nishioka T, Oda Y, Tanaka K

Journal of proteome research   13 ( 8 )   3846 - 3853   2014.8

Integrated proteomics identified novel activation of dynein IC2-GR-COX-1 signaling in neurofibromatosis type I (NF1) disease model cells. Reviewed

Hirayama M, Kobayashi D, Mizuguchi S, Morikawa T, Nagayama M, Midorikawa U, Wilson MM, Nambu AN, Yoshizawa AC, Kawano S, Araki N

Molecular & cellular proteomics : MCP   12 ( 5 )   1377 - 1394   2013.5

KEGG OC: a large-scale automatic construction of taxonomy-based ortholog clusters. Reviewed

Nakaya A, Katayama T, Itoh M, Hiranuka K, Kawashima S, Moriya Y, Okuda S, Tanaka M, Tokimatsu T, Yamanishi Y, Yoshizawa AC, Kanehisa M, Goto S

Nucleic acids research   41 ( Database issue )   D353 - 7   2013.1

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis protein database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with user rating and reviewing functionality Reviewed

Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Sasakura Y, Yamasaki C, Sera M, Yoshizawa AC, Imanishi T, Taniguchi H, and Inaba K

Nucleic acids research   39 ( Database issue )   D807 - D814   2011.1

ODB: a database for operon organizations, 2011 update Reviewed

Okuda S, Yoshizawa AC

Nucleic acids research   39 ( Database issue )   D552 - D555   2011.1

Crystal structure of aminomethyltransferase in complex with dihydrolipoyl-H-protein of the glycine cleavage system: implications for recognition of lipoyl protein substrate, disease-related mutations, and reaction mechanism. Reviewed

Okamura-Ikeda K, Hosaka H, Maita N, Fujiwara K, Yoshizawa AC, Nakagawa A, Taniguchi H

The Journal of biological chemistry   285 ( 24 )   18684 - 18692   2010.6

An age-related homeostasis mechanism is essential for spontaneous amelioration of hemophilia B Leyden. Reviewed

Kurachi S, Huo JS, Ameri A, Zhang K, Yoshizawa AC, Kurachi K

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   106 ( 19 )   7921 - 7926   2009.5

Comprehensive analysis of glycosyltransferases in eukaryotic genomes for structural and functional characterization of glycans. Reviewed

Hashimoto K, Tokimatsu T, Kawano S, Yoshizawa AC, Okuda S, Goto S, Kanehisa M

Carbohydrate research   344 ( 7 )   881 - 887   2009.5

The repertoire of desaturases and elongases reveals fatty acid variations in 56 eukaryotic genomes. Reviewed

Hashimoto K, Yoshizawa AC, Okuda S, Kuma K, Goto S, Kanehisa M

Journal of lipid research   49 ( 1 )   183 - 191   2008.1

KAAS: an automatic genome annotation and pathway reconstruction server. Reviewed

Moriya Y, Itoh M, Okuda S, Yoshizawa AC, Kanehisa M

Nucleic acids research   35 ( Web Server issue )   W182 - 5   2007.7

Extracting sequence motifs and the phylogenetic features of SNARE-dependent membrane traffic. Reviewed

Yoshizawa AC, Kawashima S, Okuda S, Fujita M, Itoh M, Moriya Y, Hattori M, Kanehisa M

Traffic (Copenhagen, Denmark)   7 ( 8 )   1104 - 1118   2006.8

The repertoire of desaturases for unsaturated fatty acid synthesis in 397 genomes. Reviewed

Hashimoto K, Yoshizawa AC, Saito K, Yamada T, Kanehisa M

Genome informatics. International Conference on Genome Informatics   17 ( 1 )   173 - 183   2006

A Standpoint of Education of Informatics in the Liberal Arts [Reprint]

Yoshizawa, AC

21 ( 3 )   328 - 333   2004

A Standpoint of Education of Informatics in the Liberal Arts

Yoshizawa, AC

Proceedings of Department of Education, Kyoto Women's University   39   131 - 142   1999

Problems on Education of Computer Science for Female Undergraduate Students (I)

Yoshizawa, AC

Proceedings of Department of Education, Kyoto Women's University   38   78 - 87   1998

Problems on Education of Computer Science for Female Undergraduate Students (II) ; On the Internet Literacy

Yoshizawa, AC

Proceedings of Department of Education, Kyoto Women's University   38   88 - 93   1998

Development of a Streak-Camera-Based Time-Resolved Microscope Fluorimeter and Its Application to Studies of Membrane Fusion in Single Cells Reviewed

Kusumi A, Tsuji A, Murata M, Sako Y, Yoshizawa AC, Kagiwada S, Hayakawa T, and Ohnishi S

Biochemistry   30   6517 - 6527   1991.7

jPOST:プロテオームデータベースの開発

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本生化学会大会(Web)   90th   ROMBUNNO.3P‐0173 (WEB ONLY) - 0173]   2017

Which Database to Use? —Confusions and Puzzles in Database Search and Sequence Analysis— Invited Reviewed

Yoshizawa Akiyasu C

Proteome Letters   1 ( 2 )   63 - 80   2016.9

Construction of proteome database

吉沢 明康

京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム研究成果報告書   2015   23 - 23   2016.3

jPOST:プロテオーム解析ワークフローの標準化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

日本生化学会大会(Web)   88th   3P0417 (WEB ONLY) - [3P0417]   2015.12

Mass++、MassBankを用いた脂質同定システムの構築

田中 聡, 吉沢 明康, 草野 麻衣子, 藤田 雄一郎, 福田 充, 宇都宮 眞一, 梶原 茂樹, 田畑 剛, 高橋 健太郎, 青島 健, 小田 吉哉, 二瓶 義人, 西岡 孝明, 田中 耕一

JSBMS Letters   38 ( Suppl. )   95 - 95   2013.8

Crystal structure of T-H protein complex of the glycine cleavage system International journal

Okamura-Ikeda, K, Hosaka, H, Maita, N, Fujiwara, K, Yoshizawa, A.C, Nakagawa, A, Taniguchi, H

Acta Crystallographica Section A Foundations of Crystallography   67 ( a1 )   C434 - C435   2011.8

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments International journal

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Nature Precedings, Biocuration 2010   2011.1

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein Database - a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating and comments International journal

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Genome Biology   11 ( S1 )   2010.10

KEGG OC:全生物種ゲノムにおけるオーソログ遺伝子のバリエーションと高速検索技術

片山俊明, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

生化学   80 ( 抄録CD )   4T9-4 - 4   2008.11

Aging and gerotological diseases in relation to age-related homeostasis and age dimension technology Reviewed

KURACHI Kotoku, KURACHI Sumiko, HAMADA Toshiyuki, SUENAGA Emi, YOSHIZAWA Akiyasu C

Japanese journal of geriatrics   45 ( 2 )   126 - 131   2008.3

遺伝子エレメントASE結合核蛋白質の同定 年齢軸恒常性分子機構の確立に向けて

倉地 須美子, 笠間 絵美, 田中 拓, 吉沢 明康, 倉地 幸徳

日本血栓止血学会誌   18 ( 5 )   460 - 460   2007.10

Analysis of Tissue Specific Expression Patterns of Isozymes International journal

