京都大学   大学院薬学研究科   特定研究員   特任助教

2017年4月 - 2018年3月

京都大学   化学研究所 バイオインフォマティクスセンター   特定研究員

2015年6月 - 2017年3月

（株）島津製作所   田中耕一記念質量分析研究所   研究員（嘱託）

2014年10月 - 2015年3月

（株）島津製作所   田中最先端研究所   研究員（嘱託）

2014年4月 - 2014年9月

（株）島津製作所   田中最先端研究所   内閣府FIRSTプログラム研究員（嘱託）

2011年4月 - 2014年3月

徳島大学   疾患酵素学研究センター 疾患プロテオミクス研究部門   学術研究員   特任助教

2009年1月 - 2011年3月

独立行政法人産業技術総合研究所   年齢軸生命工学研究センター 健康インフォマティクスチーム   特別研究員

2007年4月 - 2008年12月

聖泉短期大学   情報社会学科   非常勤講師

1995年4月 - 1997年3月

京都女子大学   文学部・短期大学部・全学一般教育   非常勤講師

1992年10月 - 2007年3月

京都女子大学   文学部   非常勤講師

1991年10月 - 1992年3月

日本生物物理学会

1988年 - 現在

jPOST Tools (I): Utilities for Peak List Processing 査読

Tabata T, Yoshizawa AC, Ishihama Y

Journal of Proteome Data and Methods   2   4   2020年12月

BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research 査読 国際共著 国際誌

Vos RA, Katayama T, Mishima H, Kawano S, KawashimaS, Kim J-D, Moriya Y, Tokimatsu T, Yamaguchi A, Yamamoto Y, Wu H, Amstutz P, Antezana E, Aoki NP, Arakawa K, Bolleman JT, Bolton E, Bonnal RJP, Bono H, Burger K, Chiba H, Cohen KB, Deutsch EW, Fernandez-Breis JT, Fu G, Fujisawa T, Fukushima A, Garcia A, Goto N, Groza T, Hercus C, Hoehndorf R, Itaya K, Juty N, Kawashima T, Kim J-H, Kinjo AR, Kotera M, Kozaki K, Kumagai S, Kushida T, Lutteke T, Matsubara M, Miyamoto J, Mohsen A, Mori H, Naito Y, Nakazato T, Nguyen-Xuan J, Nishida K, Nishida N, Nishide H, Ogishima S, Ohta T, Okuda S, Paten B, Perret J-L, Prathipati P, Prins P, Queralt-Rosinach N, Shinmachi D, Suzuki S, Tabata T, Takatsuki T, Taylor K, Thompson M, Uchiyama I, Vieira B, Wei C-H, Wilkinson M, Yamada I, Yamanaka R, Yoshitake K, Yoshizawa AC, Dumontier M, Kosaki K, Takagi T

F1000Research   9   136   2020年2月

The jPOST environment: an integrated proteomics data repository and database. 査読

Moriya Y, Kawano S, Okuda S, Watanabe Y, Matsumoto M, Takami T, Kobayashi D, Yamanouchi Y, Araki N, Yoshizawa AC, Tabata T, Iwasaki M, Sugiyama N, Tanaka S, Goto S, Ishihama Y

Nucleic acids research   47 ( D1 )   D1218 - D1224   2019年1月

Meeting Report of the International Life Science Integration Workshop 2018 査読 国際共著 国際誌

[No authors listed: Contributors] Yamada I, Akase S, Angata K, Aoki NP, Arita M, Campbell MP, Edwards N, Fujita A, Garcia L, Goto S, Henrissat B, Hosoda M, Ishihama Y, Kawasaki T, Kuoka T, Kurisu G, Lee S, Lisacek F, Mariethoz J, Narimatsu H, Neelamegham S, Okuda S, Ono T, Packer NH, Ranzinger R, Shinmachi D, Shiota M, Toukach P, Tsuchiya S, Watanabe Y, Yoshizawa AC, Aoki-Kinoshita KF

Glycobiology   28 ( 8 )   552 - 555   2018年8月

jPOSTrepo: an international standard data repository for proteomes 査読

Okuda S, Watanabe Y, Moriya Y, Kawano S, Yamamoto T, Matsumoto M, Takami T, Kobayashi D, Araki N, Yoshizawa AC, Tabata T, Sugiyama N, Goto S and Ishihama Y

Nucleic acids research   45 ( D1 )   D1107 - D1111   2017年1月

どのデータベースを使うか ～データベース検索と配列解析・誤解と難題～ 招待 査読

吉沢 明康

Proteome Letters （日本プロテオーム学会誌）   1 ( 2 )   63 - 80   2016年9月

Identification of human basic fetoprotein as glucose-6-phosphate isomerase by using N- and C-terminal sequence tags and terminal tag database. 査読

Kuyama H, Yoshizawa AC, Nakajima C, Hosako M, Tanaka K

Journal of pharmaceutical and biomedical analysis   112   116 - 125   2015年8月

GlycanAnalysis Plug-in: a database search tool for N-glycan structures using mass spectrometry. 査読

Morimoto K, Nishikaze T, Yoshizawa AC, Kajihara S, Aoshima K, Oda Y, Tanaka K

Bioinformatics (Oxford, England)   31 ( 13 )   2217 - 2219   2015年7月

Computational survey of sequence specificity for protein terminal tags covering nine organisms and its application to protein identification. 査読

Yoshizawa AC, Fukuyama Y, Kajihara S, Kuyama H, Tanaka K

Journal of proteome research   14 ( 2 )   756 - 767   2015年2月

A simple peak detection and label-free quantitation algorithm for chromatography-mass spectrometry 査読

Aoshima K, Takahashi K, Ikawa M, Kimura T, Fukuda M, Tanaka S, Parry HE, Fujita Y, Yoshizawa AC, Utsunomiya S, Kajihara S, Tanaka K, Oda Y

BMC Bioinformatics   15   376   2014年11月

計算プロテオミクス : データベースを利用したタンパク質翻訳後修飾の同定 (シンポジウム 生命システムの理解に向けたバイオインフォーマティクス : 第694回新潟医学会) 招待 査読

吉沢 明康, 田畑 剛, 木村 剛之, 青島 健, 福山 裕子, 梶原 茂樹, 九山 浩樹, 小田 吉哉, 田中 耕一

新潟医学会雑誌   128 ( 10 )   504 - 509   2014年10月

Mass++: A Visualization and Analysis Tool for Mass Spectrometry 査読 国際誌

Tanaka S, FujitaY, Parry HE, Yoshizawa AC, Morimoto K, Murase M, Yamada Y, Yao J, Utsunomiya S, Kajihara S, Fukuda M, Ikawa M, Tabata T, Takahashi K, Aoshima K, Nihei Y, Nishioka T, Oda Y, Tanaka K

Journal of proteome research   13 ( 8 )   3846 - 3853   2014年8月

Integrated proteomics identified novel activation of dynein IC2-GR-COX-1 signaling in neurofibromatosis type I (NF1) disease model cells. 査読

Hirayama M, Kobayashi D, Mizuguchi S, Morikawa T, Nagayama M, Midorikawa U, Wilson MM, Nambu AN, Yoshizawa AC, Kawano S, Araki N

Molecular & cellular proteomics : MCP   12 ( 5 )   1377 - 1394   2013年5月

KEGG OC: a large-scale automatic construction of taxonomy-based ortholog clusters. 査読 国際誌

Nakaya A, Katayama T, Itoh M, Hiranuka K, Kawashima S, Moriya Y, Okuda S, Tanaka M, Tokimatsu T, Yamanishi Y, Yoshizawa AC, Kanehisa M, Goto S

Nucleic acids research   41 ( Database issue )   D353 - 7   2013年1月

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis protein database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with user rating and reviewing functionality 査読 国際誌

Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Sasakura Y, Yamasaki C, Sera M, Yoshizawa AC, Imanishi T, Taniguchi H, and Inaba K

Nucleic acids research   39 ( SUPPL. 1 (Database issue) )   D807 - D814   2011年1月

ODB: a database for operon organizations, 2011 update 査読 国際誌

Okuda S, Yoshizawa AC

Nucleic acids research   39 ( SUPPL. 1 (Database issue) )   D552 - D555   2011年1月

Crystal structure of aminomethyltransferase in complex with dihydrolipoyl-H-protein of the glycine cleavage system: implications for recognition of lipoyl protein substrate, disease-related mutations, and reaction mechanism. 査読

Okamura-Ikeda K, Hosaka H, Maita N, Fujiwara K, Yoshizawa AC, Nakagawa A, Taniguchi H

The Journal of biological chemistry   285 ( 24 )   18684 - 18692   2010年6月

An age-related homeostasis mechanism is essential for spontaneous amelioration of hemophilia B Leyden. 査読

Kurachi S, Huo JS, Ameri A, Zhang K, Yoshizawa AC, Kurachi K

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   106 ( 19 )   7921 - 7926   2009年5月

Comprehensive analysis of glycosyltransferases in eukaryotic genomes for structural and functional characterization of glycans. 査読