Takarabe, M, Tsuchida, A, Fujita, M, Okuda, S, Yoshizawa, AC, Yamada, T, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2006 Poster Abstracts   17   2006.12

The Analysis of the Eukaryotic Intracellular Vesicular Transport

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成17年度 研究成果報告書   96 - 97   2006.3

The Analysis of the Intracellular Vesicular Transport Pathways

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成16年度 研究成果報告書   65 - 66   2005.3

Functional Classification of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes International journal

Yoshizawa, AC, Okuda, S, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Kawano, S, Okamoto, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004.12

Automatic generation of KEGG OC (Ortholog Cluster) and its assignment to draft genomes International journal

Moriya, Y, Katayama, T, Nakaya, A, Itoh, M, Yoshizawa, AC, Okuda, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004.12

Functional Categorization of Multiple Genomes using KEGG OC in the Genome Indices International journal

Okuda, S, Yoshizawa, AC, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004.12

Analysis of the bacterial sequences recognized by RNA-binding proteins and compounds International journal

Muto, A, Yoshizawa, AC, Okuda, S, Itoh, M, Hattori, M, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004.12

Integration of Biological Features of Multiple Genomes - The Construction of "Genome Indices" database - International journal

Okuda, S, Yoshizawa, AC, Moriya, Y, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, IBSB 2004 Poster Abstracts   15   2004.5

Prediction and Comparison of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes International journal

Yoshizawa, AC, Okuda, S, Itoh, M, Katayama, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, IBSB 2004 Poster Abstracts   15   2004.5

The Analysis of the Proteins Participated in the Intracellular Vesicular Transport

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成15年度 研究成果報告書   73 - 74   2004.3

Extraction of Organism Groups from Whole Genome Comparisons International journal

Yamanishi, Y, Yoshizawa, AC, Itoh, M, Katayama, T, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   438 - 439   2003.12

The Construction of a Database for Ubiquitin Signaling Cascade International journal

Sakiyama, T, Kawashima, S, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   653 - 654   2003.12

Analysis of Domain Combinations in Eukaryotic Genomes International journal

Itoh, M, Yoshizawa, AC, Okuda, S, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   434 - 435   2003.12

Comprehensive Survey of Intracellular Transport System-Related Proteins in Complete Genomes and Draft Genomes International journal

Yoshizawa, AC, Itoh, M, Okuda, S, Limviphuvadh, V, Sakiyama, T, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   436 - 437   2003.12

Metabolic pathway reconstruction for malaria parasite Plasmodium falciparum International journal

Limviphuvadh, V, Okuno, Y, Katayama, T, Goto, S, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   368 - 369   2003.12

The Analysis of the Intracellular Vesicular Transport System

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成14年度 研究成果報告書   66 - 68   2003.3

Comparative analysis of Rab GTPases and SNAREs in eukaryotic genomes International journal

Yoshizawa, AC, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   13   404 - 405   2002.12

Indirect relations in yeast protein interactome International journal

Nakaya, A, Yoshizawa, AC, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   13   328 - 329   2002.12

The Analysis of the Intracellular Vesicular Transport.

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成13年度 研究成果報告書   80 - 82   2002.3

Extraction of related genes in the vesicular transport by simultaneous comparison of two-hybrid and microarray data International journal

Yoshizawa, AC, Nakaya, A, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   12   243 - 244   2001.12

The construction of a database on the intracellular vesicular transport International journal

Yoshizawa, AC, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   11   276 - 277   2000.12

Development of a Time-Resolved Microfluorimeter with a Synchroscan Streak Camera and Its Application to Studies of Cell Membranes International journal

Kusumi, A, Tsuji, A, Murata, M, Sako, Y, Yoshizawa, AC, Hayakawa, T, Ohnishi, S

Time-Resolved Laser Spectroscopy in Biochemistry (Proceedings of SPIE)   1988.5

Protein identification by massspectrogram hierarchical clustering in shotgun-proteomics

Hikita, T., Kibe, K., Yoshizawa, A.C, Tabata, T., Yoshii, K., Ishihama, Y.

The 141st Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan  2021.3  Pharmaceutical Society of Japan

World of Computational Mass Spectrometry: Where Does It Come From?What Is It? Where Is It Going to? Invited

Yoshizawa, A.C.

nformatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2020 (IIBMP: JSBi Congress 2020)  2020.9  Japanese Society for Bioinformatics

An extension of Mass++ ver.4, a data viewer, for proteome analysis International conference

Tanaka, S., Murase, M., Kato, M., Tabata, T., Kusano, M., Kawano, S., Goto, S., Ishihama, Y., Yoshizawa, A.C.

ASMS 2020 Reboot (68th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics)  2020.6  ASMS

jPOST統合環境の機能深化と連携基盤強化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2019  2019.10  バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

Mass++ ver.4 - An open-source MS data viewer with enhanced basic functions and easy implementation of external software International conference

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, AC

ASMS 2023 (70th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics)  2023.6 

Temporal Analysis of Proteome and Phosphoproteomeof the SARS-CoV-2 Infected Cell International conference

Watanabe, Y, Muramoto, Y, Oda, Y, Ogata, K, Yoshizawa, A, Sugiyama, N, Noda, T, Toyoshima, F, Ishihama, Y

6th International Symposium of Kyoto Biomolecular Mass Spectrometry Society/International Symposium on Mass Spectrometry Imaging 2023 Kyoto  2023.1 

Mass++ ver.4 -MS data viewer meets online databases- International conference

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, AC

Human Proteome Organization World Congress (HUPO2022)  2022.12 

jPOST:「コミュニティ・ベース論文調査」によるメタデータキュレーションの加速

吉沢明康, 守屋勇樹, 小林大樹, 張智翔, 奥田修二郎, 田畑剛, 河野信, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 岩崎未央, 杉山直幸, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 石濱 泰

トーゴーの日シンポジウム2022  2022.10 

There're five mysteries about jPOST Invited

Yoshizawa, AC

JPrOS2022 Conference (20th JHUPO Congress)  2022.8 

Development of Mixed MS/MS Spectrogram Decomposition for DIA Proteomics

Machida, K, Uemura, K, Tabata, T, Ogata, K, Yoshizawa, AC, Yoshii, K, Tanaka, T, Ishihama, Y

The 3rd Workshop on Biological Molecule Analysis  2022.3 

Development of Mixed MS/MS Spectrogram Decomposition for DIA Proteomics

Machida, K, Uemura, K, Tabata, T, Ogata, K, Yoshizawa, AC, Yoshii, K, Tanaka, T, Ishihama, Y

The 142nd Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan  2022.3 

jPOSTrepoメタデータのSDRF化

有馬佳奈美, 岡本瑠璃, 小林大樹, 吉沢明康, 河野信

トーゴーの日シンポジウム2021  2021.10 

jPOSTdb: COVID-19データベースの構築

吉沢明康, 守屋勇樹, 小林大樹, 張智翔, 奥田修二郎, 田畑剛, 河野信, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 岩崎未央, 杉山直幸, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 石濱 泰

トーゴーの日シンポジウム2021  2021.10 

jPOSTリポジトリの機能強化

渡辺由, 奥田修二郎, 守屋勇樹, 河野信, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 幡野敦, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2020  2020.10  バイオサイエンスデータベースセンター

トリプシン消化ペプチドの衝突誘起解離スペクトルの予測とショットガンプロテオミクスへの応用

橘本哲志, 吉沢明康, 吉井和佳, 石濱泰

日本薬学会第140年会（大会開催中止、要旨web公開を以て発表成立と規定）  2020.3  日本薬学会

Statistical Joint Protein and Peptide Quantification Based on Hierarchical Clustering of Mass Spectrograms International conference

Kibe, K., Yoshizawa, A.C., Tabata,T., Yoshii, K., Ishihama, Y.

4th International Symposium of the Kyoto Biomolecular Mass Spectrometry Society (KBMSS)  2020.2  KBMSS

Database Development for Proteomics Invited

Yoshizawa, A.C.

2019.12  Kumamoto Univ. Medical School

マススペクトログラムの階層クラスタリングに基づくタンパク質同定

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

第42回日本分子生物学会年会  2019.12  日本分子生物学会

配列タグを用いたタンパク質配列超高速検索システムの開発

吉沢明康, 内藤雄樹, 早川英介, 五斗進, 石濱泰

第42回日本分子生物学会年会  2019.12  日本分子生物学会

深層学習を用いたペプチド由来質量分析イオンピークの検出法の開発

守屋勇樹, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 吉沢明康

第42回日本分子生物学会年会  2019.12  日本分子生物学会

プロテオームデータベースjPOSTの挑戦

石濱泰, jPOST project

トーゴーの日シンポジウム2019  2019.10 

Peptide end sequence information in HCD spectra for protein identification International conference

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019.9 

Mass++ ver.4: an open-source, simple and extensible MS data viewer International conference

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, A

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019.9 

Network analysis of proteogenomics data in lung cancer cell lines International conference

Watanabe Y, Ling Y, Uemura H, Yoshizawa, A.C, Ishihama Y, Okuda S

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019.9 

UniScore, a universal measure for annotated peptide product ion spectra International conference

Tabata, T, Yoshizawa, A.C, Sugiyama, N, Ishihama, Y

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019.9 

プロテオゲノミクスのための解析プラットフォーム開発

上村駿人, 吉沢明康, 杉山直幸, 奥田修二郎, 石濱泰

日本分析化学会 第68年会  2019.9 

Development of Annotation Support Tool with SPARQL and Sequence Cluster

YOSHIZAWA Akiyasu C

IIBMP2019  2019.9 

階層クラスタリングを用いたLC/MS/MSマススペクトログラムのタンパク質同定

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

PPF2019 第17回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム  2019.9 

Improvement of protein identification accuracy using posterior peptide sequence tags

Yoshizawa A.C, Tabata, T, Iwasaki, M, Sugiyama, N, Käll, L, Ishihama, Y

2019.7  Japanse Proteomics Society

Claque and Decoy -Discriminating real results from false results for computational proteomics- Invited

YOSHIZAWA Akiyasu C

Pre Meeting of 3rd Hackathon for Computational Mass Spectrometry  2019.7  Computational Mass Spectrometry SIG (JSBi)

The sushi proteome project towards unveiling dietary metaproteomes without genomic information International conference

Nishida, H, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Okuda, S, Ishihama, Y

67th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics  2019.6  ASMS (American Society for Mass Spectrometry)

High Accuracy Protein Identification Using Posterior Peptide Sequence Tags International coauthorship

Tabata, T, Yoshizawa, A, Iwasaki, M, Sugiyama, N, Käll, L, Ishihama, Y

The 67th Annual Conference on Mass Spectrometry, Japan  2019.5  The Mass Spectrometry Society of Japan

A Novel Peptide Ion Peak Picking Method Based on Deep Learning

Moriya, y, Tabata, T, Iwasaki, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y. Takigawa, I, Yoshizawa, A

The 67th Annual Conference on Mass Spectrometry, Japan  2019.5  The Mass Spectrometry Society of Japan

Development of a metaproteomics platform for microbe analysis International conference

Sakamoto, Y, Ito, M, Kashiwagi, Y, Nozaki,T, Murakami, S, Yoshizawa, A.C, Sugiyama, N, Ishihama, Y

3rd KBMSS Symposium  2019.2  Kyoto Biomolecular Mass Spectrometry Society

Metaproteomics of Mouse Tissues and Feces (3P-0081)

2018.11 

Developement of functional and interactive database for proteomics

2018.11 

Metaproteomics of Mouse Tissues and Feces (1PW1-02-3)

2018.11 

jPOSTプロジェクトが提供するプロテオミクスデータとその解析ツール Invited

五斗進, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢 明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 石濱泰

第41回日本分子生物学会年会  2018.11  日本分子生物学会

Analysis of proteome mass spectrometry data Invited

Akiyasu C. Yoshizawa

Clinical Mass Spectrometer Platform The 3rd training course on mass spectrometry  2018.11 

機械学習に基づくペプチド由来イオンピークの新規検出手法

守屋勇樹, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 吉沢明康

第21回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2018)  2018.11  電子情報通信学会 情報論的学習理論と機械学習研究会

Development of jPOST environment

2018.10 

Mass Spectrometry meets Genome Information Invited

Akiyasu C. Yoshizawa

Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2018 (IIBMP)  2018.9 

Protein Identification by Hierarchical Clustering of LC/MS/MS Mass Spectrogram

Koki Kibe, Akiyasu C. Yoshizawa, Tsuyoshi Tabata. KazuyoshiYoshii, Yasushi Ishihama

IIBMP2018  2018.9 

Mass++ ver.4: an open-source, quick and simple data viewer International conference

Satoshi Tanaka, Masaki Murase, Tsuyoshi Takahashi, Masaki Kato, Maiko Kusano, Shin Kawano, Akiyasu C. Yoshizawa, Susumu Goto, Yasushi Ishihama

66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics (ASMS2018)  2018.6 

Utilizing peptide sequence tags for controlling false discovery rates in database search International conference

Akiyasu C. Yoshizawa, Tsuyoshi Tabata, Mio Iwasaki, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama

66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics (ASMS2018)  2018.6 

プロテオミクスは環境化学に貢献できるか？ Invited

吉沢 明康

第27回環境化学討論会  2018.5  日本環境化学会・質量分析インフォマティクス研究会

Application of Non-negative Matrix Factorization in Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics (4P-40) International conference

Taechawattananant, P, Yoshizawa, AC, Yoshii, K, Ishihama, Y

MSP2018  2018.5 

Application of Non-negative Matrix Factorization in Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics (4C-O2-P-1605) International conference

Pasrawin Taechawattananant, Akiyasu C. Yoshizawa, Kazuyoshi Yoshii, Yasushi Ishihama

MSP2018  2018.5 

Metadata Curation for fully utilizing raw MS data in jPOST repository International conference

Kobayashi, D, Araki, N, Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, T, Takami, T, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Iwasaki, M, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

MSP2018  2018.5 

Accuracy of Peptide Isotope Distribution in Mass Spectra (2P-43) International conference

Kibe, K, Yoshizawa, AC, Tabata, T, Yoshii, K, Ishihama, Y

MSP2018  2018.5 

Accuracy of Peptide Isotope Distribution in Mass Spectra (2B-O3-M-1805) International conference