Hashimoto K, Tokimatsu T, Kawano S, Yoshizawa AC, Okuda S, Goto S, Kanehisa M

Carbohydrate research   344 ( 7 )   881 - 887   2009年5月

老年医学の展望 老化・老年病と年齢軸生命工学 査読

倉地 幸徳, 倉地 須美子, 浜田 俊幸, 末永 恵美, 吉沢 明康

日本老年医学会雑誌   45 ( 2 )   126 - 131   2008年3月

The repertoire of desaturases and elongases reveals fatty acid variations in 56 eukaryotic genomes. 査読

Hashimoto K, Yoshizawa AC, Okuda S, Kuma K, Goto S, Kanehisa M

Journal of lipid research   49 ( 1 )   183 - 191   2008年1月

KAAS: an automatic genome annotation and pathway reconstruction server. 査読

Moriya Y, Itoh M, Okuda S, Yoshizawa AC, Kanehisa M

Nucleic acids research   35 ( Web Server issue )   W182 - 5   2007年7月

Extracting sequence motifs and the phylogenetic features of SNARE-dependent membrane traffic. 査読

Yoshizawa AC, Kawashima S, Okuda S, Fujita M, Itoh M, Moriya Y, Hattori M, Kanehisa M

Traffic (Copenhagen, Denmark)   7 ( 8 )   1104 - 1118   2006年8月

The repertoire of desaturases for unsaturated fatty acid synthesis in 397 genomes. 査読

Hashimoto K, Yoshizawa AC, Saito K, Yamada T, Kanehisa M

Genome informatics. International Conference on Genome Informatics   17 ( 1 )   173 - 183   2006年7月

一般教養としての情報教育の視点 ［再収載］ 招待

吉沢 明康

教育学論説資料 （学校論・教師論）   21 ( 3 )   328 - 333   2004年

一般教養としての情報教育の視点

吉沢 明康

京都女子大学教育学科紀要   39   131 - 142   1999年

女子大生の意識調査に見る情報教育の課題（I）

吉沢 明康

京都女子大学教育学科紀要   38   78 - 87   1998年

女子大生の意識調査に見る情報教育の課題（II） －インターネットの利用について－

吉沢 明康

京都女子大学教育学科紀要   38   88 - 93   1998年

Development of a Streak-Camera-Based Time-Resolved Microscope Fluorimeter and Its Application to Studies of Membrane Fusion in Single Cells 査読

Kusumi A, Tsuji A, Murata M, Sako Y, Yoshizawa AC, Kagiwada S, Hayakawa T, and Ohnishi S

Biochemistry   30   6517 - 6527   1991年7月

質量分析インフォマティクス研究会〔地域部会・公募研究会の活動報告〕 招待

早川 英介, 守屋 勇樹, 山本 博之, 吉沢 明康

日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター   ( 35 )   14 - 15   2019年4月

メタプロテオミクスのためのデータ解析ワークフロー開発

上村 駿人, 伊藤 麻里子, 吉沢 明康, 杉山 直幸, 石濱 泰

日本薬学会年会要旨集   138年会 ( 2 )   240 - 240   2018年3月

プロテオーム・データベースの構築

吉沢 明康

京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム研究成果報告書   2016   27 - 27   2017年3月

jPOST:同定結果のFDR改善を目指す再解析プロトコルの開発

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本生化学会大会(Web)   90th   ROMBUNNO.3P‐0172 (WEB ONLY) - 0172]   2017年

jPOST:プロテオームデータベースの開発

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本生化学会大会(Web)   90th   ROMBUNNO.3P‐0173 (WEB ONLY) - 0173]   2017年

jPOST:プロテオーム統合データベースプロジェクト

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本生化学会大会(Web)   90th   ROMBUNNO.3P‐0171 (WEB ONLY) - 0171]   2017年

プロテオーム・データベースの構築

吉沢 明康

京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム研究成果報告書   2015   23 - 23   2016年3月

jPOST:プロテオーム解析ワークフローの標準化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

日本生化学会大会(Web)   88th   3P0417 (WEB ONLY) - [3P0417]   2015年12月

Mass++、MassBankを用いた脂質同定システムの構築

田中 聡, 吉沢 明康, 草野 麻衣子, 藤田 雄一郎, 福田 充, 宇都宮 眞一, 梶原 茂樹, 田畑 剛, 高橋 健太郎, 青島 健, 小田 吉哉, 二瓶 義人, 西岡 孝明, 田中 耕一

JSBMS Letters   38 ( Suppl. )   95 - 95   2013年8月

Crystal structure of T-H protein complex of the glycine cleavage system 国際誌

Okamura-Ikeda, K, Hosaka, H, Maita, N, Fujiwara, K, Yoshizawa, A.C, Nakagawa, A, Taniguchi, H

Acta Crystallographica Section A Foundations of Crystallography   67 ( a1 )   C434 - C435   2011年8月

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments 国際誌

Endo, T., Ueno, K., Yonezawa, K., Mineta, K., Hotta, K., Satou, Y., Yamada, L., Ogasawara, M., Takahashi, H., Nakajima, A., Nakachi, M., Nomura, M., Yaguchi, J., Konno, A., Sasakura, Y., Yoshizawa, AC, Taniguchi, H., Yamasaki, C., Sera, M., Imanishi, T., Inaba, K.

Nature Precedings, Biocuration 2010   2011年1月

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein Database - a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating and comments 国際誌

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Genome Biology   11 ( S1 )   2010年10月

KEGG OC:全生物種ゲノムにおけるオーソログ遺伝子のバリエーションと高速検索技術

片山俊明, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

生化学   80 ( 抄録CD )   4T9-4 - 4   2008年11月

遺伝子エレメントASE結合核蛋白質の同定 年齢軸恒常性分子機構の確立に向けて

倉地 須美子, 笠間 絵美, 田中 拓, 吉沢 明康, 倉地 幸徳

日本血栓止血学会誌   18 ( 5 )   460 - 460   2007年10月

Analysis of Tissue Specific Expression Patterns of Isozymes 国際誌

Takarabe, M, Tsuchida, A, Fujita, M, Okuda, S, Yoshizawa, AC, Yamada, T, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2006 Poster Abstracts   17   2006年12月

真核細胞内輸送の解析

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成17年度 研究成果報告書   96 - 97   2006年3月

細胞内小胞輸送パスウェイの解析

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成16年度 研究成果報告書   65 - 66   2005年3月

Functional Classification of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes 国際誌

Yoshizawa, AC, Okuda, S, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Kawano, S, Okamoto, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004年12月

Automatic generation of KEGG OC (Ortholog Cluster) and its assignment to draft genomes 国際誌

Moriya, Y, Katayama, T, Nakaya, A, Itoh, M, Yoshizawa, AC, Okuda, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004年12月

Functional Categorization of Multiple Genomes using KEGG OC in the Genome Indices 国際誌

Okuda, S, Yoshizawa, AC, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004年12月

Analysis of the bacterial sequences recognized by RNA-binding proteins and compounds 国際誌

Muto, A, Yoshizawa, AC, Okuda, S, Itoh, M, Hattori, M, Kanehisa, M

Genome Informatics, GIW 2004 Poster Abstracts   15   2004年12月

Integration of Biological Features of Multiple Genomes - The Construction of "Genome Indices" database - 国際誌

Okuda, S, Yoshizawa, AC, Moriya, Y, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, IBSB 2004 Poster Abstracts   15   2004年5月

Prediction and Comparison of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes 国際誌

Yoshizawa, AC, Okuda, S, Itoh, M, Katayama, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics, IBSB 2004 Poster Abstracts   15   2004年5月

細胞内小胞輸送蛋白質の解析

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成15年度 研究成果報告書   73 - 74   2004年3月

Extraction of Organism Groups from Whole Genome Comparisons 国際誌

Yamanishi, Y, Yoshizawa, AC, Itoh, M, Katayama, T, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   438 - 439   2003年12月

The Construction of a Database for Ubiquitin Signaling Cascade 国際誌

Sakiyama, T, Kawashima, S, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   653 - 654   2003年12月

Analysis of Domain Combinations in Eukaryotic Genomes 国際誌

Itoh, M, Yoshizawa, AC, Okuda, S, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   434 - 435   2003年12月

Comprehensive Survey of Intracellular Transport System-Related Proteins in Complete Genomes and Draft Genomes 国際誌

Yoshizawa, AC, Itoh, M, Okuda, S, Limviphuvadh, V, Sakiyama, T, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   436 - 437   2003年12月

Metabolic pathway reconstruction for malaria parasite Plasmodium falciparum 国際誌

Limviphuvadh, V, Okuno, Y, Katayama, T, Goto, S, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M

Genome Informatics   14   368 - 369   2003年12月

細胞内小胞輸送系の解析

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成14年度 研究成果報告書   66 - 68   2003年3月

Comparative analysis of Rab GTPases and SNAREs in eukaryotic genomes 国際誌

Yoshizawa, AC, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   13   404 - 405   2002年12月

Indirect relations in yeast protein interactome 国際誌

Nakaya, A, Yoshizawa, AC, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   13   328 - 329   2002年12月