Kibe, K, Yoshizawa, AC, Tabata, T, Yoshii, K, Ishihama, Y

MSP2018  2018.5 

Non-negative Matrix Factorization for Mass Spectrometry-Based Protein Identification International conference

Pasrawin Taechawattananant, Akiyasu C. Yoshizawa, Kazuyoshi Yoshii, Yasushi Ishihama

RECOMB2018  2018.4 

メタプロテオミクスのためのデータ解析ワークフロー開発

上村駿人, 伊藤麻里子, 吉沢明康, 杉山直幸, 石濱泰

2018.3 

Posting more precisive pictures of proteomes Invited International conference

YOSHIZAWA Akiyasu C

International Life Science Integration Workshop  2018.3 

L1-Regularized Nonnegative Matrix Factorization for Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics International conference

Pasrawin, T, Yoshizawa, A.C, Yoshii, K, Ishihama, Y

第2回京都生体質量分析研究会 (KBMSS) シンポジウム  2018.2  京都生体質量分析研究会 (KBMSS)

jPOST:Development of proteome database

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.12 

jPOST: Development of reanalysis protocol toward control of false discovery rate in peptide identification

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.12 

jPOST: Integrated database for proteomes

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.12 

jPOST: メタデータのキュレーション

小林大樹, 荒木令江, 奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: タンパク質発現絶対量sliceの開発

松本雅記, 高見知代, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST データベースの開発

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: 再解析プロトコルによる同定結果の質的向上

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST：プロテオーム統合データベースプロジェクト

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

Controlling FalseDiscovery Rates on Large-scale Proteome Datasets in jPOST International conference

Ishihama, Y, Yoshizawa, A, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S

16th Human Proteome Organization World Congress 2017 (HUPO2017)  2017.9 

jPOST provides a global public data repository for a wide variety of proteomics experiments International conference

Watanabe, Y, Okuda, S, Moriya, Y, Kawano,S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

16th Human Proteome Organization World Congress  2017.9 

Reducing false positive identifications for proteome datasets accumulated in jPOST repository International conference

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

16th Human Proteome Organization World Congress  2017.9 

Development of integrated proteomics database: jPOST International conference

Moriya, Y, Kawano,S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

16th Human Proteome Organization World Congress  2017.9 

From Mass to Sequence, From Results to Database Invited

YOSHIZAWA Akiyasu C

JASIS2017 Conferenc  2017.9 

プロテオーム統合データベース jPOST：質量分析データ・リポジトリ（2P-16）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会2017年大会（JHUPO第15回大会）  2017.7 

jPOST: プロテオーム統合データベースの開発（2P-18）

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.7 

プロテオーム統合データベースjPOST:質量分析データ・リポジトリ (2S-2-2)

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.7 

jPOST再解析プロトコル:偽陽性と偽陰性の同時減少を目指す Invited

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.7 

jPOST:プロテオーム統合データベースの開発 (2S-2-4)

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石澤泰

2017.7 

同定結果はどこまで信頼できるか―データベース検索の落とし穴― Invited

吉沢明康

2017.7 

プロテオミクスデータ解析2「Computational ProteomicsからProteome Informaticsへ」／演習 Invited

YOSHIZAWA, Akiyasu C

The 44th Biological Mass Spectrometry Conference  2017.7 

Controlling false discovery rate in accumulated public proteome dataset International conference

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

65th ASMS(American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics  2017.6 

データベース検索エンジンを用いたタンパク質同定における特異性向上

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

2017.5 

Challenges in standardization of database search: development of the jPOST repository and the re-analysis protocol Invited International conference

YOSHIZAWA, AC

1st International Symposium of KBMSS (Kyoto Biomolecular Mass Spectrometry Society)  2017.2 

プロテオーム統合データベースjPOST:再解析プロトコルの開発

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016.12  日本分子生物学会

プロテオーム統合データベースjPOST:質量分析データ・リポジトリの公開（2P-0039）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知世, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016.12 

プロテオーム統合データベースjPOST：質量分析データ・リポジトリの公開（1PS7-4）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016.11 

jPOST:プロテオームデータベースプロジェクト

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知世, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016.11 

jPOST: 再解析考え中です

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2016  2016.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: リポジトリ始めました

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2016  2016.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: 今こんな感じです

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2016  2016.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

実はタンパク質は測定していない ～ プロテオミクスと質量分析法 ～ Invited

吉沢 明康

第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)  2016.9  日本バイオインフォマティクス学会

jPOST: repository and re-analysis protocol

Moriya, Y, Yoshizawa, AC, Tabata, T, Kawano, S, Watanabe, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

IIBMP2016  2016.9 

jPOST for Asia and Oceania: Repository Opened (P03-01) International conference

Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, AC, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016.9  AOHUPO

A Novel Data Integration Tool iPEACH Identified the Specific Molecular Networks of Cancer Stem Cells International conference

Yamasaki, Y, Nambu,A, Silsirivanit, A, Kobayashi, D, Yoshizawa, A, Kawano, S, Araki, N

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016.9 

jPOST for Asia and Oceania: Re-analysis Protocol International conference

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016.9 

jPOST for Asia and Oceania: Repository Opened (S03-01) International conference

Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016.9 

jPOST for Asia and Oceania: Current status in 2016 International conference

Moriya, Y, Kawano, S, Watanabe, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Goto, S, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016.9 

jPOST: Re-analysis Protocol International conference

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016.9 

Analysis of the specific molecular networks of cancer stem cells using a novel data integration tool iPEACH International conference

Yamasaki, Y, Nambu,A, Silsirivanit, A, Kobayashi, D, Yoshizawa, A, Kawano, S, Araki, N

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016.9 

jPOST: repository opened International conference

Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016.9 

jPOST: Current status in 2016 International conference

Moriya, Y, Kawano, S, Watanabe, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Goto, S, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016.9 

プロテオーム統合データベースjPOSTの開発 Invited

五斗進, 奥田修二郎, 渡邉由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会  2016.7 

プロテオーム統合データベースjPOST:再解析プロトコルの開発

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡邉由, 山本格, 松本雅記, 高見知世, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会  2016.7 

ポストだけれど葉書じゃない、タンパクだけど淡泊じゃない Invited

吉沢 明康

第2回バイオインフォマティクスアゴラ  2016.7 

オープンソース版Mass++:ピーク検出機能の拡充

田中聡, 太田悠葵, 村瀬雅樹, 津元裕樹, 草野麻衣子, 吉沢明康, 三浦ゆり, 川崎ナナ, 五斗進

2016.5 

質量スペクトルはデータベース検索“グレーゾーン”を明瞭化するか

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

質量分析総合討論会  2016.5 

jPOST:プロテオーム解析ワークフローの標準化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

2015.12 

オープンソース版Mass++によるオミックス解析

2015.12 

jPOST: Development of a high-quality proteome database

Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, AC, Goto, S, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

第4回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2015)  2015.10  日本バイオインフォマティクス学会

Open-sourced Mass++ for Mass Spectrometric Data Analysis

Murase, M, Tanaka, S, Yoshizawa, AC, Goto, S

2015.10 

Search space reduction by utilizing known modification information for proteomic database search

Yoshizawa, AC, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y

第4回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2015)  2015.10  日本バイオインフォマティクス学会

タンパク質同定とデータベース

吉沢 明康

jPOST Workshop: Computational Proteomics  2015.10 

jPOST (Japan Proteome Standard Repository/Database)：プロテオーム・データの標準化と統合

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2015  2015.10  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: Development of Japan ProteOme STandard repository/database International conference

Kawano, S, Moriya, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

14th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2015)  2015.9 

融合プロテオミクスの統合ソフトウェア iPEACH によるグリオーマ幹細胞の維持と分化に関わるネットワーク解析

山崎義宗, 河野信, 吉沢明康, 南部晶子, 水口惣平, 小林大樹, 長山慈, 永井美奈子, Silsirivanit Atit, 佛淵尚人, 荒木令江

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015.7  日本プロテオーム学会

日本発の高品質プロテオームデータベース：jPOST

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015.7  日本プロテオーム学会

オープンソース版Mass++とプロテオーム解析

田中 聡, 村瀬雅樹, 吉沢明康, 五斗 進

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015.7  日本プロテオーム学会

どのデータベースを使うか ～データベース検索と配列解析・誤解と難題～ Invited

吉沢 明康

日本プロテオーム学会2015年会  2015.7  日本プロテオーム学会

データベースを使ったタンパク質同定 Invited

吉沢 明康

JHUPO2015プロテオミクストレーニングコース  2015.7 

オープンソース版Mass++

田中聡, 田中聡, 吉沢明康, 吉沢明康, 五斗進

質量分析総合討論会講演要旨集  2015.6 

質量分析ソフトウェアMass++を用いたN型糖鎖負イオンMS/MSスペクトルの解析

森本健太郎, 西風隆司, 吉沢明康, 梶原茂樹, 青島健, 小田吉哉, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2014.5 

Mass++:同定機能と翻訳後修飾文献DBとの連携

田中聡, 吉沢明康, 田畑剛, 草野麻衣子, 青島健, 宇都宮眞一, 梶原茂樹, 小田吉哉, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2014.5 

Cross-organism comparison of protein terminal sequences and development of terminal sequence database

Yoshizawa, AC, Fukuyama, Y, Kajihara,S, Kuyama, H, Tanaka, K

日本分子生物学会年会  2013.12 

計算プロテオミクス：データベースを利用したタンパク質翻訳後修飾の同定 Invited

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 福山裕子, 梶原茂樹, 九山浩樹, 小田吉哉, 田中耕一

第694回新潟医学会シンポジウム「生命システムの理解に向けたバイオインフォーマティクス」  2013.11  新潟医学会

Mass++, MassBank を用いた脂質同定システムの構築

田中聡, 吉沢明康, 草野麻衣子, 藤田雄一郎, 福田充, 宇都宮眞一, 梶原茂樹, 田畑剛, 高橋健太郎, 青島健, 小田吉哉, 二瓶義人, 西岡孝明, 田中耕一

日本医用マススペクトル学会第38回年会  2013.9 

融合プロテオミクスによる神経線維腫症1型(NF1)病態モデル細胞内活性化シグナルDynein IC2‐GR‐COX‐1の同定

小林大樹, 平山未央, 水口惣平, 森川崇, 長山慈, 緑川宇一, WILSON‐MORIFUJI Masayo, 南部(新堀)晶子, 吉沢明康, 河野信, 荒木令江

日本生化学会大会(Web)  2013.9 

Mass++:質量分析データの一括解析

田中聡, 藤田雄一郎, 吉沢明康, 福田充, 宇都宮眞一, 梶原茂樹, 青島健, 小田吉哉, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013.9 

質量分析用データ解析ソフトウェアMass++とマススペクトルデータベースMassBank連携プラグインの開発

青島健, 福田充, 井川幹之, 高橋健太郎, 木村剛之, 梶原茂樹, 宇都宮眞一, 田中聡, 吉沢明康, 田中耕一, 池田奨, 二瓶義人, 西岡孝明, 小田吉哉

質量分析総合討論会講演要旨集  2013.9 

ユーザーによる処理の追加可能なproteome解析プラットフォームJobRequestと,それを利用したタンパク質同定ツールProteoAnalysis

田畑剛, 吉沢明康, 山本昇, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013.9 

ヒトタンパク質末端配列データベースの構築と末端配列の一意性の推定

吉沢明康, 福山裕子, 梶原茂樹, 九山浩樹, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013.9 

液体マトリックス3AQ/CHCAを用いたがんマーカータンパク質BFPの構造解析

寶迫睦美, 九山浩樹, 中島ちひろ, 福山裕子, 吉沢明康, 川畑慎一郎, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013.9 

Development of ProteomeTools - a web application suite for proteomics experiment International conference

Tabata, T, Yoshizawa, A.C, Ohta, Y, Kusano, M, Yamamoto, N, Aoshima, K, Kajihara, S, Oda, Y, Tanak,a K

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013.9 

Cross-organism comparison of the uniqueness in protein terminal region sequences International conference

Yoshizawa, A.C, Fukuyama, Y, Kajihara, S, Kuyama, H, Tanaka, K

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013.9 

A simple and fast label-free quantitation algorithm for LC-MS International conference

Aoshima, K, Ikawa, M, Kimura, T, Fukuda, M, Takahashi, K, Tanaka, S, Fujita, Y, Yoshizawa, A.C, Utsunomiya, S, Kajihara, S, Tanaka, K, Oda, Y

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013.9 

iPEACH: Integrated Protein/Gene Expression Analysis Chart International conference

Kawano, S, Yoshizawa, A.C, Mizuguchi, S, Araki, N

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013.9 

Integrated Proteomics Identified Novel Activation of Dynein IC2-GR-COX-1 Signaling by Suppression of NF1 Tumor Suppressor Gene Product, Neurofibromin, in Neuronal Cells International conference

Kobayashi, D, Hirayama, M, Mizuguchi, S, Morikawa, T, Nagayama, M, Midorikawa, U, Wilson-Morifuji, M, Nambu-Niibori, A, Yoshizawa, A.C, Kawano, S, Araki, N

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013.9 

Identification and label-free quantitation of mass spectrometric data via freely available plug-in software, Mass++ International conference

Tanaka, S, Fujita, Y, Yoshizawa, A.C, Utsunomiya, S, Kajihara, S, Fukuda, M, Ikawa, M, Takahashi, K, Tabata, T, Aoshima, K, Oda, Y, Tanaka, K

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013.9 

MSPTM-DB: a Known Post-Translational Modification Database and Its Implementation Web Site "ProteoAnalysis"

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

日本分子生物学会年会  2012.12 

KEGG OC: automatically constructed comprehensive ortholog cluster based on taxonomic relation

Moriya, Y, Nakaya, A, Katayama, T, Itoh, M, Hiranuka, K, Kawashima, S, Okuda, S, Tanaka, M, Tokimatsu, T, Yamanishi, Y, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M, Goto, S

日本分子生物学会年会  2012.12 

JobRequest - an easy-to-use software platform for proteomic analysis - and ProteoAnalysis, its application for protein identification International conference

Tabata, T, Yoshizawa, A.C, Kimura, T, Nakamura, T, Aoshima, K, Oda, Y, Kajihara, S, Tanaka, K