細胞内小胞輸送過程の解析

吉沢明康

京都大学化学研究所スーパーコンピューターラボラトリー 平成13年度 研究成果報告書   80 - 82   2002年3月

Extraction of related genes in the vesicular transport by simultaneous comparison of two-hybrid and microarray data 国際誌

Yoshizawa, AC, Nakaya, A, Goto, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   12   243 - 244   2001年12月

The construction of a database on the intracellular vesicular transport 国際誌

Yoshizawa, AC, Kawashima, S, Kanehisa, M

Genome Informatics   11   276 - 277   2000年12月

Development of a Time-Resolved Microfluorimeter with a Synchroscan Streak Camera and Its Application to Studies of Cell Membranes 国際誌

Kusumi, A, Tsuji, A, Murata, M, Sako, Y, Yoshizawa, AC, Hayakawa, T, Ohnishi, S

Time-Resolved Laser Spectroscopy in Biochemistry (Proceedings of SPIE)   1988年5月

Mass spectrometry data repositories facilitate the multi-omics experimental data accumulation and reanalysis 国際会議

Takahashi, Y, Yoshizawa, AC, Matsuda, F, Aoki-Kinoshita, KF, Ishihama, Y, Okuda, S

APBJC 2024 (Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference 2024)  2024年10月 

From JPDM to jPOST：データ論文を用いたデータ再解析の半自動化

吉沢明康, 高橋悠志, 小林大樹, 守屋勇樹, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 荒木令江, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 小寺義男, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 河野信, 奥田修二郎, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2024  2024年10月  JST NBDC事業推進室

マルチオミクス質量分析データの蓄積と再解析を支えるデータリポジトリ基盤

高橋悠志, 吉沢明康, 松田史生, 木下聖子, 石濱泰, 奥田修二郎

トーゴーの日シンポジウム2024  2024年10月  JST NBDC事業推進室

jPOST meets JPDM

吉沢明康, 高橋悠志, 小林大樹, 守屋勇樹, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 荒木令江, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 小寺義男, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 河野信, 奥田修二郎, 石濱泰

統合化推進プログラム(DICP)研究交流会  2024年10月  JST NBDC事業推進室

Shin-MassBank project: Generation of high-quality spectra from human metabolome datasets 国際会議

Matsuda, F, Hirayama, A, Hayasaka, R, Takahashi, M, Yoshizawa, AC, Nishida, K, Torigoe, T, Kiuchi, T, Matsuzawa, Y, Tsugawa, H, Okuda, S, Izumi, Y

25th International Mass Spectrometry Conference  2024年8月 

JPDM データ論文のメタデータを用いたjPOSTデータ再解析の加速

高橋悠志, 吉沢明康, 小林大樹, 守屋勇樹, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 荒木令江, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 小寺義男, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 河野信, 奥田修二郎, 石濱泰

日本プロテオーム学会2024年大会・第20回日本臨床プロテオゲノミクス学会合同大会  2024年6月 

The Shin-MassBank project: Enrichment of MassBank records using human metabolome datasets 国際会議

Matsuda, F, Hirayama, A, Hayasaka, R, Takahashi, M, Yoshizawa, AC, Nishida, K, Torigoe, T, Kiuchi, T, Matsuzawa, Y, Tsugawa, H, Okuda, S, Izumi, Y

Metabolomics2024 (20th Annual International Conference of the Metabolomics Society)  2024年6月 

メタボロミクス用質量分析データレポジトリ MB-POST の構築とその運用

奥田修二郎, 木内貴仁, 吉沢明康, 松田史生

第72回質量分析総合討論会  2024年6月 

シン・マスバンクプロジェクト：MassBankレコード拡充に向けたスペクトル平均化法の開発

松田史生, 平山明由, 早坂亮祐, 高橋政友, 吉沢明康, 西田孝三, 鳥越大平, 木内貴仁, 松沢佑紀, 津川裕司, 奥田修二郎, 和泉自泰

第72回質量分析総合討論会  2024年6月 

Mass++ ver.4 Gold (official release), an Open-Source MS Data Viewer 国際会議

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Matsubara, M, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Okuda, S, Yoshizawa, AC

ASMS 2024 (72th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics)  2024年6月 

The Shin-MassBank project: Enrichment of MassBank records using human metabolome datasets 国際会議

Matsuda, F, Hirayama, A, Hayasaka, R, Takahashi, M, Yoshizawa, AC, Nishida, K, Torigoe, T, Kiuchi, T, Matsuzawa, Y, Tsugawa, H, Okuda, S, Izumi, Y

ASMS 2024 (72th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics)  2024年6月 

jPOST & JPDM：プロテオームデータベースとデータ論文ジャーナル

吉沢明康, 小林大樹, 守屋勇樹, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 荒木令江, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 小寺義男, 田中聡, 五斗進, 河野信, 奥田修二郎, 石濱泰

第46回日本分子生物学会年会  2023年12月  日本分子生物学会

メタボロームデータリポジトリMB-POSTの開発状況

吉沢明康

2023年度統合化推進プログラム（DICP）研究交流会  2023年10月  JST NBDC事業推進部

質量情報から配列情報へ－どこまで信頼できるのか 招待

吉沢 明康

質量分析インフォマティクス研究会・第7回公開ワークショップ ONLINE「質量分析オミクスデータを深く読む」  2022年4月 

マススペクトルに於けるペプチドイオンピークの深層学習による検出法の開発 招待

吉沢 明康

第17回日本臨床プロテオゲノミクス研究会  2021年5月  日本臨床プロテオゲノミクス研究会

ショットガンプロテオミクスにおけるマススペクトログラムの階層クラスタリングによるタンパク質同定

疋田拓也, 木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

第2回生体分子分析ワークショップ  2021年3月 

ショットガンプロテオミクスにおけるマススペクトログラムの階層クラスタリングによるタンパク質同定

疋田拓也,木部航希,吉沢明康,田畑剛,吉井和佳,石濱泰

日本薬学会第141年会  2021年3月  日本薬学会

質量分析インフォマティクスの世界：どこから来て、何者で、どこに向かうのか 招待

吉沢 明康

第9回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020: 2020年日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)年会）  2020年9月  日本バイオインフォマティクス学会

An extension of Mass++ ver.4, a data viewer, for proteome analysis 国際会議

Tanaka, S., Murase, M., Kato, M., Tabata, T., Kusano, M., Kawano, S., Goto, S., Ishihama, Y., Yoshizawa, A.C.

ASMS 2020 Reboot (68th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics)  2020年6月  アメリカ質量分析学会

jPOST統合環境の機能深化と連携基盤強化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2019  2019年10月  バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

大規模言語モデルに基づいたタンパク質ターンオーバー予測

石野公基, 吉沢明康, 劉鈺婷, 奥田修二郎

文部科学省 科学研究費補助金 学術変革領域研究（A）「タンパク質寿命が制御するシン・バイオロジー」第3回班会議  2024年9月 

Mass++ ver.4 - An open-source MS data viewer with enhanced basic functions and easy implementation of external software 国際会議

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, AC

ASMS 2023 (71th ASMS (American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics)  2023年6月 

Temporal Analysis of Proteome and Phosphoproteomeof the SARS-CoV-2 Infected Cell 国際会議

Watanabe, Y, Muramoto, Y, Oda, Y, Ogata, K, Yoshizawa, A, Sugiyama, N, Noda, T, Toyoshima, F, Ishihama, Y

第6回京都生体質量分析研究会(KBMSS)国際シンポジウム・国際質量分析イメージングシンポジウム2023京都  2023年1月 

Mass++ ver.4 -MS data viewer meets online databases- 国際会議

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, AC

Human Proteome Organization World Congress (HUPO2022)  2022年12月 

jPOST:「コミュニティ・ベース論文調査」によるメタデータキュレーションの加速

吉沢明康, 守屋勇樹, 小林大樹, 張智翔, 奥田修二郎, 田畑剛, 河野信, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 岩崎未央, 杉山直幸, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 石濱 泰

トーゴーの日シンポジウム2022  2022年10月 

jPOST にまつわる五つの疑問 招待

吉沢 明康

日本プロテオーム学会2022年大会（JHUPO第20回大会）  2022年8月 

DIAプロテオミクスにおける混合MS/MSスペクトログラム分解法の開発

町田和典, 上村京也, 田畑剛, 小形公亮, 吉沢明康, 吉井和佳, 田中利幸, 石濱泰

第3回生体分子分析ワークショップ  2022年3月 

DIAプロテオミクスにおける混合MS/MSスペクトログラム分解法の開発

町田和典, 上村京也, 田畑剛, 小形公亮, 吉沢明康, 吉井和佳, 田中利幸, 石濱泰

日本薬学会第142年会  2022年3月 

jPOSTrepoメタデータのSDRF化

有馬佳奈美, 岡本瑠璃, 小林大樹, 吉沢明康, 河野信

トーゴーの日シンポジウム2021  2021年10月 

jPOSTdb: COVID-19データベースの構築

吉沢明康, 守屋勇樹, 小林大樹, 張智翔, 奥田修二郎, 田畑剛, 河野信, 幡野敦, 高見知代, 松本雅記, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 岩崎未央, 杉山直幸, 福島敦史, 田中聡, 五斗進, 石濱 泰

トーゴーの日シンポジウム2021  2021年10月 

jPOSTリポジトリの機能強化

渡辺由, 奥田修二郎, 守屋勇樹, 河野信, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 幡野敦, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2020  2020年10月  バイオサイエンスデータベースセンター

トリプシン消化ペプチドの衝突誘起解離スペクトルの予測とショットガンプロテオミクスへの応用

橘本哲志, 吉沢明康, 吉井和佳, 石濱泰

日本薬学会第140年会（大会開催中止、要旨web公開を以て発表成立と規定）  2020年3月  日本薬学会

Statistical Joint Protein and Peptide Quantification Based on Hierarchical Clustering of Mass Spectrograms 国際会議

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

第4回京都生体質量分析研究会(KBMSS)シンポジウム  2020年2月  KBMSS

プロテオミクスとデータベース 招待

吉沢 明康

熊本大学 大学院生命科学研究部 プロテオミクスセミナー  2019年12月  熊本大学医学部腫瘍医学講座

マススペクトログラムの階層クラスタリングに基づくタンパク質同定

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

第42回日本分子生物学会年会  2019年12月  日本分子生物学会

配列タグを用いたタンパク質配列超高速検索システムの開発

吉沢明康, 内藤雄樹, 早川英介, 五斗進, 石濱泰

第42回日本分子生物学会年会  2019年12月  日本分子生物学会

深層学習を用いたペプチド由来質量分析イオンピークの検出法の開発

守屋勇樹, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 吉沢明康

第42回日本分子生物学会年会  2019年12月  日本分子生物学会

プロテオームデータベースjPOSTの挑戦

石濱泰, jPOST project

トーゴーの日シンポジウム2019  2019年10月 

Peptide end sequence information in HCD spectra for protein identification 国際会議

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019年9月 

Mass++ ver.4: an open-source, simple and extensible MS data viewer 国際会議

Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y, Yoshizawa, A

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019年9月 

Network analysis of proteogenomics data in lung cancer cell lines 国際会議

Watanabe Y, Ling Y, Uemura H, Yoshizawa, A.C, Ishihama Y, Okuda S

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019年9月 

UniScore, a universal measure for annotated peptide product ion spectra 国際会議

Tabata, T, Yoshizawa, A.C, Sugiyama, N, Ishihama, Y

18th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2019)  2019年9月 

プロテオゲノミクスのための解析プラットフォーム開発

上村駿人, 吉沢明康, 杉山直幸, 奥田修二郎, 石濱泰

日本分析化学会 第68年会  2019年9月 

SPARQLと配列クラスターを用いたアノテーション支援ツールの開発

吉沢 明康

第8回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2019)（日本バイオインフォマティクス学会2019年年会）  2019年9月 

階層クラスタリングを用いたLC/MS/MSマススペクトログラムのタンパク質同定

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

PPF2019 第17回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム  2019年9月 

事後ペプチドシーケンスタグの利用によるタンパク質同定の精度向上

吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, Lukas Käll, 石濱泰

日本プロテオーム学会2019年大会  2019年7月  日本プロテオーム学会

偽客（サクラ）と囮（おとり） ～計算プロテオミクスの品質保証～ 招待

吉沢 明康

第3回質量分析インフォマティクス・ハッカソン・プレ・ミーティング  2019年7月  質量分析インフォマティクス研究会（日本バイオインフォマティクス学会）

The sushi proteome project towards unveiling dietary metaproteomes without genomic information 国際会議

Nishida, H, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Okuda, S, Ishihama, Y

67th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics  2019年6月  アメリカ質量分析学会 (ASMS)

事後ペプチドシーケンスタグを利用する高精度タンパク質同定 国際共著

田畑剛, 吉沢明康, 岩崎未央, 杉山直幸, Käll, Lukas, 石濱泰

第67回質量分析総合討論会  2019年5月  日本質量分析学会

深層学習に基づくペプチド由来イオンピークの新規検出手法

守屋勇樹, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 吉沢明康

第67回質量分析総合討論会  2019年5月  日本質量分析学会

Development of a metaproteomics platform for microbe analysis 国際会議

坂本悠太, 伊藤麻里子, 柏木陽一郎, 野崎剛徳, 村上伸也, 吉沢明康, 杉山直幸, 石濱泰

第3回KBMSSシンポジウム  2019年2月  京都生体質量分析研究会

Metaproteomics of Mouse Tissues and Feces (3P-0081)

坂本悠太, 伊藤麻里子, 柏木陽一郎, 野崎剛徳, 村上伸也, 吉沢明康, 杉山直幸, 石濱泰

第41回日本分子生物学会年会  2018年11月  日本分子生物学会

プロテオーム統合データベースの機能深化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

第41回日本分子生物学会年会  2018年11月  日本分子生物学会

Metaproteomics of Mouse Tissues and Feces (1PW1-02-3)

坂本悠太, 伊藤麻里子, 柏木陽一郎, 野崎剛徳, 村上伸也, 吉沢明康, 杉山直幸, 石濱泰

第41回日本分子生物学会年会  2018年11月  日本分子生物学会

jPOSTプロジェクトが提供するプロテオミクスデータとその解析ツール 招待

五斗進, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢 明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 石濱泰

第41回日本分子生物学会年会  2018年11月  日本分子生物学会

プロテオーム質量分析データの解析 招待

吉沢 明康

臨床質量分析共用プラットフォーム 第3回 質量分析トレーニングコース  2018年11月  文部科学省 先端研究基盤共用促進事業（共用プラットフォーム形成支援プログラム）

機械学習に基づくペプチド由来イオンピークの新規検出手法

守屋勇樹, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学, 吉沢明康

第21回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2018)  2018年11月  電子情報通信学会 情報論的学習理論と機械学習研究会

jPOST統合環境の開発

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 山ノ内祥訓, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2018  2018年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

質量分析法 meets ゲノム情報 招待

吉沢 明康

第7回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2018)  2018年9月  日本バイオインフォマティクス学会

LC/MS/MSマススペクトログラムの階層クラスタリングに基づくタンパク質同定

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

第7回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2018)  2018年9月  日本バイオインフォマティクス学会

Mass++ ver.4: an open-source, quick and simple data viewer 国際会議

Satoshi Tanaka, Masaki Murase, Tsuyoshi Takahashi, Masaki Kato, Maiko Kusano, Shin Kawano, Akiyasu C. Yoshizawa, Susumu Goto, Yasushi Ishihama

66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics (ASMS2018)  2018年6月  アメリカ質量分析学会 (ASMS)

Utilizing peptide sequence tags for controlling false discovery rates in database search 国際会議

Akiyasu C. Yoshizawa, Tsuyoshi Tabata, Mio Iwasaki, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama

66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics (ASMS2018)  2018年6月  アメリカ質量分析学会 (ASMS)

プロテオミクスは環境化学に貢献できるか？ 招待

吉沢 明康

第27回環境化学討論会  2018年5月  日本環境化学会・質量分析インフォマティクス研究会

Application of Non-negative Matrix Factorization in Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics (4P-40) 国際会議

Taechawattananant, P, Yoshizawa, AC, Yoshii, K, Ishihama, Y

MSP2018  2018年5月  日本質量分析学会・日本プロテオーム学会・AOHUPO

Application of Non-negative Matrix Factorization in Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics (4C-O2-P-1605) 国際会議

Pasrawin Taechawattananant, Akiyasu C. Yoshizawa, Kazuyoshi Yoshii, Yasushi Ishihama

MSP2018  2018年5月  日本質量分析学会・日本プロテオーム学会・AOHUPO

Metadata Curation for fully utilizing raw MS data in jPOST repository 国際会議

Kobayashi, D, Araki, N, Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, T, Takami, T, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Iwasaki, M, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

MSP2018  2018年5月  日本質量分析学会・日本プロテオーム学会・AOHUPO

マススペクトルにおけるペプチド同位体比の精確性（2P-43） 国際会議

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

MSP2018  2018年5月  日本質量分析学会・日本プロテオーム学会・AOHUPO

マススペクトルにおけるペプチド同位体比の精確性（2B-O3-M-1805） 国際会議

木部航希, 吉沢明康, 田畑剛, 吉井和佳, 石濱泰

MSP2018  2018年5月  日本質量分析学会・日本プロテオーム学会・AOHUPO

Non-negative Matrix Factorization for Mass Spectrometry-Based Protein Identification 国際会議

Pasrawin Taechawattananant, Akiyasu C. Yoshizawa, Kazuyoshi Yoshii, Yasushi Ishihama

RECOMB2018  2018年4月 

メタプロテオミクスのためのデータ解析ワークフロー開発

上村駿人, 伊藤麻里子, 吉沢明康, 杉山直幸, 石濱泰

日本薬学会年会  2018年3月  日本薬学会

Posting more precisive pictures of proteomes 招待 国際会議

YOSHIZAWA Akiyasu C

International Life Science Integration Workshop  2018年3月 

L1-Regularized Nonnegative Matrix Factorization for Mass Spectrometry-Based Shotgun Proteomics 国際会議