19th International Mass Spectrometry Conference (IMSC2012)  2012.9 

MSPTM-DB: a known PTM database for high-speed and accurate search available on the "ProteoAnalysis" web site International conference

Yoshizawa, A.C, Tabata T, Kimura T, Aoshima K, Oda Y, Kajihara S, Tanaka K

19th International Mass Spectrometry Conference (IMSC2012)  2012.9 

計算プロテオミクス手法を用いたタンパク質翻訳後修飾の同定 Invited

吉沢 明康

熊本大学拠点形成研究Bセミナー「プロテオミクスを基盤とした病態システムズバイオロジー教育研究拠点の構築」  2012.6 

質量分析データベース検索への翻訳後修飾情報の利用

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

日本分子生物学会年会  2011.12 

Application of post-translational modification information in database search

2011.9 

Crystal structure of T-H protein complex of the glycine cleavage system International conference

Okamura-Ikeda, K, Hosaka, H, Maita, N, Fujiwara, K, Yoshizawa, A.C, Nakagawa, A, Taniguchi, H

XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2011.8 

Genome Context of Cellulose Biosynthesis Related Gene Families

BMB2010  2010.12 

仮想ゲルを用いたLC/MSデータの表示とタンパク質修飾の探索プログラム

吉沢明康, 山田力志, 谷口寿章

BMB2010  2010.12 

構造解析から明らかになったグリシン開裂酵素系T蛋白質によるアミノメチル転移の新たな反応機構

池田和子, 保坂晴美, 真板宣夫, 藤原和子, 吉沢明康, 中川敦史, 谷口寿章

BMB2010  2010.12 

プロテオミクス解析データのデータベース化 Invited

吉沢 明康

疾患酵素学研究センターセミナー  2010.11 

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein Database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating and comments International conference

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Beyond the Genome 2010  2010.10 

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments International conference

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Biocuration 2010  2010.10 

CIONA INTESTINALIS PROTEIN DATABASE CIPRO SHOWS A VARIETY OF PROTEOMES FOR A SINGLE SPECIES

遠藤俊徳, 上野恵介, 米澤弘毅, 峯田克彦, 堀田耕司, 佐藤ゆたか, 山田力志, 小笠原道生, 高橋弘樹, 中島綾子, 中地美都, 野村守, 谷口順子, 紺野在, 笹倉靖徳, 吉沢明康, 谷口寿章, 今西規, 稲葉一男

Computational Biology Research Center Workshop 2010 (CBRC2010)  2010.7 

セルロース合成関連遺伝子群のゲノムコンテキスト解析

河野信, 橋本浩介, 吉沢明康

セルロース学会年次大会講演要旨集  2010.7 

Western Blot-like Presentation of Gel-enhanced LC/MS Data and Software-based Detection of Protein Modifications International conference

Yoshizawa, A.C, Yamada, L, Taniguchi, H

RECOMB(Research in Computational Molecular Biology) Satellite Conference on Computational Proteomics 2010  2010.3 

Global protein profiling of ascidian C. intestinalis: toward the comprehensive understanding at the protein level International conference

Yamada, L, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H

5th International Tunicate Meeting  2009.6 

Ascidian Adult Body Map: A proteomic view of adult ascidian tissues International conference

Yoshizawa, A.C, Yamada, L, Nakachi, M, Inaba, K, Ogasawara, M, Taniguchi, H

5th International Tunicate Meeting  2009.6 

Ascidian Adult Body Map：質量分析によるホヤ・プロテオーム・データベースの構築

吉沢明康, 山田力志, 中地美都, 稲葉一男, 小笠原道生, 谷口寿章

日本分子生物学会第9回春季シンポジウム  2009.5 

KEGG OC: 全生物種ゲノムにおけるオーソログ遺伝子のバリエーションと高速検索技術（4P-0985）

片山俊明, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久 實

第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)  2008.12 

マウス肝臓蛋白質発現の年齢依存変化のGene Ontology解析

吉沢明康, BOLOTOVA Tatiana, 倉地幸徳, 倉地須美子

BMB2008  2008.12 

KEGG OC:全生物種ゲノムにおけるオーソログ遺伝子のバリエーションと高速検索技術（4T9-4）

片山俊明, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

BMB2008  2008.12 

KEGG OC:網羅的なオーソログクラスターの自動生成

中谷明弘, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 片山俊明, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

BMB2008  2008.12 

KEGG OC:オーソログクラスターのマニュアルアノテーション

川島秀一, 伊藤真純, 奥田修二郎, 片山俊明, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

BMB2008  2008.12 

網羅的データの解析による生物学的知識の抽出

吉沢 明康

疾患酵素学研究センターセミナー  2008.9 

ゲノム決定済み生物種からの多糖類生合成酵素の網羅的抽出

河野 信, 吉沢明康, 橋本浩介, 高木利久

セルロース学会第15回年次大会  2008.7 

Global analyses of age-related expression profiles of mouse liver proteins and database construction International conference

Kurachi, S, Bolotova, T, Suenaga, E, Yoshizawa, AC, Kurachi, K

The Joint 4th AOHUPO (Asian Oceania Human Proteome Organisation) and PRICPS (Pacific Rim International Conference on Protein Science)  2008.6 

マウス肝臓における遺伝子発現の年齢依存変化

吉沢明康, 末永恵美, 倉地須美子, 倉地幸徳

日本分子生物学会第8回春季シンポジウム  2008.5 

Pseudo-clique extraction method towards comprehensive clusters of orthologous genes in KEGG

中谷明弘, 片山俊明, 川島秀一, 伊藤真純, 山西芳裕, 奥田修二郎, 守屋勇樹, 吉沢明康, 金久 實

2007年日本バイオインフォマティクス学会年会  2007.12 

DesaturaseとElongaseの網羅的探索及びその組合せによる脂肪酸予測

橋本浩介, 吉沢明康, 奥田修二郎, 隈啓一, 五斗進, 金久實

BMB2007  2007.12 

遺伝子エレメントASE結合核蛋白質の同定:年齢軸恒常性分子機構の確立に向けて

倉地須美子, 笠間絵美, 田中拓, 吉沢明康, 倉地幸徳

日本血栓止血学会誌  2007.10 

Analysis of Tissue Specific Expression Patterns of Isozymes International conference

Takarabe, M, Tsuchida, A, Fujita, M, Okuda, S, Yoshizawa, A.C, Yamada, T, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

The 17th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2006.12 

不飽和脂肪酸伸長酵素「Fatty Acid Elongase」の網羅的探索

橋本浩介, 吉沢明康, 金久 實

日本分子生物学会2006フォーラム  2006.12 

Coiled-coil structures in E.coli interactome International conference

Luban, S, Yoshizawa, A, Kihara, D

Third Annual Indiana Bioinformatics Conference  2006.5 

細胞内輸送関与蛋白質のパラログ数変化に基づく真核細胞内輸送経路の多様化の考察

日本分子生物学会年会  2005.12 

選択的スプライシングとタンパク質の機能の多様化の関連解析

日本分子生物学会年会講演要旨集  2005.12 

Automatic generation of KEGG OC (Ortholog Cluster) and its assignment to draft genomes International conference

Moriya, Y, Katayama, T, Nakaya, A, Itoh, M, Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004.12 

Analysis of the bacterial sequences recognized by RNA-binding proteins and compounds International conference