Pasrawin, T, Yoshizawa, A.C, Yoshii, K, Ishihama, Y

第2回京都生体質量分析研究会 (KBMSS) シンポジウム  2018年2月  京都生体質量分析研究会 (KBMSS)

jPOST: プロテオームデータベースの開発

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

ConBio2017  2017年12月  日本分子生物学会

jPOST: 同定結果のFDR改善を目指す再解析プロトコルの開発

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

ConBio2017  2017年12月  日本分子生物学会

jPOST：プロテオーム統合データベースプロジェクト

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

ConBio2017  2017年12月  日本分子生物学会

jPOST: メタデータのキュレーション

小林大樹, 荒木令江, 奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST データベースの開発

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: 再解析プロトコルによる同定結果の質的向上

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST：プロテオーム統合データベースプロジェクト

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: タンパク質発現絶対量sliceの開発

松本雅記, 高見知代, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2017  2017年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

Controlling FalseDiscovery Rates on Large-scale Proteome Datasets in jPOST 国際会議

Ishihama, Y, Yoshizawa, A, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S

16th Human Proteome Organization World Congress 2017 (HUPO2017)  2017年9月 

jPOST provides a global public data repository for a wide variety of proteomics experiments 国際会議

Watanabe, Y, Okuda, S, Moriya, Y, Kawano,S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

16th Human Proteome Organization World Congress  2017年9月 

Reducing false positive identifications for proteome datasets accumulated in jPOST repository 国際会議

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

16th Human Proteome Organization World Congress  2017年9月 

Development of integrated proteomics database: jPOST 国際会議

Moriya, Y, Kawano,S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

16th Human Proteome Organization World Congress  2017年9月 

質量から配列へ、同定結果からデータベースへ 招待

吉沢 明康

JASIS2017コンファレンス  2017年9月 

プロテオーム統合データベース jPOST：質量分析データ・リポジトリ（2P-16）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会2017年大会（JHUPO第15回大会）  2017年7月 

jPOST: プロテオーム統合データベースの開発（2P-18）

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会2017年大会（JHUPO第15回大会）  2017年7月 

プロテオーム統合データベースjPOST:質量分析データ・リポジトリ（2S-2-2）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会  2017年7月  日本プロテオーム学会

jPOST再解析プロトコル:偽陽性と偽陰性の同時減少を目指す 招待

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会  2017年7月  日本プロテオーム学会

jPOST:プロテオーム統合データベースの開発（2S-2-4）

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石澤泰

日本プロテオーム学会大会  2017年7月  日本プロテオーム学会

同定結果はどこまで信頼できるか―データベース検索の落とし穴― 招待

吉沢明康

日本プロテオーム学会大会  2017年7月  日本プロテオーム学会

プロテオミクスデータ解析2「Computational ProteomicsからProteome Informaticsへ」／演習 招待

吉沢明康

BMSコンファレンス  2017年7月  日本質量分析学会 BMS部会

Controlling false discovery rate in accumulated public proteome dataset 国際会議

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Tanaka, S, Goto, S, Ishihama, Y

65th ASMS(American Society for Mass Spectrometry) Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics  2017年6月 

データベース検索エンジンを用いたタンパク質同定における特異性向上

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 田中聡, 五斗進, 石濱泰

質量分析総合討論会  2017年5月  日本質量分析学会

Challenges in standardization of database search: development of the jPOST repository and the re-analysis protocol 招待 国際会議

YOSHIZAWA, AC

第1回京都生体質量分析研究会(KBMSS)シンポジウム  2017年2月 

プロテオーム統合データベースjPOST:再解析プロトコルの開発

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016年12月  日本分子生物学会

プロテオーム統合データベースjPOST:質量分析データ・リポジトリの公開（2P-0039）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知世, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016年12月  日本分子生物学会

プロテオーム統合データベースjPOST：質量分析データ・リポジトリの公開（1PS7-4）

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016年11月 

jPOST:プロテオームデータベースプロジェクト

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知世, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

第39回日本分子生物学会年会  2016年11月  日本分子生物学会

jPOST: 再解析考え中です

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2016  2016年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: リポジトリ始めました

奥田修二郎, 渡辺由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2016  2016年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: 今こんな感じです

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡辺由, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2016  2016年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

実はタンパク質は測定していない ～ プロテオミクスと質量分析法 ～ 招待

吉沢 明康

第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)  2016年9月  日本バイオインフォマティクス学会

jPOST: repository and re-analysis protocol

Moriya, Y, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Kawano, S, Watanabe, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)  2016年9月  日本バイオインフォマティクス学会

jPOST for Asia and Oceania: Repository Opened (P03-01) 国際会議

Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, AC, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016年9月  AOHUPO

A Novel Data Integration Tool iPEACH Identified the Specific Molecular Networks of Cancer Stem Cells 国際会議

Yamasaki, Y, Nambu,A, Silsirivanit, A, Kobayashi, D, Yoshizawa, A, Kawano, S, Araki, N

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016年9月 

jPOST for Asia and Oceania: Re-analysis Protocol 国際会議

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016年9月 

jPOST for Asia and Oceania: Repository Opened (S03-01) 国際会議

Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016年9月 

jPOST for Asia and Oceania: Current status in 2016 国際会議

Moriya, Y, Kawano, S, Watanabe, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Goto, S, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

The 8th Asia Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) Congress  2016年9月 

jPOST: Re-analysis Protocol 国際会議

Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Watanabe, Y, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016年9月 

Analysis of the specific molecular networks of cancer stem cells using a novel data integration tool iPEACH 国際会議

Yamasaki, Y, Nambu,A, Silsirivanit, A, Kobayashi, D, Yoshizawa, A, Kawano, S, Araki, N

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016年9月 

jPOST: repository opened 国際会議

Okuda, S, Watanabe, Y, Moriya, Y, Kawano, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016年9月 

jPOST: Current status in 2016 国際会議

Moriya, Y, Kawano, S, Watanabe, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Takami, T, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Goto, S, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

15th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2016)  2016年9月 

プロテオーム統合データベースjPOSTの開発 招待

五斗進, 奥田修二郎, 渡邉由, 守屋勇樹, 河野信, 山本格, 松本雅記, 高見知代, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会  2016年7月  日本プロテオーム学会

プロテオーム統合データベースjPOST:再解析プロトコルの開発

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 渡邉由, 山本格, 松本雅記, 高見知世, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会  2016年7月  日本プロテオーム学会

ポストだけれど葉書じゃない、タンパクだけど淡泊じゃない 招待

吉沢 明康

第2回バイオインフォマティクスアゴラ  2016年7月 

オープンソース版Mass++:ピーク検出機能の拡充

田中聡, 太田悠葵, 村瀬雅樹, 津元裕樹, 草野麻衣子, 吉沢明康, 三浦ゆり, 川崎ナナ, 五斗進

質量分析総合討論会  2016年5月  日本質量分析学会

質量スペクトルはデータベース検索“グレーゾーン”を明瞭化するか

吉沢明康, 田畑剛, 守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 杉山直幸, 五斗進, 石濱泰

質量分析総合討論会  2016年5月  日本質量分析学会

jPOST:プロテオーム解析ワークフローの標準化

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

BMB2015  2015年12月  日本分子生物学会・日本生化学会

オープンソース版Mass++によるオミックス解析

田中聡, 津元裕樹, 太田悠葵, 村瀬雅樹, 吉沢明康, 川崎ナナ, 五斗進

BMB2015  2015年12月  日本分子生物学会・日本生化学会

jPOST: Development of a high-quality proteome database

Moriya, Y, Kawano, S, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, AC, Goto, S, Tabata, T, Sugiyama, N, Ishihama, Y

第4回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2015)  2015年10月  日本バイオインフォマティクス学会

Open-sourced Mass++ for Mass Spectrometric Data Analysis

村瀬雅樹, 田中聡, 吉沢明康, 五斗進

第4回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2015)  2015年10月  日本バイオインフォマティクス学会

Search space reduction by utilizing known modification information for proteomic database search

Yoshizawa, AC, Tabata, T, Moriya, Y, Kawano, S, Goto, S, Ishihama, Y

第4回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2015)  2015年10月  日本バイオインフォマティクス学会

タンパク質同定とデータベース

吉沢 明康

jPOST Workshop: Computational Proteomics  2015年10月 

jPOST (Japan Proteome Standard Repository/Database)：プロテオーム・データの標準化と統合

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

トーゴーの日シンポジウム2015  2015年10月  JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC)

jPOST: Development of Japan ProteOme STandard repository/database 国際会議

Kawano, S, Moriya, Y, Okuda, S, Yamamoto, T, Matsumoto, M, Kobayashi, D, Araki, N, Yoshizawa, A.C, Tabata, T, Sugiyama, N, Goto, S, Ishihama, Y

14th Human Proteome Organization World Congress (HUPO2015)  2015年9月 

融合プロテオミクスの統合ソフトウェア iPEACH によるグリオーマ幹細胞の維持と分化に関わるネットワーク解析

山崎義宗, 河野信, 吉沢明康, 南部晶子, 水口惣平, 小林大樹, 長山慈, 永井美奈子, Silsirivanit Atit, 佛淵尚人, 荒木令江

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015年7月  日本プロテオーム学会

日本発の高品質プロテオームデータベース：jPOST

守屋勇樹, 河野信, 奥田修二郎, 山本格, 松本雅記, 小林大樹, 荒木令江, 吉沢明康, 五斗進, 田畑剛, 杉山直幸, 石濱泰

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015年7月  日本プロテオーム学会

オープンソース版Mass++とプロテオーム解析

田中 聡, 村瀬雅樹, 吉沢明康, 五斗 進

日本プロテオーム学会2015年会（JHUPO第13回大会）  2015年7月  日本プロテオーム学会

どのデータベースを使うか ～データベース検索と配列解析・誤解と難題～ 招待

吉沢 明康

日本プロテオーム学会2015年会  2015年7月  日本プロテオーム学会

データベースを使ったタンパク質同定 招待

吉沢 明康

JHUPO2015プロテオミクストレーニングコース  2015年7月 

オープンソース版Mass++

田中聡, 吉沢明康, 五斗進

質量分析総合討論会講演要旨集  2015年6月  日本質量分析学会

質量分析ソフトウェアMass++を用いたN型糖鎖負イオンMS/MSスペクトルの解析

森本健太郎, 西風隆司, 吉沢明康, 梶原茂樹, 青島健, 小田吉哉, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2014年5月  日本質量分析学会

Mass++:同定機能と翻訳後修飾文献DBとの連携

田中聡, 吉沢明康, 田畑剛, 草野麻衣子, 青島健, 宇都宮眞一, 梶原茂樹, 小田吉哉, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2014年5月  日本質量分析学会

タンパク質末端配列の種間比較と末端配列データベース構築

吉沢明康, 福山裕子, 梶原茂樹, 九山浩樹, 田中耕一

日本分子生物学会年会  2013年12月 

計算プロテオミクス：データベースを利用したタンパク質翻訳後修飾の同定 招待

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 福山裕子, 梶原茂樹, 九山浩樹, 小田吉哉, 田中耕一

第694回新潟医学会シンポジウム「生命システムの理解に向けたバイオインフォーマティクス」  2013年11月  新潟医学会

Mass++, MassBank を用いた脂質同定システムの構築

田中聡, 吉沢明康, 草野麻衣子, 藤田雄一郎, 福田充, 宇都宮眞一, 梶原茂樹, 田畑剛, 高橋健太郎, 青島健, 小田吉哉, 二瓶義人, 西岡孝明, 田中耕一

日本医用マススペクトル学会第38回年会  2013年9月 

融合プロテオミクスによる神経線維腫症1型(NF1)病態モデル細胞内活性化シグナルDynein IC2‐GR‐COX‐1の同定

小林大樹, 平山未央, 水口惣平, 森川崇, 長山慈, 緑川宇一, WILSON‐MORIFUJI Masayo, 南部(新堀)晶子, 吉沢明康, 河野信, 荒木令江

日本生化学会大会(Web)  2013年9月 

Mass++:質量分析データの一括解析

田中聡, 藤田雄一郎, 吉沢明康, 福田充, 宇都宮眞一, 梶原茂樹, 青島健, 小田吉哉, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013年9月  日本質量分析学会

質量分析用データ解析ソフトウェアMass++とマススペクトルデータベースMassBank連携プラグインの開発

青島健, 福田充, 井川幹之, 高橋健太郎, 木村剛之, 梶原茂樹, 宇都宮眞一, 田中聡, 吉沢明康, 田中耕一, 池田奨, 二瓶義人, 西岡孝明, 小田吉哉

質量分析総合討論会講演要旨集  2013年9月  日本質量分析学会

ユーザーによる処理の追加可能なproteome解析プラットフォームJobRequestと,それを利用したタンパク質同定ツールProteoAnalysis

田畑剛, 吉沢明康, 山本昇, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013年9月  日本質量分析学会

ヒトタンパク質末端配列データベースの構築と末端配列の一意性の推定

吉沢明康, 福山裕子, 梶原茂樹, 九山浩樹, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013年9月  日本質量分析学会

液体マトリックス3AQ/CHCAを用いたがんマーカータンパク質BFPの構造解析

寶迫睦美, 九山浩樹, 中島ちひろ, 福山裕子, 吉沢明康, 川畑慎一郎, 田中耕一

質量分析総合討論会講演要旨集  2013年9月  日本質量分析学会

Development of ProteomeTools - a web application suite for proteomics experiment 国際会議

Tabata, T, Yoshizawa, A.C, Ohta, Y, Kusano, M, Yamamoto, N, Aoshima, K, Kajihara, S, Oda, Y, Tanak,a K

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013年9月 

Cross-organism comparison of the uniqueness in protein terminal region sequences 国際会議

Yoshizawa, A.C, Fukuyama, Y, Kajihara, S, Kuyama, H, Tanaka, K

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013年9月 

A simple and fast label-free quantitation algorithm for LC-MS 国際会議

Aoshima, K, Ikawa, M, Kimura, T, Fukuda, M, Takahashi, K, Tanaka, S, Fujita, Y, Yoshizawa, A.C, Utsunomiya, S, Kajihara, S, Tanaka, K, Oda, Y

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013年9月 

iPEACH: Integrated Protein/Gene Expression Analysis Chart 国際会議

Kawano, S, Yoshizawa, A.C, Mizuguchi, S, Araki, N

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013年9月 

Integrated Proteomics Identified Novel Activation of Dynein IC2-GR-COX-1 Signaling by Suppression of NF1 Tumor Suppressor Gene Product, Neurofibromin, in Neuronal Cells 国際会議

Kobayashi, D, Hirayama, M, Mizuguchi, S, Morikawa, T, Nagayama, M, Midorikawa, U, Wilson-Morifuji, M, Nambu-Niibori, A, Yoshizawa, A.C, Kawano, S, Araki, N

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013年9月 

Identification and label-free quantitation of mass spectrometric data via freely available plug-in software, Mass++ 国際会議

Tanaka, S, Fujita, Y, Yoshizawa, A.C, Utsunomiya, S, Kajihara, S, Fukuda, M, Ikawa, M, Takahashi, K, Tabata, T, Aoshima, K, Oda, Y, Tanaka, K

Human Proteome Organization 12th Annual World Congress (HUPO2013)  2013年9月 

既知翻訳後修飾情報データベースMSPTM-DBとweb実行環境ProteoAnalysis

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

日本分子生物学会年会  2012年12月 

KEGG OC:系統関係に基づいた大規模オーソログクラスタの自動生成

守屋勇樹, 中谷明弘, 片山俊明, 伊藤真純, 平糠和志, 川島秀一, 奥田修二郎, 田中道廣, 時松敏明, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久 實, 五斗 進

日本分子生物学会年会  2012年12月 

JobRequest - an easy-to-use software platform for proteomic analysis - and ProteoAnalysis, its application for protein identification 国際会議

Tabata, T, Yoshizawa, A.C, Kimura, T, Nakamura, T, Aoshima, K, Oda, Y, Kajihara, S, Tanaka, K

19th International Mass Spectrometry Conference (IMSC2012)  2012年9月 

MSPTM-DB: a known PTM database for high-speed and accurate search available on the "ProteoAnalysis" web site 国際会議

19th International Mass Spectrometry Conference (IMSC2012)  2012年9月 

計算プロテオミクス手法を用いたタンパク質翻訳後修飾の同定 招待

吉沢 明康

熊本大学拠点形成研究Bセミナー「プロテオミクスを基盤とした病態システムズバイオロジー教育研究拠点の構築」  2012年6月 

質量分析データベース検索への翻訳後修飾情報の利用

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

日本分子生物学会年会  2011年12月 

データベース検索における翻訳後修飾情報の利用

吉沢明康, 田畑剛, 木村剛之, 青島健, 小田吉哉, 梶原茂樹, 田中耕一

第59回質量分析総合討論会  2011年9月 

Crystal structure of T-H protein complex of the glycine cleavage system 国際会議

Okamura-Ikeda, K, Hosaka, H, Maita, N, Fujiwara, K, Yoshizawa, A.C, Nakagawa, A, Taniguchi, H

XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography  2011年8月 

セルロース生合成関連遺伝子ファミリーのゲノムコンテキスト

河野 信, 吉沢明康

BMB2010  2010年12月 

仮想ゲルを用いたLC/MSデータの表示とタンパク質修飾の探索プログラム

吉沢明康, 山田力志, 谷口寿章

BMB2010  2010年12月 

構造解析から明らかになったグリシン開裂酵素系T蛋白質によるアミノメチル転移の新たな反応機構

池田和子, 保坂晴美, 真板宣夫, 藤原和子, 吉沢明康, 中川敦史, 谷口寿章

BMB2010  2010年12月 

プロテオミクス解析データのデータベース化 招待

吉沢 明康

疾患酵素学研究センターセミナー  2010年11月 

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein Database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses, and curated annotation, with ability for user rating and comments 国際会議