Muto, A, Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Itoh, M, Hattori, M, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004.12 

Functional Categorization of Multiple Genomes using KEGG OC in the Genome Indices International conference

Okuda, S, Yoshizawa, A.C, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Goto, S, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004.12 

Functional Classification of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes International conference

Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Kawano, S, Okamoto, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004.12 

Genome Wide Profiling of Glycosyltransferases and Predicted Glycan Structures from Complete and Draft Eukaryote Genomes

河野 信, 吉沢明康, 五十嵐芳暢, 檜作好之, 金久 實

第27回日本分子生物学会年会  2004.12 

ゲノムを特徴づける種々の指標のデータベース化とそれらによる生物種進化の考察

2004.12 

SNARE分子のパラログ数変化に基づく真核細胞内輸送経路の多様化の考察

2004.12 

Integration of Biological Features of Multiple Genomes - The Construction of "Genome Indices" database - International conference

Okuda, S, Yoshizawa, A.C, Moriya, Y, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

The Fourth International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB)  2004.5 

Prediction and Comparison of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes International conference

Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Itoh, M, Katayama, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

The Fourth International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB)  2004.5 

SNARE分子の分類とデータベース構築

2003.12 

Comprehensive Survey of Intracellular Transport System-Related Proteins in Complete Genomes and Draft Genomes International conference

Yoshizawa, A.C, Itoh, M, Okuda, S, Limviphuvadh, V, Sakiyama, T, Kawashima, S, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003.12 

Metabolic pathway reconstruction for malaria parasite Plasmodium falciparum International conference

Limviphuvadh, V, Okuno, Y, Katayama, T, Goto, S, Yoshizawa, A.C, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003.12 

The Construction of a Database for Ubiquitin Signaling Cascade International conference

Sakiyama, T, Kawashima, S, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003.12 

Analysis of Domain Combinations in Eukaryotic Genomes International conference

Itoh, M, Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Goto, S, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003.12 

Extraction of Organism Groups from Whole Genome Comparisons International conference

Yamanishi, Y, Yoshizawa, A.C, Itoh, M, Katayama, T, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003.12 

配列解析に基づくSNARE分子の分類と配列モチーフ抽出

吉沢 明康

京都大学大学院生命科学研究科 生命科学セミナー21  2003.6 

SNARE分子の結合特異性を反映する配列モチーフ

吉沢明康, 川島秀一, 金久 實

第25回日本分子生物学会年会  2002.12 

Indirect relations in yeast protein interactome International conference

Nakaya, A, Yoshizawa, A.C, Goto, S, Kanehisa, M

The 13th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2002.12 

Comparative analysis of Rab GTPases and SNAREs in eukaryotic genomes International conference

Yoshizawa, A.C, Kawashima, S, Kanehisa, M

The 13th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2002.12 

Two-hybrid法・Microarray法のデータ同時比較による細胞内小胞輸送関連遺伝子の抽出

吉沢明康, 中谷明弘, 五斗 進, 金久 實

京都大学化学研究所第101回研究発表会  2001.12 

Extraction of related genes in the vesicular transport by simultaneous comparison of two-hybrid and microarray data International conference

Yoshizawa, A.C, Nakaya, A, Goto, S, Kanehisa, M

The Twelfth International Conference on Genome Informatics (GIW)  2001.12 

The construction of a database on the intracellular vesicular transport International conference

Yoshizawa, A.C, Kawashima, S, Kanehisa, M

The Eleventh Workshop on Genome Informatics (GIW)  2000.12 

pathway databaseの現状

吉沢 明康

第21回蛋白質核酸構造理論勉強会  1999.6 

High Resolution Cryo-Electron Microscopy Gives Clues to Transient and Metastable Structures of Subcellular Organization International conference

Kume, N.P, Yuba, A.D, Yoshizawa, A.C, Sato, S.B, Miyazu, M, Yamazaki, M

The 13th International Congress for Electron Microscopy  1994.7 

極低温高分解能電子顕微鏡による生体膜融合過程の観察

吉沢明康, 山岸秀夫

日本電子顕微鏡学会超低温技術研究部会  1991.12 

極低温電子顕微鏡によって観察した膜融合現象の諸相

吉沢明康, 弓場亜紀子, 山岸秀夫, 高橋信之, 久米直明

日本生物物理学会第29回年会  1991 

極低温電子顕微鏡を用いたインフルエンザウイルス膜融合過程の観察

吉沢 明康, 弓場 亜紀子, 佐藤 智, 山岸 秀夫, 大西 俊一, 久米 直明

日本生物物理学会年会講演予稿集  1990.9 

High Resolution Cryo-Electron Microscopy Sheds a New Light upon Biomembrane Architecture International conference

Kume, N.P, Yuba, A.D, Yoshizawa, A.C, Sato,S.B, Fujiyoshi, Y

The 12th International Congress for Electron Microscopy  1990.8 

極低温高分解能電子顕微鏡による生体膜融合過程追跡の試み

弓場亜紀子, 吉沢明康, 佐藤 智, 久米直明

日本電子顕微鏡学会第46回学術講演会  1990.5 

膜小胞の曲率が膜融合活性に及ぼす影響

吉沢明康, 村田昌之, 大西俊一

日本生物物理学会第26回年会  1988 

Development of a Time-Resolved Microfluorimeter with a Synchroscan Streak Camera and Its Application to Studies of Cell Membranes International conference

Kusumi, A, Tsuji, A, Murata, M, Sako, Y, Yoshizawa, A.C, Hayakawa, T, Ohnishi, S

SPIE (The International Society for Optical Engineering) Proceedings  1988 

時間分解顕微蛍光光度計の開発と細胞膜の動的構造研究への応用

楠見明弘, 辻 明彦, 村田昌之, 佐甲靖志, 吉沢明康, 早川 毅, 大西俊一

日本生物物理学会第25回年会  1987 

IB-7 時間分解顕微蛍光光度計の開発と細胞膜研究への応用

楠見 明弘, 辻 明彦, 村田 昌之, 佐甲 靖志, 吉沢 明康, 早川 毅

日本組織細胞化学会総会プログラムおよび抄録集  1987 

作業支援管理装置、方法、及びプログラム

吉沢 明康, 田畑 剛, 太田 悠葵

タンパク質の同定方法及び同定装置

吉沢 明康, 九山 浩樹

タンパク質又はペプチドの分析方法及び分析装置

吉沢 明康, 吉森 孝行, 太田 悠葵

SEQUENCE ANALYZING APPARATUS

KAJIHARA Shigeki, YOSHIMORI Takayuki, YOSHIZAWA Akiyasu, Kaneko Naoki

アミノ酸配列解析方法及び装置

吉沢 明康, 吉森 孝行

アミノ酸配列解析方法及び装置

梶原 茂樹, 吉森 孝行, 吉沢 明康, 金子 直樹

質量分析を用いた修飾タンパク質同定方法及び同定装置

吉沢 明康, 田畑 剛, 梶原 茂樹

METHOD AND SYSTEM FOR ANALYZING PROTEIN OR PEPTIDE

YOSHIZAWA Akiyasu, YOSHIMORI Takayuki, OHTA Yuki

CIPRO (Ciona intestinalis Protein Database)