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Beyond the Genome 2010  2010年10月 

CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments 国際会議

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Konno, A, Sasakura, Y, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H, Yamasaki, C, Sera, M, Imanishi, T, Inaba, K

Biocuration 2010  2010年10月 

CIONA INTESTINALIS PROTEIN DATABASE CIPRO SHOWS A VARIETY OF PROTEOMES FOR A SINGLE SPECIES

遠藤俊徳, 上野恵介, 米澤弘毅, 峯田克彦, 堀田耕司, 佐藤ゆたか, 山田力志, 小笠原道生, 高橋弘樹, 中島綾子, 中地美都, 野村守, 谷口順子, 紺野在, 笹倉靖徳, 吉沢明康, 谷口寿章, 今西規, 稲葉一男

Computational Biology Research Center Workshop 2010 (CBRC2010)  2010年7月 

セルロース合成関連遺伝子群のゲノムコンテキスト解析

河野信, 橋本浩介, 吉沢明康

セルロース学会年次大会講演要旨集  2010年7月 

Western Blot-like Presentation of Gel-enhanced LC/MS Data and Software-based Detection of Protein Modifications 国際会議

Yoshizawa, A.C, Yamada, L, Taniguchi, H

RECOMB(Research in Computational Molecular Biology) Satellite Conference on Computational Proteomics 2010  2010年3月 

Global protein profiling of ascidian C. intestinalis: toward the comprehensive understanding at the protein level 国際会議

Yamada, L, Yoshizawa, A.C, Taniguchi, H

5th International Tunicate Meeting  2009年6月 

Ascidian Adult Body Map: A proteomic view of adult ascidian tissues 国際会議

Yoshizawa, A.C, Yamada, L, Nakachi, M, Inaba, K, Ogasawara, M, Taniguchi, H

5th International Tunicate Meeting  2009年6月 

Ascidian Adult Body Map：質量分析によるホヤ・プロテオーム・データベースの構築

吉沢明康, 山田力志, 中地美都, 稲葉一男, 小笠原道生, 谷口寿章

日本分子生物学会第9回春季シンポジウム  2009年5月 

KEGG OC: 全生物種ゲノムにおけるオーソログ遺伝子のバリエーションと高速検索技術（4P-0985）

片山俊明, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久 實

第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)  2008年12月 

マウス肝臓蛋白質発現の年齢依存変化のGene Ontology解析

吉沢明康, BOLOTOVA Tatiana, 倉地幸徳, 倉地須美子

BMB2008  2008年12月 

KEGG OC:オーソログクラスターのマニュアルアノテーション

川島秀一, 伊藤真純, 奥田修二郎, 片山俊明, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

BMB2008  2008年12月 

KEGG OC:網羅的なオーソログクラスターの自動生成

中谷明弘, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 片山俊明, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

BMB2008  2008年12月 

KEGG OC:全生物種ゲノムにおけるオーソログ遺伝子のバリエーションと高速検索技術（4T9-4）

片山俊明, 伊藤真純, 奥田修二郎, 川島秀一, 田中道廣, 時松敏明, 中谷明弘, 平糠和志, 守屋勇樹, 山西芳裕, 吉沢明康, 金久實

BMB2008  2008年12月 

網羅的データの解析による生物学的知識の抽出

吉沢 明康

疾患酵素学研究センターセミナー  2008年9月 

ゲノム決定済み生物種からの多糖類生合成酵素の網羅的抽出

河野 信, 吉沢明康, 橋本浩介, 高木利久

セルロース学会第15回年次大会  2008年7月 

Global analyses of age-related expression profiles of mouse liver proteins and database construction 国際会議

Kurachi, S, Bolotova, T, Suenaga, E, Yoshizawa, AC, Kurachi, K

The Joint 4th AOHUPO (Asian Oceania Human Proteome Organisation) and PRICPS (Pacific Rim International Conference on Protein Science)  2008年6月 

マウス肝臓における遺伝子発現の年齢依存変化

吉沢明康, 末永恵美, 倉地須美子, 倉地幸徳

日本分子生物学会第8回春季シンポジウム  2008年5月 

Pseudo-clique extraction method towards comprehensive clusters of orthologous genes in KEGG

中谷明弘, 片山俊明, 川島秀一, 伊藤真純, 山西芳裕, 奥田修二郎, 守屋勇樹, 吉沢明康, 金久 實

2007年日本バイオインフォマティクス学会年会  2007年12月 

DesaturaseとElongaseの網羅的探索及びその組合せによる脂肪酸予測

橋本浩介, 吉沢明康, 奥田修二郎, 隈啓一, 五斗進, 金久實

BMB2007  2007年12月 

遺伝子エレメントASE結合核蛋白質の同定:年齢軸恒常性分子機構の確立に向けて

倉地須美子, 笠間絵美, 田中拓, 吉沢明康, 倉地幸徳

日本血栓止血学会誌  2007年10月 

Analysis of Tissue Specific Expression Patterns of Isozymes 国際会議

Takarabe, M, Tsuchida, A, Fujita, M, Okuda, S, Yoshizawa, A.C, Yamada, T, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

The 17th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2006年12月 

不飽和脂肪酸伸長酵素「Fatty Acid Elongase」の網羅的探索

橋本浩介, 吉沢明康, 金久 實

日本分子生物学会2006フォーラム  2006年12月 

Coiled-coil structures in E.coli interactome 国際会議

Luban, S, Yoshizawa, A, Kihara, D

Third Annual Indiana Bioinformatics Conference  2006年5月 

細胞内輸送関与蛋白質のパラログ数変化に基づく真核細胞内輸送経路の多様化の考察

吉沢明康, 奥田修二郎, 守屋勇樹, 伊藤真純, 川島秀一, 五斗進, 金久實

日本分子生物学会年会  2005年12月 

選択的スプライシングとタンパク質の機能の多様化の関連解析

重水大智, 奥田修二郎, 吉沢明康, 伊藤真純, 服部正秦, 五斗進, 金久實

日本分子生物学会年会講演要旨集  2005年12月 

Automatic generation of KEGG OC (Ortholog Cluster) and its assignment to draft genomes 国際会議

Moriya, Y, Katayama, T, Nakaya, A, Itoh, M, Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004年12月 

Analysis of the bacterial sequences recognized by RNA-binding proteins and compounds 国際会議

Muto, A, Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Itoh, M, Hattori, M, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004年12月 

Functional Categorization of Multiple Genomes using KEGG OC in the Genome Indices 国際会議

Okuda, S, Yoshizawa, A.C, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Goto, S, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004年12月 

Functional Classification of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes 国際会議

Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Moriya, Y, Itoh, M, Katayama, T, Kawano, S, Okamoto, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2004年12月 

Genome Wide Profiling of Glycosyltransferases and Predicted Glycan Structures from Complete and Draft Eukaryote Genomes

河野 信, 吉沢明康, 五十嵐芳暢, 檜作好之, 金久 實

第27回日本分子生物学会年会  2004年12月 

ゲノムを特徴づける種々の指標のデータベース化とそれらによる生物種進化の考察

奥田修二郎, 吉沢明康, 守屋勇樹, 伊藤真純, 五斗進, 金久實

日本分子生物学会年会  2004年12月 

SNARE分子のパラログ数変化に基づく真核細胞内輸送経路の多様化の考察

吉沢明康, 奥田修二郎, 伊藤真純, 守屋勇樹, 川島秀一, 五斗進, 金久實

日本分子生物学会年会  2004年12月 

Integration of Biological Features of Multiple Genomes - The Construction of "Genome Indices" database - 国際会議

Okuda, S, Yoshizawa, A.C, Moriya, Y, Itoh, M, Goto, S, Kanehisa, M

The Fourth International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB)  2004年5月 

Prediction and Comparison of Coiled-Coil Proteins in Multiple Genomes 国際会議

Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Itoh, M, Katayama, S, Kawashima, S, Kanehisa, M

The Fourth International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB)  2004年5月 

SNARE分子の分類とデータベース構築

吉沢明康, 五斗進, 川島秀一, 金久實

日本分子生物学会年会  2003年12月 

Comprehensive Survey of Intracellular Transport System-Related Proteins in Complete Genomes and Draft Genomes 国際会議

Yoshizawa, A.C, Itoh, M, Okuda, S, Limviphuvadh, V, Sakiyama, T, Kawashima, S, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003年12月 

Metabolic pathway reconstruction for malaria parasite Plasmodium falciparum 国際会議

Limviphuvadh, V, Okuno, Y, Katayama, T, Goto, S, Yoshizawa, A.C, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003年12月 

The Construction of a Database for Ubiquitin Signaling Cascade 国際会議

Sakiyama, T, Kawashima, S, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003年12月 

Analysis of Domain Combinations in Eukaryotic Genomes 国際会議

Itoh, M, Yoshizawa, A.C, Okuda, S, Goto, S, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003年12月 