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Sasakura, Y, Yamasaki, C, Sera, M, Yoshizawa, AC, Imanishi, T, Taniguchi, H, Inaba, K

The SNARE Map

Development and application of the novel protein sequence identification resource by high-speed character string search and RDF

Grant number：017RP2019

2019.7 - 2020.3

System name：The Joint Research Program, ROIS-DS-JOINT

Awarding organization：ROIS DS

Yoshizawa, AC, Naito,Y, Moriya, Y, Kawano, S, Tabata, T, Ishihama, Y, Goto, S

Computational Mass Spectrometry Hackathon Pre-meeting

Grant number：005RM2019

2019.7 - 2020.3

System name：The Joint Research Meeting Program, ROIS-DS-JOINT

Awarding organization：ROIS DS

Development and application of the novel protein/nucleic acid sequence identification resource by high-speed character string search and RDF

Grant number：005RP2018

2018.6 - 2019.3

System name：The Joint Research Program, ROIS-DS-JOINT

Awarding organization：ROIS DS

Yoshizawa, AC, Naito, Y, Kato, M, Moriya, Y, Tabata, T, Uchiyama, I, Kawano, S, Ishihama, Y, Goto, S

Computational Mass Spectrometry Hackathon Symposium

Grant number：002RM2018

2018.6 - 2019.3

System name：The Joint Research Meeting Program, ROIS-DS-JOINT

Awarding organization：ROIS DS

2nd Hackathon on Computational Mass Spectrometry2

2018.4 - 2019.3

System name：Subsidies for Conferences

Awarding organization：Kato Memorial Bioscience Foundation

Pre-Meeting for Computational Mass Spectrometry Hackathon

Grant number：006RM2017

2017.11 - 2018.3

System name：The Joint Research Meeting Program, ROIS-DS-JOINT

Awarding organization：ROIS DS

Development of the novel protein identification resource by high-speed character string search and RDF

Grant number：013RP2017

2017.10 - 2018.3

System name：The Joint Research Program, ROIS-DS-JOINT

Awarding organization：ROIS DS

Yoshizawa, AC, Naito,Y, Moriya, Y, Kawano, S, Tabata, T, Ishihama, Y, Goto, S

Computational Mass Spectrometry Hackathon

2017.4 - 2018.3

System name：Subsidies for Conferences

Awarding organization：Kato Memorial Bioscience Foundation

Development of mass peak picking method by deep learning

Grant number：16K00390

2016.4 - 2019.3

System name：Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research category：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Awarding organization：Japan Society for the Promotion of Science

Yoshizawa Akiyasu, TABATA Tsuyoshi, IWASAKI Mio, KAWANO Shin, GOTO Susumu, ISHIHAMA Yasushi, TAKIGAWA Ichigaku

Comprehensive analysis of eukaryotic operons using proteomic information and comparative genomics

Grant number：23510245

2011.4 - 2012.3

System name：Grant-in-Aid for Scientific Research (C) [Declined after adoption]

Research category：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Awarding organization：JSPS

Yoshizawa, AC, Yamada, L, Okuda, S, Moriya,Y

Information Processing

Introduction to Computer Science

Programming Exercise I, II 1

Elementary Science (Lectures on Physics and Chemistry)

Specialized pedagogy in Science (chemistry/physics experiment)

質量分析インフォマティクス研究会・第6回公開ワークショップ ONLINE（2021年）「質量分析情報で代謝を理解する」

Role(s)： Planning, management, etc.

質量分析インフォマティクス研究会  2021.6

質量分析インフォマティクス研究会・第5回公開ワークショップ ONLINE（2020年）「質量分析とデータ科学で生命に迫る」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会  2020.8

jPOSTデータ解析ショートコース

Role(s)： Planning, management, etc.

JPrOS2019/JES2019合同大会（日本プロテオーム学会・日本電気泳動学会合同大会）サテライトイベント  2019.7

第3回質量分析インフォマティクス・ハッカソン（2019年）

Role(s)： Planning, management, etc.

質量分析インフォマティクス研究会（DBCLS国内版バイオハッカソン(BH19.7)と共同開催）  2019.7

質量分析インフォマティクス研究会・第4回公開ワークショップ（2019年）「データ科学が拡大する質量分析の地平線」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会  2019.3

メタオミクスワークショップ in 京都 2019

Role(s)： Planning, management, etc.

京都大学融合チーム研究プロジェクトSPIRITS・メタプロテオミクスプロジェクト  2019.3

Reviewer & Curator, "Journal of Proteome Data and Methods" International contribution

Role(s)： Peer review

2019

BoFセッション「質量情報から生物情報へ」（第7回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2018: 2018年日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)年会））

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

日本バイオインフォマティクス学会  2018.9

第2回質量分析インフォマティクス・ハッカソン（2018年）

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会（DBCLS国内版バイオハッカソン(BH18.7)と共同開催）  2018.7

International Proteogenome Workshop 2018

Role(s)： Planning, management, etc.

MSP2018 (Mass Spectrometry and Proteomics 2018) Satellite Workshop  2018.5

4C-O2-P「情報科学から迫る質量分析・オミクスの世界」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

MSP2018（Mass Spectrometry and Proteomics 2018: 日本質量分析学会(MSSJ)・日本プロテオーム学会(JPrOS)・アジアオセアニア・ヒトプロテオーム機構(AOHUPO)合同大会）  2018.5

質量分析インフォマティクス研究会・第3回公開ワークショップ（2018年）「質量分析法とオミクス計算処理」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会  2018.4

ワークショップ2PW23「オミクス研究から実用的システム生物学の構築へ」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)(第40回日本分子生物学会年会）2  2017.12

第1回質量分析インフォマティクス・ハッカソン（2017年）

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会（DBCLS国内版バイオハッカソン(BH17.11)と共同開催）  2017.11 - 2017.12

BoFセッション「質量分析とケモインフォマティクスの実りある連携」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

第6回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2017: 2017年日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)年会）  2017.9

質量分析インフォマティクス研究会・第2回公開ワークショップ（2017年）「質量分析研究に於ける情報処理の現在と今後」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会  2017.2

質量分析インフォマティクス研究会・第1回公開ワークショップ（2016年度）「質量分析データ解析のための計算科学」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

質量分析インフォマティクス研究会  2016.10

質量分析インフォマティクス研究会（JCompMS, 旧ms-bio.info） 設立（発起人・世話人）

Role(s)： Planning, management, etc.

（日本バイオインフォマティクス学会）  2016.4

BoFセッション「質量分析インフォマティクスとデータベース」

Role(s)： Planning, management, etc.,　Panel moderator, session chair, etc.

第4回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2015: 2015年日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)年会）  2015.10

Mass++ユーザー会公開ワークショップ

Role(s)： Planning, management, etc.

Mass++ユーザー会（オープンソース・プロジェクト）  2015.8

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）トレーニングコース

Role(s)： Planning, management, etc.

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015.7

Mass++ユーザー会 設立（発起人・世話人）

Role(s)： Planning, management, etc.

Mass++ユーザー会（オープンソース・プロジェクト）  2015.6

Reviewer, "Current Protein and Peptide Science" International contribution

Role(s)： Peer review

2010

Reviewer, "International Journal of Molecular Sciences" International contribution

Role(s)： Peer review

2010