Extraction of Organism Groups from Whole Genome Comparisons 国際会議

Yamanishi, Y, Yoshizawa, A.C, Itoh, M, Katayama, T, Kanehisa, M

The 14th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2003年12月 

配列解析に基づくSNARE分子の分類と配列モチーフ抽出

吉沢 明康

京都大学大学院生命科学研究科 生命科学セミナー21  2003年6月 

SNARE分子の結合特異性を反映する配列モチーフ

吉沢明康, 川島秀一, 金久 實

第25回日本分子生物学会年会  2002年12月 

Indirect relations in yeast protein interactome 国際会議

Nakaya, A, Yoshizawa, A.C, Goto, S, Kanehisa, M

The 13th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2002年12月 

Comparative analysis of Rab GTPases and SNAREs in eukaryotic genomes 国際会議

Yoshizawa, A.C, Kawashima, S, Kanehisa, M

The 13th International Conference on Genome Informatics (GIW)  2002年12月 

Two-hybrid法・Microarray法のデータ同時比較による細胞内小胞輸送関連遺伝子の抽出

吉沢明康, 中谷明弘, 五斗 進, 金久 實

京都大学化学研究所第101回研究発表会  2001年12月 

Extraction of related genes in the vesicular transport by simultaneous comparison of two-hybrid and microarray data 国際会議

Yoshizawa, A.C, Nakaya, A, Goto, S, Kanehisa, M

The Twelfth International Conference on Genome Informatics (GIW)  2001年12月 

The construction of a database on the intracellular vesicular transport 国際会議

Yoshizawa, A.C, Kawashima, S, Kanehisa, M

The Eleventh Workshop on Genome Informatics (GIW)  2000年12月 

pathway databaseの現状

吉沢 明康

第21回蛋白質核酸構造理論勉強会  1999年6月 

High Resolution Cryo-Electron Microscopy Gives Clues to Transient and Metastable Structures of Subcellular Organization 国際会議

Kume, N.P, Yuba, A.D, Yoshizawa, A.C, Sato, S.B, Miyazu, M, Yamazaki, M

The 13th International Congress for Electron Microscopy  1994年7月 

極低温高分解能電子顕微鏡による生体膜融合過程の観察

吉沢明康, 山岸秀夫

日本電子顕微鏡学会超低温技術研究部会  1991年12月 

極低温電子顕微鏡によって観察した膜融合現象の諸相

吉沢明康, 弓場亜紀子, 山岸秀夫, 高橋信之, 久米直明

日本生物物理学会第29回年会  1991年 

極低温電子顕微鏡を用いたインフルエンザウイルス膜融合過程の観察

吉沢 明康, 弓場 亜紀子, 佐藤 智, 山岸 秀夫, 大西 俊一, 久米 直明

日本生物物理学会年会講演予稿集  1990年9月 

High Resolution Cryo-Electron Microscopy Sheds a New Light upon Biomembrane Architecture 国際会議

Kume, N.P, Yuba, A.D, Yoshizawa, A.C, Sato,S.B, Fujiyoshi, Y

The 12th International Congress for Electron Microscopy  1990年8月 

極低温高分解能電子顕微鏡による生体膜融合過程追跡の試み

弓場亜紀子, 吉沢明康, 佐藤 智, 久米直明

日本電子顕微鏡学会第46回学術講演会  1990年5月 

膜小胞の曲率が膜融合活性に及ぼす影響

吉沢明康, 村田昌之, 大西俊一

日本生物物理学会第26回年会  1988年 

Development of a Time-Resolved Microfluorimeter with a Synchroscan Streak Camera and Its Application to Studies of Cell Membranes 国際会議

Kusumi, A, Tsuji, A, Murata, M, Sako, Y, Yoshizawa, A.C, Hayakawa, T, Ohnishi, S

SPIE (The International Society for Optical Engineering) Proceedings  1988年 

時間分解顕微蛍光光度計の開発と細胞膜の動的構造研究への応用

楠見明弘, 辻 明彦, 村田昌之, 佐甲靖志, 吉沢明康, 早川 毅, 大西俊一

日本生物物理学会第25回年会  1987年 

IB-7 時間分解顕微蛍光光度計の開発と細胞膜研究への応用

楠見 明弘, 辻 明彦, 村田 昌之, 佐甲 靖志, 吉沢 明康, 早川 毅

日本組織細胞化学会総会プログラムおよび抄録集  1987年 

作業支援管理装置、方法、及びプログラム

吉沢 明康, 田畑 剛, 太田 悠葵

タンパク質の同定方法及び同定装置

吉沢 明康, 九山 浩樹

タンパク質又はペプチドの分析方法及び分析装置

吉沢 明康, 吉森 孝行, 太田 悠葵

SEQUENCE ANALYZING APPARATUS

梶原 茂樹, 吉森 孝行, 吉沢 明康, 金子 直樹

アミノ酸配列解析方法及び装置

吉沢 明康, 吉森 孝行

アミノ酸配列解析方法及び装置

梶原 茂樹, 吉森 孝行, 吉沢 明康, 金子 直樹

質量分析を用いた修飾タンパク質同定方法及び同定装置

吉沢 明康, 田畑 剛, 梶原 茂樹

METHOD AND SYSTEM FOR ANALYZING PROTEIN OR PEPTIDE

吉沢 明康, 吉森 孝行, 太田 悠葵

CIPRO (Ciona intestinalis Protein Database)

Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Sasakura, Y, Yamasaki, C, Sera, M, Yoshizawa, AC, Imanishi, T, Taniguchi, H, Inaba, K

The SNARE Map

文字列高速検索技術を用いた全ゲノム・アミノ酸配列同定リソースの開発

研究課題/領域番号：018RP2021

2021年7月 - 2022年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・一般共同研究

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

吉沢明康, 内藤雄樹, 五斗進

文字列高速検索技術を用いた全ゲノム・アミノ酸配列同定リソースの開発

研究課題/領域番号：019RP2020

2020年7月 - 2021年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・一般共同研究

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

吉沢明康, 内藤雄樹, 五斗進

質量分析によるアミノ酸配列de novo決定のための新規手法開発

研究課題/領域番号：20H03245

2020年4月 - 2023年3月

制度名：科学研究費助成事業

研究種目：基盤研究(B)

提供機関：日本学術振興会

河野 信, 岩崎 未央, 小林 大樹, 吉沢 明康

文字列高速検索技術とRDFを用いたタンパク質配列同定リソースの開発とその応用

研究課題/領域番号：017RP2019

2019年7月 - 2020年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・一般共同研究

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

吉沢明康, 内藤雄樹, 守屋勇樹, 河野信, 田畑剛, 石濱泰, 五斗進

質量分析インフォマティクス・ハッカソン・プレ・ミーティング

研究課題/領域番号：005RM2019

2019年7月 - 2020年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・共同研究集会

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

文字列高速検索技術とRDFを用いたタンパク質及び塩基配列同定リソースの開発とその応用

研究課題/領域番号：005RP2018

2018年6月 - 2019年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・一般共同研究

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

吉沢明康, 内藤雄樹, 加藤雅樹, 守屋勇樹, 田畑剛, 内山郁夫, 河野信, 石濱泰, 五斗進

質量分析インフォマティクス・ハッカソン・シンポジウム

研究課題/領域番号：002RM2018

2018年6月 - 2019年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・共同研究集会

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

第2回・質量分析インフォマティクス・ハッカソン

2018年4月 - 2019年3月

制度名：学会等開催助成

提供機関：公益財団法人・加藤記念バイオサイエンス振興財団

質量分析インフォマティクス・ハッカソン・プレ・ミーティング

研究課題/領域番号：006RM2017

2017年11月 - 2018年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・共同研究集会

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

文字列高速検索技術とRDFを用いたタンパク質同定リソースの開発

研究課題/領域番号：013RP2017

2017年10月 - 2018年3月

制度名：公募型共同研究「ROIS-DS-JOINT」・一般共同研究

提供機関：情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設

吉沢明康, 内藤雄樹, 守屋勇樹, 河野信, 田畑剛, 石濱泰, 五斗進

質量分析インフォマティクス・ハッカソン

2017年4月 - 2018年3月

制度名：学会等開催助成

提供機関：公益財団法人・加藤記念バイオサイエンス振興財団

深層学習による質量ピーク探知法の開発

研究課題/領域番号：16K00390

2016年4月 - 2019年3月

制度名：科学研究費助成事業 基盤研究(C)

研究種目：基盤研究(C)

提供機関：日本学術振興会

吉沢 明康, 守屋 勇樹, 田畑 剛, 岩崎 未央, 河野 信, 五斗 進, 石濱 泰, 瀧川 一学

プロテオミクス情報と比較ゲノム手法を用いた真核生物オペロンの網羅的解析

研究課題/領域番号：23510245

2011年4月 - 2012年3月

制度名：科学研究費助成事業 基盤研究(C) ［採択後辞退］

研究種目：基盤研究(C)

提供機関：日本学術振興会

吉沢 明康, 山田力志, 奥田修二郎, 守屋勇樹